Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 157962791

Identifier: 157962791

GI number: 157962791

Start: 3641580

End: 3643751

Strand: Direct

Name: 157962791

Synonym: Spea_2973

Alternate gene names: NA

Gene position: 3641580-3643751 (Clockwise)

Preceding gene: 157962789

Following gene: 157962792

Centisome position: 70.37

GC content: 42.22

Gene sequence:

>2172_bases
ATGCGTATTGTAATTTCCCTAGTATCCTTGATATTTTTATCACTCTCTCCTAGCCATGTTTATGCCGCGTCAAGAGATGA
AGTGTTAACAGAAGTGCAATTAAGAGAAGCGCCGAAAGCGCTTGAACAATCATTAGCGAAAACGCTTCCCGTGCTACCTC
AATTCACTTCTGCTGAGATGTTTACTGCTTTTACCCAACAGCGACGACTGCCAAGCGAGGAGGTAAAACGTGACATCCAA
CTTTCTGCTCGCTTAACAATGGAGCTTTATAACAAAGATAAAGACCGTTATATCGCTGCAAAACGCCTCACGGATCAACT
GGAATATATTAGTCACAGTGCATTCGACAAGAGTTATTTGTTAATGCTTAAAGGACGCTACGCGGGGAAAAGCCAACAAG
ACTACCTCAGCGCAATCGAATACTATCAACAAGCCGTAGCACTGCTTGAGCACTCAAATCTTCAGACTGATCGCGTTCTA
CAGTATACATTGCAAGAACACCTCAGTGTCATGCACATGATTTTGCGTGAGGAAGTTGTCGCTTTACAGCACTTAAGAAA
ACTGTCGACACTCTCCAAGCAGCTCAATAACGATTATCTGCTCGCCCATGCTGAATCAATATTGGGTAAATATTATTATC
AACAAGATCAACTCGGTAAGTCACTTTCTCATTACACTGAAGCGGTAAAGTACACTAGAACGGGGAAAAACGCTTCTCAA
AATGCCCATATAGAGCTTCAACTTGCCAGGGTCTATCGAGATATCGAGTCTTGGGATGAGGCACTAAAAGCGGCTCATAA
TGCCGCCGATGCTTTTAGTCAGCTTGGTAACGACAATTATTTGTCCTCTTCGATGACGGTCATAGCCATGATTTATGCCC
GCCAAGGGCAATGGTACAAGTCGATTGATTACCATTTGAATGCACAACAAATTGAATCAAGGCTAGGTAACTATATTGGC
TTAGCGCTTAACCTGCATAATCTAGGCGAAGCCTACTTCAAAGTTGGTGACTCCCAAAGTTCACTGGCTAACTTAGAGCG
AGCCAACGAAATTTTCACATCCAAGAAGAGTGACCACTATTTAGTTTATAACGACCTACTCATCGCCGAAGTGACTGCGA
GTACTAACGACTGGACTAAATCACTCGATTACGCCACAAAAGCGGTTGCTATTGCCGAGTCTAAACAGCTAAATGAAGAG
TTAAAAGAAGCATTAACAAGGCAAACCTATGCCTTCGAAAAGCTTGGCCGCTATGAAGATGCCTTCAACAGCCTTCAGAG
GCTAAATAAATTGAATAACCAGACTAAGCCGCAATCGATAGGAATAGAGCAGCAGTCACAAGTCATCGAGCAAAAACTTA
AGCTCAATTTAAGTCAGAGTAAAAATGAATTACAGGCAAAAATTGAGCAGCTTAATATCAGCCGATTAGTCAGCATATTC
TGTATATTTGCCCTATGCTTGGCCCTGTTGTTTTTAATTAAGCAATGGCGCCTCAAGAGTAAACTCGTCGCTGTAAATTC
AAACCTAAGTAAGGCTCAGCTGCTGGAACCTTTCACTGGCCTTCCAAACTATTTGGCCTTCAAACTGGATTTTGAGCGGC
AGAATAAACCAACAAAAACATTGGTATTGGTTTCACTCTCTGAACAGCTTGATTTTGATCTAGTTCAGGGATTTCAATGC
AATTCTGATATGAATACTCAGCAAGTATTAGCGATCAAGAATGCATTAAACTGCCAAGCGTACATTATCCGCCCGGGGGT
ATTCTTAATCAGTTTTGACTCACTCATAGACCCTAATGACCTACTCACAATGCTAACGGATGTTATTGGTGAGCATCATG
GGGAGACAAGCCTTCATATGGGAATATTACACCTGCCATTATTAGGGGATTCTGCCATCAAATTATCGGCCGCTCAGCAT
TTCGGCAGCTTGCAGATGTTGTTATCCGCCGCGAGAACATTAGGTAGCGAGCAAGACTACTTTGTCACAATGAAGGCTCT
TAAGTTTGCTTCGGCTGGAATATTCAATAAGCCCCTTTACCTTAACATCGAAAAGAGTATCGTTCGCGGCATAATGAAGG
TCGAAACCAATGGCAATAAAGAAGATATCATTTGGCCAAGATGGAAGAGCCATCAAAACATCGATATCGATGAAGATAAA
ATCGCCATATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAATTGAGCAAAAAAAATATAACACAAGACTCAACCAAGCCAAAGAATAACAAAAATCAGGCGCTTAATTTAACATTTAG
ACGCAAGGAGTGGCCTTTTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GCAGTTAAATCTCAGCTTATGCCGATGTTGATTTCTCTATTTTGAAGACTACTGATAAGATAAGTGATTAAATTTAAGCT
TCATTTTTAAATTGCGCAAT

Product: tetratricopeptide domain-containing protein

Products: NA

Alternate protein names: TPR Domain-Containing Protein; Tetratricopeptide Domain-Containing Protein; Tetratricopeptide TPR2 Protein

Number of amino acids: Translated: 723; Mature: 723

Protein sequence:

>723_residues
MRIVISLVSLIFLSLSPSHVYAASRDEVLTEVQLREAPKALEQSLAKTLPVLPQFTSAEMFTAFTQQRRLPSEEVKRDIQ
LSARLTMELYNKDKDRYIAAKRLTDQLEYISHSAFDKSYLLMLKGRYAGKSQQDYLSAIEYYQQAVALLEHSNLQTDRVL
QYTLQEHLSVMHMILREEVVALQHLRKLSTLSKQLNNDYLLAHAESILGKYYYQQDQLGKSLSHYTEAVKYTRTGKNASQ
NAHIELQLARVYRDIESWDEALKAAHNAADAFSQLGNDNYLSSSMTVIAMIYARQGQWYKSIDYHLNAQQIESRLGNYIG
LALNLHNLGEAYFKVGDSQSSLANLERANEIFTSKKSDHYLVYNDLLIAEVTASTNDWTKSLDYATKAVAIAESKQLNEE
LKEALTRQTYAFEKLGRYEDAFNSLQRLNKLNNQTKPQSIGIEQQSQVIEQKLKLNLSQSKNELQAKIEQLNISRLVSIF
CIFALCLALLFLIKQWRLKSKLVAVNSNLSKAQLLEPFTGLPNYLAFKLDFERQNKPTKTLVLVSLSEQLDFDLVQGFQC
NSDMNTQQVLAIKNALNCQAYIIRPGVFLISFDSLIDPNDLLTMLTDVIGEHHGETSLHMGILHLPLLGDSAIKLSAAQH
FGSLQMLLSAARTLGSEQDYFVTMKALKFASAGIFNKPLYLNIEKSIVRGIMKVETNGNKEDIIWPRWKSHQNIDIDEDK
IAI

Sequences:

>Translated_723_residues
MRIVISLVSLIFLSLSPSHVYAASRDEVLTEVQLREAPKALEQSLAKTLPVLPQFTSAEMFTAFTQQRRLPSEEVKRDIQ
LSARLTMELYNKDKDRYIAAKRLTDQLEYISHSAFDKSYLLMLKGRYAGKSQQDYLSAIEYYQQAVALLEHSNLQTDRVL
QYTLQEHLSVMHMILREEVVALQHLRKLSTLSKQLNNDYLLAHAESILGKYYYQQDQLGKSLSHYTEAVKYTRTGKNASQ
NAHIELQLARVYRDIESWDEALKAAHNAADAFSQLGNDNYLSSSMTVIAMIYARQGQWYKSIDYHLNAQQIESRLGNYIG
LALNLHNLGEAYFKVGDSQSSLANLERANEIFTSKKSDHYLVYNDLLIAEVTASTNDWTKSLDYATKAVAIAESKQLNEE
LKEALTRQTYAFEKLGRYEDAFNSLQRLNKLNNQTKPQSIGIEQQSQVIEQKLKLNLSQSKNELQAKIEQLNISRLVSIF
CIFALCLALLFLIKQWRLKSKLVAVNSNLSKAQLLEPFTGLPNYLAFKLDFERQNKPTKTLVLVSLSEQLDFDLVQGFQC
NSDMNTQQVLAIKNALNCQAYIIRPGVFLISFDSLIDPNDLLTMLTDVIGEHHGETSLHMGILHLPLLGDSAIKLSAAQH
FGSLQMLLSAARTLGSEQDYFVTMKALKFASAGIFNKPLYLNIEKSIVRGIMKVETNGNKEDIIWPRWKSHQNIDIDEDK
IAI
>Mature_723_residues
MRIVISLVSLIFLSLSPSHVYAASRDEVLTEVQLREAPKALEQSLAKTLPVLPQFTSAEMFTAFTQQRRLPSEEVKRDIQ
LSARLTMELYNKDKDRYIAAKRLTDQLEYISHSAFDKSYLLMLKGRYAGKSQQDYLSAIEYYQQAVALLEHSNLQTDRVL
QYTLQEHLSVMHMILREEVVALQHLRKLSTLSKQLNNDYLLAHAESILGKYYYQQDQLGKSLSHYTEAVKYTRTGKNASQ
NAHIELQLARVYRDIESWDEALKAAHNAADAFSQLGNDNYLSSSMTVIAMIYARQGQWYKSIDYHLNAQQIESRLGNYIG
LALNLHNLGEAYFKVGDSQSSLANLERANEIFTSKKSDHYLVYNDLLIAEVTASTNDWTKSLDYATKAVAIAESKQLNEE
LKEALTRQTYAFEKLGRYEDAFNSLQRLNKLNNQTKPQSIGIEQQSQVIEQKLKLNLSQSKNELQAKIEQLNISRLVSIF
CIFALCLALLFLIKQWRLKSKLVAVNSNLSKAQLLEPFTGLPNYLAFKLDFERQNKPTKTLVLVSLSEQLDFDLVQGFQC
NSDMNTQQVLAIKNALNCQAYIIRPGVFLISFDSLIDPNDLLTMLTDVIGEHHGETSLHMGILHLPLLGDSAIKLSAAQH
FGSLQMLLSAARTLGSEQDYFVTMKALKFASAGIFNKPLYLNIEKSIVRGIMKVETNGNKEDIIWPRWKSHQNIDIDEDK
IAI

Specific function: Unknown

COG id: COG0457

COG function: function code R; FOG: TPR repeat

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 82222; Mature: 82222

Theoretical pI: Translated: 7.35; Mature: 7.35

Prosite motif: PS50293 TPR_REGION

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
2.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
2.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRIVISLVSLIFLSLSPSHVYAASRDEVLTEVQLREAPKALEQSLAKTLPVLPQFTSAEM
CHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHH
FTAFTQQRRLPSEEVKRDIQLSARLTMELYNKDKDRYIAAKRLTDQLEYISHSAFDKSYL
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEE
LMLKGRYAGKSQQDYLSAIEYYQQAVALLEHSNLQTDRVLQYTLQEHLSVMHMILREEVV
EEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALQHLRKLSTLSKQLNNDYLLAHAESILGKYYYQQDQLGKSLSHYTEAVKYTRTGKNASQ
HHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
NAHIELQLARVYRDIESWDEALKAAHNAADAFSQLGNDNYLSSSMTVIAMIYARQGQWYK
CCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEE
SIDYHLNAQQIESRLGNYIGLALNLHNLGEAYFKVGDSQSSLANLERANEIFTSKKSDHY
HHCCCCCHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCE
LVYNDLLIAEVTASTNDWTKSLDYATKAVAIAESKQLNEELKEALTRQTYAFEKLGRYED
EEEECEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFNSLQRLNKLNNQTKPQSIGIEQQSQVIEQKLKLNLSQSKNELQAKIEQLNISRLVSIF
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CIFALCLALLFLIKQWRLKSKLVAVNSNLSKAQLLEPFTGLPNYLAFKLDFERQNKPTKT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCEE
LVLVSLSEQLDFDLVQGFQCNSDMNTQQVLAIKNALNCQAYIIRPGVFLISFDSLIDPND
EEEEEECHHCCHHHHCCEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCEEEEEECCCCCHHH
LLTMLTDVIGEHHGETSLHMGILHLPLLGDSAIKLSAAQHFGSLQMLLSAARTLGSEQDY
HHHHHHHHHHCCCCCCHHEEHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
FVTMKALKFASAGIFNKPLYLNIEKSIVRGIMKVETNGNKEDIIWPRWKSHQNIDIDEDK
EEHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCCCC
IAI
CCC
>Mature Secondary Structure
MRIVISLVSLIFLSLSPSHVYAASRDEVLTEVQLREAPKALEQSLAKTLPVLPQFTSAEM
CHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHH
FTAFTQQRRLPSEEVKRDIQLSARLTMELYNKDKDRYIAAKRLTDQLEYISHSAFDKSYL
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEE
LMLKGRYAGKSQQDYLSAIEYYQQAVALLEHSNLQTDRVLQYTLQEHLSVMHMILREEVV
EEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALQHLRKLSTLSKQLNNDYLLAHAESILGKYYYQQDQLGKSLSHYTEAVKYTRTGKNASQ
HHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
NAHIELQLARVYRDIESWDEALKAAHNAADAFSQLGNDNYLSSSMTVIAMIYARQGQWYK
CCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEE
SIDYHLNAQQIESRLGNYIGLALNLHNLGEAYFKVGDSQSSLANLERANEIFTSKKSDHY
HHCCCCCHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCE
LVYNDLLIAEVTASTNDWTKSLDYATKAVAIAESKQLNEELKEALTRQTYAFEKLGRYED
EEEECEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFNSLQRLNKLNNQTKPQSIGIEQQSQVIEQKLKLNLSQSKNELQAKIEQLNISRLVSIF
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CIFALCLALLFLIKQWRLKSKLVAVNSNLSKAQLLEPFTGLPNYLAFKLDFERQNKPTKT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCEE
LVLVSLSEQLDFDLVQGFQCNSDMNTQQVLAIKNALNCQAYIIRPGVFLISFDSLIDPND
EEEEEECHHCCHHHHCCEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCEEEEEECCCCCHHH
LLTMLTDVIGEHHGETSLHMGILHLPLLGDSAIKLSAAQHFGSLQMLLSAARTLGSEQDY
HHHHHHHHHHCCCCCCHHEEHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
FVTMKALKFASAGIFNKPLYLNIEKSIVRGIMKVETNGNKEDIIWPRWKSHQNIDIDEDK
EEHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCCCC
IAI
CCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA