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The map label for this gene is 226222904

Identifier: 226222904

GI number: 226222904

Start: 297932

End: 299818

Strand: Direct

Name: 226222904

Synonym: Lm4b_00296

Alternate gene names: NA

Gene position: 297932-299818 (Clockwise)

Preceding gene: 226222903

Following gene: 226222909

Centisome position: 10.23

GC content: 41.18

Gene sequence:

>1887_bases
ATGAAAAGAATTGTCAAAATTTTTCTACATTATTTATTAGGAATTTTAGGAATTATTTTAATCAGTTGTGTTCCCGCGAT
ATTTAGCAAAGTGACTTCATGGTCATCAAGCACGTACTGGGAGGCTCTTAAGTCAATTTTCACAGCGATTTTCCACCCAA
CCAAATGGGAAATTAGTTACCAAGGAAGCGCAGAAGTTTTTCATGTCTCGTTGGCAGATTTTATTACCGGACCATATTTC
TACTCCATGAAAATTATCGTAGCGAGCTTGCTAATTTCAGCGATTATTGCTTATTTACTAGTGATTGCAACATTTCGCGG
GCCAAAATGGTTGCGCCAAGGCTTAAGCGGATTCTTATCAATACTTCAAGCTTTTCCAGATTTTTCCTTTATTTTCCTTA
TTCAAATGGCCGTCGTCTACATATATCAGCAAACAGGCGTGTTCACCTTGAATTTTTACAGCTTAAACGGCGAGCAAATT
TATGCAGCACCAATCGTCTGCTTATCCATCATACCAACCGTGCTCTTTTACAAAATGATGATGCTCCTTATGGAAAATGA
ATGGCAAGCTGACTACATCCAACTGGCTCGCGGGAAAGGCTTAACCGATAGAGCGATACTACTTCGCCATGCCACACCCA
ATATGATGCAAAGCCTATTTTACCAATCCAAAACCATCGTTTGGTTTATTTTAAGCGCCTACCTCATTGTAGAATTTTTA
TTCGGTATCGAAGGCGTGCTCTACTATTTACTAGCAGGATTTAGCCCATTAAATATTTTCCTAGTATTAGCACTCGTGTT
CACCCCATTTTACTTCTTTTACGCACTAATAGACCTATGGATTAGCCGTGGGAAAAATACCGAGAGCGCAAACGTGACCC
GAATACCGCTGCACTGGAATAGTTTCCAGAAAACCTTTACGGAAAAAGTAAACCTTAAAAGCAAATGGCGCAACTTTGTA
GTAACGACCGGGCAGCTCCTAAAACGCCCATCCTTCAGCATTCCGCTGGCAACACTTAGCATCTTACTAATCGCGAGCCT
TATTTACGGGCTTATGGGAGACAAAATCAACTCGCTTAAATTTATCAGTGATGCGACCGGACGAGTGACCGATATGGCGC
CCTTCAAACCAAATGCGCAAGTATGGCTAGGCACCGACCAAGCCGGCAACTCCATTCTCGACCAATTACTCGTCGGCATC
AAGTATACGCTACTTATAGCTGTCATCATCGCAACGCTACGTGTCGTGATTGGTTACATTTTGGCAGTACCGCTCGCATT
TTTCAGCAAGCCACGAACCCGCAATTTTGTTCAATCAATAGCGGACGGAATGCATTATCTACCACTGTCATTACTCGTCT
TTATTATCATGGTCAACGAATTCATCAGCTATTCTGGCGTTTTCGAAACAAGCCTTTTTACACGCATAACCTTCCAAATT
TTAATCATGGTTGTCATCGTTTTACCAATTACAACCAACCGAATCAGCAGTGAAATTTCCCAGGTGTTAAAAAAAGAGTT
CGTCTTGAGTGCGCTCGTTTTTGGCGGAAATGCTCGCTGGATATTAACCAAGCATATCAATCCACAAATCTGGTCCAAAT
TAATTTTGATTTGGATTGAGCAGCTCATTCAAACGCTACAGATGTTCGTCCATTTAGCTATCTTTGGAATTTTCATCGGA
GGGGCAATCATGGGCGCCGATGACGGCATGCTAAACCCAGTTATCCCTGAATTATCTGGTTTAATCGCAAACGCTAAATT
CGTGTTCGCCAACCACCAATTCTGGATAATTTTACCTCCATTAGTGGTATTTATGATTTTAATTCTTTGTTTCCAAATGA
TGGCAAATTCGCTTTTGAAACGAGAAGAAGAAAGTAAAAAAGCCTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTTAGACTTAAAATAAGTAGAATCTTGGACATATCTCATTGGAGGTGTGTCCTAGATTTATACATAAGAGAAAGCTAGA
AAAAGGGAGAAAACATACAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTCTATAAAAGAACTAGGCTATTATTATTTAAGGAGTGACTGTTTGATAGACAGTCACTGTGACAGAAGGGTAAGTTGGA
TATTGATTATTTAAAAAGTA

Product: transporter

Products: NA

Alternate protein names: Oligopeptide Transport System Permease; Oligopeptide Transport System Permease Protein-Like Protein; Oligopeptide Transport System Permease Protein OppC

Number of amino acids: Translated: 628; Mature: 628

Protein sequence:

>628_residues
MKRIVKIFLHYLLGILGIILISCVPAIFSKVTSWSSSTYWEALKSIFTAIFHPTKWEISYQGSAEVFHVSLADFITGPYF
YSMKIIVASLLISAIIAYLLVIATFRGPKWLRQGLSGFLSILQAFPDFSFIFLIQMAVVYIYQQTGVFTLNFYSLNGEQI
YAAPIVCLSIIPTVLFYKMMMLLMENEWQADYIQLARGKGLTDRAILLRHATPNMMQSLFYQSKTIVWFILSAYLIVEFL
FGIEGVLYYLLAGFSPLNIFLVLALVFTPFYFFYALIDLWISRGKNTESANVTRIPLHWNSFQKTFTEKVNLKSKWRNFV
VTTGQLLKRPSFSIPLATLSILLIASLIYGLMGDKINSLKFISDATGRVTDMAPFKPNAQVWLGTDQAGNSILDQLLVGI
KYTLLIAVIIATLRVVIGYILAVPLAFFSKPRTRNFVQSIADGMHYLPLSLLVFIIMVNEFISYSGVFETSLFTRITFQI
LIMVVIVLPITTNRISSEISQVLKKEFVLSALVFGGNARWILTKHINPQIWSKLILIWIEQLIQTLQMFVHLAIFGIFIG
GAIMGADDGMLNPVIPELSGLIANAKFVFANHQFWIILPPLVVFMILILCFQMMANSLLKREEESKKA

Sequences:

>Translated_628_residues
MKRIVKIFLHYLLGILGIILISCVPAIFSKVTSWSSSTYWEALKSIFTAIFHPTKWEISYQGSAEVFHVSLADFITGPYF
YSMKIIVASLLISAIIAYLLVIATFRGPKWLRQGLSGFLSILQAFPDFSFIFLIQMAVVYIYQQTGVFTLNFYSLNGEQI
YAAPIVCLSIIPTVLFYKMMMLLMENEWQADYIQLARGKGLTDRAILLRHATPNMMQSLFYQSKTIVWFILSAYLIVEFL
FGIEGVLYYLLAGFSPLNIFLVLALVFTPFYFFYALIDLWISRGKNTESANVTRIPLHWNSFQKTFTEKVNLKSKWRNFV
VTTGQLLKRPSFSIPLATLSILLIASLIYGLMGDKINSLKFISDATGRVTDMAPFKPNAQVWLGTDQAGNSILDQLLVGI
KYTLLIAVIIATLRVVIGYILAVPLAFFSKPRTRNFVQSIADGMHYLPLSLLVFIIMVNEFISYSGVFETSLFTRITFQI
LIMVVIVLPITTNRISSEISQVLKKEFVLSALVFGGNARWILTKHINPQIWSKLILIWIEQLIQTLQMFVHLAIFGIFIG
GAIMGADDGMLNPVIPELSGLIANAKFVFANHQFWIILPPLVVFMILILCFQMMANSLLKREEESKKA
>Mature_628_residues
MKRIVKIFLHYLLGILGIILISCVPAIFSKVTSWSSSTYWEALKSIFTAIFHPTKWEISYQGSAEVFHVSLADFITGPYF
YSMKIIVASLLISAIIAYLLVIATFRGPKWLRQGLSGFLSILQAFPDFSFIFLIQMAVVYIYQQTGVFTLNFYSLNGEQI
YAAPIVCLSIIPTVLFYKMMMLLMENEWQADYIQLARGKGLTDRAILLRHATPNMMQSLFYQSKTIVWFILSAYLIVEFL
FGIEGVLYYLLAGFSPLNIFLVLALVFTPFYFFYALIDLWISRGKNTESANVTRIPLHWNSFQKTFTEKVNLKSKWRNFV
VTTGQLLKRPSFSIPLATLSILLIASLIYGLMGDKINSLKFISDATGRVTDMAPFKPNAQVWLGTDQAGNSILDQLLVGI
KYTLLIAVIIATLRVVIGYILAVPLAFFSKPRTRNFVQSIADGMHYLPLSLLVFIIMVNEFISYSGVFETSLFTRITFQI
LIMVVIVLPITTNRISSEISQVLKKEFVLSALVFGGNARWILTKHINPQIWSKLILIWIEQLIQTLQMFVHLAIFGIFIG
GAIMGADDGMLNPVIPELSGLIANAKFVFANHQFWIILPPLVVFMILILCFQMMANSLLKREEESKKA

Specific function: Unknown

COG id: COG0601

COG function: function code EP; ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 71164; Mature: 71164

Theoretical pI: Translated: 9.85; Mature: 9.85

Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN ; PS50928 ABC_TM1

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
3.2 %Met     (Translated Protein)
3.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
3.2 %Met     (Mature Protein)
3.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKRIVKIFLHYLLGILGIILISCVPAIFSKVTSWSSSTYWEALKSIFTAIFHPTKWEISY
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEE
QGSAEVFHVSLADFITGPYFYSMKIIVASLLISAIIAYLLVIATFRGPKWLRQGLSGFLS
CCCCCEEEEEHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
ILQAFPDFSFIFLIQMAVVYIYQQTGVFTLNFYSLNGEQIYAAPIVCLSIIPTVLFYKMM
HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEECCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MLLMENEWQADYIQLARGKGLTDRAILLRHATPNMMQSLFYQSKTIVWFILSAYLIVEFL
HHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHH
FGIEGVLYYLLAGFSPLNIFLVLALVFTPFYFFYALIDLWISRGKNTESANVTRIPLHWN
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCHH
SFQKTFTEKVNLKSKWRNFVVTTGQLLKRPSFSIPLATLSILLIASLIYGLMGDKINSLK
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHEECHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHH
FISDATGRVTDMAPFKPNAQVWLGTDQAGNSILDQLLVGIKYTLLIAVIIATLRVVIGYI
HHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAVPLAFFSKPRTRNFVQSIADGMHYLPLSLLVFIIMVNEFISYSGVFETSLFTRITFQI
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
LIMVVIVLPITTNRISSEISQVLKKEFVLSALVFGGNARWILTKHINPQIWSKLILIWIE
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHH
QLIQTLQMFVHLAIFGIFIGGAIMGADDGMLNPVIPELSGLIANAKFVFANHQFWIILPP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCEEEEECCEEEEEHHH
LVVFMILILCFQMMANSLLKREEESKKA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MKRIVKIFLHYLLGILGIILISCVPAIFSKVTSWSSSTYWEALKSIFTAIFHPTKWEISY
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEE
QGSAEVFHVSLADFITGPYFYSMKIIVASLLISAIIAYLLVIATFRGPKWLRQGLSGFLS
CCCCCEEEEEHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
ILQAFPDFSFIFLIQMAVVYIYQQTGVFTLNFYSLNGEQIYAAPIVCLSIIPTVLFYKMM
HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEECCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MLLMENEWQADYIQLARGKGLTDRAILLRHATPNMMQSLFYQSKTIVWFILSAYLIVEFL
HHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHH
FGIEGVLYYLLAGFSPLNIFLVLALVFTPFYFFYALIDLWISRGKNTESANVTRIPLHWN
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCHH
SFQKTFTEKVNLKSKWRNFVVTTGQLLKRPSFSIPLATLSILLIASLIYGLMGDKINSLK
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHEECHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHH
FISDATGRVTDMAPFKPNAQVWLGTDQAGNSILDQLLVGIKYTLLIAVIIATLRVVIGYI
HHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAVPLAFFSKPRTRNFVQSIADGMHYLPLSLLVFIIMVNEFISYSGVFETSLFTRITFQI
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
LIMVVIVLPITTNRISSEISQVLKKEFVLSALVFGGNARWILTKHINPQIWSKLILIWIE
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHH
QLIQTLQMFVHLAIFGIFIGGAIMGADDGMLNPVIPELSGLIANAKFVFANHQFWIILPP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCEEEEECCEEEEEHHH
LVVFMILILCFQMMANSLLKREEESKKA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA