Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is ydaO [H]

Identifier: 116492225

GI number: 116492225

Start: 471751

End: 473583

Strand: Direct

Name: ydaO [H]

Synonym: PEPE_0422

Alternate gene names: 116492225

Gene position: 471751-473583 (Clockwise)

Preceding gene: 116492224

Following gene: 116492226

Centisome position: 25.75

GC content: 40.92

Gene sequence:

>1833_bases
ATGTTTTCGTATTTGAAGCGTATTTTAATTGGTAAACCACTGAAAACGCTCGACGAGAGTGGACAAGCTTTAACGAAGTT
CAAAGCCCTCGCCTTGCTATCTTCAGATGCTTTATCATCTATTGCATATGGTACCGAAGAAATTTTGTCGGTTTTGATTG
TTTTATCTGCCGCTGCAACTTGGTATTCAATTCCAATTGCTGGGATTGTATTAGTGCTATTATTCGCGATTACCGTGTCA
TACCGCCAAATTATTAAGGCTTATCCATCTGGTGGTGGGGCGTATGTAGTAGCTAGTAAAAATTGGGGGACGTCGGCCGG
TCTGGTGGCCGGTGGCTCACTTTTAGTGGATTACATGCTGACCGTAGCGGTTAGTGTGACCTCTGGTACAGAAGCGATTA
CGTCGGCGATTCCAGCATTGCAAAAGTACCATATTGCCATTGCGGTTTTGATTGTACTGGGGATTATGGCGCTGAATTTG
CGGGGACTACGAGAATCAGCTAGTTTCTTAACGATTCCGGTTTACCTATTTATCGTGGTTATTTCCTTGATGATTGTGGT
TGGTTTATACAACATTGCAACTGGTCAAGTGGCTTATCATGCGGCTTCCGCAGTGGGATCGGCAGTGCCCGGGATGACTT
TTGTGATTTTCCTTAGAGCACTATCGTCTGGTTCTTCTTCTCTGACTGGGGTTGAAGCGATTAGTAATGCTGTTCCTAAC
TTTAAGAAACCACGTCGTAAGAATGCTGCAGGAACCTTAGCCATTATGTCATTGATTTTAGCTTCATTCTTTGCTGGAAT
TACGTTCTTGGCATACTACAGTGGAATTACACCAAGTTCTTCTCAAACCGTTTTATCTCAAATCGGTGTGACAATTTTTG
GACATGGTATTTTCTACTACATCCTTCAATTATCAACGGCATTGATTTTGGCCGTGGCTGCTAATACTGGTTTCTCAGCC
TTTCCAATGTTGGCATATAACTTAGCTAAAGATAAGTTTATGCCACATGCTTATATGGATCGTGGTGACCGTTTAGGCTA
TTCCAACGGTATTATTTCCTTGGCTGCCGGAGCAATCGTTTTGATTTTAATCTTTGGTGGACAAACAGGACTATTGATTC
CATTGTATGCCATCGGGGTTTTCGTACCTTTCACATTGTCACAATCAGGAATGATTGTTCATTGGAAGCGTGAAGGCGGT
AAAAAGTGGATGATAAATGCTTCTGCTAACTTGCTGGGAGCTTTACTATCAGCCGTTTTAGTAATTTGTTTGCTATTCTT
ACACTTTAGCAATGTTTGGCCATACTTTATTGTTATGCCACTCTTGTTAAGAATGTTCTACAAGATTCGTAAACATTACG
ATGAAGTTGCTGATCAATTACGAGTAATTGAAAAAGGTAAAGTTAACTTGCATGACTATGATGGTTCAACTGTGATTGTC
TTAGTTAGCAACGTTACTCAAGTTACTTCTGGAGCAATTAACTACGCTCGTTCAATCGGGGACTACGTAATTGCAATGCA
TGTCTCTTTTGATGCTAATCCTGAAAAAGAACATAAGACCGCGATGGAATTTAAAGCTGAATATCCAGATGTACGCTTCA
TTGATATCCATTCATCTTATCGCTCAATTACGAACCCAACCTTACGTTTCTGTGATGTGATTGCCCGGCGTGCGGCTGAA
CGAAACTACACAACTACTGTGTTAGTTCCACAGTTTGTTCCAAGAAAACCATGGCAAAATATTTTGCATAACCAAACTGG
TTTGCGTTTACGTGCTTCTTTGAACTCGCGTGAGAATATTATTGTCTCAACCTATAATTACCATCTGAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTATCAGTATATGAATTATAATCTTAAAAATTGTGCTAGTCATTTTGCGAGATTTGGAGTAGAATTTCACTTGCATATTT
TTGAAAATGGAGAGTAAAAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATAAAAAGTAAAACCTAGCTGAGGCTAGGTTTTTTTGTGTCAAAATATGAAAAAATAATTTAAATTCTTTGCATTTTTAG
TGAAGAAGATTGTATAAGGC

Product: amino acid transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 610; Mature: 610

Protein sequence:

>610_residues
MFSYLKRILIGKPLKTLDESGQALTKFKALALLSSDALSSIAYGTEEILSVLIVLSAAATWYSIPIAGIVLVLLFAITVS
YRQIIKAYPSGGGAYVVASKNWGTSAGLVAGGSLLVDYMLTVAVSVTSGTEAITSAIPALQKYHIAIAVLIVLGIMALNL
RGLRESASFLTIPVYLFIVVISLMIVVGLYNIATGQVAYHAASAVGSAVPGMTFVIFLRALSSGSSSLTGVEAISNAVPN
FKKPRRKNAAGTLAIMSLILASFFAGITFLAYYSGITPSSSQTVLSQIGVTIFGHGIFYYILQLSTALILAVAANTGFSA
FPMLAYNLAKDKFMPHAYMDRGDRLGYSNGIISLAAGAIVLILIFGGQTGLLIPLYAIGVFVPFTLSQSGMIVHWKREGG
KKWMINASANLLGALLSAVLVICLLFLHFSNVWPYFIVMPLLLRMFYKIRKHYDEVADQLRVIEKGKVNLHDYDGSTVIV
LVSNVTQVTSGAINYARSIGDYVIAMHVSFDANPEKEHKTAMEFKAEYPDVRFIDIHSSYRSITNPTLRFCDVIARRAAE
RNYTTTVLVPQFVPRKPWQNILHNQTGLRLRASLNSRENIIVSTYNYHLK

Sequences:

>Translated_610_residues
MFSYLKRILIGKPLKTLDESGQALTKFKALALLSSDALSSIAYGTEEILSVLIVLSAAATWYSIPIAGIVLVLLFAITVS
YRQIIKAYPSGGGAYVVASKNWGTSAGLVAGGSLLVDYMLTVAVSVTSGTEAITSAIPALQKYHIAIAVLIVLGIMALNL
RGLRESASFLTIPVYLFIVVISLMIVVGLYNIATGQVAYHAASAVGSAVPGMTFVIFLRALSSGSSSLTGVEAISNAVPN
FKKPRRKNAAGTLAIMSLILASFFAGITFLAYYSGITPSSSQTVLSQIGVTIFGHGIFYYILQLSTALILAVAANTGFSA
FPMLAYNLAKDKFMPHAYMDRGDRLGYSNGIISLAAGAIVLILIFGGQTGLLIPLYAIGVFVPFTLSQSGMIVHWKREGG
KKWMINASANLLGALLSAVLVICLLFLHFSNVWPYFIVMPLLLRMFYKIRKHYDEVADQLRVIEKGKVNLHDYDGSTVIV
LVSNVTQVTSGAINYARSIGDYVIAMHVSFDANPEKEHKTAMEFKAEYPDVRFIDIHSSYRSITNPTLRFCDVIARRAAE
RNYTTTVLVPQFVPRKPWQNILHNQTGLRLRASLNSRENIIVSTYNYHLK
>Mature_610_residues
MFSYLKRILIGKPLKTLDESGQALTKFKALALLSSDALSSIAYGTEEILSVLIVLSAAATWYSIPIAGIVLVLLFAITVS
YRQIIKAYPSGGGAYVVASKNWGTSAGLVAGGSLLVDYMLTVAVSVTSGTEAITSAIPALQKYHIAIAVLIVLGIMALNL
RGLRESASFLTIPVYLFIVVISLMIVVGLYNIATGQVAYHAASAVGSAVPGMTFVIFLRALSSGSSSLTGVEAISNAVPN
FKKPRRKNAAGTLAIMSLILASFFAGITFLAYYSGITPSSSQTVLSQIGVTIFGHGIFYYILQLSTALILAVAANTGFSA
FPMLAYNLAKDKFMPHAYMDRGDRLGYSNGIISLAAGAIVLILIFGGQTGLLIPLYAIGVFVPFTLSQSGMIVHWKREGG
KKWMINASANLLGALLSAVLVICLLFLHFSNVWPYFIVMPLLLRMFYKIRKHYDEVADQLRVIEKGKVNLHDYDGSTVIV
LVSNVTQVTSGAINYARSIGDYVIAMHVSFDANPEKEHKTAMEFKAEYPDVRFIDIHSSYRSITNPTLRFCDVIARRAAE
RNYTTTVLVPQFVPRKPWQNILHNQTGLRLRASLNSRENIIVSTYNYHLK

Specific function: Probable Amino-Acid Or Metabolite Transport Protein. [C]

COG id: COG0531

COG function: function code E; Amino acid transporters

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the amino acid-polyamine-organocation (APC) superfamily [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002293 [H]

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 66293; Mature: 66293

Theoretical pI: Translated: 9.97; Mature: 9.97

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
2.5 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
2.5 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFSYLKRILIGKPLKTLDESGQALTKFKALALLSSDALSSIAYGTEEILSVLIVLSAAAT
CHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
WYSIPIAGIVLVLLFAITVSYRQIIKAYPSGGGAYVVASKNWGTSAGLVAGGSLLVDYML
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHCHHHHHHHHH
TVAVSVTSGTEAITSAIPALQKYHIAIAVLIVLGIMALNLRGLRESASFLTIPVYLFIVV
HHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
ISLMIVVGLYNIATGQVAYHAASAVGSAVPGMTFVIFLRALSSGSSSLTGVEAISNAVPN
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCC
FKKPRRKNAAGTLAIMSLILASFFAGITFLAYYSGITPSSSQTVLSQIGVTIFGHGIFYY
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHH
ILQLSTALILAVAANTGFSAFPMLAYNLAKDKFMPHAYMDRGDRLGYSNGIISLAAGAIV
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHE
LILIFGGQTGLLIPLYAIGVFVPFTLSQSGMIVHWKREGGKKWMINASANLLGALLSAVL
EEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEEEEEEECCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHH
VICLLFLHFSNVWPYFIVMPLLLRMFYKIRKHYDEVADQLRVIEKGKVNLHDYDGSTVIV
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCEEEE
LVSNVTQVTSGAINYARSIGDYVIAMHVSFDANPEKEHKTAMEFKAEYPDVRFIDIHSSY
EECCHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECHHH
RSITNPTLRFCDVIARRAAERNYTTTVLVPQFVPRKPWQNILHNQTGLRLRASLNSRENI
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCE
IVSTYNYHLK
EEEEEEEECC
>Mature Secondary Structure
MFSYLKRILIGKPLKTLDESGQALTKFKALALLSSDALSSIAYGTEEILSVLIVLSAAAT
CHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
WYSIPIAGIVLVLLFAITVSYRQIIKAYPSGGGAYVVASKNWGTSAGLVAGGSLLVDYML
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHCHHHHHHHHH
TVAVSVTSGTEAITSAIPALQKYHIAIAVLIVLGIMALNLRGLRESASFLTIPVYLFIVV
HHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
ISLMIVVGLYNIATGQVAYHAASAVGSAVPGMTFVIFLRALSSGSSSLTGVEAISNAVPN
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCC
FKKPRRKNAAGTLAIMSLILASFFAGITFLAYYSGITPSSSQTVLSQIGVTIFGHGIFYY
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHH
ILQLSTALILAVAANTGFSAFPMLAYNLAKDKFMPHAYMDRGDRLGYSNGIISLAAGAIV
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHE
LILIFGGQTGLLIPLYAIGVFVPFTLSQSGMIVHWKREGGKKWMINASANLLGALLSAVL
EEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEEEEEEECCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHH
VICLLFLHFSNVWPYFIVMPLLLRMFYKIRKHYDEVADQLRVIEKGKVNLHDYDGSTVIV
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCEEEE
LVSNVTQVTSGAINYARSIGDYVIAMHVSFDANPEKEHKTAMEFKAEYPDVRFIDIHSSY
EECCHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECHHH
RSITNPTLRFCDVIARRAAERNYTTTVLVPQFVPRKPWQNILHNQTGLRLRASLNSRENI
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCE
IVSTYNYHLK
EEEEEEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]