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The map label for this gene is 45658027

Identifier: 45658027

GI number: 45658027

Start: 2631184

End: 2632836

Strand: Reverse

Name: 45658027

Synonym: LIC12178

Alternate gene names: NA

Gene position: 2632836-2631184 (Counterclockwise)

Preceding gene: 45658028

Following gene: 45658026

Centisome position: 61.56

GC content: 32.18

Gene sequence:

>1653_bases
ATGAAATTAATTTCATGGGTTGTTCTTTCTTCGGCTCTTTTTTTAAGTTTCTTTTTTCCATGGGAAATGGGAGGCGAATC
ATGGGGATATTGGAGTTTTACTAAAATTCTAAACGAAACAGGTCATTTTGTAAACTTAGACCGTTCGCCTCTTTATACGC
TGTATCTATTACCTTTTAGCTTAATTCCATATCCATATTCTACTTATTTGGAATATTTGCTTTCGATGCTAATAGTTCTG
TTAGCCATGAACATTTTTTTAGTTACGGAAATTAAAAATGTGTTTGCGGCTTTGGTTGGGACAATTATTTGGATTCCAAT
TTTTCAAAGTTTTGAACCGCCAGTTCAGAAGTTAGGACTTGCTTCTGTTTTATTCGCTTTTACTTTAAGGAATAGTAATG
TTTTTTTTAAAAAATACTGTATTGCATACAGTTTATTAATCTTAGCGTATTTATTGAGGCCCGTTTATTTATTTCCTCTT
GTGTTTTTAATCCTCTATGATTTTGTAATTCAGATTCAGGCAATCTATCGCAAGGAGTTTGTTTTTAACTTAAAGAAAAC
ATTCTCTATGTTATTCGTTTTCTCCTTGTTATTTTTAATCCAACTCACTTTCTCTTTAAATCAAATAAAAGATCCTTGGA
ATAATGCTATGTTTGGAACATCTCAATGGTTTCCAGGGGGGGATGATCTTTTTTCTATTGGTCTAATTCAGGCTATCAGT
TGGCATTATATTCCGATCAAATATGGAACCTTTGATAATTACGACTTTTGGCAAACTCAAAAGGAATTGTTTGGAAACGC
TGTAACTTTTACCGGAATGATTCAAGCCAATCCTTCCTTTCTTGTTGAGTTTTTTGTTTGGAATACTATACGTTTAATAA
GAGCGGTTACCTGGAATTTTCCTAATATGGGTTTAGTTGGATATAAAGATCTTTTTTTGAGAATGGTATTGATTGGATTA
ACTGTTTGGGGAATATTCAGATTTTCTAAAAAACGACTTTTTTTTCAAGTAAAAATGTTGAGTTTGTGTGTCTCTGCCTT
CATTTGTATTATCAATTGGCCGGCTACGCGATATATGATGCCGCTAACTCCGTTAATTTCTCTTTCGGCATATTACTATT
TTACTTCAGTTAAGATAAATCGTATAGCTATAAAGCTAATTGCAGGTTGTTTCATTTTAGTATTTTTTTTCTTTCAACCA
CTTTTCGAATGGGGTAGAAAGCTTCGACAAGTAGGGATTGATTACTTTGTAGATGGACAACCTAAAATTCTTACCTCTAG
AGTAAGATCGATGAGTTCGGTTCATAATGAATTGGATAAGTATGTTCATGGTTGTTCAGGAATCATGTCCTTAGAATATT
CATATCTTTTTGCTTTCTTTTCAATACCAAGGGAAATAATATTTGATTTATGGGAAATACCTCCATTTGGTTCTTTAGGT
AAATCTGAATATAAAGGTCTGAGAAGGGATAGGGTAGATTGTTTGTTCATTTCAAACGGGTTGGAAACTGGAATTGGGAT
GGGGACAAATCAAAAACTGAGATATTTAAATTATATTAAACCATATGCAGATTATTTATTAAGTCAAGGAGCAATGGTTT
CTAATATAAATGGTTACGGAAAAGTTATATTTTTTGAACAAGAAAATAGATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATCCAAATATTAAAACGGAAGTTTTTAGGGTTCCCTTTACAAAATGTTTTCAAAATTTTATTTCAAGAGACCGTAACTA
TGAATCTTAACGAAAAAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATTAACTTATAGTTAGTTTAAGAACTTGATAAGTTATATAAAAGAAAGTTTCTTTTATGTTAGGTGAAAGAGATATGCA
AGAAGAGGTCTAAAATTTTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 550; Mature: 550

Protein sequence:

>550_residues
MKLISWVVLSSALFLSFFFPWEMGGESWGYWSFTKILNETGHFVNLDRSPLYTLYLLPFSLIPYPYSTYLEYLLSMLIVL
LAMNIFLVTEIKNVFAALVGTIIWIPIFQSFEPPVQKLGLASVLFAFTLRNSNVFFKKYCIAYSLLILAYLLRPVYLFPL
VFLILYDFVIQIQAIYRKEFVFNLKKTFSMLFVFSLLFLIQLTFSLNQIKDPWNNAMFGTSQWFPGGDDLFSIGLIQAIS
WHYIPIKYGTFDNYDFWQTQKELFGNAVTFTGMIQANPSFLVEFFVWNTIRLIRAVTWNFPNMGLVGYKDLFLRMVLIGL
TVWGIFRFSKKRLFFQVKMLSLCVSAFICIINWPATRYMMPLTPLISLSAYYYFTSVKINRIAIKLIAGCFILVFFFFQP
LFEWGRKLRQVGIDYFVDGQPKILTSRVRSMSSVHNELDKYVHGCSGIMSLEYSYLFAFFSIPREIIFDLWEIPPFGSLG
KSEYKGLRRDRVDCLFISNGLETGIGMGTNQKLRYLNYIKPYADYLLSQGAMVSNINGYGKVIFFEQENR

Sequences:

>Translated_550_residues
MKLISWVVLSSALFLSFFFPWEMGGESWGYWSFTKILNETGHFVNLDRSPLYTLYLLPFSLIPYPYSTYLEYLLSMLIVL
LAMNIFLVTEIKNVFAALVGTIIWIPIFQSFEPPVQKLGLASVLFAFTLRNSNVFFKKYCIAYSLLILAYLLRPVYLFPL
VFLILYDFVIQIQAIYRKEFVFNLKKTFSMLFVFSLLFLIQLTFSLNQIKDPWNNAMFGTSQWFPGGDDLFSIGLIQAIS
WHYIPIKYGTFDNYDFWQTQKELFGNAVTFTGMIQANPSFLVEFFVWNTIRLIRAVTWNFPNMGLVGYKDLFLRMVLIGL
TVWGIFRFSKKRLFFQVKMLSLCVSAFICIINWPATRYMMPLTPLISLSAYYYFTSVKINRIAIKLIAGCFILVFFFFQP
LFEWGRKLRQVGIDYFVDGQPKILTSRVRSMSSVHNELDKYVHGCSGIMSLEYSYLFAFFSIPREIIFDLWEIPPFGSLG
KSEYKGLRRDRVDCLFISNGLETGIGMGTNQKLRYLNYIKPYADYLLSQGAMVSNINGYGKVIFFEQENR
>Mature_550_residues
MKLISWVVLSSALFLSFFFPWEMGGESWGYWSFTKILNETGHFVNLDRSPLYTLYLLPFSLIPYPYSTYLEYLLSMLIVL
LAMNIFLVTEIKNVFAALVGTIIWIPIFQSFEPPVQKLGLASVLFAFTLRNSNVFFKKYCIAYSLLILAYLLRPVYLFPL
VFLILYDFVIQIQAIYRKEFVFNLKKTFSMLFVFSLLFLIQLTFSLNQIKDPWNNAMFGTSQWFPGGDDLFSIGLIQAIS
WHYIPIKYGTFDNYDFWQTQKELFGNAVTFTGMIQANPSFLVEFFVWNTIRLIRAVTWNFPNMGLVGYKDLFLRMVLIGL
TVWGIFRFSKKRLFFQVKMLSLCVSAFICIINWPATRYMMPLTPLISLSAYYYFTSVKINRIAIKLIAGCFILVFFFFQP
LFEWGRKLRQVGIDYFVDGQPKILTSRVRSMSSVHNELDKYVHGCSGIMSLEYSYLFAFFSIPREIIFDLWEIPPFGSLG
KSEYKGLRRDRVDCLFISNGLETGIGMGTNQKLRYLNYIKPYADYLLSQGAMVSNINGYGKVIFFEQENR

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 64144; Mature: 64144

Theoretical pI: Translated: 9.51; Mature: 9.51

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
2.9 %Met     (Translated Protein)
4.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
2.9 %Met     (Mature Protein)
4.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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EEEEEECCCC
>Mature Secondary Structure
MKLISWVVLSSALFLSFFFPWEMGGESWGYWSFTKILNETGHFVNLDRSPLYTLYLLPFS
CCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCHHHEEHHHH
LIPYPYSTYLEYLLSMLIVLLAMNIFLVTEIKNVFAALVGTIIWIPIFQSFEPPVQKLGL
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH
ASVLFAFTLRNSNVFFKKYCIAYSLLILAYLLRPVYLFPLVFLILYDFVIQIQAIYRKEF
HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VFNLKKTFSMLFVFSLLFLIQLTFSLNQIKDPWNNAMFGTSQWFPGGDDLFSIGLIQAIS
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WHYIPIKYGTFDNYDFWQTQKELFGNAVTFTGMIQANPSFLVEFFVWNTIRLIRAVTWNF
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PNMGLVGYKDLFLRMVLIGLTVWGIFRFSKKRLFFQVKMLSLCVSAFICIINWPATRYMM
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCC
PLTPLISLSAYYYFTSVKINRIAIKLIAGCFILVFFFFQPLFEWGRKLRQVGIDYFVDGQ
CCHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCC
PKILTSRVRSMSSVHNELDKYVHGCSGIMSLEYSYLFAFFSIPREIIFDLWEIPPFGSLG
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCCCCCC
KSEYKGLRRDRVDCLFISNGLETGIGMGTNQKLRYLNYIKPYADYLLSQGAMVSNINGYG
CHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCE
KVIFFEQENR
EEEEEECCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA