| Definition | Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002162 |
| Length | 751,719 |
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Identifier: 13358143
GI number: 13358143
Start: 722443
End: 724023
Strand: Direct
Name: Not Available
Synonym: UU578
Alternate gene names: NA
Gene position: 722443-724023 (Clockwise)
Preceding gene: 13358138
Following gene: 13358144
Centisome position: 96.11
GC content: 26.94
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases ATTAATTATTTTTTATATTTTTGATATATAGATTATCGTAAATTCCAAATTTTATCGTTAAATAATATTAGGAGTCTATA AAAGGAATCTATAAAAAATT
Downstream 100 bases:
>100_bases TAATTCTTACTTTAAAGTTAATAATTATTCAATTAAACTAATAAATATTTTAAAAACAGTATTAAAAATATTTTTTTAGA AAATTATTTTTTTTTAATTT
Product: membrane lipoprotein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 526; Mature: 526
Protein sequence:
>526_residues MKRKNKIITSSLALLFTGVIATISIAACSKQNNQKTKNFNSQEQANKIIEAILNKKEGKDNFIDWVHWWNSPFQQARKLA KDLDKYIDLTKSKNFKSMIDKNEYKSTFSAQIENVIRIIKDDIKMYANSPFWKKWRQQKKTALFLINYAPIQKDDSQINA PGILLPAEYPLLYSKPDFEELPGFGAFFPTPKSMDAVDLLDTWKSFGSLISSKGNSVEKSVLASKLQNSFAKTADKVVYI YDDAIVPNIYDKNGNRNLKITQEFANWMINQNYKGYLAREFLKINQKNDLIPLPMSIVWHASYGIIGMHRMLYTLSKAFG MPKDELEHLKAQEKFKIPTLKKLLTNDELELKNGIQTIKTGIDSPFKYHRDQNRDDWKIWATNSQVLDICIALGLKPDLL VKGELSTSVHEDPNLAYYLNDVIKNQLSDIEQISIKKNHINWTATNYEPIKNLNVNLILMGVHGLIKNSAFKKMMDEGKQ IKNWAFTDRRFSDETRQYVKKGEEDLYSQNASILGWDEFLKTKNNQ
Sequences:
>Translated_526_residues MKRKNKIITSSLALLFTGVIATISIAACSKQNNQKTKNFNSQEQANKIIEAILNKKEGKDNFID*VH**NSPFQQARKLA KDLDKYIDLTKSKNFKSMIDKNEYKSTFSAQIENVIRIIKDDIKMYANSPF*KK*RQQKKTALFLINYAPIQKDDSQINA PGILLPAEYPLLYSKPDFEELPGFGAFFPTPKSMDAVDLLDT*KSFGSLISSKGNSVEKSVLASKLQNSFAKTADKVVYI YDDAIVPNIYDKNGNRNLKITQEFAN*MINQNYKGYLAREFLKINQKNDLIPLPMSIV*HASYGIIGMHRMLYTLSKAFG MPKDELEHLKAQEKFKIPTLKKLLTNDELELKNGIQTIKTGIDSPFKYHRDQNRDD*KI*ATNSQVLDICIALGLKPDLL VKGELSTSVHEDPNLAYYLNDVIKNQLSDIEQISIKKNHIN*TATNYEPIKNLNVNLILMGVHGLIKNSAFKKMMDEGKQ IKNWAFTDRRFSDETRQYVKKGEEDLYSQNASILG*DEFLKTKNNQ >Mature_526_residues MKRKNKIITSSLALLFTGVIATISIAACSKQNNQKTKNFNSQEQANKIIEAILNKKEGKDNFID*VH**NSPFQQARKLA KDLDKYIDLTKSKNFKSMIDKNEYKSTFSAQIENVIRIIKDDIKMYANSPF*KK*RQQKKTALFLINYAPIQKDDSQINA PGILLPAEYPLLYSKPDFEELPGFGAFFPTPKSMDAVDLLDT*KSFGSLISSKGNSVEKSVLASKLQNSFAKTADKVVYI YDDAIVPNIYDKNGNRNLKITQEFAN*MINQNYKGYLAREFLKINQKNDLIPLPMSIV*HASYGIIGMHRMLYTLSKAFG MPKDELEHLKAQEKFKIPTLKKLLTNDELELKNGIQTIKTGIDSPFKYHRDQNRDD*KI*ATNSQVLDICIALGLKPDLL VKGELSTSVHEDPNLAYYLNDVIKNQLSDIEQISIKKNHIN*TATNYEPIKNLNVNLILMGVHGLIKNSAFKKMMDEGKQ IKNWAFTDRRFSDETRQYVKKGEEDLYSQNASILG*DEFLKTKNNQ
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 58262; Mature: 58262
Theoretical pI: Translated: 9.84; Mature: 9.84
Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 2.3 %Met (Translated Protein) 2.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 2.3 %Met (Mature Protein) 2.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKRKNKIITSSLALLFTGVIATISIAACSKQNNQKTKNFNSQEQANKIIEAILNKKEGKD CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCC NFIDVHNSPFQQARKLAKDLDKYIDLTKSKNFKSMIDKNEYKSTFSAQIENVIRIIKDDI CEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KMYANSPFKKRQQKKTALFLINYAPIQKDDSQINAPGILLPAEYPLLYSKPDFEELPGFG HHHHCCCHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCEECCCCHHHCCCCC AFFPTPKSMDAVDLLDTKSFGSLISSKGNSVEKSVLASKLQNSFAKTADKVVYIYDDAIV CCCCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCC PNIYDKNGNRNLKITQEFANMINQNYKGYLAREFLKINQKNDLIPLPMSIVHASYGIIGM CCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEECCCHHHHHHHCCHHHH HRMLYTLSKAFGMPKDELEHLKAQEKFKIPTLKKLLTNDELELKNGIQTIKTGIDSPFKY HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH HRDQNRDDKIATNSQVLDICIALGLKPDLLVKGELSTSVHEDPNLAYYLNDVIKNQLSDI HCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH EQISIKKNHINTATNYEPIKNLNVNLILMGVHGLIKNSAFKKMMDEGKQIKNWAFTDRRF HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCC SDETRQYVKKGEEDLYSQNASILGDEFLKTKNNQ CHHHHHHHHCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure MKRKNKIITSSLALLFTGVIATISIAACSKQNNQKTKNFNSQEQANKIIEAILNKKEGKD CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCC NFIDVHNSPFQQARKLAKDLDKYIDLTKSKNFKSMIDKNEYKSTFSAQIENVIRIIKDDI CEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KMYANSPFKKRQQKKTALFLINYAPIQKDDSQINAPGILLPAEYPLLYSKPDFEELPGFG HHHHCCCHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCEECCCCHHHCCCCC AFFPTPKSMDAVDLLDTKSFGSLISSKGNSVEKSVLASKLQNSFAKTADKVVYIYDDAIV CCCCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCC PNIYDKNGNRNLKITQEFANMINQNYKGYLAREFLKINQKNDLIPLPMSIVHASYGIIGM CCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEECCCHHHHHHHCCHHHH HRMLYTLSKAFGMPKDELEHLKAQEKFKIPTLKKLLTNDELELKNGIQTIKTGIDSPFKY HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH HRDQNRDDKIATNSQVLDICIALGLKPDLLVKGELSTSVHEDPNLAYYLNDVIKNQLSDI HCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH EQISIKKNHINTATNYEPIKNLNVNLILMGVHGLIKNSAFKKMMDEGKQIKNWAFTDRRF HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCC SDETRQYVKKGEEDLYSQNASILGDEFLKTKNNQ CHHHHHHHHCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA