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Definition Shewanella pealeana ATCC 700345 chromosome, complete genome.
Accession NC_009901
Length 5,174,581

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The map label for this gene is 157963223

Identifier: 157963223

GI number: 157963223

Start: 4164434

End: 4168030

Strand: Direct

Name: 157963223

Synonym: Spea_3409

Alternate gene names: NA

Gene position: 4164434-4168030 (Clockwise)

Preceding gene: 157963221

Following gene: 157963226

Centisome position: 80.48

GC content: 45.7

Gene sequence:

>3597_bases
ATGGACGCATTTAGCCAGCTACAAGTTATCGAATTTAACCGCCACGACAGCGCTAGTATTGAGCAAGCCTTAAAGGCATA
TCAAGCTCAATTAGAAGCGCATCAAGCCTTTGATAGAGGCGGTCTATTCAACTTGATGTTTATGGATAACAGCAGCGGCA
CGCGTGAACACCTGCAACTGGACATGCTACAAGATCAACAGCTTGCAATGGCAGCACTCTCACTCAATCCAGATGGCGGC
CACTTAAGTAGTTATGTTGTCAGTGATGAACGTCTGCTGTATCTATCTGAAACCCTATTATTTGCCCTAGCGCTAGAGCA
TGAGTCGCTCACACCACAGCTACGCAAGACTGCACAAGCCATGGTCAACTACGCCCGCTTTGAAAACGACACCAGTGAGA
TGTGGCTCGATGAGACCCGAGTATTTGGCGCAGAACCCCTGTATATGATGGCGGCCAAAGACGCTAATGACGCCACTTAT
TTAGCGCAGTTTTTTATCCCCTATTGGGATGGTGACCATGCGGTAGGCTATGGCGATATGTTGCTAAGCCTACTCAGGAA
ACATGGTTGGTGCGAGGCGATGATGAACGCCTTTATCTGGTGTGACAATCACAGCTTTAGATTCGCTTTTTACGGCAGTG
ATTGGGAACAACCAGCTCCAAGATACCAGCCACTTGGGGATTATTTAAAAGCTAATCCAGATAAATACCCACGCTTTATT
GAGCTGGTTAAGCAACGCTTTCATGCCCAGCCTGCACTGGTATATAGCCAACATGACTCGCTGGAAGAGCAAAAGCCGAT
CCTCAATTTATATATCACCTTAATTGCAGAGTGTTGTGGTCTAGACAGTGAAGGGATGAGCGCTGAGCTGGCTGAGCACT
TTATTCATGATAGCCTTGAAAATGAGGCGATGGACCTGCAAAATCTGCTAAAACATGAGCTTAATGGCAAACTCAGTTGT
TACGCAGGCAGTATTGCCCAGCAACGAAAGCAACGAATTGAGCGCGCAGAGCGTAAAGAAGCACGCGATAAGTATCTAGG
CGGACTTAAGATGGTCAGCGAGTTTATGCTGAGCCTTGAAAATAGCCACGCTCTACTGTCTTACATATCTACTGGTGAAA
ATCCGGAGATCCTCGATGATATTGAATGCTTTAACATCATCCCTCATAGTGAAAAGCACGCATTAACCTTTTTTGAAGCC
ATCCATGAGTCTTGCTGGGATATGGACGATTTTGACCATGTGCGCGATAATTTCCATGAGGTGATGGAGCACCTAGCAAA
AGATTTGCTACAAGATAATGATGAGGACATGAGCGAAGCTGCAATCAATGGCTTTATCAGTCGAGTCAATGCTCGTGCAG
ATACGCATTGTAATGATACGGAGCAGGCATCGGCTAACACTCAGCCGGCAAGCCAAGTACGCGACGCGCAAACCATGCTG
CGCTTTGTCGACATTTTCTATCGTTTCTTTGGCCAGCAAGCCTTTAATGACGAAATGTGCGACCTGTTTACGGGCGAATC
AGAATATCAAGCCATTATCAGCGTTGAACAATACTACGCCCGTTTCATGCCAACCGATGCCACACCAAAGCTGGGTTCAG
ATGTAAGCAGAACGGAGCAAAAGGCACTTGAAAGCCTGCTCGATGAATTTATCGATATGGGTTACAACCAGATCTCTGCT
GAAATGCTTAAGCAAACTGATGAGCTATTTGCAAATCGCGCCTGCTTAGACTGCCAAGACTGGCCCGAAGATGAGCTAGG
TATCGACGCGCTTTGCGCTTACTTGCTGTTGCAAGATAAACAGCAAAATCACAATGATGACTACACCCAAGCCTTGCGAG
CAAAGCTAAATGGCGTGTTTGAGCGTGCATTAAACTTGATGCTAGAAAACGCCAACATTTTAGGTGATGGTCCCTTTACT
GAAAAAGGCTTAAACGACGTTGAGCAAGCACAAATCAAAGCTTACTTTACCGATACTGATCCTGAGCTTAATCAGCAACA
GATGATAGCCCTATTAAACCAGCACCTTTTTAGCCAAGATATCTGTCGTCAGGCATTTTTATATTTCCCAAAAATTAGCC
CAGTGCAAAAAAGCTATAGCTTCTTAGATGATCATGACGATGACTATCAACGCGTGGTACTGATTTGCTTATGGCTAAAA
CAACTCGATATCCCCGAAGCCATTAACGCAGAGCGTATTTGGCAACTGCTAATCACTATGGCACCTATTAGAGTTGTTCA
TGTTATCGCTAAAGCCTTTAGCGAGCATAGCCGTAAATTCAAGTGTGATTCGCCGTTAGATGAAATCAACTTCTTCGACA
TGCTAAACAGCCACGGCATAGATAAAGCCTTCACCTTGACCTACCAGGTTGAGCAGTTTAGCACTAGCACCTCACGTACA
GGTGATTACCTTAACTTAGTGGAACTGATTGGAGAGCTCGTCGATGAGGACTCCGCGATTATAGATCAGAGCATGCTGGC
CGCCGCAAGACGTAGTGATGCCAAGGCGTTACTGCGCGGCCTAGATTACAGCTATCAACCAATAAAGCTAGATTTTCATA
AGCACGTGGCGATGCGTTTTCCAAGCATGCCTTTTGCACTCGATAATGAACTAAAGCAATGCCTGAGTGACTTTATCAAG
CTAAACCACAACTCGTGGGAAGAGGTGATTGAGAGCAAATTTACAGACTATGTGAGCTTCTCAGGCTTTGTCACTGACGC
TGGCGAGCTACCTAAAAAGTTACGATTACCACTGACATTGCATCCTAATGCCGATCTGAGTCAAACCCGCAGAAACGATA
GGATGGATTGGATATGCTGCGAGATCTTGCTGCAAGTTGGCGACGAGCTACAGGTGTTAGTGGCTGACAAAGATACCGTT
AGAGAAGGCAATCTCTACCTCGGCGGCGAGGTGTTAATCCTTAACGACAAGGTAGACGCCCAAAGCGTTATTGATGCAGT
CAAAAACTTACCTAGTCCAGAAGAGCGCCGAAACGAAATTAACCAGAACCTATGGGCATATCTGCAAGGCGAGCTAGATT
ATGCTGAGTTTGCGCCGCAATTTAACCAATATGTCAGCTATGAAACCACGGCCAATTTGAAAGAGTATCGTAGCCATGCG
TTAAGCCAGTATCTGTGGCTACTCGATGATGAACGCTGTGGCCGCTTAGTAGAACTACTCGCAAACCATAGCTACGCAGC
CTATAAGGTGTTTACCGATGGCCTTGTAGATAGCTATATGGATCAGCTTGCTTTGCAGGGCAAAATGGATTTGGCCACGC
GCCTAGCATGTAATGAAGATGCCTATGAAGCGGCGGCCAATCAAGTGCTGCTAGATTGGCTATTTAGCCGAAACGTTAAA
CGTGAATATCTACTGCTATATATGATCAAAAACTACCATCCATGTATGGGCGATTATATTGCAGCCATGGCGCGCCGAGA
TGAAATCAAGCCACTGATGTCATTCTTGCATATTGAAACCAAGGCTGATTTGGTCGATATATTGGCGAGCCATCCCTATG
AGAATGATTTTATGACGCTATTTGCTAAAGAGAAGTCACGTAAAATCCGTGATCGAGTTGAGGCGGCATTAAGCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AACACCTGTTCTTAAAAGGGTAATAGGCTATTATCCAATCAAAACCTAGCCGTGAAACCACTCTCGGCAGCAATCGATTC
AGCGTTAATAGGACAGAAGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GCAGCTTAAACCAACATCGTGAAGTCAATTAGTTTTAACGGTCACTTCAATGATGTAACTAAAAAGCGCTAGTCCATTTT
TGCTAGCGCTTTTTATCATA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 1198; Mature: 1198

Protein sequence:

>1198_residues
MDAFSQLQVIEFNRHDSASIEQALKAYQAQLEAHQAFDRGGLFNLMFMDNSSGTREHLQLDMLQDQQLAMAALSLNPDGG
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IHESCWDMDDFDHVRDNFHEVMEHLAKDLLQDNDEDMSEAAINGFISRVNARADTHCNDTEQASANTQPASQVRDAQTML
RFVDIFYRFFGQQAFNDEMCDLFTGESEYQAIISVEQYYARFMPTDATPKLGSDVSRTEQKALESLLDEFIDMGYNQISA
EMLKQTDELFANRACLDCQDWPEDELGIDALCAYLLLQDKQQNHNDDYTQALRAKLNGVFERALNLMLENANILGDGPFT
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LSQYLWLLDDERCGRLVELLANHSYAAYKVFTDGLVDSYMDQLALQGKMDLATRLACNEDAYEAAANQVLLDWLFSRNVK
REYLLLYMIKNYHPCMGDYIAAMARRDEIKPLMSFLHIETKADLVDILASHPYENDFMTLFAKEKSRKIRDRVEAALS

Sequences:

>Translated_1198_residues
MDAFSQLQVIEFNRHDSASIEQALKAYQAQLEAHQAFDRGGLFNLMFMDNSSGTREHLQLDMLQDQQLAMAALSLNPDGG
HLSSYVVSDERLLYLSETLLFALALEHESLTPQLRKTAQAMVNYARFENDTSEMWLDETRVFGAEPLYMMAAKDANDATY
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EMLKQTDELFANRACLDCQDWPEDELGIDALCAYLLLQDKQQNHNDDYTQALRAKLNGVFERALNLMLENANILGDGPFT
EKGLNDVEQAQIKAYFTDTDPELNQQQMIALLNQHLFSQDICRQAFLYFPKISPVQKSYSFLDDHDDDYQRVVLICLWLK
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REYLLLYMIKNYHPCMGDYIAAMARRDEIKPLMSFLHIETKADLVDILASHPYENDFMTLFAKEKSRKIRDRVEAALS
>Mature_1198_residues
MDAFSQLQVIEFNRHDSASIEQALKAYQAQLEAHQAFDRGGLFNLMFMDNSSGTREHLQLDMLQDQQLAMAALSLNPDGG
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ELVKQRFHAQPALVYSQHDSLEEQKPILNLYITLIAECCGLDSEGMSAELAEHFIHDSLENEAMDLQNLLKHELNGKLSC
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EKGLNDVEQAQIKAYFTDTDPELNQQQMIALLNQHLFSQDICRQAFLYFPKISPVQKSYSFLDDHDDDYQRVVLICLWLK
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GDYLNLVELIGELVDEDSAIIDQSMLAAARRSDAKALLRGLDYSYQPIKLDFHKHVAMRFPSMPFALDNELKQCLSDFIK
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REGNLYLGGEVLILNDKVDAQSVIDAVKNLPSPEERRNEINQNLWAYLQGELDYAEFAPQFNQYVSYETTANLKEYRSHA
LSQYLWLLDDERCGRLVELLANHSYAAYKVFTDGLVDSYMDQLALQGKMDLATRLACNEDAYEAAANQVLLDWLFSRNVK
REYLLLYMIKNYHPCMGDYIAAMARRDEIKPLMSFLHIETKADLVDILASHPYENDFMTLFAKEKSRKIRDRVEAALS

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 137675; Mature: 137675

Theoretical pI: Translated: 4.45; Mature: 4.45

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.8 %Cys     (Translated Protein)
3.3 %Met     (Translated Protein)
5.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.8 %Cys     (Mature Protein)
3.3 %Met     (Mature Protein)
5.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDAFSQLQVIEFNRHDSASIEQALKAYQAQLEAHQAFDRGGLFNLMFMDNSSGTREHLQL
CCCHHCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHH
DMLQDQQLAMAALSLNPDGGHLSSYVVSDERLLYLSETLLFALALEHESLTPQLRKTAQA
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MVNYARFENDTSEMWLDETRVFGAEPLYMMAAKDANDATYLAQFFIPYWDGDHAVGYGDM
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LLSLLRKHGWCEAMMNAFIWCDNHSFRFAFYGSDWEQPAPRYQPLGDYLKANPDKYPRFI
HHHHHHHCCHHHHHHHHEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCHHHH
ELVKQRFHAQPALVYSQHDSLEEQKPILNLYITLIAECCGLDSEGMSAELAEHFIHDSLE
HHHHHHHCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
NEAMDLQNLLKHELNGKLSCYAGSIAQQRKQRIERAERKEARDKYLGGLKMVSEFMLSLE
HHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
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CCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
VMEHLAKDLLQDNDEDMSEAAINGFISRVNARADTHCNDTEQASANTQPASQVRDAQTML
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH
RFVDIFYRFFGQQAFNDEMCDLFTGESEYQAIISVEQYYARFMPTDATPKLGSDVSRTEQ
HHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHH
KALESLLDEFIDMGYNQISAEMLKQTDELFANRACLDCQDWPEDELGIDALCAYLLLQDK
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QQNHNDDYTQALRAKLNGVFERALNLMLENANILGDGPFTEKGLNDVEQAQIKAYFTDTD
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CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
QLDIPEAINAERIWQLLITMAPIRVVHVIAKAFSEHSRKFKCDSPLDEINFFDMLNSHGI
HCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCC
DKAFTLTYQVEQFSTSTSRTGDYLNLVELIGELVDEDSAIIDQSMLAAARRSDAKALLRG
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CCCCCCCEEEEHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHC
SGFVTDAGELPKKLRLPLTLHPNADLSQTRRNDRMDWICCEILLQVGDELQVLVADKDTV
CCCCCCHHHCCHHHCCCEEECCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCC
REGNLYLGGEVLILNDKVDAQSVIDAVKNLPSPEERRNEINQNLWAYLQGELDYAEFAPQ
CCCCEEECCEEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCHH
FNQYVSYETTANLKEYRSHALSQYLWLLDDERCGRLVELLANHSYAAYKVFTDGLVDSYM
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HHHHHCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH
AAMARRDEIKPLMSFLHIETKADLVDILASHPYENDFMTLFAKEKSRKIRDRVEAALS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
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CCCHHCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHH
DMLQDQQLAMAALSLNPDGGHLSSYVVSDERLLYLSETLLFALALEHESLTPQLRKTAQA
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MVNYARFENDTSEMWLDETRVFGAEPLYMMAAKDANDATYLAQFFIPYWDGDHAVGYGDM
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHH
LLSLLRKHGWCEAMMNAFIWCDNHSFRFAFYGSDWEQPAPRYQPLGDYLKANPDKYPRFI
HHHHHHHCCHHHHHHHHEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCHHHH
ELVKQRFHAQPALVYSQHDSLEEQKPILNLYITLIAECCGLDSEGMSAELAEHFIHDSLE
HHHHHHHCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
NEAMDLQNLLKHELNGKLSCYAGSIAQQRKQRIERAERKEARDKYLGGLKMVSEFMLSLE
HHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
NSHALLSYISTGENPEILDDIECFNIIPHSEKHALTFFEAIHESCWDMDDFDHVRDNFHE
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VMEHLAKDLLQDNDEDMSEAAINGFISRVNARADTHCNDTEQASANTQPASQVRDAQTML
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RFVDIFYRFFGQQAFNDEMCDLFTGESEYQAIISVEQYYARFMPTDATPKLGSDVSRTEQ
HHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHH
KALESLLDEFIDMGYNQISAEMLKQTDELFANRACLDCQDWPEDELGIDALCAYLLLQDK
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
QQNHNDDYTQALRAKLNGVFERALNLMLENANILGDGPFTEKGLNDVEQAQIKAYFTDTD
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCCCCCCCHHHHHHEEEEECCCC
PELNQQQMIALLNQHLFSQDICRQAFLYFPKISPVQKSYSFLDDHDDDYQRVVLICLWLK
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
QLDIPEAINAERIWQLLITMAPIRVVHVIAKAFSEHSRKFKCDSPLDEINFFDMLNSHGI
HCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCC
DKAFTLTYQVEQFSTSTSRTGDYLNLVELIGELVDEDSAIIDQSMLAAARRSDAKALLRG
CCEEEEEEEHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LDYSYQPIKLDFHKHVAMRFPSMPFALDNELKQCLSDFIKLNHNSWEEVIESKFTDYVSF
CCCCCCCEEEEHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHC
SGFVTDAGELPKKLRLPLTLHPNADLSQTRRNDRMDWICCEILLQVGDELQVLVADKDTV
CCCCCCHHHCCHHHCCCEEECCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCC
REGNLYLGGEVLILNDKVDAQSVIDAVKNLPSPEERRNEINQNLWAYLQGELDYAEFAPQ
CCCCEEECCEEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCHH
FNQYVSYETTANLKEYRSHALSQYLWLLDDERCGRLVELLANHSYAAYKVFTDGLVDSYM
HHHHCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
DQLALQGKMDLATRLACNEDAYEAAANQVLLDWLFSRNVKREYLLLYMIKNYHPCMGDYI
HHHHHCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH
AAMARRDEIKPLMSFLHIETKADLVDILASHPYENDFMTLFAKEKSRKIRDRVEAALS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA