Definition | Shewanella sp. ANA-3 chromosome chromosome 1, complete sequence. |
---|---|
Accession | NC_008577 |
Length | 4,972,204 |
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The map label for this gene is 117919090
Identifier: 117919090
GI number: 117919090
Start: 751959
End: 755630
Strand: Direct
Name: 117919090
Synonym: Shewana3_0638
Alternate gene names: NA
Gene position: 751959-755630 (Clockwise)
Preceding gene: 117919089
Following gene: 117919091
Centisome position: 15.12
GC content: 52.4
Gene sequence:
>3672_bases ATGCCAAGCTTGATTCGTATTGTGCTGATTGATACGCACCTTCCGGGCGTTGTGGAACTCGCCCTCAATGGCCATACCAA TATTTGTGGTACTAACGCCTCGGGTAAAACCACGCTGCAACGTTTAGTGCCGGTATTTTATGGCGAATATCCTAGCCGCG TGGTGCCTTCAACCCGCGATAGTTTCGAGCGTTGGTACTTGCCACACGATTCAAGCTACATCATTTACGAATACCAAAAG GCCGATGGCTTGCTCTATCAAGCCGTGCTGGCATCGGCGGGTGATGGTAAAGGGGTGAACTACCGCTTTATCGGCAAAGG TTTCGAGTTAAGCGATTATATTAAAACCCAAAATGGTGACACCATTTTATGTCACACCATGGCAGAACTCGGCCGAGAAT TAAAACGCCAAGGCGTAGCCACCACTAACTTACTGAATACCCGCGAATACCGCGCGATTATTCAAAACGATCGCACTTTG TTAAGCACGGGCAGTAACCGCAGCGAACTGCGAGCCTATGCGCACCAATTCGCCCTGTGTGAAGGTGAGCATTCACTGCG CCATATCGAAAAACTCGCTAAAGCGGTGCACTCCAAAGAAGGCAAAATGGAAACGGTCAAATCCATGATCGCCGCCATTT TGGAAGAAGACGGGGTGAATCCGCCCAGCTCACGCCTCAATCCGCAACGCGTCGAGGCGTGGATCCGCGAGAGCCAGTTA ATTCAAGGCTTTGAAGTGATCCGCCCCGAGTTTGAAAAGCTCGAGCAGGAATTTAACCAACTGCTCAGCGCTGAGATGCG TCTCTCGAGTCTGTCCCGTGGTTATCGCAATGACGAAACCTTAGAGGCCGACCGTTTAGAGATCCAACAAACTCTGTCTA AGGAGCTGAATTTAAAGCTTCGAATGTTGGATGACGAATGGAAAGAAGTGCGCGATGAGCTTAACCTCGACCTATCCGCC GCCAAGGGTGACGTAGCTAAGTGCGAGTACGAGTTAGATGCCATTGAAGATCAGCACGGCGCCTTTTTAGATGCCAATAT TGAGCAAGCCAAGGCCGACTTGGACATGCTGCCAAACTGGCGCGCGGACATGGAAAACTTAAGCGAGCGCCATAAATTAC AAACCGAAAAACATCAAGATATTGAAGCGGCTTACAATGCCCGCCGCAGCAAAATTGGCGAGCAGTTAAACCGCGAGCTG GAAGGCTTACACGCCGAACAGGACAAACAGCGCGAAGCGCGCGACAAACAGCGTGAAGTGGCAAGAGCCGATCTCGATGC CCTCGAAGCCCAATGGCGAAGCCAAATGGATGCGGGTAAGGCGAGCTTTAGTGAGCAGGAATACCAATTCAAACTCAATG CCGCCGAGCTTAAGTTACGTGTCGATGGCGTGACCTACACCGAGGAAGAAAAGCTAAGCCTTGCGATTTTCGACGAGCGG ATTCACCGCGCTGACGAAGAGCAAGAAAGCTGCAATGCCAAGGTTGAGCGCTTAACGGGCGAGGAGCGTAAGCTGCGCGC CAAACGCGACCAAGCCAACGAAGCGCTGCGCATTGCTAGCCTGCGTGTTAACGAGCGGCAAACCGCGCTCGATGAACTGC ACCATATGCTGTTCCCGCAATCCCATACCTTGCTCGAGTTCCTGCGTAAGGAAGCCCAAGGCTGGGAGCAGAGTCTGGGT AAAGTGATTGCGCCAGAGTTACTGCATCGCACCGATTTACACCCAACGGTCACGGGCGAGAGCGACACTGTGTTTGGGGT GCATTTAGATCTTAAAGCCATTGATGTGCCTGAATATGCCGCCTCCGAGCAGGAACTGCGTATTCGTTTAAGCAAGGCCG AAGAGGCGCTGCAAAGCGCGCAGGAATTACAGGCCGAGGCCGAATCACAGCTGGTGGCGATTAACGGCGAGCTGGATAAG CTCAGCCGCGAACTGACCTTTGCCCGCACGGCTTACAAGAATAGCCGCGATGATTTACGTCGTCTATTCGATGAAAAACG CAGTGAGCAGGACAAGATCAACAAGGCGCTGGCCGAGCGTAAAGCCTTTGCCCAGCAGCGCTTAACTCAACTCGATGGCG AGCTAAAACAGCTTAAGCACCAACATCAGCTCTGGCTCGAAGAGCAAAAAGAGCAGGCGCTCGAAGCGCGGATGGAAAAA CAAGCCTACTGGCAGGAAGTCATTGGCGCGCTCGACAATCAACTGGGGCAAATCAAGGCCACTATCGATGCCCGCCGCGA AAGCGCTAAGGCCGAGCAAAAAGCCTGTGAAACCTGGTACAAAAACGAGCTTAAATCCCGAGGTGTGGATGAGGACAATA TCCTTAAGCTCAAGCAACAAATCCGTGAGCTTGAAACCAAAATCAGCCGCGCCGAGCAGCGTCGCAGCGAAGTATTGCGC TTCGACGATTGGTATCAACACACTTGGCTTATCCGTAAGCCCAAGCTGCAAACCCAGTTAAGCGACGTGAAACGCGCCGC CTCGGAAATCGATCAGCAGCTTAAAGCCAAGACTCAAGAAGTGAAGACCCGCCGTCAACAACTCGAGACCGAGCGTAAGG CCTCGGATGCGGCCCAGATTGAAGCCTCTGAAAACTTAACTAAATTGCGCGCCGTGATGCGTAAGTTGGCCGAGCTGAAA TTGCCCGCCAACAATGAAGAGGCTCAGGGTAGCCTCGGCGAGCGTTTGCGTCAGGGCGAAGATTTACTGCTAAAACGCGA TTATTTGATGGGCTCGGTTAAGCAATATGTGGAGCATTTCGACTCTGTGATTGCCAGCAAGTCAGGCTCAGGTTTAGCCG AGACTTGGGAGCGCGCCCGCGAAGAATCGAGCTTTATCAACGACAAAGGTATTCGCCTGCTGGATTACCGCAAACTAGTG CCGCAGCTTGAGCAGCTACTCAATGTGATGGTGCCGCAATCGATTATGGCGCTGCGTGAGCAGGGACGGATCTTCGGTGT CGACTTAACCGCCTTCTACGATGTGCTTGCCGATATCGACCGTCGCATCGCCTCCCAAAGTGCGCGCATTACCCGCGAAG TGGGCGAGGAGTTATTCCTCGATGGCGTATCCGAATCTGCGGTACGTATTCGCTCTAAGATCAGTGAATTAGAGTTTTGG CCTGAGCTTGAACAGTTCGTTAAAGCCTTCAAACAATGGAAGGCCGACGGCTTTAATGGTCTGCCCGATGAGGAATATAC CAACAGCATGCGCCGCGCCTTAGACATTATTGGCCGCGCGGCCTTAACCGGTGGCATTGCTAAGTTGCTGGAAATCGAAC TGCGCCTCAAAGAGGGCAATAGCGACCTGATTATCCGCACCGACAGACAGCTGAACGAATCCTCGAGCCACGGTATGGCT TACTTGATCCTGTGTAAGTTCCTGTTGGCATTCACGCGCTTGTTACGTGGCCGTGCCGATGTGACCATTCACTGGCCGAT CGACGAGCTGGGCACGCTGCACCACACCAACGTGAAGAAGATTTTCGATGCCTGTGGTAACAACAATATCAGCGTGTTAG GCGCTTTCCCGAACCCAGAGTCAGAAGTGCTGAACCTGTTCGAGAACCGTTACATTATTAATAAACAAACTAAGAAGTTG CAGGTGGTGAAGCCCAAAGCCAATCCGATTGCCGATATGTTGAGTAAACGCCTGAGCAAGGAGGCCATCTAA
Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TGAGTGCTGCCATGAATGAGTCAAACCAAACCGTATTAGTCGGCACGGGCGCCATTATCGAACTCTTGCTAAAAGGTGAG TTTATTTGCCGCACCACCAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1223; Mature: 1222
Protein sequence:
>1223_residues MPSLIRIVLIDTHLPGVVELALNGHTNICGTNASGKTTLQRLVPVFYGEYPSRVVPSTRDSFERWYLPHDSSYIIYEYQK ADGLLYQAVLASAGDGKGVNYRFIGKGFELSDYIKTQNGDTILCHTMAELGRELKRQGVATTNLLNTREYRAIIQNDRTL LSTGSNRSELRAYAHQFALCEGEHSLRHIEKLAKAVHSKEGKMETVKSMIAAILEEDGVNPPSSRLNPQRVEAWIRESQL IQGFEVIRPEFEKLEQEFNQLLSAEMRLSSLSRGYRNDETLEADRLEIQQTLSKELNLKLRMLDDEWKEVRDELNLDLSA AKGDVAKCEYELDAIEDQHGAFLDANIEQAKADLDMLPNWRADMENLSERHKLQTEKHQDIEAAYNARRSKIGEQLNREL EGLHAEQDKQREARDKQREVARADLDALEAQWRSQMDAGKASFSEQEYQFKLNAAELKLRVDGVTYTEEEKLSLAIFDER IHRADEEQESCNAKVERLTGEERKLRAKRDQANEALRIASLRVNERQTALDELHHMLFPQSHTLLEFLRKEAQGWEQSLG KVIAPELLHRTDLHPTVTGESDTVFGVHLDLKAIDVPEYAASEQELRIRLSKAEEALQSAQELQAEAESQLVAINGELDK LSRELTFARTAYKNSRDDLRRLFDEKRSEQDKINKALAERKAFAQQRLTQLDGELKQLKHQHQLWLEEQKEQALEARMEK QAYWQEVIGALDNQLGQIKATIDARRESAKAEQKACETWYKNELKSRGVDEDNILKLKQQIRELETKISRAEQRRSEVLR FDDWYQHTWLIRKPKLQTQLSDVKRAASEIDQQLKAKTQEVKTRRQQLETERKASDAAQIEASENLTKLRAVMRKLAELK LPANNEEAQGSLGERLRQGEDLLLKRDYLMGSVKQYVEHFDSVIASKSGSGLAETWERAREESSFINDKGIRLLDYRKLV PQLEQLLNVMVPQSIMALREQGRIFGVDLTAFYDVLADIDRRIASQSARITREVGEELFLDGVSESAVRIRSKISELEFW PELEQFVKAFKQWKADGFNGLPDEEYTNSMRRALDIIGRAALTGGIAKLLEIELRLKEGNSDLIIRTDRQLNESSSHGMA YLILCKFLLAFTRLLRGRADVTIHWPIDELGTLHHTNVKKIFDACGNNNISVLGAFPNPESEVLNLFENRYIINKQTKKL QVVKPKANPIADMLSKRLSKEAI
Sequences:
>Translated_1223_residues MPSLIRIVLIDTHLPGVVELALNGHTNICGTNASGKTTLQRLVPVFYGEYPSRVVPSTRDSFERWYLPHDSSYIIYEYQK ADGLLYQAVLASAGDGKGVNYRFIGKGFELSDYIKTQNGDTILCHTMAELGRELKRQGVATTNLLNTREYRAIIQNDRTL LSTGSNRSELRAYAHQFALCEGEHSLRHIEKLAKAVHSKEGKMETVKSMIAAILEEDGVNPPSSRLNPQRVEAWIRESQL IQGFEVIRPEFEKLEQEFNQLLSAEMRLSSLSRGYRNDETLEADRLEIQQTLSKELNLKLRMLDDEWKEVRDELNLDLSA AKGDVAKCEYELDAIEDQHGAFLDANIEQAKADLDMLPNWRADMENLSERHKLQTEKHQDIEAAYNARRSKIGEQLNREL EGLHAEQDKQREARDKQREVARADLDALEAQWRSQMDAGKASFSEQEYQFKLNAAELKLRVDGVTYTEEEKLSLAIFDER IHRADEEQESCNAKVERLTGEERKLRAKRDQANEALRIASLRVNERQTALDELHHMLFPQSHTLLEFLRKEAQGWEQSLG KVIAPELLHRTDLHPTVTGESDTVFGVHLDLKAIDVPEYAASEQELRIRLSKAEEALQSAQELQAEAESQLVAINGELDK LSRELTFARTAYKNSRDDLRRLFDEKRSEQDKINKALAERKAFAQQRLTQLDGELKQLKHQHQLWLEEQKEQALEARMEK QAYWQEVIGALDNQLGQIKATIDARRESAKAEQKACETWYKNELKSRGVDEDNILKLKQQIRELETKISRAEQRRSEVLR FDDWYQHTWLIRKPKLQTQLSDVKRAASEIDQQLKAKTQEVKTRRQQLETERKASDAAQIEASENLTKLRAVMRKLAELK LPANNEEAQGSLGERLRQGEDLLLKRDYLMGSVKQYVEHFDSVIASKSGSGLAETWERAREESSFINDKGIRLLDYRKLV PQLEQLLNVMVPQSIMALREQGRIFGVDLTAFYDVLADIDRRIASQSARITREVGEELFLDGVSESAVRIRSKISELEFW PELEQFVKAFKQWKADGFNGLPDEEYTNSMRRALDIIGRAALTGGIAKLLEIELRLKEGNSDLIIRTDRQLNESSSHGMA YLILCKFLLAFTRLLRGRADVTIHWPIDELGTLHHTNVKKIFDACGNNNISVLGAFPNPESEVLNLFENRYIINKQTKKL QVVKPKANPIADMLSKRLSKEAI >Mature_1222_residues PSLIRIVLIDTHLPGVVELALNGHTNICGTNASGKTTLQRLVPVFYGEYPSRVVPSTRDSFERWYLPHDSSYIIYEYQKA DGLLYQAVLASAGDGKGVNYRFIGKGFELSDYIKTQNGDTILCHTMAELGRELKRQGVATTNLLNTREYRAIIQNDRTLL STGSNRSELRAYAHQFALCEGEHSLRHIEKLAKAVHSKEGKMETVKSMIAAILEEDGVNPPSSRLNPQRVEAWIRESQLI QGFEVIRPEFEKLEQEFNQLLSAEMRLSSLSRGYRNDETLEADRLEIQQTLSKELNLKLRMLDDEWKEVRDELNLDLSAA KGDVAKCEYELDAIEDQHGAFLDANIEQAKADLDMLPNWRADMENLSERHKLQTEKHQDIEAAYNARRSKIGEQLNRELE GLHAEQDKQREARDKQREVARADLDALEAQWRSQMDAGKASFSEQEYQFKLNAAELKLRVDGVTYTEEEKLSLAIFDERI HRADEEQESCNAKVERLTGEERKLRAKRDQANEALRIASLRVNERQTALDELHHMLFPQSHTLLEFLRKEAQGWEQSLGK VIAPELLHRTDLHPTVTGESDTVFGVHLDLKAIDVPEYAASEQELRIRLSKAEEALQSAQELQAEAESQLVAINGELDKL SRELTFARTAYKNSRDDLRRLFDEKRSEQDKINKALAERKAFAQQRLTQLDGELKQLKHQHQLWLEEQKEQALEARMEKQ AYWQEVIGALDNQLGQIKATIDARRESAKAEQKACETWYKNELKSRGVDEDNILKLKQQIRELETKISRAEQRRSEVLRF DDWYQHTWLIRKPKLQTQLSDVKRAASEIDQQLKAKTQEVKTRRQQLETERKASDAAQIEASENLTKLRAVMRKLAELKL PANNEEAQGSLGERLRQGEDLLLKRDYLMGSVKQYVEHFDSVIASKSGSGLAETWERAREESSFINDKGIRLLDYRKLVP QLEQLLNVMVPQSIMALREQGRIFGVDLTAFYDVLADIDRRIASQSARITREVGEELFLDGVSESAVRIRSKISELEFWP ELEQFVKAFKQWKADGFNGLPDEEYTNSMRRALDIIGRAALTGGIAKLLEIELRLKEGNSDLIIRTDRQLNESSSHGMAY LILCKFLLAFTRLLRGRADVTIHWPIDELGTLHHTNVKKIFDACGNNNISVLGAFPNPESEVLNLFENRYIINKQTKKLQ VVKPKANPIADMLSKRLSKEAI
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 140267; Mature: 140136
Theoretical pI: Translated: 5.98; Mature: 5.98
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 1.5 %Met (Translated Protein) 2.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 1.4 %Met (Mature Protein) 2.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MPSLIRIVLIDTHLPGVVELALNGHTNICGTNASGKTTLQRLVPVFYGEYPSRVVPSTRD CCCEEEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHH SFERWYLPHDSSYIIYEYQKADGLLYQAVLASAGDGKGVNYRFIGKGFELSDYIKTQNGD HHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHCCCCC TILCHTMAELGRELKRQGVATTNLLNTREYRAIIQNDRTLLSTGSNRSELRAYAHQFALC EEEHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHH EGEHSLRHIEKLAKAVHSKEGKMETVKSMIAAILEEDGVNPPSSRLNPQRVEAWIRESQL CCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH IQGFEVIRPEFEKLEQEFNQLLSAEMRLSSLSRGYRNDETLEADRLEIQQTLSKELNLKL HHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCEEE RMLDDEWKEVRDELNLDLSAAKGDVAKCEYELDAIEDQHGAFLDANIEQAKADLDMLPNW EECCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCHHHHHHHHHCCCCC RADMENLSERHKLQTEKHQDIEAAYNARRSKIGEQLNRELEGLHAEQDKQREARDKQREV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH ARADLDALEAQWRSQMDAGKASFSEQEYQFKLNAAELKLRVDGVTYTEEEKLSLAIFDER 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PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA