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The map label for this gene is 117918970

Identifier: 117918970

GI number: 117918970

Start: 604751

End: 606121

Strand: Direct

Name: 117918970

Synonym: Shewana3_0516

Alternate gene names: NA

Gene position: 604751-606121 (Clockwise)

Preceding gene: 117918969

Following gene: 117918971

Centisome position: 12.16

GC content: 53.46

Gene sequence:

>1371_bases
ATGAAGAAAACCATTATCGCCCAGACCTTGTTTGGCCTGTTTAGCACACTCATGCTCGTTGGCGGACAGGTTCACTCTGC
TGTTGCAGCAACCTCAGGCCTTGAAGTGAACGAGCTAAATGCCGAAGGCACTTTATTAGCGCAAGGCGAGCTATTAACCG
AAGAAACTCAAGCTTCCCTCAAGCAGTGGATGCCAGAGTTACTCAAGCAAATTAATCAGTTACCCGAAGTGCAGGCACAA
ATTGCTCGGCAGCAACAGGCAGAGCTCGCCATTGCGGCAGCGGATCGCGCCATCTATAACCCTGAGCTTGGACTCAATTA
TCAAAACGCCGACACCGATACCTACAGCCTAGGGCTGAGTCAAACCCTAGATTGGGGTGATAAGCGCGGCGTCGCGACTC
GCCTTGCCCAGCTCGAGGCACAAATCCTGTTAGCGGATATACAGCTAGAGCGCAGTCAGATGTTGGCCGAGCGGCTATTG
GCACTGGCCGAGCAGGCGCAAAGCAATAAGGCGCTGACCTTTGCCGAGCAGCAATTAAGGTTTACGCAGGCACAGCTCAA
TATTGCCGAGCAGCGCTTTGCGGCGGGGGATTTATCCGATGTTGAGTTGCAACTGCTAAAGCTCGAACTGGCGAGTAACA
CCGCCGATTATGCGCTGGCCGAGCAAGCGGCGTTAGTGGCCGATGGCAAAGTCATCGAATTACTCGGCGTCGATAAGCTG
GGATTTAGGGAGTTTATCCCCGAGATTGGTCAATGGGTGACGCAATTGACCCCGAAAGTGGATTTACCCGCATTGACCAG
TGCCCATCAACAGGTGCAGCTGGCCAAGGCCAATGCCATGAAGGTTAAGGCGGACACTGCGGCCGATCCCACCATTAACC
TAGGTGTTGAAAAGGAAGGCGATGACAACAAGTTTGGCGTCGGCGTGGCCATCCCTTTGCAGGTGCGGAATAACTACAGT
GAGTTACAGGCGGTTGCCGACAAAGGTATCGCAATCGCGGAGCAGAACTACTTAGCCCGTGAGCGAGTACTTACGGCCAA
ACAGGCACAATTTACCAATGCTTTACCCCGTTTACTGGCGCGCTACCAAGATTGGCGCGAGCGAGTCGCTGCCTCGGGGA
GTAAAGCTGCTAAATCCTTAAGTGAGCTGTGGCGTTCGGGTGATGTGAGTACCAGCGAGTATTTGCAGAGTCGGCGCCAG
CTCGCGGCCAGTTATTTGGTCGGTTTAAACCTCGAAACGGCAATTTATCAGAGTTGGTTAACTTGGATGGGGGACAGCGG
TCAGCTGCTGCCCATGATTGACACCTTAGCCGACACATCCGTCGGTAAATCAAGGTCCACTTCTTCCACACATGCCGTGC
CAGCAAAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGAGCTTATTCGACATTTTACGCTTTGGGGGAGCTTTCGATTGGTATTCACACGTCTCTTGCGTGGGGCCAGTCCTATTT
AGATATTGTTAGGAATTGCG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCGTGAGGTAATACTATGAATTCATTTACTCAAAAATCGTCTTTCCAAACGTTGGGCACAGTGTCTACTGCGGGCTTAAG
GTCGTTGTTTACTCCTTCCC

Product: outer membrane efflux family protein

Products: NA

Alternate protein names: Outer Membrane Efflux Protein; Efflux Family Outer Membrane Protein; Outer Membrane Protein Probably Efflux Family; Outer Membrane Protein; Cation Efflux System Protein; Lipoprotein

Number of amino acids: Translated: 456; Mature: 456

Protein sequence:

>456_residues
MKKTIIAQTLFGLFSTLMLVGGQVHSAVAATSGLEVNELNAEGTLLAQGELLTEETQASLKQWMPELLKQINQLPEVQAQ
IARQQQAELAIAAADRAIYNPELGLNYQNADTDTYSLGLSQTLDWGDKRGVATRLAQLEAQILLADIQLERSQMLAERLL
ALAEQAQSNKALTFAEQQLRFTQAQLNIAEQRFAAGDLSDVELQLLKLELASNTADYALAEQAALVADGKVIELLGVDKL
GFREFIPEIGQWVTQLTPKVDLPALTSAHQQVQLAKANAMKVKADTAADPTINLGVEKEGDDNKFGVGVAIPLQVRNNYS
ELQAVADKGIAIAEQNYLARERVLTAKQAQFTNALPRLLARYQDWRERVAASGSKAAKSLSELWRSGDVSTSEYLQSRRQ
LAASYLVGLNLETAIYQSWLTWMGDSGQLLPMIDTLADTSVGKSRSTSSTHAVPAK

Sequences:

>Translated_456_residues
MKKTIIAQTLFGLFSTLMLVGGQVHSAVAATSGLEVNELNAEGTLLAQGELLTEETQASLKQWMPELLKQINQLPEVQAQ
IARQQQAELAIAAADRAIYNPELGLNYQNADTDTYSLGLSQTLDWGDKRGVATRLAQLEAQILLADIQLERSQMLAERLL
ALAEQAQSNKALTFAEQQLRFTQAQLNIAEQRFAAGDLSDVELQLLKLELASNTADYALAEQAALVADGKVIELLGVDKL
GFREFIPEIGQWVTQLTPKVDLPALTSAHQQVQLAKANAMKVKADTAADPTINLGVEKEGDDNKFGVGVAIPLQVRNNYS
ELQAVADKGIAIAEQNYLARERVLTAKQAQFTNALPRLLARYQDWRERVAASGSKAAKSLSELWRSGDVSTSEYLQSRRQ
LAASYLVGLNLETAIYQSWLTWMGDSGQLLPMIDTLADTSVGKSRSTSSTHAVPAK
>Mature_456_residues
MKKTIIAQTLFGLFSTLMLVGGQVHSAVAATSGLEVNELNAEGTLLAQGELLTEETQASLKQWMPELLKQINQLPEVQAQ
IARQQQAELAIAAADRAIYNPELGLNYQNADTDTYSLGLSQTLDWGDKRGVATRLAQLEAQILLADIQLERSQMLAERLL
ALAEQAQSNKALTFAEQQLRFTQAQLNIAEQRFAAGDLSDVELQLLKLELASNTADYALAEQAALVADGKVIELLGVDKL
GFREFIPEIGQWVTQLTPKVDLPALTSAHQQVQLAKANAMKVKADTAADPTINLGVEKEGDDNKFGVGVAIPLQVRNNYS
ELQAVADKGIAIAEQNYLARERVLTAKQAQFTNALPRLLARYQDWRERVAASGSKAAKSLSELWRSGDVSTSEYLQSRRQ
LAASYLVGLNLETAIYQSWLTWMGDSGQLLPMIDTLADTSVGKSRSTSSTHAVPAK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 49704; Mature: 49704

Theoretical pI: Translated: 4.71; Mature: 4.71

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
1.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
1.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKKTIIAQTLFGLFSTLMLVGGQVHSAVAATSGLEVNELNAEGTLLAQGELLTEETQASL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCEEEECCCHHHHHHHHHH
KQWMPELLKQINQLPEVQAQIARQQQAELAIAAADRAIYNPELGLNYQNADTDTYSLGLS
HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEECCCH
QTLDWGDKRGVATRLAQLEAQILLADIQLERSQMLAERLLALAEQAQSNKALTFAEQQLR
HHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH
FTQAQLNIAEQRFAAGDLSDVELQLLKLELASNTADYALAEQAALVADGKVIELLGVDKL
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCC
GFREFIPEIGQWVTQLTPKVDLPALTSAHQQVQLAKANAMKVKADTAADPTINLGVEKEG
CHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCEEECCCCCC
DDNKFGVGVAIPLQVRNNYSELQAVADKGIAIAEQNYLARERVLTAKQAQFTNALPRLLA
CCCCEEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RYQDWRERVAASGSKAAKSLSELWRSGDVSTSEYLQSRRQLAASYLVGLNLETAIYQSWL
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
TWMGDSGQLLPMIDTLADTSVGKSRSTSSTHAVPAK
HHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKKTIIAQTLFGLFSTLMLVGGQVHSAVAATSGLEVNELNAEGTLLAQGELLTEETQASL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCEEEECCCHHHHHHHHHH
KQWMPELLKQINQLPEVQAQIARQQQAELAIAAADRAIYNPELGLNYQNADTDTYSLGLS
HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEECCCH
QTLDWGDKRGVATRLAQLEAQILLADIQLERSQMLAERLLALAEQAQSNKALTFAEQQLR
HHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH
FTQAQLNIAEQRFAAGDLSDVELQLLKLELASNTADYALAEQAALVADGKVIELLGVDKL
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCC
GFREFIPEIGQWVTQLTPKVDLPALTSAHQQVQLAKANAMKVKADTAADPTINLGVEKEG
CHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCEEECCCCCC
DDNKFGVGVAIPLQVRNNYSELQAVADKGIAIAEQNYLARERVLTAKQAQFTNALPRLLA
CCCCEEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RYQDWRERVAASGSKAAKSLSELWRSGDVSTSEYLQSRRQLAASYLVGLNLETAIYQSWL
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
TWMGDSGQLLPMIDTLADTSVGKSRSTSSTHAVPAK
HHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA