Definition Prochlorococcus marinus str. AS9601, complete genome.
Accession NC_008816
Length 1,669,886

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The map label for this gene is 123968937

Identifier: 123968937

GI number: 123968937

Start: 1174329

End: 1175612

Strand: Reverse

Name: 123968937

Synonym: A9601_14041

Alternate gene names: NA

Gene position: 1175612-1174329 (Counterclockwise)

Preceding gene: 123968938

Following gene: 123968936

Centisome position: 70.4

GC content: 22.43

Gene sequence:

>1284_bases
TTGAAAATATCAAAATCTTATATTTTATGTTTATCTCTTTTTCTACCTTTTAGATCATATATAATACTTTTTCCATTAAT
AGTTTTTAGTTTATTTAATAAAATAACTATTCCTAGAAAAGTTTTAAGAGATTTTTTGGTTTGTATATTTGCTTTAAGTA
TTGCTTTAATATTTGGGAACTCAATAAATTTTGAATTTAATTCAAGTTCAAATCTTTTAAGAATTTTTAGAGAGTATTTT
TCAACTGTACGATATTTTTTTCTTATAGTTATCTTTTGTAATGCTGTTAAGAATATTCACCGTTATCATAAATTAATTAA
TAAATTAGAAAAATTTTTTACTGGATTTTTAGTATTAAATTCTTTAGTTATTTTACTATGTTTATTTTTTCCTCAATTAA
ATGATTTTTTGAAATATTTATATAACTTTGGTAATGTAGTTGATACTTTGCCAGTTAAATATAGAGCTATGGGTTTAGTT
GGAGCATATGAATATTCGTCTCTAGCATGTATCAGTTTATCAATTTTGGGACTAGTTAATAAGAGTCAAACTATGTTTTA
TTTAGGTATTTTTTCTTCTGCTGCTACAGGAAGATTTGGCGTATTAGCTTCATTCTTATTAATATTTTTTCAATTTGCAA
GTTTGATATTTGTGACATTAAAGAAATTAATTTTTAATTTAAAAATTTCAAAAAATATCTCAGTAAAAATTTTAATTTCA
GTTGTTTCACTTTCAGGATTTTTATTAACAATATATTTGCTTTTGGTTAATATTCTTGGTCAAAATTTATCAATAAGTCA
ATTGGTACAAATTTTTGGAGATGCCTCTTATTTTTCAAATACAACATCTAGTAATATTGGGGTTTTTGATAAACTAGGTT
ATGCTAATTATGATATTTTTGCTGATTATTTTAAATCAAGGATGGGATTTACAGAATTAATGATAGGTTCTGGTGATTCC
TCAATTGATTTAATTGAGATTGATTCAGGATGGTATAGATTATTGAATAAAGGGGGTATTCTTTTTTTAATATTTACACT
ATCTACTTTTTTCTATTTTCTTAAAAAATCATTTGAGCGTGCAGAAAAGATTATTGAAAATAAAGATTTATATAAAAAAC
TTAAATTCTACATTTCAACTTATTCAATATTTATGCTTTTACTTAATACAAAAAGTATGGCATTATTATCATCTTTTACT
TTAGATATTTTCTTAATTACTATTTTGATTATTGTAAATTGTGGTTATAAATACCGAGAAGATTACATTTTTGAAGAAAA
TTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATACTTTAAAAAAAATTTTCAAAATTGTGATTTTTTTATTTTATTAATTTCAAATATCAATAAATACTTTAAAATTGAGC
TTAATGCTGAAATAAAAAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTATAACTGTTTATGCTATTTGTATTCCGAAATTTAAATATATAATGTAGATAGTTTCAAGGGGAAATAGGATTTATAT
GAATTATAAATTCCTTATAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 427; Mature: 427

Protein sequence:

>427_residues
MKISKSYILCLSLFLPFRSYIILFPLIVFSLFNKITIPRKVLRDFLVCIFALSIALIFGNSINFEFNSSSNLLRIFREYF
STVRYFFLIVIFCNAVKNIHRYHKLINKLEKFFTGFLVLNSLVILLCLFFPQLNDFLKYLYNFGNVVDTLPVKYRAMGLV
GAYEYSSLACISLSILGLVNKSQTMFYLGIFSSAATGRFGVLASFLLIFFQFASLIFVTLKKLIFNLKISKNISVKILIS
VVSLSGFLLTIYLLLVNILGQNLSISQLVQIFGDASYFSNTTSSNIGVFDKLGYANYDIFADYFKSRMGFTELMIGSGDS
SIDLIEIDSGWYRLLNKGGILFLIFTLSTFFYFLKKSFERAEKIIENKDLYKKLKFYISTYSIFMLLLNTKSMALLSSFT
LDIFLITILIIVNCGYKYREDYIFEEN

Sequences:

>Translated_427_residues
MKISKSYILCLSLFLPFRSYIILFPLIVFSLFNKITIPRKVLRDFLVCIFALSIALIFGNSINFEFNSSSNLLRIFREYF
STVRYFFLIVIFCNAVKNIHRYHKLINKLEKFFTGFLVLNSLVILLCLFFPQLNDFLKYLYNFGNVVDTLPVKYRAMGLV
GAYEYSSLACISLSILGLVNKSQTMFYLGIFSSAATGRFGVLASFLLIFFQFASLIFVTLKKLIFNLKISKNISVKILIS
VVSLSGFLLTIYLLLVNILGQNLSISQLVQIFGDASYFSNTTSSNIGVFDKLGYANYDIFADYFKSRMGFTELMIGSGDS
SIDLIEIDSGWYRLLNKGGILFLIFTLSTFFYFLKKSFERAEKIIENKDLYKKLKFYISTYSIFMLLLNTKSMALLSSFT
LDIFLITILIIVNCGYKYREDYIFEEN
>Mature_427_residues
MKISKSYILCLSLFLPFRSYIILFPLIVFSLFNKITIPRKVLRDFLVCIFALSIALIFGNSINFEFNSSSNLLRIFREYF
STVRYFFLIVIFCNAVKNIHRYHKLINKLEKFFTGFLVLNSLVILLCLFFPQLNDFLKYLYNFGNVVDTLPVKYRAMGLV
GAYEYSSLACISLSILGLVNKSQTMFYLGIFSSAATGRFGVLASFLLIFFQFASLIFVTLKKLIFNLKISKNISVKILIS
VVSLSGFLLTIYLLLVNILGQNLSISQLVQIFGDASYFSNTTSSNIGVFDKLGYANYDIFADYFKSRMGFTELMIGSGDS
SIDLIEIDSGWYRLLNKGGILFLIFTLSTFFYFLKKSFERAEKIIENKDLYKKLKFYISTYSIFMLLLNTKSMALLSSFT
LDIFLITILIIVNCGYKYREDYIFEEN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 49151; Mature: 49151

Theoretical pI: Translated: 9.73; Mature: 9.73

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.4 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.4 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
3.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKISKSYILCLSLFLPFRSYIILFPLIVFSLFNKITIPRKVLRDFLVCIFALSIALIFGN
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
SINFEFNSSSNLLRIFREYFSTVRYFFLIVIFCNAVKNIHRYHKLINKLEKFFTGFLVLN
CCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLVILLCLFFPQLNDFLKYLYNFGNVVDTLPVKYRAMGLVGAYEYSSLACISLSILGLVN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
KSQTMFYLGIFSSAATGRFGVLASFLLIFFQFASLIFVTLKKLIFNLKISKNISVKILIS
CCCEEEEEEEHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH
VVSLSGFLLTIYLLLVNILGQNLSISQLVQIFGDASYFSNTTSSNIGVFDKLGYANYDIF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCCHHHCCCCCHHHH
ADYFKSRMGFTELMIGSGDSSIDLIEIDSGWYRLLNKGGILFLIFTLSTFFYFLKKSFER
HHHHHHHCCHHHEEECCCCCCEEEEEECCHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AEKIIENKDLYKKLKFYISTYSIFMLLLNTKSMALLSSFTLDIFLITILIIVNCGYKYRE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCC
DYIFEEN
CCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKISKSYILCLSLFLPFRSYIILFPLIVFSLFNKITIPRKVLRDFLVCIFALSIALIFGN
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
SINFEFNSSSNLLRIFREYFSTVRYFFLIVIFCNAVKNIHRYHKLINKLEKFFTGFLVLN
CCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLVILLCLFFPQLNDFLKYLYNFGNVVDTLPVKYRAMGLVGAYEYSSLACISLSILGLVN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
KSQTMFYLGIFSSAATGRFGVLASFLLIFFQFASLIFVTLKKLIFNLKISKNISVKILIS
CCCEEEEEEEHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH
VVSLSGFLLTIYLLLVNILGQNLSISQLVQIFGDASYFSNTTSSNIGVFDKLGYANYDIF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCCHHHCCCCCHHHH
ADYFKSRMGFTELMIGSGDSSIDLIEIDSGWYRLLNKGGILFLIFTLSTFFYFLKKSFER
HHHHHHHCCHHHEEECCCCCCEEEEEECCHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AEKIIENKDLYKKLKFYISTYSIFMLLLNTKSMALLSSFTLDIFLITILIIVNCGYKYRE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCC
DYIFEEN
CCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA