Definition | Borrelia hermsii DAH chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_010673 |
Length | 922,307 |
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The map label for this gene is 187918446
Identifier: 187918446
GI number: 187918446
Start: 610688
End: 612031
Strand: Direct
Name: 187918446
Synonym: BH0584
Alternate gene names: NA
Gene position: 610688-612031 (Clockwise)
Preceding gene: 187918444
Following gene: 187918447
Centisome position: 66.21
GC content: 27.75
Gene sequence:
>1344_bases ATGTATTCATTAAGTAAATTCAAGAAAAGCAGTGTGTATCAAGATATTTTAAATATTGCAATCCCAACAACCATTGAATT CTTTTTATTTAATGTTGTTGCATTTACAGATAATATTATGGTGTCTTATCTTGGCGATTATCCTGTTGTTGGGGTTTCTC TTGCAAATAAATTTTTCGAACTCTTTAGTACTATTGCTTTTGCCGTAATGGGAGCTTATAATATATTGGCAACAAGGCAA TATGCCCAAGGTAATATTGCTGGTTTTAAAAATACATTTTTTATTAGCATTTTAATTCTTCTATTTTTTTCCTTTTTATT TATAGTAATTTCATTATTTTATTCATATTTTTTTCTTGGATTATTATCTGATGACTTATTAGCTATTTCTTATGGAGTAT CTTATCTTAATATTGCTGTTTATTCTTTTATATTTGCAGTTGTTAAGGGAATTATTGCTAATTCACTAAAAGTTGTTAAA ATAACTAAAATTCAAATTGCTACTTCTGTTATTTCAGTTATTTTGAATGTGGTTTTTAACTATTTATTTATTTTTGTGCT TAATATGGGAGTAGTTGGTGCTGCTATTGCAACTACGTTGGTTCGCCTGATTGAGCTTATTTTTTATCTTATTTATACTG TTTTTAATACAAATTCACATTTTTATCTTAAGCTTGAAAATTTAAAAATCAATCCTGTGATATTTTCTGAGTTAATTAAG GTTTTTGTTCCAATTTTTTTAAATGATTTTATTTGGTATTTGGGATATTTTGGTTTAATTGCGATCTTTTCAAGAATTGA TACGGCTAAGTATGCGGCTTATAGTATAACTTTTTCTATTTATTTTATTGGATTTAATATAATTCATGCTTTTTGCTTTG CTGTTAATATTGTGATGGGACATGAGATGAATAATGATAAAGAAGAGATAATGTCTGTTGCGATATATTTGAGCAAGATA GGTTTTGTTTTGGCTGTTTTGACTTCTTTCATAATGTTTGCTTTGTCATTTATAGCCCCCCATATTTTCTATAAATTGGA GTATGCAGATCTTATGGGAGTTATGCTAAGATATTATTCTATTTCAGTATTTTTTACATCACTTGCGTTTCAATATTTAT TTGGGTTTTTCCGTGCAGGTGCATCTCCAAATTTTGGAGCTATTATGGAAGGTTCTGTAACTTTTATTTATACAATTCCT ATTGCATACTTTTTAGCAAAGTATACGCAGACCCCATTTGAACTTATTGTCTTTATTCCAACTCTTGAAGATGTAATTAA GTTGGGTATTTCTCTTCCTTATTTTTATAGTACTAAGTGGATTAAGTCTATTAAAACAGGTTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases GAATTCCCTCTATTTTTCTATAGTATGTTTGTTTAAACTCGAATTCGTTTGTTTTTTTGACAATTTGAAAATTTGCTGTT TTTGTATTTAGGGGGAGGTT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTATTTTGTTATAATACTGATGCTGTGTATTTAAATGATATAAGAGGTAAAAATTTTTTGATTATGGGCTTGGGGCTTCA TGGAGGAGGTCTTGCTGCTG
Product: Na+ driven multidrug efflux pump
Products: NA
Alternate protein names: Na+ Driven Multidrug Efflux Pump; Na+-Driven Multidrug Efflux Pump; Mate Efflux Family Protein; Adhesin; MatE Efflux Family Protein; Drug/Sodium Antiporter; MOP/MATE Family Multidrug-Resistance Efflux Pump; Cation Efflux Pump; MOP/MATE Superfamily Multidrug-Resistance Efflux Pump NorM; Multi Antimicrobial Extrusion Protein MatE; MATE Family Multidrug Efflux Pumps; Multidrug Efflux Pump
Number of amino acids: Translated: 447; Mature: 447
Protein sequence:
>447_residues MYSLSKFKKSSVYQDILNIAIPTTIEFFLFNVVAFTDNIMVSYLGDYPVVGVSLANKFFELFSTIAFAVMGAYNILATRQ YAQGNIAGFKNTFFISILILLFFSFLFIVISLFYSYFFLGLLSDDLLAISYGVSYLNIAVYSFIFAVVKGIIANSLKVVK ITKIQIATSVISVILNVVFNYLFIFVLNMGVVGAAIATTLVRLIELIFYLIYTVFNTNSHFYLKLENLKINPVIFSELIK VFVPIFLNDFIWYLGYFGLIAIFSRIDTAKYAAYSITFSIYFIGFNIIHAFCFAVNIVMGHEMNNDKEEIMSVAIYLSKI GFVLAVLTSFIMFALSFIAPHIFYKLEYADLMGVMLRYYSISVFFTSLAFQYLFGFFRAGASPNFGAIMEGSVTFIYTIP IAYFLAKYTQTPFELIVFIPTLEDVIKLGISLPYFYSTKWIKSIKTG
Sequences:
>Translated_447_residues MYSLSKFKKSSVYQDILNIAIPTTIEFFLFNVVAFTDNIMVSYLGDYPVVGVSLANKFFELFSTIAFAVMGAYNILATRQ YAQGNIAGFKNTFFISILILLFFSFLFIVISLFYSYFFLGLLSDDLLAISYGVSYLNIAVYSFIFAVVKGIIANSLKVVK ITKIQIATSVISVILNVVFNYLFIFVLNMGVVGAAIATTLVRLIELIFYLIYTVFNTNSHFYLKLENLKINPVIFSELIK VFVPIFLNDFIWYLGYFGLIAIFSRIDTAKYAAYSITFSIYFIGFNIIHAFCFAVNIVMGHEMNNDKEEIMSVAIYLSKI GFVLAVLTSFIMFALSFIAPHIFYKLEYADLMGVMLRYYSISVFFTSLAFQYLFGFFRAGASPNFGAIMEGSVTFIYTIP IAYFLAKYTQTPFELIVFIPTLEDVIKLGISLPYFYSTKWIKSIKTG >Mature_447_residues MYSLSKFKKSSVYQDILNIAIPTTIEFFLFNVVAFTDNIMVSYLGDYPVVGVSLANKFFELFSTIAFAVMGAYNILATRQ YAQGNIAGFKNTFFISILILLFFSFLFIVISLFYSYFFLGLLSDDLLAISYGVSYLNIAVYSFIFAVVKGIIANSLKVVK ITKIQIATSVISVILNVVFNYLFIFVLNMGVVGAAIATTLVRLIELIFYLIYTVFNTNSHFYLKLENLKINPVIFSELIK VFVPIFLNDFIWYLGYFGLIAIFSRIDTAKYAAYSITFSIYFIGFNIIHAFCFAVNIVMGHEMNNDKEEIMSVAIYLSKI GFVLAVLTSFIMFALSFIAPHIFYKLEYADLMGVMLRYYSISVFFTSLAFQYLFGFFRAGASPNFGAIMEGSVTFIYTIP IAYFLAKYTQTPFELIVFIPTLEDVIKLGISLPYFYSTKWIKSIKTG
Specific function: Unknown
COG id: COG0534
COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 50770; Mature: 50770
Theoretical pI: Translated: 8.99; Mature: 8.99
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 2.5 %Met (Translated Protein) 2.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 2.5 %Met (Mature Protein) 2.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MYSLSKFKKSSVYQDILNIAIPTTIEFFLFNVVAFTDNIMVSYLGDYPVVGVSLANKFFE CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH LFSTIAFAVMGAYNILATRQYAQGNIAGFKNTFFISILILLFFSFLFIVISLFYSYFFLG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLSDDLLAISYGVSYLNIAVYSFIFAVVKGIIANSLKVVKITKIQIATSVISVILNVVFN HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YLFIFVLNMGVVGAAIATTLVRLIELIFYLIYTVFNTNSHFYLKLENLKINPVIFSELIK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECEEECHHHHHHHHH VFVPIFLNDFIWYLGYFGLIAIFSRIDTAKYAAYSITFSIYFIGFNIIHAFCFAVNIVMG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC HEMNNDKEEIMSVAIYLSKIGFVLAVLTSFIMFALSFIAPHIFYKLEYADLMGVMLRYYS CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISVFFTSLAFQYLFGFFRAGASPNFGAIMEGSVTFIYTIPIAYFLAKYTQTPFELIVFIP HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCHHEEEECC TLEDVIKLGISLPYFYSTKWIKSIKTG CHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MYSLSKFKKSSVYQDILNIAIPTTIEFFLFNVVAFTDNIMVSYLGDYPVVGVSLANKFFE CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH LFSTIAFAVMGAYNILATRQYAQGNIAGFKNTFFISILILLFFSFLFIVISLFYSYFFLG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLSDDLLAISYGVSYLNIAVYSFIFAVVKGIIANSLKVVKITKIQIATSVISVILNVVFN HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YLFIFVLNMGVVGAAIATTLVRLIELIFYLIYTVFNTNSHFYLKLENLKINPVIFSELIK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECEEECHHHHHHHHH VFVPIFLNDFIWYLGYFGLIAIFSRIDTAKYAAYSITFSIYFIGFNIIHAFCFAVNIVMG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC HEMNNDKEEIMSVAIYLSKIGFVLAVLTSFIMFALSFIAPHIFYKLEYADLMGVMLRYYS CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISVFFTSLAFQYLFGFFRAGASPNFGAIMEGSVTFIYTIPIAYFLAKYTQTPFELIVFIP HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCHHEEEECC TLEDVIKLGISLPYFYSTKWIKSIKTG CHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA