Definition Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970, complete genome.
Accession NC_002162
Length 751,719

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Identifier: 13358144

GI number: 13358144

Start: 724218

End: 725831

Strand: Direct

Name: Not Available

Synonym: UU579

Alternate gene names: 13358144

Gene position: 724218-725831 (Clockwise)

Preceding gene: 13358143

Following gene: 18656942

Centisome position: 96.34

GC content: 23.54

Gene sequence:

>1614_bases
ATGAAGATTAGTGTTAAAAAAACAAAGCAAATAGGTTTGTTTACATCTATTGCAATTATGATTAGTAGCGTTGTGGGAAT
TGGTATTTTTTTTAAAAATGGATCTATTTTTCGGTTTAATAACTTTAATGAAATAGGAATTATTATTTCTTGAGTGGTGG
CAAGTTTAATCGCCTTTTTTACAGCATTAAGTTTTGCATATATTACCTTTTCTAAAAAATCTGGTTCTGGAATAGCTGGT
ATAATAGATGAATTAAAAGCTCCTAAATGTGCTCGTTTTATTTCTGTTTTGCAAACTTTTTTTTATAATGGAATACTGAT
GCCTTCCATTTCCTTTTTCGCTGCAGAATCATTATTAATGACAATAATACCTAAAAATTCATCATCACCACAAATATATC
AAATTTTTATTTTGGCTATCGGGTTGTTTTTATTTTTTTTGTTGCTTAATTTTATTTCATTTAAATTTAGTTCAATTTTA
CAAAACATTGCAACAATTATTAAATTTATTCCTATTATTGCTATTGCTATTATTGGTATTACATATGGTATCAACAATGC
ACAAAATTCATTGTTCAATCATAATAATCCTAAGCATGCGAATTTTAGTCTTTTAGGAATATTAGCTTCTCTTCCTTCGA
TCTTATTCTCATTCGATTCTTTTTTAGGCATTTCATCATTACAACACAAAATTAAAAATGCTCAAAAAAATGTTCCAATT
ACATTAATTGTTGGTATGTTTTTAGTCGCTATTGTTTATATTCTAATAACTATAGGGCAAGTTTTTGTAGGCGAAGGTTA
TGCTTATGGTGTAATTAATAAAGTATTTAAAAATAATATCAATCTCCTAAAAATTATTACTATTATTGTTAATGTTTTTA
TTACAATTTCAATTATTGGTGTTTTAAATTCATTTGTTATTTTTTCAATTCATAATGCTCAATATGTAATTAATGAAAAA
ATTATTTTTTGATGATCTTGAATCCAACGTGTTCAATCAAAACATTTTAAAGAAGCACAAGGATTAATCAGTGTTTTATT
CATTTTTTTTACATGAATAACCATTTTTATGATAATTAGTATTCCATTAAATACAGACGCGTATATTGATTTATTATCTA
ATTATCCAATTGTTTTCTTTTTTGCAGTTTATGGTTTAATAATTGCTTTTGCCTTTTATAAAAAAGTTAAAACAAAGCAA
AAAATAAAAGGCATTAAAAAACAATATTATACAAGTGATGTTACAAAACGTCCTAAATGATTTTTTAATTATCAAAATAG
TAGTTTAAAAAATAAGAATATTCTTAATAAGGAATTAAAAATTGCTAATAATTGAATTTTAAGTGTTTGAATAATTGGCA
TCACAAGTTGTTTATTTGTTTTTTTATACCAATTTTTATATGGATATACAATTTATGCTTGATTAGATCCTTATAATTTA
AAACTATATACTTTTGGATTATTTTATGCAAATAATGTTAGTGTCATTCCATGAATCGTTAGTTTGTTATTTTTTGTTAT
GCTTATATTTTTCATAGGATTTCCATTTTTAAATGATGCTATTTTAAATCTTAATCATAAAAAAGTAAACAAACAGCAAA
AAGTTTTTGTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAATTTCCTATTGTATAATATAAAAATAAAATTTTAAATTTTTTAAAAAAGAGGTCGTTAAAATGCGTCCTCTTTTTTAA
AAGAATGATAAGGTTGTATC

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGATTTATTGATTTAATATTTATTAATGAGGTATAATTGAATATTATGATTAAAAAAATAATACTAGTTTGCGAAATGT
GCATGAGTCGAAATTATCAA

Product: membrane lipoprotein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 537; Mature: 537

Protein sequence:

>537_residues
MKISVKKTKQIGLFTSIAIMISSVVGIGIFFKNGSIFRFNNFNEIGIIISWVVASLIAFFTALSFAYITFSKKSGSGIAG
IIDELKAPKCARFISVLQTFFYNGILMPSISFFAAESLLMTIIPKNSSSPQIYQIFILAIGLFLFFLLLNFISFKFSSIL
QNIATIIKFIPIIAIAIIGITYGINNAQNSLFNHNNPKHANFSLLGILASLPSILFSFDSFLGISSLQHKIKNAQKNVPI
TLIVGMFLVAIVYILITIGQVFVGEGYAYGVINKVFKNNINLLKIITIIVNVFITISIIGVLNSFVIFSIHNAQYVINEK
IIFWWSWIQRVQSKHFKEAQGLISVLFIFFTWITIFMIISIPLNTDAYIDLLSNYPIVFFFAVYGLIIAFAFYKKVKTKQ
KIKGIKKQYYTSDVTKRPKWFFNYQNSSLKNKNILNKELKIANNWILSVWIIGITSCLFVFLYQFLYGYTIYAWLDPYNL
KLYTFGLFYANNVSVIPWIVSLLFFVMLIFFIGFPFLNDAILNLNHKKVNKQQKVFV

Sequences:

>Translated_537_residues
MKISVKKTKQIGLFTSIAIMISSVVGIGIFFKNGSIFRFNNFNEIGIIIS*VVASLIAFFTALSFAYITFSKKSGSGIAG
IIDELKAPKCARFISVLQTFFYNGILMPSISFFAAESLLMTIIPKNSSSPQIYQIFILAIGLFLFFLLLNFISFKFSSIL
QNIATIIKFIPIIAIAIIGITYGINNAQNSLFNHNNPKHANFSLLGILASLPSILFSFDSFLGISSLQHKIKNAQKNVPI
TLIVGMFLVAIVYILITIGQVFVGEGYAYGVINKVFKNNINLLKIITIIVNVFITISIIGVLNSFVIFSIHNAQYVINEK
IIF**S*IQRVQSKHFKEAQGLISVLFIFFT*ITIFMIISIPLNTDAYIDLLSNYPIVFFFAVYGLIIAFAFYKKVKTKQ
KIKGIKKQYYTSDVTKRPK*FFNYQNSSLKNKNILNKELKIANN*ILSV*IIGITSCLFVFLYQFLYGYTIYA*LDPYNL
KLYTFGLFYANNVSVIP*IVSLLFFVMLIFFIGFPFLNDAILNLNHKKVNKQQKVFV
>Mature_537_residues
MKISVKKTKQIGLFTSIAIMISSVVGIGIFFKNGSIFRFNNFNEIGIIIS*VVASLIAFFTALSFAYITFSKKSGSGIAG
IIDELKAPKCARFISVLQTFFYNGILMPSISFFAAESLLMTIIPKNSSSPQIYQIFILAIGLFLFFLLLNFISFKFSSIL
QNIATIIKFIPIIAIAIIGITYGINNAQNSLFNHNNPKHANFSLLGILASLPSILFSFDSFLGISSLQHKIKNAQKNVPI
TLIVGMFLVAIVYILITIGQVFVGEGYAYGVINKVFKNNINLLKIITIIVNVFITISIIGVLNSFVIFSIHNAQYVINEK
IIF**S*IQRVQSKHFKEAQGLISVLFIFFT*ITIFMIISIPLNTDAYIDLLSNYPIVFFFAVYGLIIAFAFYKKVKTKQ
KIKGIKKQYYTSDVTKRPK*FFNYQNSSLKNKNILNKELKIANN*ILSV*IIGITSCLFVFLYQFLYGYTIYA*LDPYNL
KLYTFGLFYANNVSVIP*IVSLLFFVMLIFFIGFPFLNDAILNLNHKKVNKQQKVFV

Specific function: Exhibits an obligate exchange activity for serine, threonine and aromatic amino acids [H]

COG id: COG0531

COG function: function code E; Amino acid transporters

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the amino acid-polyamine-organocation (APC) superfamily. L-type amino acid transporter (LAT) (TC 2.A.3.8) family [H]

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI186910308, Length=259, Percent_Identity=23.5521235521236, Blast_Score=67, Evalue=6e-11,
Organism=Homo sapiens, GI186910306, Length=259, Percent_Identity=23.5521235521236, Blast_Score=67, Evalue=6e-11,
Organism=Homo sapiens, GI186910304, Length=259, Percent_Identity=23.5521235521236, Blast_Score=67, Evalue=6e-11,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004841
- InterPro:   IPR002293 [H]

Pfam domain/function: PF00324 AA_permease [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 59188; Mature: 59188

Theoretical pI: Translated: 10.45; Mature: 10.45

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
1.3 %Met     (Translated Protein)
1.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
1.3 %Met     (Mature Protein)
1.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKISVKKTKQIGLFTSIAIMISSVVGIGIFFKNGSIFRFNNFNEIGIIISVVASLIAFFT
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALSFAYITFSKKSGSGIAGIIDELKAPKCARFISVLQTFFYNGILMPSISFFAAESLLMT
HHHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHHHHE
IIPKNSSSPQIYQIFILAIGLFLFFLLLNFISFKFSSILQNIATIIKFIPIIAIAIIGIT
EECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YGINNAQNSLFNHNNPKHANFSLLGILASLPSILFSFDSFLGISSLQHKIKNAQKNVPIT
HCCCCHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH
LIVGMFLVAIVYILITIGQVFVGEGYAYGVINKVFKNNINLLKIITIIVNVFITISIIGV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNSFVIFSIHNAQYVINEKIIFSIQRVQSKHFKEAQGLISVLFIFFTITIFMIISIPLNT
HHHHHEEEECCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
DAYIDLLSNYPIVFFFAVYGLIIAFAFYKKVKTKQKIKGIKKQYYTSDVTKRPKFFNYQN
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
SSLKNKNILNKELKIANNILSVIIGITSCLFVFLYQFLYGYTIYALDPYNLKLYTFGLFY
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCEEEEEEEEEE
ANNVSVIPIVSLLFFVMLIFFIGFPFLNDAILNLNHKKVNKQQKVFV
ECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKISVKKTKQIGLFTSIAIMISSVVGIGIFFKNGSIFRFNNFNEIGIIISVVASLIAFFT
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALSFAYITFSKKSGSGIAGIIDELKAPKCARFISVLQTFFYNGILMPSISFFAAESLLMT
HHHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHHHHE
IIPKNSSSPQIYQIFILAIGLFLFFLLLNFISFKFSSILQNIATIIKFIPIIAIAIIGIT
EECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YGINNAQNSLFNHNNPKHANFSLLGILASLPSILFSFDSFLGISSLQHKIKNAQKNVPIT
HCCCCHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH
LIVGMFLVAIVYILITIGQVFVGEGYAYGVINKVFKNNINLLKIITIIVNVFITISIIGV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNSFVIFSIHNAQYVINEKIIFSIQRVQSKHFKEAQGLISVLFIFFTITIFMIISIPLNT
HHHHHEEEECCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
DAYIDLLSNYPIVFFFAVYGLIIAFAFYKKVKTKQKIKGIKKQYYTSDVTKRPKFFNYQN
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
SSLKNKNILNKELKIANNILSVIIGITSCLFVFLYQFLYGYTIYALDPYNLKLYTFGLFY
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCEEEEEEEEEE
ANNVSVIPIVSLLFFVMLIFFIGFPFLNDAILNLNHKKVNKQQKVFV
ECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]