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The map label for this gene is 226948328

Identifier: 226948328

GI number: 226948328

Start: 1252917

End: 1254290

Strand: Reverse

Name: 226948328

Synonym: CLM_1208

Alternate gene names: NA

Gene position: 1254290-1252917 (Counterclockwise)

Preceding gene: 226948329

Following gene: 226948320

Centisome position: 30.19

GC content: 22.85

Gene sequence:

>1374_bases
ATGGAAAAACAACAAATATTACAGATTTCTCGATTTTTATCAGGATACTCAACAATGATTTTTCTATATACAATCAAATA
CTATTTCTATAAAAATTTTTTAGGATTTAAAAATAAAGTTTGGCATTTTACTTTATGTGCATTATTAGTAACAGTTATTG
ATTTTTATATGATGAAAACAATATCCCTACTATGGAGTATAATTATAAATAATATAATTTGGCTACTAATTATATGTTTT
TTATGTAATGGTAATTTCTTAATGAAATTTTATGCTGTTATTCTTGAAGAAGCAGCATTACTACTCATTAATCTAACTTT
TTTAACCTTTGATTTTACAATTTTGCCTACTATTCATAACATTAATGTATCTTTTAATAAACATATAATTATTAGTTTTA
TCACTAACATTATTAATGATCTTATACGTTATACTATATTATTTGTATTTTTAAAAAACATTTGTAAATTTCTAAATTTA
AAAGAAAAATCAATAAAATTATATGAAAACTTATTTTTGCTCATTCCTTGTTTATCAATTTATAGTTTAGGACTTATTTT
TTATATCATTCAGCCTATTAATATTGATAATAAAAGATACTATTTACCTTATATTTTTCCTAAAATTTATTATACCCTCC
CCTTTATAAGTTTTGCTTTATTAGTATCATTATTAATTATGGCCTATACCTTTAAAAAAATGCTTGAAGGCCAATTAGAA
GAGAATAAAAACCTTCTCATGGAACAACAATTTAAGCTACAGCTCACTCATAGCAACAACATAGAAATGCTTTATAAAGG
GATAAGAGGCATAATCCACGATATGAATAATCATGTTTCCTGTTTGAAAAATTTAGCTGTTACTAATAACATTGAAGATA
TAAAAAAGTATCTTATAAATATTGATGAAACCATAAGCAAACTTGATTTTAAAATAAAAACGGGTAATTCTATATCTGAT
GCAGTGATAAATGAAAAATATAATATTGCTAAAACTAATAAAATAGAGTTTATATGCGATTTCCTATTACCCAAAGAAAC
CCTATTAGAGCCTGTAGATTTATGCATTATTTTAAGTAACGCATTGGACAATGCCCTTGAAGCGTGTATGAAAATTACAG
ATAATAATCTTCAAAAAAAAATATGTATAAAATCTTACATAAAAAATATGTATTTAATAATTGAAGTTTCTAACAGTGCT
ACAGATAAAATTCAATATGCCGAAAATAAAATTATCAGCACAAAAACTGATAAAAATAACCATGGTATAGGAATTTCTAA
CATAAAAACTGTTGCAAAAAAATATAATGGCATAGTTGATATACTAGAAGAAAAACATAAATTTATTATTAATATTATGC
TTAAAATAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAACCTTAATAAACTCAGAAAAAATATATGTTTCAAAATATAGATTAGATGATTTTTCAAAGGCCTTTATGTATTATTTA
AAAAATGAGGTTCAGTAATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CAATAACATATAATGACTTATATAAAATTCATATATATATTCCTTAAAAATCATATAATAATTATCTTTTTTATATAAAA
AGCTACATAAAAAATAAAAG

Product: sensor histidine kinase

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 457; Mature: 457

Protein sequence:

>457_residues
MEKQQILQISRFLSGYSTMIFLYTIKYYFYKNFLGFKNKVWHFTLCALLVTVIDFYMMKTISLLWSIIINNIIWLLIICF
LCNGNFLMKFYAVILEEAALLLINLTFLTFDFTILPTIHNINVSFNKHIIISFITNIINDLIRYTILFVFLKNICKFLNL
KEKSIKLYENLFLLIPCLSIYSLGLIFYIIQPINIDNKRYYLPYIFPKIYYTLPFISFALLVSLLIMAYTFKKMLEGQLE
ENKNLLMEQQFKLQLTHSNNIEMLYKGIRGIIHDMNNHVSCLKNLAVTNNIEDIKKYLINIDETISKLDFKIKTGNSISD
AVINEKYNIAKTNKIEFICDFLLPKETLLEPVDLCIILSNALDNALEACMKITDNNLQKKICIKSYIKNMYLIIEVSNSA
TDKIQYAENKIISTKTDKNNHGIGISNIKTVAKKYNGIVDILEEKHKFIINIMLKIK

Sequences:

>Translated_457_residues
MEKQQILQISRFLSGYSTMIFLYTIKYYFYKNFLGFKNKVWHFTLCALLVTVIDFYMMKTISLLWSIIINNIIWLLIICF
LCNGNFLMKFYAVILEEAALLLINLTFLTFDFTILPTIHNINVSFNKHIIISFITNIINDLIRYTILFVFLKNICKFLNL
KEKSIKLYENLFLLIPCLSIYSLGLIFYIIQPINIDNKRYYLPYIFPKIYYTLPFISFALLVSLLIMAYTFKKMLEGQLE
ENKNLLMEQQFKLQLTHSNNIEMLYKGIRGIIHDMNNHVSCLKNLAVTNNIEDIKKYLINIDETISKLDFKIKTGNSISD
AVINEKYNIAKTNKIEFICDFLLPKETLLEPVDLCIILSNALDNALEACMKITDNNLQKKICIKSYIKNMYLIIEVSNSA
TDKIQYAENKIISTKTDKNNHGIGISNIKTVAKKYNGIVDILEEKHKFIINIMLKIK
>Mature_457_residues
MEKQQILQISRFLSGYSTMIFLYTIKYYFYKNFLGFKNKVWHFTLCALLVTVIDFYMMKTISLLWSIIINNIIWLLIICF
LCNGNFLMKFYAVILEEAALLLINLTFLTFDFTILPTIHNINVSFNKHIIISFITNIINDLIRYTILFVFLKNICKFLNL
KEKSIKLYENLFLLIPCLSIYSLGLIFYIIQPINIDNKRYYLPYIFPKIYYTLPFISFALLVSLLIMAYTFKKMLEGQLE
ENKNLLMEQQFKLQLTHSNNIEMLYKGIRGIIHDMNNHVSCLKNLAVTNNIEDIKKYLINIDETISKLDFKIKTGNSISD
AVINEKYNIAKTNKIEFICDFLLPKETLLEPVDLCIILSNALDNALEACMKITDNNLQKKICIKSYIKNMYLIIEVSNSA
TDKIQYAENKIISTKTDKNNHGIGISNIKTVAKKYNGIVDILEEKHKFIINIMLKIK

Specific function: Unknown

COG id: COG2972

COG function: function code T; Predicted signal transduction protein with a C-terminal ATPase domain

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 53422; Mature: 53422

Theoretical pI: Translated: 9.21; Mature: 9.21

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.2 %Cys     (Translated Protein)
2.8 %Met     (Translated Protein)
5.0 %Cys+Met (Translated Protein)
2.2 %Cys     (Mature Protein)
2.8 %Met     (Mature Protein)
5.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEKQQILQISRFLSGYSTMIFLYTIKYYFYKNFLGFKNKVWHFTLCALLVTVIDFYMMKT
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISLLWSIIINNIIWLLIICFLCNGNFLMKFYAVILEEAALLLINLTFLTFDFTILPTIHN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHEEECEEEE
INVSFNKHIIISFITNIINDLIRYTILFVFLKNICKFLNLKEKSIKLYENLFLLIPCLSI
EEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YSLGLIFYIIQPINIDNKRYYLPYIFPKIYYTLPFISFALLVSLLIMAYTFKKMLEGQLE
HHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ENKNLLMEQQFKLQLTHSNNIEMLYKGIRGIIHDMNNHVSCLKNLAVTNNIEDIKKYLIN
CCCCHHHEHEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
IDETISKLDFKIKTGNSISDAVINEKYNIAKTNKIEFICDFLLPKETLLEPVDLCIILSN
HHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
ALDNALEACMKITDNNLQKKICIKSYIKNMYLIIEVSNSATDKIQYAENKIISTKTDKNN
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCHHHHHHCCCEEECCCCCCC
HGIGISNIKTVAKKYNGIVDILEEKHKFIINIMLKIK
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHEEEEEC
>Mature Secondary Structure
MEKQQILQISRFLSGYSTMIFLYTIKYYFYKNFLGFKNKVWHFTLCALLVTVIDFYMMKT
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISLLWSIIINNIIWLLIICFLCNGNFLMKFYAVILEEAALLLINLTFLTFDFTILPTIHN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHEEECEEEE
INVSFNKHIIISFITNIINDLIRYTILFVFLKNICKFLNLKEKSIKLYENLFLLIPCLSI
EEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YSLGLIFYIIQPINIDNKRYYLPYIFPKIYYTLPFISFALLVSLLIMAYTFKKMLEGQLE
HHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ENKNLLMEQQFKLQLTHSNNIEMLYKGIRGIIHDMNNHVSCLKNLAVTNNIEDIKKYLIN
CCCCHHHEHEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
IDETISKLDFKIKTGNSISDAVINEKYNIAKTNKIEFICDFLLPKETLLEPVDLCIILSN
HHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
ALDNALEACMKITDNNLQKKICIKSYIKNMYLIIEVSNSATDKIQYAENKIISTKTDKNN
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCHHHHHHCCCEEECCCCCCC
HGIGISNIKTVAKKYNGIVDILEEKHKFIINIMLKIK
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHEEEEEC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA