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The map label for this gene is mepA [H]

Identifier: 226950248

GI number: 226950248

Start: 3226753

End: 3228123

Strand: Direct

Name: mepA [H]

Synonym: CLM_3203

Alternate gene names: 226950248

Gene position: 3226753-3228123 (Clockwise)

Preceding gene: 226950247

Following gene: 226950252

Centisome position: 77.65

GC content: 29.54

Gene sequence:

>1371_bases
ATGAATAAAAATCGTGAAGAATTAATTAATGGTAATATGTTTACATTGCTTTTAAAACTTTCTATTCCAGGCATTATAGG
AATGCTAGTCATAGGTTTATACAATTTATGTGATGCTATTTTTGTTGGAAAGTTAGTAGGAGAAACTGCCTTAGCTGCTG
TAAGCATATCCTCTCCATTTACTTTTATAAACAATTGTATTGCTGTACTTGTAGGTGTTGGTTCATCTTCAATTTTATCT
CGAGCTATTGGAGCAAAGGATAATAAAGTTATTAATGAAATTTTAGGTAATTTAATACTATCTATATTAGTATTATCATT
AGCTGTAACTATATTAGGATGCTTATTTTCAGAAAATTTACTTAGATTCTCAGGAGCTACAGGAGAAATATTAAAATCAG
GCATAAACTATTTAAGAATAGTTTATATTGGCTCATTCTTTGTTAATTTTTCACAAAGTGCTAATATGCTCATAAGAGGA
GAGGGAAAGATGAAAGAAGCTATGAGCATTATGGCATTAGGCGCAATATTAAATATCATTTTAGATCCAATATTTATAAA
AACTTTAAATTTGGGCGTTGAAGGTGCAGCTATAGCTACAATAATTGCACAAATAATCCAAGCTTTAGTTACATTTATAT
ACTTTAAACGTAACAAATCAATCCTATCAGTAAATAAATTAAAGTTTGCTTTCGATTTAATGCCAGAGATATTATCCGTA
GGAGGCTCAGCTGCAATGATGCAACTTATGTATCTAGTGCAACAAACTGCTTTATACAAGCTTATCTCAATATATGGAGG
AGATGACCAATTGGTATTAATGGGTGTAGCTCTTAGAATTTTAATGTTTACATTTATACCTATCTGGGGAATCGGACAAG
GACTTCAACCTATAGTAGGAATGAATTTTGGAGCTAAAAAATATGATCGTGTTAAAGATGCTGTTAAAATCTTTAGTATA
GCATCTACTATATTTATTGGAGCATTATGGGGTTTTTATATGCTTAAACCTAGAGTTGTTTTAAGTTGGTTTATTAATGA
TAAGACTATAATTGAAAATGGATACAATTTTTTTAGGCTTATGTTTTTGACCTTTCCAGTGTCTGGACTTATAGTTATGT
CTATGACATTTTTCCAATCAATAGGTAAAGGCGGAAAATCTGCACTAATAACTATTTTAAAACAGGTAATACTTTTCATG
CCTATAGCTATAATTCTTACTAAAGTTATTGGCGTCAAAGGAACATGGTTGGCCTCTTCAGTTACTGATGCAATAGTATT
TGTACTTTCTTTTGTTCTTTTAGCTATTGAATTTAAAAAATTATATGGTATAAATTCTTCAAAAAATGAAAATGTAACTT
ACATTAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATTCATTGATATTAAGGGAGGTAGATAAAAATATAATCAACCACAAAATTACTAATACTCACTATCATAAAAAATAATT
TTTAAAAAGGGAGGATATAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATGGATGAAGAATATATATTTAGATAAAAGGTGACATTTATGTTATGTCACCTTTTATTCATTTTTAGTCAATATCTTT
TTTCATGCATTAATATTCTG

Product: MATE efflux family protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 456; Mature: 456

Protein sequence:

>456_residues
MNKNREELINGNMFTLLLKLSIPGIIGMLVIGLYNLCDAIFVGKLVGETALAAVSISSPFTFINNCIAVLVGVGSSSILS
RAIGAKDNKVINEILGNLILSILVLSLAVTILGCLFSENLLRFSGATGEILKSGINYLRIVYIGSFFVNFSQSANMLIRG
EGKMKEAMSIMALGAILNIILDPIFIKTLNLGVEGAAIATIIAQIIQALVTFIYFKRNKSILSVNKLKFAFDLMPEILSV
GGSAAMMQLMYLVQQTALYKLISIYGGDDQLVLMGVALRILMFTFIPIWGIGQGLQPIVGMNFGAKKYDRVKDAVKIFSI
ASTIFIGALWGFYMLKPRVVLSWFINDKTIIENGYNFFRLMFLTFPVSGLIVMSMTFFQSIGKGGKSALITILKQVILFM
PIAIILTKVIGVKGTWLASSVTDAIVFVLSFVLLAIEFKKLYGINSSKNENVTYIK

Sequences:

>Translated_456_residues
MNKNREELINGNMFTLLLKLSIPGIIGMLVIGLYNLCDAIFVGKLVGETALAAVSISSPFTFINNCIAVLVGVGSSSILS
RAIGAKDNKVINEILGNLILSILVLSLAVTILGCLFSENLLRFSGATGEILKSGINYLRIVYIGSFFVNFSQSANMLIRG
EGKMKEAMSIMALGAILNIILDPIFIKTLNLGVEGAAIATIIAQIIQALVTFIYFKRNKSILSVNKLKFAFDLMPEILSV
GGSAAMMQLMYLVQQTALYKLISIYGGDDQLVLMGVALRILMFTFIPIWGIGQGLQPIVGMNFGAKKYDRVKDAVKIFSI
ASTIFIGALWGFYMLKPRVVLSWFINDKTIIENGYNFFRLMFLTFPVSGLIVMSMTFFQSIGKGGKSALITILKQVILFM
PIAIILTKVIGVKGTWLASSVTDAIVFVLSFVLLAIEFKKLYGINSSKNENVTYIK
>Mature_456_residues
MNKNREELINGNMFTLLLKLSIPGIIGMLVIGLYNLCDAIFVGKLVGETALAAVSISSPFTFINNCIAVLVGVGSSSILS
RAIGAKDNKVINEILGNLILSILVLSLAVTILGCLFSENLLRFSGATGEILKSGINYLRIVYIGSFFVNFSQSANMLIRG
EGKMKEAMSIMALGAILNIILDPIFIKTLNLGVEGAAIATIIAQIIQALVTFIYFKRNKSILSVNKLKFAFDLMPEILSV
GGSAAMMQLMYLVQQTALYKLISIYGGDDQLVLMGVALRILMFTFIPIWGIGQGLQPIVGMNFGAKKYDRVKDAVKIFSI
ASTIFIGALWGFYMLKPRVVLSWFINDKTIIENGYNFFRLMFLTFPVSGLIVMSMTFFQSIGKGGKSALITILKQVILFM
PIAIILTKVIGVKGTWLASSVTDAIVFVLSFVLLAIEFKKLYGINSSKNENVTYIK

Specific function: Multidrug resistance efflux protein [H]

COG id: COG0534

COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the multi antimicrobial extrusion (MATE) (TC 2.A.66.1) family. MepA subfamily [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528
- InterPro:   IPR015522 [H]

Pfam domain/function: PF01554 MatE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 49832; Mature: 49832

Theoretical pI: Translated: 10.17; Mature: 10.17

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
4.2 %Met     (Translated Protein)
4.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
4.2 %Met     (Mature Protein)
4.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNKNREELINGNMFTLLLKLSIPGIIGMLVIGLYNLCDAIFVGKLVGETALAAVSISSPF
CCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCH
TFINNCIAVLVGVGSSSILSRAIGAKDNKVINEILGNLILSILVLSLAVTILGCLFSENL
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LRFSGATGEILKSGINYLRIVYIGSFFVNFSQSANMLIRGEGKMKEAMSIMALGAILNII
HHHCCCCHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LDPIFIKTLNLGVEGAAIATIIAQIIQALVTFIYFKRNKSILSVNKLKFAFDLMPEILSV
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHC
GGSAAMMQLMYLVQQTALYKLISIYGGDDQLVLMGVALRILMFTFIPIWGIGQGLQPIVG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHC
MNFGAKKYDRVKDAVKIFSIASTIFIGALWGFYMLKPRVVLSWFINDKTIIENGYNFFRL
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCHHHHHH
MFLTFPVSGLIVMSMTFFQSIGKGGKSALITILKQVILFMPIAIILTKVIGVKGTWLASS
HHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH
VTDAIVFVLSFVLLAIEFKKLYGINSSKNENVTYIK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEC
>Mature Secondary Structure
MNKNREELINGNMFTLLLKLSIPGIIGMLVIGLYNLCDAIFVGKLVGETALAAVSISSPF
CCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCH
TFINNCIAVLVGVGSSSILSRAIGAKDNKVINEILGNLILSILVLSLAVTILGCLFSENL
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LRFSGATGEILKSGINYLRIVYIGSFFVNFSQSANMLIRGEGKMKEAMSIMALGAILNII
HHHCCCCHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LDPIFIKTLNLGVEGAAIATIIAQIIQALVTFIYFKRNKSILSVNKLKFAFDLMPEILSV
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHC
GGSAAMMQLMYLVQQTALYKLISIYGGDDQLVLMGVALRILMFTFIPIWGIGQGLQPIVG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHC
MNFGAKKYDRVKDAVKIFSIASTIFIGALWGFYMLKPRVVLSWFINDKTIIENGYNFFRL
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCHHHHHH
MFLTFPVSGLIVMSMTFFQSIGKGGKSALITILKQVILFMPIAIILTKVIGVKGTWLASS
HHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH
VTDAIVFVLSFVLLAIEFKKLYGINSSKNENVTYIK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA