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Definition Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome, complete genome.
Accession NC_012032
Length 5,268,950

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The map label for this gene is 222527060

Identifier: 222527060

GI number: 222527060

Start: 4784102

End: 4785976

Strand: Reverse

Name: 222527060

Synonym: Chy400_3839

Alternate gene names: NA

Gene position: 4785976-4784102 (Counterclockwise)

Preceding gene: 222527061

Following gene: 222527057

Centisome position: 90.83

GC content: 57.07

Gene sequence:

>1875_bases
ATGATAGCGGTGAGGCGCTGGTATCTGTTTGTGAGTGCCACGATTGGCCTCCAGGGCTTCACATGGTCGTTGATCTGGTT
GCTCTACGGAATTCTGGTTGCCGATGAACAGCCGGTTATCGAGGCGACAGCGCTGCAACTGGCGGCCATACTGGTCTGTT
TGCCGCTCTGGTTGGGGCATTGGTTGTGGGGTGAACGGCTGGCGCGACGTGATCGGGACGAACGAGCTTCGGCGATACGA
AAACTCTATCTCTACGGCAACCTGACCCTGTTTTTGATTGCACTAATTGGAAGTGTTTTCGATCTGCTGACAGCAATACT
GCGGTTTATCTTACGCATCCCAGGCGGCGACCGCGTTGGGCAGTTTGAATATGGGATCATTGCGTCATCGATCCTTGGTG
TGCTCTTTGCCTACCACAGTGTCGTTGCCCGTAACGATCTCCATCAGGCACCGTTGACCGGTGGTGGTGCATTGGTGAGG
CGTCTCTACCTGTTGTTTGCCGCCGGGGTTGGTCTGGCTGTCTGGGCAAGTAGTATTACGACGTTGGCTCAGCAAATAGC
CAATGCCTTCGGCGGTTCCCTTTCGCTGCCGATCTTGCCCGAACTCATCGCCTCCACAATCATCGGTCTGGTCGTCTGGC
TTGGTCACTGGTGGCGTGCGCAACAGCTTTTTGCCAGTGCGGAAGAAGATGAACGGGCATCAGTGTTGCGCAAGTTTTAC
CTCTACCTGGTGATTGTGGTGAGCAGTCTGGCAGCAGTGACAAATGCAACCATCCTGCTGGCCGGGGTGTTTCGCCAAAT
GGTGGGATTGACGGTAACCGGTAGCCCGCTAGATGTGCTGATCTCATCGGTTGTCTTCCTTGTCATCGCCCTGTATCACA
GTCAGGTCTTGCGGGCCGATGCAGCGGTCATTCCCGAAGCTCCCCGTCAGGCCGGGGTGCGGCGTGTGGCATGGTACCTG
GTGGCAGCCGTCGGGCAACTGGCTCTGGTTGGTGGTCTGGGTGGAATGTTGAGTGTGATCATTCGAGGTGTGGCCGGAGC
CGAGACAACATCCGATCTCCGCGAACCACTGTCCTGGTTTGGGGCGATGCTGATTGTCGGGCTGGCAGTCTGGGCAGTGT
GCTGGCGTCGGATACAGCGCATATCCAGCGCTACGGGTGAGGCAGGTGTGGCCGAGCGTAGCTCACTCACACGCCGTATC
TACCTCTTCGGCTTCTTGTTCGTCGCCTCATTGACGCTTTTGCTGGCGATGATGTACATCCTCTTCCGCATCATCAGTAT
CGCACTGGGTGAGCCGTTTGCCGGTTCGCTGCTGGCCGACATTGCCCAGGCGTTGGCCTTCGCGCTGATTGCTAGTGGTG
TGCTGGCAACTCACGGGCTTGCGCTACGATCTGACACGCGGGTGCGTGAGGAAGCAGCGCTGGCGAAACAGGCGCAGACG
CGGGTCGCTGTTGTCGCCGATGATGGTCTGGCCAATCAGATTGCCACTGAATTGCGCGCACAATTTCCACAACTGGTCAT
CTACGTCAGGGATCAGTCTGCCGAAGCTGAACAGCAACTAGCGAACGCTAACCTGATCGTTGGCACGTGGCGCCAGACTG
AGAATCCACAGTGGTTGAATCGCTATCCGGCGCGTAAATTGCTGGTACCGCTGACCGATACGAACTGGATGTGGGTGGGA
GTGGAGCCGATGACGGGGACTGAGATTGCCCGTCAACTGGCAGATGCTGTGCGTCAGGTGCTGGCCGGTGAGTCATTGCG
CCCCAAACGCGCAGTCACTGCCGGTACGATTGTGGCAGTAGTGGTTGGAGTAGTTTTGGTGGTTTCGTTGTTAAGCGGAT
CACTGGTATTTCTGATCGCCCTGTTCTCGTTTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTACTGTTGAGCTTCTGCAACACGAGGGTAGCTGGAAATTAATTGCGAATGACGATTGGCGCACGTGGCAGTGGTGCTGG
GGGCAAGAGGGAGGCTGCTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGAGAATCTGTGTCAACTATGGACACCGGGGCATGGGTAGGAGCGACATACGCTTCATCTCAATGCAAACGTCTGTCAAA
TGGTGAGGACGGAAGCAAAC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 624; Mature: 624

Protein sequence:

>624_residues
MIAVRRWYLFVSATIGLQGFTWSLIWLLYGILVADEQPVIEATALQLAAILVCLPLWLGHWLWGERLARRDRDERASAIR
KLYLYGNLTLFLIALIGSVFDLLTAILRFILRIPGGDRVGQFEYGIIASSILGVLFAYHSVVARNDLHQAPLTGGGALVR
RLYLLFAAGVGLAVWASSITTLAQQIANAFGGSLSLPILPELIASTIIGLVVWLGHWWRAQQLFASAEEDERASVLRKFY
LYLVIVVSSLAAVTNATILLAGVFRQMVGLTVTGSPLDVLISSVVFLVIALYHSQVLRADAAVIPEAPRQAGVRRVAWYL
VAAVGQLALVGGLGGMLSVIIRGVAGAETTSDLREPLSWFGAMLIVGLAVWAVCWRRIQRISSATGEAGVAERSSLTRRI
YLFGFLFVASLTLLLAMMYILFRIISIALGEPFAGSLLADIAQALAFALIASGVLATHGLALRSDTRVREEAALAKQAQT
RVAVVADDGLANQIATELRAQFPQLVIYVRDQSAEAEQQLANANLIVGTWRQTENPQWLNRYPARKLLVPLTDTNWMWVG
VEPMTGTEIARQLADAVRQVLAGESLRPKRAVTAGTIVAVVVGVVLVVSLLSGSLVFLIALFSF

Sequences:

>Translated_624_residues
MIAVRRWYLFVSATIGLQGFTWSLIWLLYGILVADEQPVIEATALQLAAILVCLPLWLGHWLWGERLARRDRDERASAIR
KLYLYGNLTLFLIALIGSVFDLLTAILRFILRIPGGDRVGQFEYGIIASSILGVLFAYHSVVARNDLHQAPLTGGGALVR
RLYLLFAAGVGLAVWASSITTLAQQIANAFGGSLSLPILPELIASTIIGLVVWLGHWWRAQQLFASAEEDERASVLRKFY
LYLVIVVSSLAAVTNATILLAGVFRQMVGLTVTGSPLDVLISSVVFLVIALYHSQVLRADAAVIPEAPRQAGVRRVAWYL
VAAVGQLALVGGLGGMLSVIIRGVAGAETTSDLREPLSWFGAMLIVGLAVWAVCWRRIQRISSATGEAGVAERSSLTRRI
YLFGFLFVASLTLLLAMMYILFRIISIALGEPFAGSLLADIAQALAFALIASGVLATHGLALRSDTRVREEAALAKQAQT
RVAVVADDGLANQIATELRAQFPQLVIYVRDQSAEAEQQLANANLIVGTWRQTENPQWLNRYPARKLLVPLTDTNWMWVG
VEPMTGTEIARQLADAVRQVLAGESLRPKRAVTAGTIVAVVVGVVLVVSLLSGSLVFLIALFSF
>Mature_624_residues
MIAVRRWYLFVSATIGLQGFTWSLIWLLYGILVADEQPVIEATALQLAAILVCLPLWLGHWLWGERLARRDRDERASAIR
KLYLYGNLTLFLIALIGSVFDLLTAILRFILRIPGGDRVGQFEYGIIASSILGVLFAYHSVVARNDLHQAPLTGGGALVR
RLYLLFAAGVGLAVWASSITTLAQQIANAFGGSLSLPILPELIASTIIGLVVWLGHWWRAQQLFASAEEDERASVLRKFY
LYLVIVVSSLAAVTNATILLAGVFRQMVGLTVTGSPLDVLISSVVFLVIALYHSQVLRADAAVIPEAPRQAGVRRVAWYL
VAAVGQLALVGGLGGMLSVIIRGVAGAETTSDLREPLSWFGAMLIVGLAVWAVCWRRIQRISSATGEAGVAERSSLTRRI
YLFGFLFVASLTLLLAMMYILFRIISIALGEPFAGSLLADIAQALAFALIASGVLATHGLALRSDTRVREEAALAKQAQT
RVAVVADDGLANQIATELRAQFPQLVIYVRDQSAEAEQQLANANLIVGTWRQTENPQWLNRYPARKLLVPLTDTNWMWVG
VEPMTGTEIARQLADAVRQVLAGESLRPKRAVTAGTIVAVVVGVVLVVSLLSGSLVFLIALFSF

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 67729; Mature: 67729

Theoretical pI: Translated: 9.76; Mature: 9.76

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
1.3 %Met     (Translated Protein)
1.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
1.3 %Met     (Mature Protein)
1.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIAVRRWYLFVSATIGLQGFTWSLIWLLYGILVADEQPVIEATALQLAAILVCLPLWLGH
CCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WLWGERLARRDRDERASAIRKLYLYGNLTLFLIALIGSVFDLLTAILRFILRIPGGDRVG
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
QFEYGIIASSILGVLFAYHSVVARNDLHQAPLTGGGALVRRLYLLFAAGVGLAVWASSIT
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TLAQQIANAFGGSLSLPILPELIASTIIGLVVWLGHWWRAQQLFASAEEDERASVLRKFY
HHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
LYLVIVVSSLAAVTNATILLAGVFRQMVGLTVTGSPLDVLISSVVFLVIALYHSQVLRAD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AAVIPEAPRQAGVRRVAWYLVAAVGQLALVGGLGGMLSVIIRGVAGAETTSDLREPLSWF
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
GAMLIVGLAVWAVCWRRIQRISSATGEAGVAERSSLTRRIYLFGFLFVASLTLLLAMMYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFRIISIALGEPFAGSLLADIAQALAFALIASGVLATHGLALRSDTRVREEAALAKQAQT
HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHC
RVAVVADDGLANQIATELRAQFPQLVIYVRDQSAEAEQQLANANLIVGTWRQTENPQWLN
CEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCHHHH
RYPARKLLVPLTDTNWMWVGVEPMTGTEIARQLADAVRQVLAGESLRPKRAVTAGTIVAV
HCCCHHEEEEEECCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
VVGVVLVVSLLSGSLVFLIALFSF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
>Mature Secondary Structure
MIAVRRWYLFVSATIGLQGFTWSLIWLLYGILVADEQPVIEATALQLAAILVCLPLWLGH
CCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WLWGERLARRDRDERASAIRKLYLYGNLTLFLIALIGSVFDLLTAILRFILRIPGGDRVG
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
QFEYGIIASSILGVLFAYHSVVARNDLHQAPLTGGGALVRRLYLLFAAGVGLAVWASSIT
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TLAQQIANAFGGSLSLPILPELIASTIIGLVVWLGHWWRAQQLFASAEEDERASVLRKFY
HHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
LYLVIVVSSLAAVTNATILLAGVFRQMVGLTVTGSPLDVLISSVVFLVIALYHSQVLRAD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AAVIPEAPRQAGVRRVAWYLVAAVGQLALVGGLGGMLSVIIRGVAGAETTSDLREPLSWF
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
GAMLIVGLAVWAVCWRRIQRISSATGEAGVAERSSLTRRIYLFGFLFVASLTLLLAMMYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFRIISIALGEPFAGSLLADIAQALAFALIASGVLATHGLALRSDTRVREEAALAKQAQT
HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHC
RVAVVADDGLANQIATELRAQFPQLVIYVRDQSAEAEQQLANANLIVGTWRQTENPQWLN
CEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCHHHH
RYPARKLLVPLTDTNWMWVGVEPMTGTEIARQLADAVRQVLAGESLRPKRAVTAGTIVAV
HCCCHHEEEEEECCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
VVGVVLVVSLLSGSLVFLIALFSF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA