| Definition | Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002162 |
| Length | 751,719 |
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Identifier: 13358018
GI number: 13358018
Start: 515969
End: 519367
Strand: Direct
Name: Not Available
Synonym: UU455
Alternate gene names: NA
Gene position: 515969-519367 (Clockwise)
Preceding gene: 13358010
Following gene: 13358019
Centisome position: 68.64
GC content: 22.36
Gene sequence:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TGAATAAGCAACTAGTTCCATCCCTTTTAGCATTTGATAAAAAATATCCTTATGAACAATTAAAGATCTTTAAAAAGCAT CATCTTCAAACAATACATTA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1132; Mature: 1132
Protein sequence:
>1132_residues MEFDMKFKKILLTSTLSVLGVISIASLATNCSQTKTKINQYKITINKLDSLNLTSNLTTKQALKDVLFSKEGQNEFLLSN VKKVVYDWAKNNNDPKLAHDVSEYNTQLDEQLKRIKENVKKSYPNDWQSVLQSELYDTEGGSEKSWKEAKLIDQAYKSIT SSIFDDNDNWISVLNDQNQLIDAYSNDATKLLENESTFKSTKIGDRNKIVAKTNNFLQKGYANLFNFLIDDYIKYNLPLS FANIEFKYDDLKNQNIYNKDFFTKIPTSGTSPNFPWFDPKPTDNKSTNTTTNYLEVAKLLKENKYLDSKDDTNNIDKKFN NNNDINKYLSLNDFITQDNTNLTLSVGLLAKFLSLFGNENFGIYQLDNLDENNILNNFISKNQSNANTNNVDLFYPLVKK DKTAFLNDFKDVKAIRQINDLKNGYTLLRNENSVDLWGINNFKRLQQAAKIGLNALLTELKNDFLYNGALYLNSRKSNSV KKQGYDIKAKIKDYFNNNKERLLALYIATHQNDSDFLFKSNLKNDSKVFAFDQRTINIIKENNEIHLLNYYDNLIDKLND KLIKFNKKTFIIPSVDSLYDNGINTPIYLIKDQNQQISLFQTLKIKLVGNKNLIDENQKLSTMINDYVENFDIKKHLVAN NKNSQSIVFDDYVINKVFSKGINSVFANIIKQEQIKKSVAKFFEFNDFNFKNNFLENQELLAAFNQIIKNTSVLETTQTN NFSNFDNLKKVYEQALKLWNDNYTKNGPFNQLSINYQKYQALFETLAIINYLLDFKDGKPTYQNLINYLLKKTANHQPLF IGWKALNDVTKIPNFGKDSKEDFSFKKYQINLYNGLDLYQLKKADVYEIDQNSQEVKFKKTFIDALTYTNDKNYWNSTVN KDGSVYNNFIGLIDQNNQKDKLGKAFEKIDLFDKLVYANNPSKQFKGALYGYGSRELLIKTLDGFVSYHDYQTLAQLLYD LNFNAEANAEFKTILDNQKQIIPGNQKDSKIKNIDLATNEIKTIMIKGINKIPQTAFQRLDLDLVYNKLDKNATPLVNKE DNANLKYILLVSQFNANDVQNLVINNQLNQSATGYLGLSKSQFYNLLFDLALNDQTLKIEAFSQIENEHKIKVYDKRLAN NSNLKGWIINNL
Sequences:
>Translated_1132_residues MEFDMKFKKILLTSTLSVLGVISIASLATNCSQTKTKINQYKITINKLDSLNLTSNLTTKQALKDVLFSKEGQNEFLLSN VKKVVYD*AKNNNDPKLAHDVSEYNTQLDEQLKRIKENVKKSYPND*QSVLQSELYDTEGGSEKS*KEAKLIDQAYKSIT SSIFDDNDN*ISVLNDQNQLIDAYSNDATKLLENESTFKSTKIGDRNKIVAKTNNFLQKGYANLFNFLIDDYIKYNLPLS FANIEFKYDDLKNQNIYNKDFFTKIPTSGTSPNFP*FDPKPTDNKSTNTTTNYLEVAKLLKENKYLDSKDDTNNIDKKFN NNNDINKYLSLNDFITQDNTNLTLSVGLLAKFLSLFGNENFGIYQLDNLDENNILNNFISKNQSNANTNNVDLFYPLVKK DKTAFLNDFKDVKAIRQINDLKNGYTLLRNENSVDL*GINNFKRLQQAAKIGLNALLTELKNDFLYNGALYLNSRKSNSV KKQGYDIKAKIKDYFNNNKERLLALYIATHQNDSDFLFKSNLKNDSKVFAFDQRTINIIKENNEIHLLNYYDNLIDKLND KLIKFNKKTFIIPSVDSLYDNGINTPIYLIKDQNQQISLFQTLKIKLVGNKNLIDENQKLSTMINDYVENFDIKKHLVAN NKNSQSIVFDDYVINKVFSKGINSVFANIIKQEQIKKSVAKFFEFNDFNFKNNFLENQELLAAFNQIIKNTSVLETTQTN NFSNFDNLKKVYEQALKL*NDNYTKNGPFNQLSINYQKYQALFETLAIINYLLDFKDGKPTYQNLINYLLKKTANHQPLF IG*KALNDVTKIPNFGKDSKEDFSFKKYQINLYNGLDLYQLKKADVYEIDQNSQEVKFKKTFIDALTYTNDKNY*NSTVN KDGSVYNNFIGLIDQNNQKDKLGKAFEKIDLFDKLVYANNPSKQFKGALYGYGSRELLIKTLDGFVSYHDYQTLAQLLYD LNFNAEANAEFKTILDNQKQIIPGNQKDSKIKNIDLATNEIKTIMIKGINKIPQTAFQRLDLDLVYNKLDKNATPLVNKE DNANLKYILLVSQFNANDVQNLVINNQLNQSATGYLGLSKSQFYNLLFDLALNDQTLKIEAFSQIENEHKIKVYDKRLAN NSNLKG*IINNL >Mature_1132_residues MEFDMKFKKILLTSTLSVLGVISIASLATNCSQTKTKINQYKITINKLDSLNLTSNLTTKQALKDVLFSKEGQNEFLLSN VKKVVYD*AKNNNDPKLAHDVSEYNTQLDEQLKRIKENVKKSYPND*QSVLQSELYDTEGGSEKS*KEAKLIDQAYKSIT SSIFDDNDN*ISVLNDQNQLIDAYSNDATKLLENESTFKSTKIGDRNKIVAKTNNFLQKGYANLFNFLIDDYIKYNLPLS FANIEFKYDDLKNQNIYNKDFFTKIPTSGTSPNFP*FDPKPTDNKSTNTTTNYLEVAKLLKENKYLDSKDDTNNIDKKFN NNNDINKYLSLNDFITQDNTNLTLSVGLLAKFLSLFGNENFGIYQLDNLDENNILNNFISKNQSNANTNNVDLFYPLVKK DKTAFLNDFKDVKAIRQINDLKNGYTLLRNENSVDL*GINNFKRLQQAAKIGLNALLTELKNDFLYNGALYLNSRKSNSV KKQGYDIKAKIKDYFNNNKERLLALYIATHQNDSDFLFKSNLKNDSKVFAFDQRTINIIKENNEIHLLNYYDNLIDKLND KLIKFNKKTFIIPSVDSLYDNGINTPIYLIKDQNQQISLFQTLKIKLVGNKNLIDENQKLSTMINDYVENFDIKKHLVAN NKNSQSIVFDDYVINKVFSKGINSVFANIIKQEQIKKSVAKFFEFNDFNFKNNFLENQELLAAFNQIIKNTSVLETTQTN NFSNFDNLKKVYEQALKL*NDNYTKNGPFNQLSINYQKYQALFETLAIINYLLDFKDGKPTYQNLINYLLKKTANHQPLF IG*KALNDVTKIPNFGKDSKEDFSFKKYQINLYNGLDLYQLKKADVYEIDQNSQEVKFKKTFIDALTYTNDKNY*NSTVN KDGSVYNNFIGLIDQNNQKDKLGKAFEKIDLFDKLVYANNPSKQFKGALYGYGSRELLIKTLDGFVSYHDYQTLAQLLYD LNFNAEANAEFKTILDNQKQIIPGNQKDSKIKNIDLATNEIKTIMIKGINKIPQTAFQRLDLDLVYNKLDKNATPLVNKE DNANLKYILLVSQFNANDVQNLVINNQLNQSATGYLGLSKSQFYNLLFDLALNDQTLKIEAFSQIENEHKIKVYDKRLAN NSNLKG*IINNL
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 128876; Mature: 128876
Theoretical pI: Translated: 9.25; Mature: 9.25
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 0.4 %Met (Translated Protein) 0.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 0.4 %Met (Mature Protein) 0.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MEFDMKFKKILLTSTLSVLGVISIASLATNCSQTKTKINQYKITINKLDSLNLTSNLTTK CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHEEEEEEEECCCCCCCCCCCHHH QALKDVLFSKEGQNEFLLSNVKKVVYDAKNNNDPKLAHDVSEYNTQLDEQLKRIKENVKK HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SYPNDQSVLQSELYDTEGGSEKSKEAKLIDQAYKSITSSIFDDNDNISVLNDQNQLIDAY CCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCHHHHHHH SNDATKLLENESTFKSTKIGDRNKIVAKTNNFLQKGYANLFNFLIDDYIKYNLPLSFANI CCHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEE EFKYDDLKNQNIYNKDFFTKIPTSGTSPNFPFDPKPTDNKSTNTTTNYLEVAKLLKENKY EEEECCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCC LDSKDDTNNIDKKFNNNNDINKYLSLNDFITQDNTNLTLSVGLLAKFLSLFGNENFGIYQ CCCCCCCCCHHHHCCCCCCHHHHEEHHHHEECCCCCEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCEEE LDNLDENNILNNFISKNQSNANTNNVDLFYPLVKKDKTAFLNDFKDVKAIRQINDLKNGY ECCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEEHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCE TLLRNENSVDLGINNFKRLQQAAKIGLNALLTELKNDFLYNGALYLNSRKSNSVKKQGYD EEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCEEEEECCCCCCHHHCCCC IKAKIKDYFNNNKERLLALYIATHQNDSDFLFKSNLKNDSKVFAFDQRTINIIKENNEIH EEEHHHHHHCCCCCEEEEEEEEECCCCCCEEEECCCCCCCEEEEECCCEEEEEECCCCEE LLNYYDNLIDKLNDKLIKFNKKTFIIPSVDSLYDNGINTPIYLIKDQNQQISLFQTLKIK EEHHHHHHHHHHHHHHEEECCCEEEECCHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCEEEEEEEEEEE LVGNKNLIDENQKLSTMINDYVENFDIKKHLVANNKNSQSIVFDDYVINKVFSKGINSVF EECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH ANIIKQEQIKKSVAKFFEFNDFNFKNNFLENQELLAAFNQIIKNTSVLETTQTNNFSNFD HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCHH NLKKVYEQALKLNDNYTKNGPFNQLSINYQKYQALFETLAIINYLLDFKDGKPTYQNLIN HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH YLLKKTANHQPLFIGKALNDVTKIPNFGKDSKEDFSFKKYQINLYNGLDLYQLKKADVYE HHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCEEECCCCEEE IDQNSQEVKFKKTFIDALTYTNDKNYNSTVNKDGSVYNNFIGLIDQNNQKDKLGKAFEKI ECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHH DLFDKLVYANNPSKQFKGALYGYGSRELLIKTLDGFVSYHDYQTLAQLLYDLNFNAEANA HHHHHHHHCCCCHHHHCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC EFKTILDNQKQIIPGNQKDSKIKNIDLATNEIKTIMIKGINKIPQTAFQRLDLDLVYNKL HHHHHHCCCCEECCCCCCCCCCCEEECCHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DKNATPLVNKEDNANLKYILLVSQFNANDVQNLVINNQLNQSATGYLGLSKSQFYNLLFD CCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHH LALNDQTLKIEAFSQIENEHKIKVYDKRLANNSNLKGIINNL HEECCCEEEEEEHHHCCCCCEEEEEEHHHCCCCCCCHHHCCC >Mature Secondary Structure MEFDMKFKKILLTSTLSVLGVISIASLATNCSQTKTKINQYKITINKLDSLNLTSNLTTK CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHEEEEEEEECCCCCCCCCCCHHH QALKDVLFSKEGQNEFLLSNVKKVVYDAKNNNDPKLAHDVSEYNTQLDEQLKRIKENVKK HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SYPNDQSVLQSELYDTEGGSEKSKEAKLIDQAYKSITSSIFDDNDNISVLNDQNQLIDAY CCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCHHHHHHH SNDATKLLENESTFKSTKIGDRNKIVAKTNNFLQKGYANLFNFLIDDYIKYNLPLSFANI CCHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEE EFKYDDLKNQNIYNKDFFTKIPTSGTSPNFPFDPKPTDNKSTNTTTNYLEVAKLLKENKY EEEECCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCC LDSKDDTNNIDKKFNNNNDINKYLSLNDFITQDNTNLTLSVGLLAKFLSLFGNENFGIYQ CCCCCCCCCHHHHCCCCCCHHHHEEHHHHEECCCCCEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCEEE LDNLDENNILNNFISKNQSNANTNNVDLFYPLVKKDKTAFLNDFKDVKAIRQINDLKNGY ECCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEEHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCE TLLRNENSVDLGINNFKRLQQAAKIGLNALLTELKNDFLYNGALYLNSRKSNSVKKQGYD EEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCEEEEECCCCCCHHHCCCC IKAKIKDYFNNNKERLLALYIATHQNDSDFLFKSNLKNDSKVFAFDQRTINIIKENNEIH EEEHHHHHHCCCCCEEEEEEEEECCCCCCEEEECCCCCCCEEEEECCCEEEEEECCCCEE LLNYYDNLIDKLNDKLIKFNKKTFIIPSVDSLYDNGINTPIYLIKDQNQQISLFQTLKIK EEHHHHHHHHHHHHHHEEECCCEEEECCHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCEEEEEEEEEEE LVGNKNLIDENQKLSTMINDYVENFDIKKHLVANNKNSQSIVFDDYVINKVFSKGINSVF EECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH ANIIKQEQIKKSVAKFFEFNDFNFKNNFLENQELLAAFNQIIKNTSVLETTQTNNFSNFD HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCHH NLKKVYEQALKLNDNYTKNGPFNQLSINYQKYQALFETLAIINYLLDFKDGKPTYQNLIN HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH YLLKKTANHQPLFIGKALNDVTKIPNFGKDSKEDFSFKKYQINLYNGLDLYQLKKADVYE HHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCEEECCCCEEE IDQNSQEVKFKKTFIDALTYTNDKNYNSTVNKDGSVYNNFIGLIDQNNQKDKLGKAFEKI ECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHH DLFDKLVYANNPSKQFKGALYGYGSRELLIKTLDGFVSYHDYQTLAQLLYDLNFNAEANA HHHHHHHHCCCCHHHHCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC EFKTILDNQKQIIPGNQKDSKIKNIDLATNEIKTIMIKGINKIPQTAFQRLDLDLVYNKL HHHHHHCCCCEECCCCCCCCCCCEEECCHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DKNATPLVNKEDNANLKYILLVSQFNANDVQNLVINNQLNQSATGYLGLSKSQFYNLLFD CCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHH LALNDQTLKIEAFSQIENEHKIKVYDKRLANNSNLKGIINNL HEECCCEEEEEEHHHCCCCCEEEEEEHHHCCCCCCCHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA