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The map label for this gene is 113474128

Identifier: 113474128

GI number: 113474128

Start: 354244

End: 356607

Strand: Direct

Name: 113474128

Synonym: Tery_0228

Alternate gene names: NA

Gene position: 354244-356607 (Clockwise)

Preceding gene: 113474127

Following gene: 113474129

Centisome position: 4.57

GC content: 31.26

Gene sequence:

>2364_bases
ATGTATCATGATACTGGAGGAAGCTTATCAGCAGACGACCCGACTTATGTAGAAAGGAAACAAGATAGAGAACTATTGGA
AAAACTCCTAAAAGGAGAATATTGTTATGTGTTTAATGCTCGTCAAATGGGTAAGTCTAGTTTGCGGGTAAAAGTTATAG
ATAGATTAACACATCAATTAAGTTCCCAAGGTTGCCAATGCATCTCAATTGATATGAGTATGTTGTCTGATTTTTCGATA
CCAAAAGAATCTTGGTATGATGGTTTTTTAATTGAGCTATTAGATAGATGTGACTTAGAAAATAGTAGCAATTATCAAGA
CTGGATAGCTACTCATCGAAACTTAAAAATTAATAATCCTCAGCGTTGCAAACTGTTTATTGAAGAAATTTTATTTATTA
ATTTTCCTACTCAGAAAATATATATTTTTCTTGATGAAATTGATACATTGGGAAAATCTTATTTTAAACAAGAATTTTTA
GGTTTTATTCGGTCTTGTTATAATCGCCGTGCTGAGGATAAAAATTCTGATTATCATCGATTAGTTTTTGTTTTTTTTGG
TGCAGTTACTCCAGGAGATTTAATTCGAGATATAAGACAGACTCCTTTTAATATTGGCTATGGAATTGAGTTAACTGAAT
TAAGTTTTTTAGAAACCAAGAAAAAATTAATTCAGGGATTAGAAGAATTTGTAGAAAAGCCAGATATTGTGTTAAAAAAA
GTTTTTGATTGGACTGGAGGCCAACCTTTTTTAACTCAAAAAAGTTGTCAAATTATTGTTGATTATGCTGATACTACTCA
AGTAGATGTTGATAGTTTGCTAGAAAAAAATATTGTCAAAGATTGGGAAGATAAAGATAATCCTATTCATTTAAAACATA
TACGGGATTATTTACTTAGTGACATTGAATTACTGAGACTATATCAAAAGGTTCTTAAGAAGGGAGAAGTTAAATTTAAT
AATAGTAAAGTACAGATGTCTTTAAAGTTATCAGGTATAGTTCTAAAAAAACAAGATAAATTAGTTGTTTTTAATAAGAT
TTATCAGAAAGTTTTTAATCCAGATTGGGTTGAGGAACAGTTAGCAAACTTAGAAAATAATCTGGATTTACCTAAACTTA
AAAGATTAAGTTCAAGTTGGGTTATTGTTAGTTTAGTATGGGTATTAGCCATTATTATGAGAGCTTTAGGTTGGCTCCAA
CCATTTGAGTTAAATGAGTTTGATCGCTTAATGCAATGGCGACCCAAAGAAAAACGAGACCCTAATATTTTAATTGTTGA
AGCTACACAAACAGACATTAAAAAATATGGTAAAGGTGGGACTTTAAAAGATAAGATATTGGCTGATGTAATAAAAAAAA
TAAATACTTTACAACCGGCAATTATTGGTTTAGATTTGTGGCGGGAGAAAGCTTTAGGTTCTGAGGCTGATTATCAAAAT
TTATTGACTCTTTTGGAAAATAATCAGAAAATAATTGCTGTTTGTAGTACCAGTGAAAATAGCCCAAATAAATCTGGTAC
AAGACCTCCTGAAGGAGTGCCAAAAGAACGTTTAGGTTTTACTGATGTAGTTCTTGATAATGGTCAAGTTGACATTGTCC
GTCGCCACTTAATGTTTATGGGTTTAGAAGAGAAAGATCCTTGTAAAACACAGTATTCATTGAGTACTATAGTGGCCTTA
GATTTTTTGGAAATTAAAGGAGTTAAAGCCAAAAATATTTCCTCGGAGAGTATTAGAATTGGTAATGTTACTTTCAGGAA
ACTGAGAAAAGGAAATGGTATTTATGAAAAACTTGACGATGGTGGATTTCAAATTTTACTTAACTATAGAAATTCTCATC
ATATAGATAATAGAGTAGCTCAAAAAATTAGTATTTCGGAAGTTTTGGATGGGAACATTAATGATTCTTTAGTTAAGGAT
AAAATTGTCATTATTGGCATTACAGACCGTACTTCTGGTGACAAGTTTTATACTCCTTATAGTAATGTTCAGCCTCCTAA
TCAAAAGCAAATGCCTGGTGTTATTATACACGCACACAAGGTCAGTCAAATTATTAGTGCAGTTTTATATGGCAGACCTT
TGATTATTTTTTGGAGTTGGTGGGTAGAATGGCTATGGATTTTTGCTTGGTCTTTTTTGAGTTATGTGATCGGACATTTT
TTTCGAGGTTTTTTATTTTTCTTATTTGTAGGAGGAAATATTATTGTTTTATATTCGGTTAGTTTGTTTTTTCTAGTTCA
AGGTTTTGTAGTTCCATTAGTACCATCTATTTTGGTCTTAATTGTGAATACTGTCATTATTTTCGTTGATGATTCTCACT
TTTTTAAGACCAGGAAGCTCCCAGGACCGGTAGAAGAGGAATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
GCTAATGGTTAGATATTAACCCTTCAACTCCCAAGGAACTTCAGATCAGTAAAACCTTGCTGGGAGGCGAGGACATCAAA
TATTTATTAATGAAATTATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGAGAAAGAAAAGAGTATAATAACTAAGTTCAAATACTTTAAGTCTTCAAAAAAATGTATTTAGAGAATACATTTTTTCT
CCCACAAAAGCCTATTAAAT

Product: putative Chase2 sensor protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 787; Mature: 787

Protein sequence:

>787_residues
MYHDTGGSLSADDPTYVERKQDRELLEKLLKGEYCYVFNARQMGKSSLRVKVIDRLTHQLSSQGCQCISIDMSMLSDFSI
PKESWYDGFLIELLDRCDLENSSNYQDWIATHRNLKINNPQRCKLFIEEILFINFPTQKIYIFLDEIDTLGKSYFKQEFL
GFIRSCYNRRAEDKNSDYHRLVFVFFGAVTPGDLIRDIRQTPFNIGYGIELTELSFLETKKKLIQGLEEFVEKPDIVLKK
VFDWTGGQPFLTQKSCQIIVDYADTTQVDVDSLLEKNIVKDWEDKDNPIHLKHIRDYLLSDIELLRLYQKVLKKGEVKFN
NSKVQMSLKLSGIVLKKQDKLVVFNKIYQKVFNPDWVEEQLANLENNLDLPKLKRLSSSWVIVSLVWVLAIIMRALGWLQ
PFELNEFDRLMQWRPKEKRDPNILIVEATQTDIKKYGKGGTLKDKILADVIKKINTLQPAIIGLDLWREKALGSEADYQN
LLTLLENNQKIIAVCSTSENSPNKSGTRPPEGVPKERLGFTDVVLDNGQVDIVRRHLMFMGLEEKDPCKTQYSLSTIVAL
DFLEIKGVKAKNISSESIRIGNVTFRKLRKGNGIYEKLDDGGFQILLNYRNSHHIDNRVAQKISISEVLDGNINDSLVKD
KIVIIGITDRTSGDKFYTPYSNVQPPNQKQMPGVIIHAHKVSQIISAVLYGRPLIIFWSWWVEWLWIFAWSFLSYVIGHF
FRGFLFFLFVGGNIIVLYSVSLFFLVQGFVVPLVPSILVLIVNTVIIFVDDSHFFKTRKLPGPVEEE

Sequences:

>Translated_787_residues
MYHDTGGSLSADDPTYVERKQDRELLEKLLKGEYCYVFNARQMGKSSLRVKVIDRLTHQLSSQGCQCISIDMSMLSDFSI
PKESWYDGFLIELLDRCDLENSSNYQDWIATHRNLKINNPQRCKLFIEEILFINFPTQKIYIFLDEIDTLGKSYFKQEFL
GFIRSCYNRRAEDKNSDYHRLVFVFFGAVTPGDLIRDIRQTPFNIGYGIELTELSFLETKKKLIQGLEEFVEKPDIVLKK
VFDWTGGQPFLTQKSCQIIVDYADTTQVDVDSLLEKNIVKDWEDKDNPIHLKHIRDYLLSDIELLRLYQKVLKKGEVKFN
NSKVQMSLKLSGIVLKKQDKLVVFNKIYQKVFNPDWVEEQLANLENNLDLPKLKRLSSSWVIVSLVWVLAIIMRALGWLQ
PFELNEFDRLMQWRPKEKRDPNILIVEATQTDIKKYGKGGTLKDKILADVIKKINTLQPAIIGLDLWREKALGSEADYQN
LLTLLENNQKIIAVCSTSENSPNKSGTRPPEGVPKERLGFTDVVLDNGQVDIVRRHLMFMGLEEKDPCKTQYSLSTIVAL
DFLEIKGVKAKNISSESIRIGNVTFRKLRKGNGIYEKLDDGGFQILLNYRNSHHIDNRVAQKISISEVLDGNINDSLVKD
KIVIIGITDRTSGDKFYTPYSNVQPPNQKQMPGVIIHAHKVSQIISAVLYGRPLIIFWSWWVEWLWIFAWSFLSYVIGHF
FRGFLFFLFVGGNIIVLYSVSLFFLVQGFVVPLVPSILVLIVNTVIIFVDDSHFFKTRKLPGPVEEE
>Mature_787_residues
MYHDTGGSLSADDPTYVERKQDRELLEKLLKGEYCYVFNARQMGKSSLRVKVIDRLTHQLSSQGCQCISIDMSMLSDFSI
PKESWYDGFLIELLDRCDLENSSNYQDWIATHRNLKINNPQRCKLFIEEILFINFPTQKIYIFLDEIDTLGKSYFKQEFL
GFIRSCYNRRAEDKNSDYHRLVFVFFGAVTPGDLIRDIRQTPFNIGYGIELTELSFLETKKKLIQGLEEFVEKPDIVLKK
VFDWTGGQPFLTQKSCQIIVDYADTTQVDVDSLLEKNIVKDWEDKDNPIHLKHIRDYLLSDIELLRLYQKVLKKGEVKFN
NSKVQMSLKLSGIVLKKQDKLVVFNKIYQKVFNPDWVEEQLANLENNLDLPKLKRLSSSWVIVSLVWVLAIIMRALGWLQ
PFELNEFDRLMQWRPKEKRDPNILIVEATQTDIKKYGKGGTLKDKILADVIKKINTLQPAIIGLDLWREKALGSEADYQN
LLTLLENNQKIIAVCSTSENSPNKSGTRPPEGVPKERLGFTDVVLDNGQVDIVRRHLMFMGLEEKDPCKTQYSLSTIVAL
DFLEIKGVKAKNISSESIRIGNVTFRKLRKGNGIYEKLDDGGFQILLNYRNSHHIDNRVAQKISISEVLDGNINDSLVKD
KIVIIGITDRTSGDKFYTPYSNVQPPNQKQMPGVIIHAHKVSQIISAVLYGRPLIIFWSWWVEWLWIFAWSFLSYVIGHF
FRGFLFFLFVGGNIIVLYSVSLFFLVQGFVVPLVPSILVLIVNTVIIFVDDSHFFKTRKLPGPVEEE

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 11 WD repeats [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR020472
- InterPro:   IPR015943
- InterPro:   IPR001680
- InterPro:   IPR011046
- InterPro:   IPR019782
- InterPro:   IPR019775
- InterPro:   IPR017986
- InterPro:   IPR019781 [H]

Pfam domain/function: PF00400 WD40 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 90838; Mature: 90838

Theoretical pI: Translated: 7.95; Mature: 7.95

Prosite motif: PS00485 A_DEAMINASE

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
1.3 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
1.3 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MYHDTGGSLSADDPTYVERKQDRELLEKLLKGEYCYVFNARQMGKSSLRVKVIDRLTHQL
CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
SSQGCQCISIDMSMLSDFSIPKESWYDGFLIELLDRCDLENSSNYQDWIATHRNLKINNP
HHCCCEEEEEEHHHHHCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCEECCCH
QRCKLFIEEILFINFPTQKIYIFLDEIDTLGKSYFKQEFLGFIRSCYNRRAEDKNSDYHR
HHHHHHHHHHHHEECCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHE
LVFVFFGAVTPGDLIRDIRQTPFNIGYGIELTELSFLETKKKLIQGLEEFVEKPDIVLKK
EEEEHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
VFDWTGGQPFLTQKSCQIIVDYADTTQVDVDSLLEKNIVKDWEDKDNPIHLKHIRDYLLS
HHHCCCCCCCEECCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHH
DIELLRLYQKVLKKGEVKFNNSKVQMSLKLSGIVLKKQDKLVVFNKIYQKVFNPDWVEEQ
HHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCEEEEEEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
LANLENNLDLPKLKRLSSSWVIVSLVWVLAIIMRALGWLQPFELNEFDRLMQWRPKEKRD
HHHHHCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCC
PNILIVEATQTDIKKYGKGGTLKDKILADVIKKINTLQPAIIGLDLWREKALGSEADYQN
CCEEEEECCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
LLTLLENNQKIIAVCSTSENSPNKSGTRPPEGVPKERLGFTDVVLDNGQVDIVRRHLMFM
HHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHH
GLEEKDPCKTQYSLSTIVALDFLEIKGVKAKNISSESIRIGNVTFRKLRKGNGIYEKLDD
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEECCHHHHHHHCCCCCHHHCCC
GGFQILLNYRNSHHIDNRVAQKISISEVLDGNINDSLVKDKIVIIGITDRTSGDKFYTPY
CCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCEEEEEEECCCCCCCEECCC
SNVQPPNQKQMPGVIIHAHKVSQIISAVLYGRPLIIFWSWWVEWLWIFAWSFLSYVIGHF
CCCCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FRGFLFFLFVGGNIIVLYSVSLFFLVQGFVVPLVPSILVLIVNTVIIFVDDSHFFKTRKL
HHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCEECCCC
PGPVEEE
CCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MYHDTGGSLSADDPTYVERKQDRELLEKLLKGEYCYVFNARQMGKSSLRVKVIDRLTHQL
CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
SSQGCQCISIDMSMLSDFSIPKESWYDGFLIELLDRCDLENSSNYQDWIATHRNLKINNP
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VFDWTGGQPFLTQKSCQIIVDYADTTQVDVDSLLEKNIVKDWEDKDNPIHLKHIRDYLLS
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HHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCEEEEEEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
LANLENNLDLPKLKRLSSSWVIVSLVWVLAIIMRALGWLQPFELNEFDRLMQWRPKEKRD
HHHHHCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCC
PNILIVEATQTDIKKYGKGGTLKDKILADVIKKINTLQPAIIGLDLWREKALGSEADYQN
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FRGFLFFLFVGGNIIVLYSVSLFFLVQGFVVPLVPSILVLIVNTVIIFVDDSHFFKTRKL
HHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCEECCCC
PGPVEEE
CCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8905231 [H]