| Definition | Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002162 |
| Length | 751,719 |
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Identifier: 13358144
GI number: 13358144
Start: 724218
End: 725831
Strand: Direct
Name: Not Available
Synonym: UU579
Alternate gene names: 13358144
Gene position: 724218-725831 (Clockwise)
Preceding gene: 13358143
Following gene: 18656942
Centisome position: 96.34
GC content: 23.54
Gene sequence:
>1614_bases ATGAAGATTAGTGTTAAAAAAACAAAGCAAATAGGTTTGTTTACATCTATTGCAATTATGATTAGTAGCGTTGTGGGAAT TGGTATTTTTTTTAAAAATGGATCTATTTTTCGGTTTAATAACTTTAATGAAATAGGAATTATTATTTCTTGAGTGGTGG CAAGTTTAATCGCCTTTTTTACAGCATTAAGTTTTGCATATATTACCTTTTCTAAAAAATCTGGTTCTGGAATAGCTGGT ATAATAGATGAATTAAAAGCTCCTAAATGTGCTCGTTTTATTTCTGTTTTGCAAACTTTTTTTTATAATGGAATACTGAT GCCTTCCATTTCCTTTTTCGCTGCAGAATCATTATTAATGACAATAATACCTAAAAATTCATCATCACCACAAATATATC AAATTTTTATTTTGGCTATCGGGTTGTTTTTATTTTTTTTGTTGCTTAATTTTATTTCATTTAAATTTAGTTCAATTTTA CAAAACATTGCAACAATTATTAAATTTATTCCTATTATTGCTATTGCTATTATTGGTATTACATATGGTATCAACAATGC ACAAAATTCATTGTTCAATCATAATAATCCTAAGCATGCGAATTTTAGTCTTTTAGGAATATTAGCTTCTCTTCCTTCGA TCTTATTCTCATTCGATTCTTTTTTAGGCATTTCATCATTACAACACAAAATTAAAAATGCTCAAAAAAATGTTCCAATT ACATTAATTGTTGGTATGTTTTTAGTCGCTATTGTTTATATTCTAATAACTATAGGGCAAGTTTTTGTAGGCGAAGGTTA TGCTTATGGTGTAATTAATAAAGTATTTAAAAATAATATCAATCTCCTAAAAATTATTACTATTATTGTTAATGTTTTTA TTACAATTTCAATTATTGGTGTTTTAAATTCATTTGTTATTTTTTCAATTCATAATGCTCAATATGTAATTAATGAAAAA ATTATTTTTTGATGATCTTGAATCCAACGTGTTCAATCAAAACATTTTAAAGAAGCACAAGGATTAATCAGTGTTTTATT CATTTTTTTTACATGAATAACCATTTTTATGATAATTAGTATTCCATTAAATACAGACGCGTATATTGATTTATTATCTA ATTATCCAATTGTTTTCTTTTTTGCAGTTTATGGTTTAATAATTGCTTTTGCCTTTTATAAAAAAGTTAAAACAAAGCAA AAAATAAAAGGCATTAAAAAACAATATTATACAAGTGATGTTACAAAACGTCCTAAATGATTTTTTAATTATCAAAATAG TAGTTTAAAAAATAAGAATATTCTTAATAAGGAATTAAAAATTGCTAATAATTGAATTTTAAGTGTTTGAATAATTGGCA TCACAAGTTGTTTATTTGTTTTTTTATACCAATTTTTATATGGATATACAATTTATGCTTGATTAGATCCTTATAATTTA AAACTATATACTTTTGGATTATTTTATGCAAATAATGTTAGTGTCATTCCATGAATCGTTAGTTTGTTATTTTTTGTTAT GCTTATATTTTTCATAGGATTTCCATTTTTAAATGATGCTATTTTAAATCTTAATCATAAAAAAGTAAACAAACAGCAAA AAGTTTTTGTTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TAATTTCCTATTGTATAATATAAAAATAAAATTTTAAATTTTTTAAAAAAGAGGTCGTTAAAATGCGTCCTCTTTTTTAA AAGAATGATAAGGTTGTATC
Downstream 100 bases:
>100_bases ATGATTTATTGATTTAATATTTATTAATGAGGTATAATTGAATATTATGATTAAAAAAATAATACTAGTTTGCGAAATGT GCATGAGTCGAAATTATCAA
Product: membrane lipoprotein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 537; Mature: 537
Protein sequence:
>537_residues MKISVKKTKQIGLFTSIAIMISSVVGIGIFFKNGSIFRFNNFNEIGIIISWVVASLIAFFTALSFAYITFSKKSGSGIAG IIDELKAPKCARFISVLQTFFYNGILMPSISFFAAESLLMTIIPKNSSSPQIYQIFILAIGLFLFFLLLNFISFKFSSIL QNIATIIKFIPIIAIAIIGITYGINNAQNSLFNHNNPKHANFSLLGILASLPSILFSFDSFLGISSLQHKIKNAQKNVPI TLIVGMFLVAIVYILITIGQVFVGEGYAYGVINKVFKNNINLLKIITIIVNVFITISIIGVLNSFVIFSIHNAQYVINEK IIFWWSWIQRVQSKHFKEAQGLISVLFIFFTWITIFMIISIPLNTDAYIDLLSNYPIVFFFAVYGLIIAFAFYKKVKTKQ KIKGIKKQYYTSDVTKRPKWFFNYQNSSLKNKNILNKELKIANNWILSVWIIGITSCLFVFLYQFLYGYTIYAWLDPYNL KLYTFGLFYANNVSVIPWIVSLLFFVMLIFFIGFPFLNDAILNLNHKKVNKQQKVFV
Sequences:
>Translated_537_residues MKISVKKTKQIGLFTSIAIMISSVVGIGIFFKNGSIFRFNNFNEIGIIIS*VVASLIAFFTALSFAYITFSKKSGSGIAG IIDELKAPKCARFISVLQTFFYNGILMPSISFFAAESLLMTIIPKNSSSPQIYQIFILAIGLFLFFLLLNFISFKFSSIL QNIATIIKFIPIIAIAIIGITYGINNAQNSLFNHNNPKHANFSLLGILASLPSILFSFDSFLGISSLQHKIKNAQKNVPI TLIVGMFLVAIVYILITIGQVFVGEGYAYGVINKVFKNNINLLKIITIIVNVFITISIIGVLNSFVIFSIHNAQYVINEK IIF**S*IQRVQSKHFKEAQGLISVLFIFFT*ITIFMIISIPLNTDAYIDLLSNYPIVFFFAVYGLIIAFAFYKKVKTKQ KIKGIKKQYYTSDVTKRPK*FFNYQNSSLKNKNILNKELKIANN*ILSV*IIGITSCLFVFLYQFLYGYTIYA*LDPYNL KLYTFGLFYANNVSVIP*IVSLLFFVMLIFFIGFPFLNDAILNLNHKKVNKQQKVFV >Mature_537_residues MKISVKKTKQIGLFTSIAIMISSVVGIGIFFKNGSIFRFNNFNEIGIIIS*VVASLIAFFTALSFAYITFSKKSGSGIAG IIDELKAPKCARFISVLQTFFYNGILMPSISFFAAESLLMTIIPKNSSSPQIYQIFILAIGLFLFFLLLNFISFKFSSIL QNIATIIKFIPIIAIAIIGITYGINNAQNSLFNHNNPKHANFSLLGILASLPSILFSFDSFLGISSLQHKIKNAQKNVPI TLIVGMFLVAIVYILITIGQVFVGEGYAYGVINKVFKNNINLLKIITIIVNVFITISIIGVLNSFVIFSIHNAQYVINEK IIF**S*IQRVQSKHFKEAQGLISVLFIFFT*ITIFMIISIPLNTDAYIDLLSNYPIVFFFAVYGLIIAFAFYKKVKTKQ KIKGIKKQYYTSDVTKRPK*FFNYQNSSLKNKNILNKELKIANN*ILSV*IIGITSCLFVFLYQFLYGYTIYA*LDPYNL KLYTFGLFYANNVSVIP*IVSLLFFVMLIFFIGFPFLNDAILNLNHKKVNKQQKVFV
Specific function: Exhibits an obligate exchange activity for serine, threonine and aromatic amino acids [H]
COG id: COG0531
COG function: function code E; Amino acid transporters
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the amino acid-polyamine-organocation (APC) superfamily. L-type amino acid transporter (LAT) (TC 2.A.3.8) family [H]
Homologues:
Organism=Homo sapiens, GI186910308, Length=259, Percent_Identity=23.5521235521236, Blast_Score=67, Evalue=6e-11, Organism=Homo sapiens, GI186910306, Length=259, Percent_Identity=23.5521235521236, Blast_Score=67, Evalue=6e-11, Organism=Homo sapiens, GI186910304, Length=259, Percent_Identity=23.5521235521236, Blast_Score=67, Evalue=6e-11,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR004841 - InterPro: IPR002293 [H]
Pfam domain/function: PF00324 AA_permease [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 59188; Mature: 59188
Theoretical pI: Translated: 10.45; Mature: 10.45
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 1.3 %Met (Translated Protein) 1.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 1.3 %Met (Mature Protein) 1.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKISVKKTKQIGLFTSIAIMISSVVGIGIFFKNGSIFRFNNFNEIGIIISVVASLIAFFT CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH ALSFAYITFSKKSGSGIAGIIDELKAPKCARFISVLQTFFYNGILMPSISFFAAESLLMT HHHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHHHHE IIPKNSSSPQIYQIFILAIGLFLFFLLLNFISFKFSSILQNIATIIKFIPIIAIAIIGIT EECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YGINNAQNSLFNHNNPKHANFSLLGILASLPSILFSFDSFLGISSLQHKIKNAQKNVPIT HCCCCHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH LIVGMFLVAIVYILITIGQVFVGEGYAYGVINKVFKNNINLLKIITIIVNVFITISIIGV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LNSFVIFSIHNAQYVINEKIIFSIQRVQSKHFKEAQGLISVLFIFFTITIFMIISIPLNT HHHHHEEEECCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC DAYIDLLSNYPIVFFFAVYGLIIAFAFYKKVKTKQKIKGIKKQYYTSDVTKRPKFFNYQN HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC SSLKNKNILNKELKIANNILSVIIGITSCLFVFLYQFLYGYTIYALDPYNLKLYTFGLFY CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCEEEEEEEEEE ANNVSVIPIVSLLFFVMLIFFIGFPFLNDAILNLNHKKVNKQQKVFV ECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MKISVKKTKQIGLFTSIAIMISSVVGIGIFFKNGSIFRFNNFNEIGIIISVVASLIAFFT CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH ALSFAYITFSKKSGSGIAGIIDELKAPKCARFISVLQTFFYNGILMPSISFFAAESLLMT HHHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHHHHE IIPKNSSSPQIYQIFILAIGLFLFFLLLNFISFKFSSILQNIATIIKFIPIIAIAIIGIT EECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YGINNAQNSLFNHNNPKHANFSLLGILASLPSILFSFDSFLGISSLQHKIKNAQKNVPIT HCCCCHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH LIVGMFLVAIVYILITIGQVFVGEGYAYGVINKVFKNNINLLKIITIIVNVFITISIIGV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LNSFVIFSIHNAQYVINEKIIFSIQRVQSKHFKEAQGLISVLFIFFTITIFMIISIPLNT HHHHHEEEECCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC DAYIDLLSNYPIVFFFAVYGLIIAFAFYKKVKTKQKIKGIKKQYYTSDVTKRPKFFNYQN HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC SSLKNKNILNKELKIANNILSVIIGITSCLFVFLYQFLYGYTIYALDPYNLKLYTFGLFY CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCEEEEEEEEEE ANNVSVIPIVSLLFFVMLIFFIGFPFLNDAILNLNHKKVNKQQKVFV ECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9384377 [H]