The gene/protein map for NC_010673 is currently unavailable.
Definition Borrelia hermsii DAH chromosome, complete genome.
Accession NC_010673
Length 922,307

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 187918446

Identifier: 187918446

GI number: 187918446

Start: 610688

End: 612031

Strand: Direct

Name: 187918446

Synonym: BH0584

Alternate gene names: NA

Gene position: 610688-612031 (Clockwise)

Preceding gene: 187918444

Following gene: 187918447

Centisome position: 66.21

GC content: 27.75

Gene sequence:

>1344_bases
ATGTATTCATTAAGTAAATTCAAGAAAAGCAGTGTGTATCAAGATATTTTAAATATTGCAATCCCAACAACCATTGAATT
CTTTTTATTTAATGTTGTTGCATTTACAGATAATATTATGGTGTCTTATCTTGGCGATTATCCTGTTGTTGGGGTTTCTC
TTGCAAATAAATTTTTCGAACTCTTTAGTACTATTGCTTTTGCCGTAATGGGAGCTTATAATATATTGGCAACAAGGCAA
TATGCCCAAGGTAATATTGCTGGTTTTAAAAATACATTTTTTATTAGCATTTTAATTCTTCTATTTTTTTCCTTTTTATT
TATAGTAATTTCATTATTTTATTCATATTTTTTTCTTGGATTATTATCTGATGACTTATTAGCTATTTCTTATGGAGTAT
CTTATCTTAATATTGCTGTTTATTCTTTTATATTTGCAGTTGTTAAGGGAATTATTGCTAATTCACTAAAAGTTGTTAAA
ATAACTAAAATTCAAATTGCTACTTCTGTTATTTCAGTTATTTTGAATGTGGTTTTTAACTATTTATTTATTTTTGTGCT
TAATATGGGAGTAGTTGGTGCTGCTATTGCAACTACGTTGGTTCGCCTGATTGAGCTTATTTTTTATCTTATTTATACTG
TTTTTAATACAAATTCACATTTTTATCTTAAGCTTGAAAATTTAAAAATCAATCCTGTGATATTTTCTGAGTTAATTAAG
GTTTTTGTTCCAATTTTTTTAAATGATTTTATTTGGTATTTGGGATATTTTGGTTTAATTGCGATCTTTTCAAGAATTGA
TACGGCTAAGTATGCGGCTTATAGTATAACTTTTTCTATTTATTTTATTGGATTTAATATAATTCATGCTTTTTGCTTTG
CTGTTAATATTGTGATGGGACATGAGATGAATAATGATAAAGAAGAGATAATGTCTGTTGCGATATATTTGAGCAAGATA
GGTTTTGTTTTGGCTGTTTTGACTTCTTTCATAATGTTTGCTTTGTCATTTATAGCCCCCCATATTTTCTATAAATTGGA
GTATGCAGATCTTATGGGAGTTATGCTAAGATATTATTCTATTTCAGTATTTTTTACATCACTTGCGTTTCAATATTTAT
TTGGGTTTTTCCGTGCAGGTGCATCTCCAAATTTTGGAGCTATTATGGAAGGTTCTGTAACTTTTATTTATACAATTCCT
ATTGCATACTTTTTAGCAAAGTATACGCAGACCCCATTTGAACTTATTGTCTTTATTCCAACTCTTGAAGATGTAATTAA
GTTGGGTATTTCTCTTCCTTATTTTTATAGTACTAAGTGGATTAAGTCTATTAAAACAGGTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GAATTCCCTCTATTTTTCTATAGTATGTTTGTTTAAACTCGAATTCGTTTGTTTTTTTGACAATTTGAAAATTTGCTGTT
TTTGTATTTAGGGGGAGGTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTATTTTGTTATAATACTGATGCTGTGTATTTAAATGATATAAGAGGTAAAAATTTTTTGATTATGGGCTTGGGGCTTCA
TGGAGGAGGTCTTGCTGCTG

Product: Na+ driven multidrug efflux pump

Products: NA

Alternate protein names: Na+ Driven Multidrug Efflux Pump; Na+-Driven Multidrug Efflux Pump; Mate Efflux Family Protein; Adhesin; MatE Efflux Family Protein; Drug/Sodium Antiporter; MOP/MATE Family Multidrug-Resistance Efflux Pump; Cation Efflux Pump; MOP/MATE Superfamily Multidrug-Resistance Efflux Pump NorM; Multi Antimicrobial Extrusion Protein MatE; MATE Family Multidrug Efflux Pumps; Multidrug Efflux Pump

Number of amino acids: Translated: 447; Mature: 447

Protein sequence:

>447_residues
MYSLSKFKKSSVYQDILNIAIPTTIEFFLFNVVAFTDNIMVSYLGDYPVVGVSLANKFFELFSTIAFAVMGAYNILATRQ
YAQGNIAGFKNTFFISILILLFFSFLFIVISLFYSYFFLGLLSDDLLAISYGVSYLNIAVYSFIFAVVKGIIANSLKVVK
ITKIQIATSVISVILNVVFNYLFIFVLNMGVVGAAIATTLVRLIELIFYLIYTVFNTNSHFYLKLENLKINPVIFSELIK
VFVPIFLNDFIWYLGYFGLIAIFSRIDTAKYAAYSITFSIYFIGFNIIHAFCFAVNIVMGHEMNNDKEEIMSVAIYLSKI
GFVLAVLTSFIMFALSFIAPHIFYKLEYADLMGVMLRYYSISVFFTSLAFQYLFGFFRAGASPNFGAIMEGSVTFIYTIP
IAYFLAKYTQTPFELIVFIPTLEDVIKLGISLPYFYSTKWIKSIKTG

Sequences:

>Translated_447_residues
MYSLSKFKKSSVYQDILNIAIPTTIEFFLFNVVAFTDNIMVSYLGDYPVVGVSLANKFFELFSTIAFAVMGAYNILATRQ
YAQGNIAGFKNTFFISILILLFFSFLFIVISLFYSYFFLGLLSDDLLAISYGVSYLNIAVYSFIFAVVKGIIANSLKVVK
ITKIQIATSVISVILNVVFNYLFIFVLNMGVVGAAIATTLVRLIELIFYLIYTVFNTNSHFYLKLENLKINPVIFSELIK
VFVPIFLNDFIWYLGYFGLIAIFSRIDTAKYAAYSITFSIYFIGFNIIHAFCFAVNIVMGHEMNNDKEEIMSVAIYLSKI
GFVLAVLTSFIMFALSFIAPHIFYKLEYADLMGVMLRYYSISVFFTSLAFQYLFGFFRAGASPNFGAIMEGSVTFIYTIP
IAYFLAKYTQTPFELIVFIPTLEDVIKLGISLPYFYSTKWIKSIKTG
>Mature_447_residues
MYSLSKFKKSSVYQDILNIAIPTTIEFFLFNVVAFTDNIMVSYLGDYPVVGVSLANKFFELFSTIAFAVMGAYNILATRQ
YAQGNIAGFKNTFFISILILLFFSFLFIVISLFYSYFFLGLLSDDLLAISYGVSYLNIAVYSFIFAVVKGIIANSLKVVK
ITKIQIATSVISVILNVVFNYLFIFVLNMGVVGAAIATTLVRLIELIFYLIYTVFNTNSHFYLKLENLKINPVIFSELIK
VFVPIFLNDFIWYLGYFGLIAIFSRIDTAKYAAYSITFSIYFIGFNIIHAFCFAVNIVMGHEMNNDKEEIMSVAIYLSKI
GFVLAVLTSFIMFALSFIAPHIFYKLEYADLMGVMLRYYSISVFFTSLAFQYLFGFFRAGASPNFGAIMEGSVTFIYTIP
IAYFLAKYTQTPFELIVFIPTLEDVIKLGISLPYFYSTKWIKSIKTG

Specific function: Unknown

COG id: COG0534

COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 50770; Mature: 50770

Theoretical pI: Translated: 8.99; Mature: 8.99

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
2.5 %Met     (Translated Protein)
2.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
2.5 %Met     (Mature Protein)
2.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MYSLSKFKKSSVYQDILNIAIPTTIEFFLFNVVAFTDNIMVSYLGDYPVVGVSLANKFFE
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
LFSTIAFAVMGAYNILATRQYAQGNIAGFKNTFFISILILLFFSFLFIVISLFYSYFFLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLSDDLLAISYGVSYLNIAVYSFIFAVVKGIIANSLKVVKITKIQIATSVISVILNVVFN
HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YLFIFVLNMGVVGAAIATTLVRLIELIFYLIYTVFNTNSHFYLKLENLKINPVIFSELIK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECEEECHHHHHHHHH
VFVPIFLNDFIWYLGYFGLIAIFSRIDTAKYAAYSITFSIYFIGFNIIHAFCFAVNIVMG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
HEMNNDKEEIMSVAIYLSKIGFVLAVLTSFIMFALSFIAPHIFYKLEYADLMGVMLRYYS
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISVFFTSLAFQYLFGFFRAGASPNFGAIMEGSVTFIYTIPIAYFLAKYTQTPFELIVFIP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCHHEEEECC
TLEDVIKLGISLPYFYSTKWIKSIKTG
CHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MYSLSKFKKSSVYQDILNIAIPTTIEFFLFNVVAFTDNIMVSYLGDYPVVGVSLANKFFE
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
LFSTIAFAVMGAYNILATRQYAQGNIAGFKNTFFISILILLFFSFLFIVISLFYSYFFLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLSDDLLAISYGVSYLNIAVYSFIFAVVKGIIANSLKVVKITKIQIATSVISVILNVVFN
HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YLFIFVLNMGVVGAAIATTLVRLIELIFYLIYTVFNTNSHFYLKLENLKINPVIFSELIK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECEEECHHHHHHHHH
VFVPIFLNDFIWYLGYFGLIAIFSRIDTAKYAAYSITFSIYFIGFNIIHAFCFAVNIVMG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
HEMNNDKEEIMSVAIYLSKIGFVLAVLTSFIMFALSFIAPHIFYKLEYADLMGVMLRYYS
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISVFFTSLAFQYLFGFFRAGASPNFGAIMEGSVTFIYTIPIAYFLAKYTQTPFELIVFIP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCHHEEEECC
TLEDVIKLGISLPYFYSTKWIKSIKTG
CHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA