| Definition | Shewanella pealeana ATCC 700345 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009901 |
| Length | 5,174,581 |
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The map label for this gene is pqqL [C]
Identifier: 157961035
GI number: 157961035
Start: 1468994
End: 1471831
Strand: Direct
Name: pqqL [C]
Synonym: Spea_1207
Alternate gene names: 157961035
Gene position: 1468994-1471831 (Clockwise)
Preceding gene: 157961032
Following gene: 157961036
Centisome position: 28.39
GC content: 46.69
Gene sequence:
>2838_bases TTGAAAAAATGGATATTAGCCGCAGCAGTTAGTGCTGCATTAATGGGTTGCGCAGGACAGCAACAGGCCGAAACCTCTTT ACCTGAAGGGGTGACTCTATTAGAGACGGTAAGTTTCAGCGGCGAGCAAGTTGGGATCCCTTACCGGAAATACCAGCTGG CCAATGGCTTGACGGTGATCTTGCATGAAGATCACTCCGATCCTTTAGTACATGTGGATGTGACTTACCATGTAGGCTCA GGCCGTGAGCTCGAAGGCCGCAGCGGTTTTGCTCACCTATTCGAGCATATGATGTTTCAAGGCTCACAGAACGTCGGTGA TGAGCAGCACTTCAAGATGGTCACCGAGGCGGGGGGCACGTTAAACGGCACGACTAATACCGATCGAACCAACTATTTTG AAACGGTACCTAATAATCAGCTTGAGAAAATGCTCTGGCTAGAGTCGGACCGCATGGGCTTCTTCCTACCGGCATTAACC GAAGAGAAGTTCGAAGTACAGCGTGAGACAGTTAAGAATGAGCGCGCACAACGGGTCGATAACCGCCCTTATGGCCGTAT GGGAGAGCGTTTCAATCAAGCATTCTATCCTCAGGGGCACCCATACTCTTGGCCTGTTATTGGCTGGCCTGAAGACTTAA ACCGTGCCGATGTTGAAGATGTGAAGCATTTCTTCCAGCGTTGGTATGGCCCTAATAACGCCACTCTTACCATAGGCGGC GATTTTGATGAGATGCAAGTCCTGGCGTGGGTGAATAAGTATTTCGGCGAGATCCCATCGGGGCCTAAAGTCGATGCACC GAAAAAAGAATTAGTGACCCTTGATGAGACGCTTTACCTGTCGATGGAAGACAGAGTCCATTTGCCACTGCTTAGAATCG GTATGCCAACGGTTTATGCCCGCCATGAAGATGAAGCGGCACTGGATCTACTCTCTAATATTTTAGGTGGTGGTAAAACA TCACTGTTTTATAAAAATCTCGTTAAAGATGGCTTGGCCGTCCAGGCTGGCGTGAATCACCCATGCCAAGAGCTGGCTTG TCAGTTCTCTATGTATGCATTGGCTAACCCTGCACGAGGCGGTAACTTGGCCGAAGTCGAGCAGGCGATGCGTGACTCGA TTAAAGAGTTTGAAAAGCGTGGCGTGACCGATGACGATCTTGAGAAAGTAAAAGTAAACTTTGAGGCGGGCACCATATTT GGTCTGCAAAGCGTACAAGGCAAGGTTGCAAGCTTAGCCTTCAACGAGACCTTTTCTAATAATCCCAACATGATTGGATT TGATCTGTCTCGTTATGCCAATGTCACTAAAGAAGATGTGATGCGAGTCTTTAATAAGTACATCAAAGATAAGCCTATGG TGGTGATGAGCATTGTGCCTCAAGGACAAACTCAGCTTATTGCTAAGGCTGATAACTTTGTTGCACCTGCAGAAAAAGTC GCTAGCGTTGCGGTAGAGGAGTTAACGCTTACGCCGCAGGTAGTTTCATCATTCGATAGAAGTGTTATCCCTGCGGCGGG TCCAGCTCCTGTGCTGACCATGCCTGAACTTTGGAAAGGGAAACTTGCTAACGATATCGAAGTGATAGGTACGCAAACTA GCGAGACGCCGACGGTTGAGATTGTGGTTTATCTTAATGGCGGTCATCGACTACTCGATGTTAGCCAAGCGGGCCTTGCA GGTATGACTGCGGCGATGATGAATGAGTCGAGCCTAAAGCGTAGCTCTGAAGAGTTAACTCAGGCGTTAGAGATGCTGGG AAGTAACGTAAGCTTTAGTGCCAGTGGCTATCAAAGCCAGCTGAAGATCTCGTCACTTACTGCAAACCTCGATAAGACGA TGGCGATTGTGCAGGAGAAGTTATTTGATCCGGGCTTTAAGCCTGCTGACTTTGAGCGAGTCAAACAGCAAAAACTTCAG CACTTGCAGCGTGAGTTGACCGAGCCAAACTATTTGGCAAACACGGCATTTAGTGGCTTACTTTATGGCGATAAGAGTCC ATTTGGGGTTAGCAGTGGTGGCTCTCTAGAGACTGTCTCGGCAATCACTCTAGATGATGTTAAAGCCTTCTATAAGCAGC AGTACACAGCGGGAAATGCACAAGTTGTGGCTGTGGGTAACCTGAATGAAACGCAAATGTTAGCTAAACTTTCGACTCTT GCAAGTTGGAATGGAGCGGCGACACCATTGCCTGAGCTTGCCGAGTTACCAGAGTTTCAAGGTGGCAAAGTCTTTATTGT AGATAAGCCTGATGCGGCGCAATCGGTTATCAAGATAGGTAAGCGAGCATTACCGTTTGATGCCACAGGCGAGTACTTTG AGTCATACTTGATGAACTATCCGCTAGGTGGTGCGTTCAACAGCCGTATCAACCTTAACCTGCGCGAAGACAAAGGTTAC ACCTATGGGGCGAGGAGTTATTTCTCCGGTGGGCCTGAGCAAGGTTACTATCAAGCAACAGCAAGTGTGCGCAGCGATGT AACCACAAAGGCATTAATCGAGTTCATAAAAGAGATTAATACGTTCCAAGAGTCAGGAATGACAGATAAAGAGCTAGACT TTATGAAAAGCTCTATCTCTCAGTCAAAGGCACTTGATTATGAAACGCCATATCAAAAGGCGGGGTTGATGCGTAATATT CAACGCTATAATTTGGATGATAACTATAGTGAAAAACAAAGCGAAATCACCAATAGTATCGGTCGTAATGAGTTGAATAA ATTGGCTAAAGAGCAGTTGAATATTGATGACATGGTGATCTTAGTTGTAGGGGATCGCGCTAAAATAGAGTCTGAATTAT CAACACTTGGTTATCCAATTGAAATTTTACAGTTGTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTCATGCCTTGAACTCTGTCACTTCTCGACATGCTGAATCCTGCATCTTGAAGTTGTTTGGGTATATAAAATACCGCCTG TTGGAAAAAGGAGAAAGTCA
Downstream 100 bases:
>100_bases AAGACCTCGGTAGGCCATATATCCGAAAGATGGTGCCATGGATATGGCACCATCTCATCGTTTATTAGGCAGGTGGTTGA TAAACGCTAATTTGGTACGA
Product: peptidase M16 domain-containing protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 945; Mature: 945
Protein sequence:
>945_residues MKKWILAAAVSAALMGCAGQQQAETSLPEGVTLLETVSFSGEQVGIPYRKYQLANGLTVILHEDHSDPLVHVDVTYHVGS GRELEGRSGFAHLFEHMMFQGSQNVGDEQHFKMVTEAGGTLNGTTNTDRTNYFETVPNNQLEKMLWLESDRMGFFLPALT EEKFEVQRETVKNERAQRVDNRPYGRMGERFNQAFYPQGHPYSWPVIGWPEDLNRADVEDVKHFFQRWYGPNNATLTIGG DFDEMQVLAWVNKYFGEIPSGPKVDAPKKELVTLDETLYLSMEDRVHLPLLRIGMPTVYARHEDEAALDLLSNILGGGKT SLFYKNLVKDGLAVQAGVNHPCQELACQFSMYALANPARGGNLAEVEQAMRDSIKEFEKRGVTDDDLEKVKVNFEAGTIF GLQSVQGKVASLAFNETFSNNPNMIGFDLSRYANVTKEDVMRVFNKYIKDKPMVVMSIVPQGQTQLIAKADNFVAPAEKV ASVAVEELTLTPQVVSSFDRSVIPAAGPAPVLTMPELWKGKLANDIEVIGTQTSETPTVEIVVYLNGGHRLLDVSQAGLA GMTAAMMNESSLKRSSEELTQALEMLGSNVSFSASGYQSQLKISSLTANLDKTMAIVQEKLFDPGFKPADFERVKQQKLQ HLQRELTEPNYLANTAFSGLLYGDKSPFGVSSGGSLETVSAITLDDVKAFYKQQYTAGNAQVVAVGNLNETQMLAKLSTL ASWNGAATPLPELAELPEFQGGKVFIVDKPDAAQSVIKIGKRALPFDATGEYFESYLMNYPLGGAFNSRINLNLREDKGY TYGARSYFSGGPEQGYYQATASVRSDVTTKALIEFIKEINTFQESGMTDKELDFMKSSISQSKALDYETPYQKAGLMRNI QRYNLDDNYSEKQSEITNSIGRNELNKLAKEQLNIDDMVILVVGDRAKIESELSTLGYPIEILQL
Sequences:
>Translated_945_residues MKKWILAAAVSAALMGCAGQQQAETSLPEGVTLLETVSFSGEQVGIPYRKYQLANGLTVILHEDHSDPLVHVDVTYHVGS GRELEGRSGFAHLFEHMMFQGSQNVGDEQHFKMVTEAGGTLNGTTNTDRTNYFETVPNNQLEKMLWLESDRMGFFLPALT EEKFEVQRETVKNERAQRVDNRPYGRMGERFNQAFYPQGHPYSWPVIGWPEDLNRADVEDVKHFFQRWYGPNNATLTIGG DFDEMQVLAWVNKYFGEIPSGPKVDAPKKELVTLDETLYLSMEDRVHLPLLRIGMPTVYARHEDEAALDLLSNILGGGKT SLFYKNLVKDGLAVQAGVNHPCQELACQFSMYALANPARGGNLAEVEQAMRDSIKEFEKRGVTDDDLEKVKVNFEAGTIF GLQSVQGKVASLAFNETFSNNPNMIGFDLSRYANVTKEDVMRVFNKYIKDKPMVVMSIVPQGQTQLIAKADNFVAPAEKV ASVAVEELTLTPQVVSSFDRSVIPAAGPAPVLTMPELWKGKLANDIEVIGTQTSETPTVEIVVYLNGGHRLLDVSQAGLA GMTAAMMNESSLKRSSEELTQALEMLGSNVSFSASGYQSQLKISSLTANLDKTMAIVQEKLFDPGFKPADFERVKQQKLQ HLQRELTEPNYLANTAFSGLLYGDKSPFGVSSGGSLETVSAITLDDVKAFYKQQYTAGNAQVVAVGNLNETQMLAKLSTL ASWNGAATPLPELAELPEFQGGKVFIVDKPDAAQSVIKIGKRALPFDATGEYFESYLMNYPLGGAFNSRINLNLREDKGY TYGARSYFSGGPEQGYYQATASVRSDVTTKALIEFIKEINTFQESGMTDKELDFMKSSISQSKALDYETPYQKAGLMRNI QRYNLDDNYSEKQSEITNSIGRNELNKLAKEQLNIDDMVILVVGDRAKIESELSTLGYPIEILQL >Mature_945_residues MKKWILAAAVSAALMGCAGQQQAETSLPEGVTLLETVSFSGEQVGIPYRKYQLANGLTVILHEDHSDPLVHVDVTYHVGS GRELEGRSGFAHLFEHMMFQGSQNVGDEQHFKMVTEAGGTLNGTTNTDRTNYFETVPNNQLEKMLWLESDRMGFFLPALT EEKFEVQRETVKNERAQRVDNRPYGRMGERFNQAFYPQGHPYSWPVIGWPEDLNRADVEDVKHFFQRWYGPNNATLTIGG DFDEMQVLAWVNKYFGEIPSGPKVDAPKKELVTLDETLYLSMEDRVHLPLLRIGMPTVYARHEDEAALDLLSNILGGGKT SLFYKNLVKDGLAVQAGVNHPCQELACQFSMYALANPARGGNLAEVEQAMRDSIKEFEKRGVTDDDLEKVKVNFEAGTIF GLQSVQGKVASLAFNETFSNNPNMIGFDLSRYANVTKEDVMRVFNKYIKDKPMVVMSIVPQGQTQLIAKADNFVAPAEKV ASVAVEELTLTPQVVSSFDRSVIPAAGPAPVLTMPELWKGKLANDIEVIGTQTSETPTVEIVVYLNGGHRLLDVSQAGLA GMTAAMMNESSLKRSSEELTQALEMLGSNVSFSASGYQSQLKISSLTANLDKTMAIVQEKLFDPGFKPADFERVKQQKLQ HLQRELTEPNYLANTAFSGLLYGDKSPFGVSSGGSLETVSAITLDDVKAFYKQQYTAGNAQVVAVGNLNETQMLAKLSTL ASWNGAATPLPELAELPEFQGGKVFIVDKPDAAQSVIKIGKRALPFDATGEYFESYLMNYPLGGAFNSRINLNLREDKGY TYGARSYFSGGPEQGYYQATASVRSDVTTKALIEFIKEINTFQESGMTDKELDFMKSSISQSKALDYETPYQKAGLMRNI QRYNLDDNYSEKQSEITNSIGRNELNKLAKEQLNIDDMVILVVGDRAKIESELSTLGYPIEILQL
Specific function: Unknown
COG id: COG0612
COG function: function code R; Predicted Zn-dependent peptidases
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Single-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the peptidase M16 family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1787770, Length=892, Percent_Identity=20.8520179372197, Blast_Score=77, Evalue=5e-15, Organism=Caenorhabditis elegans, GI72001443, Length=269, Percent_Identity=27.8810408921933, Blast_Score=69, Evalue=1e-11, Organism=Caenorhabditis elegans, GI115533970, Length=267, Percent_Identity=29.2134831460674, Blast_Score=67, Evalue=5e-11,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR011249 - InterPro: IPR011237 - InterPro: IPR011765 - InterPro: IPR001431 - InterPro: IPR007863 [H]
Pfam domain/function: PF00675 Peptidase_M16; PF05193 Peptidase_M16_C [H]
EC number: 3.4.99.- [C]
Molecular weight: Translated: 104654; Mature: 104654
Theoretical pI: Translated: 4.78; Mature: 4.78
Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 3.1 %Met (Translated Protein) 3.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 3.1 %Met (Mature Protein) 3.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKKWILAAAVSAALMGCAGQQQAETSLPEGVTLLETVSFSGEQVGIPYRKYQLANGLTVI CCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCHHHEECCCCEEEE LHEDHSDPLVHVDVTYHVGSGRELEGRSGFAHLFEHMMFQGSQNVGDEQHFKMVTEAGGT EECCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCC LNGTTNTDRTNYFETVPNNQLEKMLWLESDRMGFFLPALTEEKFEVQRETVKNERAQRVD CCCCCCCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC NRPYGRMGERFNQAFYPQGHPYSWPVIGWPEDLNRADVEDVKHFFQRWYGPNNATLTIGG CCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECC DFDEMQVLAWVNKYFGEIPSGPKVDAPKKELVTLDETLYLSMEDRVHLPLLRIGMPTVYA CHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHEEECCEEEEEECCCCCCCHHHHCCCEEEE RHEDEAALDLLSNILGGGKTSLFYKNLVKDGLAVQAGVNHPCQELACQFSMYALANPARG CCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCC GNLAEVEQAMRDSIKEFEKRGVTDDDLEKVKVNFEAGTIFGLQSVQGKVASLAFNETFSN CCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCEEEEHHHHCCHHHHEEECCCCCC NPNMIGFDLSRYANVTKEDVMRVFNKYIKDKPMVVMSIVPQGQTQLIAKADNFVAPAEKV CCCEEEEEHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCEEEECCCCCCCCHHHH ASVAVEELTLTPQVVSSFDRSVIPAAGPAPVLTMPELWKGKLANDIEVIGTQTSETPTVE HHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCEEEEECCCCCCCEEE IVVYLNGGHRLLDVSQAGLAGMTAAMMNESSLKRSSEELTQALEMLGSNVSFSASGYQSQ EEEEECCCCEEEEEHHCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCHHH LKISSLTANLDKTMAIVQEKLFDPGFKPADFERVKQQKLQHLQRELTEPNYLANTAFSGL EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHE LYGDKSPFGVSSGGSLETVSAITLDDVKAFYKQQYTAGNAQVVAVGNLNETQMLAKLSTL EECCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHH ASWNGAATPLPELAELPEFQGGKVFIVDKPDAAQSVIKIGKRALPFDATGEYFESYLMNY HCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHC PLGGAFNSRINLNLREDKGYTYGARSYFSGGPEQGYYQATASVRSDVTTKALIEFIKEIN CCCCCCCCEEEEEEECCCCCEECCHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TFQESGMTDKELDFMKSSISQSKALDYETPYQKAGLMRNIQRYNLDDNYSEKQSEITNSI HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH GRNELNKLAKEQLNIDDMVILVVGDRAKIESELSTLGYPIEILQL CHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEC >Mature Secondary Structure MKKWILAAAVSAALMGCAGQQQAETSLPEGVTLLETVSFSGEQVGIPYRKYQLANGLTVI CCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCHHHEECCCCEEEE LHEDHSDPLVHVDVTYHVGSGRELEGRSGFAHLFEHMMFQGSQNVGDEQHFKMVTEAGGT EECCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCC LNGTTNTDRTNYFETVPNNQLEKMLWLESDRMGFFLPALTEEKFEVQRETVKNERAQRVD CCCCCCCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC NRPYGRMGERFNQAFYPQGHPYSWPVIGWPEDLNRADVEDVKHFFQRWYGPNNATLTIGG CCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECC DFDEMQVLAWVNKYFGEIPSGPKVDAPKKELVTLDETLYLSMEDRVHLPLLRIGMPTVYA CHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHEEECCEEEEEECCCCCCCHHHHCCCEEEE RHEDEAALDLLSNILGGGKTSLFYKNLVKDGLAVQAGVNHPCQELACQFSMYALANPARG CCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCC GNLAEVEQAMRDSIKEFEKRGVTDDDLEKVKVNFEAGTIFGLQSVQGKVASLAFNETFSN CCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCEEEEHHHHCCHHHHEEECCCCCC NPNMIGFDLSRYANVTKEDVMRVFNKYIKDKPMVVMSIVPQGQTQLIAKADNFVAPAEKV CCCEEEEEHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCEEEECCCCCCCCHHHH ASVAVEELTLTPQVVSSFDRSVIPAAGPAPVLTMPELWKGKLANDIEVIGTQTSETPTVE HHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCEEEEECCCCCCCEEE IVVYLNGGHRLLDVSQAGLAGMTAAMMNESSLKRSSEELTQALEMLGSNVSFSASGYQSQ EEEEECCCCEEEEEHHCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCHHH LKISSLTANLDKTMAIVQEKLFDPGFKPADFERVKQQKLQHLQRELTEPNYLANTAFSGL EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHE LYGDKSPFGVSSGGSLETVSAITLDDVKAFYKQQYTAGNAQVVAVGNLNETQMLAKLSTL EECCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHH ASWNGAATPLPELAELPEFQGGKVFIVDKPDAAQSVIKIGKRALPFDATGEYFESYLMNY HCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHC PLGGAFNSRINLNLREDKGYTYGARSYFSGGPEQGYYQATASVRSDVTTKALIEFIKEIN CCCCCCCCEEEEEEECCCCCEECCHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TFQESGMTDKELDFMKSSISQSKALDYETPYQKAGLMRNIQRYNLDDNYSEKQSEITNSI HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH GRNELNKLAKEQLNIDDMVILVVGDRAKIESELSTLGYPIEILQL CHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: Zn [C]
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: Hydrolase; Acting on peptide bonds (Peptidases); Endopeptidases of unknown catalytic mechanism [C]
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9163424 [H]