| Definition | Shewanella pealeana ATCC 700345 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009901 |
| Length | 5,174,581 |
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The map label for this gene is 157963223
Identifier: 157963223
GI number: 157963223
Start: 4164434
End: 4168030
Strand: Direct
Name: 157963223
Synonym: Spea_3409
Alternate gene names: NA
Gene position: 4164434-4168030 (Clockwise)
Preceding gene: 157963221
Following gene: 157963226
Centisome position: 80.48
GC content: 45.7
Gene sequence:
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Downstream 100 bases:
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Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1198; Mature: 1198
Protein sequence:
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Sequences:
>Translated_1198_residues MDAFSQLQVIEFNRHDSASIEQALKAYQAQLEAHQAFDRGGLFNLMFMDNSSGTREHLQLDMLQDQQLAMAALSLNPDGG HLSSYVVSDERLLYLSETLLFALALEHESLTPQLRKTAQAMVNYARFENDTSEMWLDETRVFGAEPLYMMAAKDANDATY LAQFFIPYWDGDHAVGYGDMLLSLLRKHGWCEAMMNAFIWCDNHSFRFAFYGSDWEQPAPRYQPLGDYLKANPDKYPRFI ELVKQRFHAQPALVYSQHDSLEEQKPILNLYITLIAECCGLDSEGMSAELAEHFIHDSLENEAMDLQNLLKHELNGKLSC YAGSIAQQRKQRIERAERKEARDKYLGGLKMVSEFMLSLENSHALLSYISTGENPEILDDIECFNIIPHSEKHALTFFEA IHESCWDMDDFDHVRDNFHEVMEHLAKDLLQDNDEDMSEAAINGFISRVNARADTHCNDTEQASANTQPASQVRDAQTML RFVDIFYRFFGQQAFNDEMCDLFTGESEYQAIISVEQYYARFMPTDATPKLGSDVSRTEQKALESLLDEFIDMGYNQISA EMLKQTDELFANRACLDCQDWPEDELGIDALCAYLLLQDKQQNHNDDYTQALRAKLNGVFERALNLMLENANILGDGPFT EKGLNDVEQAQIKAYFTDTDPELNQQQMIALLNQHLFSQDICRQAFLYFPKISPVQKSYSFLDDHDDDYQRVVLICLWLK QLDIPEAINAERIWQLLITMAPIRVVHVIAKAFSEHSRKFKCDSPLDEINFFDMLNSHGIDKAFTLTYQVEQFSTSTSRT GDYLNLVELIGELVDEDSAIIDQSMLAAARRSDAKALLRGLDYSYQPIKLDFHKHVAMRFPSMPFALDNELKQCLSDFIK LNHNSWEEVIESKFTDYVSFSGFVTDAGELPKKLRLPLTLHPNADLSQTRRNDRMDWICCEILLQVGDELQVLVADKDTV REGNLYLGGEVLILNDKVDAQSVIDAVKNLPSPEERRNEINQNLWAYLQGELDYAEFAPQFNQYVSYETTANLKEYRSHA LSQYLWLLDDERCGRLVELLANHSYAAYKVFTDGLVDSYMDQLALQGKMDLATRLACNEDAYEAAANQVLLDWLFSRNVK REYLLLYMIKNYHPCMGDYIAAMARRDEIKPLMSFLHIETKADLVDILASHPYENDFMTLFAKEKSRKIRDRVEAALS >Mature_1198_residues MDAFSQLQVIEFNRHDSASIEQALKAYQAQLEAHQAFDRGGLFNLMFMDNSSGTREHLQLDMLQDQQLAMAALSLNPDGG HLSSYVVSDERLLYLSETLLFALALEHESLTPQLRKTAQAMVNYARFENDTSEMWLDETRVFGAEPLYMMAAKDANDATY LAQFFIPYWDGDHAVGYGDMLLSLLRKHGWCEAMMNAFIWCDNHSFRFAFYGSDWEQPAPRYQPLGDYLKANPDKYPRFI ELVKQRFHAQPALVYSQHDSLEEQKPILNLYITLIAECCGLDSEGMSAELAEHFIHDSLENEAMDLQNLLKHELNGKLSC YAGSIAQQRKQRIERAERKEARDKYLGGLKMVSEFMLSLENSHALLSYISTGENPEILDDIECFNIIPHSEKHALTFFEA IHESCWDMDDFDHVRDNFHEVMEHLAKDLLQDNDEDMSEAAINGFISRVNARADTHCNDTEQASANTQPASQVRDAQTML RFVDIFYRFFGQQAFNDEMCDLFTGESEYQAIISVEQYYARFMPTDATPKLGSDVSRTEQKALESLLDEFIDMGYNQISA EMLKQTDELFANRACLDCQDWPEDELGIDALCAYLLLQDKQQNHNDDYTQALRAKLNGVFERALNLMLENANILGDGPFT EKGLNDVEQAQIKAYFTDTDPELNQQQMIALLNQHLFSQDICRQAFLYFPKISPVQKSYSFLDDHDDDYQRVVLICLWLK QLDIPEAINAERIWQLLITMAPIRVVHVIAKAFSEHSRKFKCDSPLDEINFFDMLNSHGIDKAFTLTYQVEQFSTSTSRT GDYLNLVELIGELVDEDSAIIDQSMLAAARRSDAKALLRGLDYSYQPIKLDFHKHVAMRFPSMPFALDNELKQCLSDFIK LNHNSWEEVIESKFTDYVSFSGFVTDAGELPKKLRLPLTLHPNADLSQTRRNDRMDWICCEILLQVGDELQVLVADKDTV REGNLYLGGEVLILNDKVDAQSVIDAVKNLPSPEERRNEINQNLWAYLQGELDYAEFAPQFNQYVSYETTANLKEYRSHA LSQYLWLLDDERCGRLVELLANHSYAAYKVFTDGLVDSYMDQLALQGKMDLATRLACNEDAYEAAANQVLLDWLFSRNVK REYLLLYMIKNYHPCMGDYIAAMARRDEIKPLMSFLHIETKADLVDILASHPYENDFMTLFAKEKSRKIRDRVEAALS
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 137675; Mature: 137675
Theoretical pI: Translated: 4.45; Mature: 4.45
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
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Cys/Met content:
1.8 %Cys (Translated Protein) 3.3 %Met (Translated Protein) 5.0 %Cys+Met (Translated Protein) 1.8 %Cys (Mature Protein) 3.3 %Met (Mature Protein) 5.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
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PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA