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The map label for this gene is mviN [H]

Identifier: 71892231

GI number: 71892231

Start: 560978

End: 562525

Strand: Reverse

Name: mviN [H]

Synonym: BPEN_469

Alternate gene names: 71892231

Gene position: 562525-560978 (Counterclockwise)

Preceding gene: 71892233

Following gene: 71892229

Centisome position: 71.06

GC content: 29.01

Gene sequence:

>1548_bases
ATGAATCTGTTAAAGTCTTTGACCGCGATAAGTTTTATAACTATTTTATCTCGTATTTTAGGTTTTATTAGAGATACTAT
CGTAGCTCGAATGTTTGGAGTTAGTATTATGACAGATGCATTCTTTATTGCTTTTAAATTGCCTAATTTATTAAGACGTA
TTTTTGCTGAAGGAGCATTCTATCAAGTTTTTCTCCCTATATTATCAGAATATCAATCTCGAGAAAGTAAAGAAGAAATA
CGAGTATTTATTTCTAGAGTATCTGCCTTGTTAATATTCACCGTAACTGTTGTAGTATTCATTGGTTTACTGATAGCACC
TTGGGTTATTATGGTTATTGCTCCAGGTTTTAATAGTTCTTCAGAAAAATTTATTATGACTATTGAGATGTTTCGAGTGA
TGCTTCCTTATATTTTATTAGTGTCATTGACATCATTAATGGGGGCGATTTTGAATGCTTGTAATTTTTTTTTGGTTCCA
GCGTTTACTCCTATTTTTTTAAATATTAGCATGATAAGTTATATGTTATTTATGGGATATTCATGTTTTCATGTTCCTAT
TATTGGATTGGCTTGGTCAGTTATTGTAGGGGGGATATTACAGTGTGTTTATTGTTTGTTATTTTTAAAAAAAATTAATA
TGTTAGTTATCCCAAAAATGCAACTTTATGATAATAGGGTATATAGAATATGTCGATCCATGGTGCCTGCTGTGATTGCG
GTCTCAAGTAGTCAAGTATCATTAATTATTAATACTGTTTTTGCGTCTTTTTTAAGAGATGGTTCTGTTTCTTGGATGTA
TTATGCTGATAGGTTAATGGAATTACCTATTGGAGTTTTTGGTGTGACATTAAGCACTATTTTAGTGCCATATTTATCTC
GTTTTATTTCTAAGAAAAATTATGGAGATTATTTTTATTTAATGAATTGGGGTATAAGATTATGTTTTATATTAAGTTTA
CCTAGTGCTCTTATTTTAGGTGTTTTGTCTGAACCGTTAGTAATAACATTGTTTAAGTATGGGAAATTTTTAGAATTTGA
TGTGTTAATGACACAGTATTCTGTAATTGCGTATGCAATAGGTTTGCCTGGATTAATTTTTACCAAAGTATTAACATCTG
GTTTTTATGCGCTCCGTGATATTAAAACTCCAGCGTATATAGTTGTTATTGTTCTTTTTTTTACTCAATTTATAAATTTA
GTATGCATTAATACATTAAAGCATATTGTTTTTTCTTTTTCTATCAGTTTGGGTGCATGGCTAAATGCGGGGTTGTTATA
TTGGAAATTTAAAAAAAAATATTTATTTCAATTGCAATCTGGATGGTTATGTTTTTGTTGTCAATTAATGATTGCTCTTT
TTGTAATGTGTATAGTATGTTTGGGATTATTAATGTATGTATCTAGTTGGGATCAAGGAAATATCTTGTATAGATTAATT
AGAATGATAGGGGCTTTGATATTAGTTAGCAGTAGTTATGGTATAATGTTATGGTGTGTAGGGATGCGTTTAAAAGATTT
TATTTTTTTGAGTAAAGATTTATATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAAAATTGTACATAAAACTGGAGCAATCGTTTAAGTTATAAAAAAAAATAGTGTTTTTGTGTTGTTGTGTTAATACTGAA
TGCTAAATATTTTGAATATG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGTAATAAAAGATATATTAATTTTTACATATATCTTACCGTTTTAATTCCTAACAAATTTAATCCTGTTTTCAAAGTACG
CATAGTAATTAATGCTAATT

Product: putative virulence factor

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 515; Mature: 515

Protein sequence:

>515_residues
MNLLKSLTAISFITILSRILGFIRDTIVARMFGVSIMTDAFFIAFKLPNLLRRIFAEGAFYQVFLPILSEYQSRESKEEI
RVFISRVSALLIFTVTVVVFIGLLIAPWVIMVIAPGFNSSSEKFIMTIEMFRVMLPYILLVSLTSLMGAILNACNFFLVP
AFTPIFLNISMISYMLFMGYSCFHVPIIGLAWSVIVGGILQCVYCLLFLKKINMLVIPKMQLYDNRVYRICRSMVPAVIA
VSSSQVSLIINTVFASFLRDGSVSWMYYADRLMELPIGVFGVTLSTILVPYLSRFISKKNYGDYFYLMNWGIRLCFILSL
PSALILGVLSEPLVITLFKYGKFLEFDVLMTQYSVIAYAIGLPGLIFTKVLTSGFYALRDIKTPAYIVVIVLFFTQFINL
VCINTLKHIVFSFSISLGAWLNAGLLYWKFKKKYLFQLQSGWLCFCCQLMIALFVMCIVCLGLLMYVSSWDQGNILYRLI
RMIGALILVSSSYGIMLWCVGMRLKDFIFLSKDLY

Sequences:

>Translated_515_residues
MNLLKSLTAISFITILSRILGFIRDTIVARMFGVSIMTDAFFIAFKLPNLLRRIFAEGAFYQVFLPILSEYQSRESKEEI
RVFISRVSALLIFTVTVVVFIGLLIAPWVIMVIAPGFNSSSEKFIMTIEMFRVMLPYILLVSLTSLMGAILNACNFFLVP
AFTPIFLNISMISYMLFMGYSCFHVPIIGLAWSVIVGGILQCVYCLLFLKKINMLVIPKMQLYDNRVYRICRSMVPAVIA
VSSSQVSLIINTVFASFLRDGSVSWMYYADRLMELPIGVFGVTLSTILVPYLSRFISKKNYGDYFYLMNWGIRLCFILSL
PSALILGVLSEPLVITLFKYGKFLEFDVLMTQYSVIAYAIGLPGLIFTKVLTSGFYALRDIKTPAYIVVIVLFFTQFINL
VCINTLKHIVFSFSISLGAWLNAGLLYWKFKKKYLFQLQSGWLCFCCQLMIALFVMCIVCLGLLMYVSSWDQGNILYRLI
RMIGALILVSSSYGIMLWCVGMRLKDFIFLSKDLY
>Mature_515_residues
MNLLKSLTAISFITILSRILGFIRDTIVARMFGVSIMTDAFFIAFKLPNLLRRIFAEGAFYQVFLPILSEYQSRESKEEI
RVFISRVSALLIFTVTVVVFIGLLIAPWVIMVIAPGFNSSSEKFIMTIEMFRVMLPYILLVSLTSLMGAILNACNFFLVP
AFTPIFLNISMISYMLFMGYSCFHVPIIGLAWSVIVGGILQCVYCLLFLKKINMLVIPKMQLYDNRVYRICRSMVPAVIA
VSSSQVSLIINTVFASFLRDGSVSWMYYADRLMELPIGVFGVTLSTILVPYLSRFISKKNYGDYFYLMNWGIRLCFILSL
PSALILGVLSEPLVITLFKYGKFLEFDVLMTQYSVIAYAIGLPGLIFTKVLTSGFYALRDIKTPAYIVVIVLFFTQFINL
VCINTLKHIVFSFSISLGAWLNAGLLYWKFKKKYLFQLQSGWLCFCCQLMIALFVMCIVCLGLLMYVSSWDQGNILYRLI
RMIGALILVSSSYGIMLWCVGMRLKDFIFLSKDLY

Specific function: Unknown

COG id: COG0728

COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the mviN family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1787309, Length=507, Percent_Identity=53.8461538461538, Blast_Score=556, Evalue=1e-159,

Paralogues:

None

Copy number: 10-20 Molecules/Cell [C]

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004268 [H]

Pfam domain/function: PF03023 MVIN [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 58656; Mature: 58656

Theoretical pI: Translated: 9.52; Mature: 9.52

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.5 %Cys     (Translated Protein)
4.7 %Met     (Translated Protein)
7.2 %Cys+Met (Translated Protein)
2.5 %Cys     (Mature Protein)
4.7 %Met     (Mature Protein)
7.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8200538; 11677609 [H]