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The map label for this gene is 126698543

Identifier: 126698543

GI number: 126698543

Start: 1127194

End: 1129545

Strand: Direct

Name: 126698543

Synonym: CD0959

Alternate gene names: NA

Gene position: 1127194-1129545 (Clockwise)

Preceding gene: 126698542

Following gene: 126698544

Centisome position: 26.27

GC content: 34.35

Gene sequence:

>2352_bases
ATGGCTACAATACAAACATCTATCCGTATTTTTGACGGAATGACACCTGCTTTTCGTAATATGACTACATCTATTAACAC
AACAATTAATAGTTTGGAGAGATTACAAGGTAGATTGAATAATCCACTCAATACAGGTGGAATACAGACATCTCAACAAA
GTTTGAATAACATAGAAAGCATTCTTACTAGAATAGAACAAAGCATAGGAAAAGCAGATGAACAACAAAGAAAGTTTAAT
GATGATATCAATAAAGGAGCAAGTAATACAGATAGATTATTAGGAAGTGTTAAAAAGGTTGTTGGGACTTATATGGGATT
AAAGACGATAGGAGGATTAGCAAATTTAAGTGACCAAATGACGAGTACAAATGCCCGTTTAAACATGATAAATGATGGTC
AACTTTCTGACGGAGGATTGAATAAAATGATTTTCCAGTCGGCTGAAAGGTCAAGAGCATCCTATCTAGACACAGCACAG
ATAGTAAGCCGTATAGGTATGAATGCAGGGAGTGCATTTAGTAGTACTAGAGAAATAGTAAGCTTTGCAGAGCAGCTCAA
CAAAAAATTTGTAATAGCAGGTGCAAGTACTGAGGAAATGAACTCGGCACTTTTACAGTTGACTCAAGGATTAGGAAGTG
GAGTTTTGCGTGGGGAAGAATTAAATGCTGTATTTGAGTCAGCACCTAATATCATCAAAAGTATTGCGGATTATTTAGAT
GTGGACATAGGAAAGATTCGAGGAATGGCAAGCGAGGGAATGTTGACAGCAGATATTGTAAAAAATTCTCTGCTTGCAGC
ATCAGCAGAAACAAATGCTCAATTTGAAAAAATGCCACTTACAATAGGTCAAATCTTTACATCAATTAAGAATAACGCAG
TAATGATATTTGGAGCGATACAAAAAAAGATTGAGGATACAGTTTCAAGCGGAGGATTTCGAACCTTCATAGTTAATGTA
ACAGATTCGTTGTATGTCTTGGGAGCTGTTGGATATAGTGTCTTTAATGGGTTTATTGATTTGCTGAGCAGTCCAACATT
TCAAGGTTTTGCAAATATGATGATTGTCGGAATCAGTTTAATTACTCAAGGATTTGGGTGGCTATTAACAGTATTAGGAA
GTGTTATTAATTTTATTTCACAAGGTTGGAGTATAATACAACCTATTTTGATAACGAGCATCGTTTTGTGGGGCTTATAT
AAAACAGCTGTCATAGCAGGTGCTTTAGTTACAGCTATTCAGGTAGTGTGGATAGCTTTACAGACATTTTGGACTAATTT
GCTAAATGGTTCGTTATTAACTAATATAATGATGAATATAGCTGCAAAAATATCAACAGATGCACTAAGTGGTTCAATGT
TACTTTTAATTACCACAATAGTTATGGTTGTAGCAGCAGTAGCCTTAGTAATAGCAGCAATATTTGTAGCAGTAGCAATA
TTTAACCATTTTGCAGGAACAAGCATTTCTGCAACTGGAGTAGTTGTAGGAGCTTTCTATTTTCTAGGAACTTGCATTTA
TGATGTATTCGCAGGAGCGTGGAACATAGTTATGGCATTTGCAGAGTTCTTTGTTAATTCATTTAATATCGTTATCTACA
ATGTGCAGTTATTATTTTATAAATTCCAAAACTTTGTAATAAATGCCATGGGAGATGTAGGAGGAAGTTTTGACAATTGT
GCTACAGCTTTAGCAAATGCTTTTGTAAGTGCTGCTAATATAGCAATAAAAGGTATAAATGGAGTTATAAAAACACTAAA
TTTGATACCAGGCGTTAATATAAAGACATTTGGAAGCTTGGACAAAATAGATTCTTTTGTAAAACAATATAAAGATTACC
AAAAAACGTTAAAAGAGCCTGTAAAGCCTGCTGAATGGAAAGCTCCAACTATGAAATTGAAGAATCCTGTAGATTCATTT
AAAAAAGGGTATGAAGTAGGTCAAAATTTAGAAAATAAAATAAAAGATGCTTTTGACATTAGCAAGATAGCAGAAAAGGC
AAAAAAAGATTTAGGACTAGATGACCTTTGGGATGATAAATATGGATTAGGAGATAGATTTGGTTCAGCGGGACTAAACT
CTCCGCTTAACAATGCAGCAAAAGGAGCAAAAGACACGGCGGGAAATACTGCCAAAATGGCTAAAACAATGGATAAAAGT
CAAGAAGATTTAAAATATCTTAGAGACATTGCAGAGCAAGAAACAATAAACCGATTCACAGGGGTAAATATAAAAATTGA
CATGAACAATACAAATAACATAAGTAAAGATACAGATGTCGACGGCATAGTAAATGTACTAACTGAAAAATTAAATGATG
CTATGGTTGTTTCAGCCGAAGGAATAGTTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGGAAACAGTTTTGGGCAGGCAAAAAATAGATACTAAAAATAAAACACTTACTTAGGTAGGTGTTTTTTATGTGAAAATT
TAAGAAAGGAGAGTGAAGAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGAGGGGGAATATAAATGGCTTATGACTTTTATTTAGATGGAGTACAATTACCAATACCTCCGCCAAAGTTAGAGATTAA
AGTTACAAATAAAAACAAGA

Product: phage tail tape measure protein

Products: NA

Alternate protein names: Tail Length Tape Measure Protein; Phage-Related Minor Tail Protein; Tail Tape Measure Protein; Phage Tail Tape Measure Protein; Tape Measure Domain Protein; Lambda Family Phage Tail Tape Measure Protein; Bacteriophage Tail Tape Meausure Protein; Tail Tape Meausure Protein; Tape Measure Domain-Containing Protein; Tail Component; Bacteriophage-Related Protein; Phage Protein; Bacteriophage-Related Protein Tape Measure Domain; Bacteriophage-Related Transmembrane Protein; Prophage; Bacteriophage Protein; Phage Membrane Protein; Phage Tail Tape Measure Protein Lambda Family

Number of amino acids: Translated: 783; Mature: 782

Protein sequence:

>783_residues
MATIQTSIRIFDGMTPAFRNMTTSINTTINSLERLQGRLNNPLNTGGIQTSQQSLNNIESILTRIEQSIGKADEQQRKFN
DDINKGASNTDRLLGSVKKVVGTYMGLKTIGGLANLSDQMTSTNARLNMINDGQLSDGGLNKMIFQSAERSRASYLDTAQ
IVSRIGMNAGSAFSSTREIVSFAEQLNKKFVIAGASTEEMNSALLQLTQGLGSGVLRGEELNAVFESAPNIIKSIADYLD
VDIGKIRGMASEGMLTADIVKNSLLAASAETNAQFEKMPLTIGQIFTSIKNNAVMIFGAIQKKIEDTVSSGGFRTFIVNV
TDSLYVLGAVGYSVFNGFIDLLSSPTFQGFANMMIVGISLITQGFGWLLTVLGSVINFISQGWSIIQPILITSIVLWGLY
KTAVIAGALVTAIQVVWIALQTFWTNLLNGSLLTNIMMNIAAKISTDALSGSMLLLITTIVMVVAAVALVIAAIFVAVAI
FNHFAGTSISATGVVVGAFYFLGTCIYDVFAGAWNIVMAFAEFFVNSFNIVIYNVQLLFYKFQNFVINAMGDVGGSFDNC
ATALANAFVSAANIAIKGINGVIKTLNLIPGVNIKTFGSLDKIDSFVKQYKDYQKTLKEPVKPAEWKAPTMKLKNPVDSF
KKGYEVGQNLENKIKDAFDISKIAEKAKKDLGLDDLWDDKYGLGDRFGSAGLNSPLNNAAKGAKDTAGNTAKMAKTMDKS
QEDLKYLRDIAEQETINRFTGVNIKIDMNNTNNISKDTDVDGIVNVLTEKLNDAMVVSAEGIV

Sequences:

>Translated_783_residues
MATIQTSIRIFDGMTPAFRNMTTSINTTINSLERLQGRLNNPLNTGGIQTSQQSLNNIESILTRIEQSIGKADEQQRKFN
DDINKGASNTDRLLGSVKKVVGTYMGLKTIGGLANLSDQMTSTNARLNMINDGQLSDGGLNKMIFQSAERSRASYLDTAQ
IVSRIGMNAGSAFSSTREIVSFAEQLNKKFVIAGASTEEMNSALLQLTQGLGSGVLRGEELNAVFESAPNIIKSIADYLD
VDIGKIRGMASEGMLTADIVKNSLLAASAETNAQFEKMPLTIGQIFTSIKNNAVMIFGAIQKKIEDTVSSGGFRTFIVNV
TDSLYVLGAVGYSVFNGFIDLLSSPTFQGFANMMIVGISLITQGFGWLLTVLGSVINFISQGWSIIQPILITSIVLWGLY
KTAVIAGALVTAIQVVWIALQTFWTNLLNGSLLTNIMMNIAAKISTDALSGSMLLLITTIVMVVAAVALVIAAIFVAVAI
FNHFAGTSISATGVVVGAFYFLGTCIYDVFAGAWNIVMAFAEFFVNSFNIVIYNVQLLFYKFQNFVINAMGDVGGSFDNC
ATALANAFVSAANIAIKGINGVIKTLNLIPGVNIKTFGSLDKIDSFVKQYKDYQKTLKEPVKPAEWKAPTMKLKNPVDSF
KKGYEVGQNLENKIKDAFDISKIAEKAKKDLGLDDLWDDKYGLGDRFGSAGLNSPLNNAAKGAKDTAGNTAKMAKTMDKS
QEDLKYLRDIAEQETINRFTGVNIKIDMNNTNNISKDTDVDGIVNVLTEKLNDAMVVSAEGIV
>Mature_782_residues
ATIQTSIRIFDGMTPAFRNMTTSINTTINSLERLQGRLNNPLNTGGIQTSQQSLNNIESILTRIEQSIGKADEQQRKFND
DINKGASNTDRLLGSVKKVVGTYMGLKTIGGLANLSDQMTSTNARLNMINDGQLSDGGLNKMIFQSAERSRASYLDTAQI
VSRIGMNAGSAFSSTREIVSFAEQLNKKFVIAGASTEEMNSALLQLTQGLGSGVLRGEELNAVFESAPNIIKSIADYLDV
DIGKIRGMASEGMLTADIVKNSLLAASAETNAQFEKMPLTIGQIFTSIKNNAVMIFGAIQKKIEDTVSSGGFRTFIVNVT
DSLYVLGAVGYSVFNGFIDLLSSPTFQGFANMMIVGISLITQGFGWLLTVLGSVINFISQGWSIIQPILITSIVLWGLYK
TAVIAGALVTAIQVVWIALQTFWTNLLNGSLLTNIMMNIAAKISTDALSGSMLLLITTIVMVVAAVALVIAAIFVAVAIF
NHFAGTSISATGVVVGAFYFLGTCIYDVFAGAWNIVMAFAEFFVNSFNIVIYNVQLLFYKFQNFVINAMGDVGGSFDNCA
TALANAFVSAANIAIKGINGVIKTLNLIPGVNIKTFGSLDKIDSFVKQYKDYQKTLKEPVKPAEWKAPTMKLKNPVDSFK
KGYEVGQNLENKIKDAFDISKIAEKAKKDLGLDDLWDDKYGLGDRFGSAGLNSPLNNAAKGAKDTAGNTAKMAKTMDKSQ
EDLKYLRDIAEQETINRFTGVNIKIDMNNTNNISKDTDVDGIVNVLTEKLNDAMVVSAEGIV

Specific function: Unknown

COG id: COG5281

COG function: function code S; Phage-related minor tail protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 84506; Mature: 84375

Theoretical pI: Translated: 6.25; Mature: 6.25

Prosite motif: PS00678 WD_REPEATS_1

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
3.3 %Met     (Translated Protein)
3.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
3.2 %Met     (Mature Protein)
3.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MATIQTSIRIFDGMTPAFRNMTTSINTTINSLERLQGRLNNPLNTGGIQTSQQSLNNIES
CCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
ILTRIEQSIGKADEQQRKFNDDINKGASNTDRLLGSVKKVVGTYMGLKTIGGLANLSDQM
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
TSTNARLNMINDGQLSDGGLNKMIFQSAERSRASYLDTAQIVSRIGMNAGSAFSSTREIV
HCCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH
SFAEQLNKKFVIAGASTEEMNSALLQLTQGLGSGVLRGEELNAVFESAPNIIKSIADYLD
HHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
VDIGKIRGMASEGMLTADIVKNSLLAASAETNAQFEKMPLTIGQIFTSIKNNAVMIFGAI
CCHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHH
QKKIEDTVSSGGFRTFIVNVTDSLYVLGAVGYSVFNGFIDLLSSPTFQGFANMMIVGISL
HHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
ITQGFGWLLTVLGSVINFISQGWSIIQPILITSIVLWGLYKTAVIAGALVTAIQVVWIAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QTFWTNLLNGSLLTNIMMNIAAKISTDALSGSMLLLITTIVMVVAAVALVIAAIFVAVAI
HHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FNHFAGTSISATGVVVGAFYFLGTCIYDVFAGAWNIVMAFAEFFVNSFNIVIYNVQLLFY
HHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHH
KFQNFVINAMGDVGGSFDNCATALANAFVSAANIAIKGINGVIKTLNLIPGVNIKTFGSL
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCH
DKIDSFVKQYKDYQKTLKEPVKPAEWKAPTMKLKNPVDSFKKGYEVGQNLENKIKDAFDI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
SKIAEKAKKDLGLDDLWDDKYGLGDRFGSAGLNSPLNNAAKGAKDTAGNTAKMAKTMDKS
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCC
QEDLKYLRDIAEQETINRFTGVNIKIDMNNTNNISKDTDVDGIVNVLTEKLNDAMVVSAE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEECC
GIV
CCC
>Mature Secondary Structure 
ATIQTSIRIFDGMTPAFRNMTTSINTTINSLERLQGRLNNPLNTGGIQTSQQSLNNIES
CCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
ILTRIEQSIGKADEQQRKFNDDINKGASNTDRLLGSVKKVVGTYMGLKTIGGLANLSDQM
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
TSTNARLNMINDGQLSDGGLNKMIFQSAERSRASYLDTAQIVSRIGMNAGSAFSSTREIV
HCCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH
SFAEQLNKKFVIAGASTEEMNSALLQLTQGLGSGVLRGEELNAVFESAPNIIKSIADYLD
HHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
VDIGKIRGMASEGMLTADIVKNSLLAASAETNAQFEKMPLTIGQIFTSIKNNAVMIFGAI
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HHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
ITQGFGWLLTVLGSVINFISQGWSIIQPILITSIVLWGLYKTAVIAGALVTAIQVVWIAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QTFWTNLLNGSLLTNIMMNIAAKISTDALSGSMLLLITTIVMVVAAVALVIAAIFVAVAI
HHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FNHFAGTSISATGVVVGAFYFLGTCIYDVFAGAWNIVMAFAEFFVNSFNIVIYNVQLLFY
HHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHH
KFQNFVINAMGDVGGSFDNCATALANAFVSAANIAIKGINGVIKTLNLIPGVNIKTFGSL
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
SKIAEKAKKDLGLDDLWDDKYGLGDRFGSAGLNSPLNNAAKGAKDTAGNTAKMAKTMDKS
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCC
QEDLKYLRDIAEQETINRFTGVNIKIDMNNTNNISKDTDVDGIVNVLTEKLNDAMVVSAE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEECC
GIV
CCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA