| Definition | Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012032 |
| Length | 5,268,950 |
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The map label for this gene is 222526818
Identifier: 222526818
GI number: 222526818
Start: 4467062
End: 4470745
Strand: Reverse
Name: 222526818
Synonym: Chy400_3593
Alternate gene names: NA
Gene position: 4470745-4467062 (Counterclockwise)
Preceding gene: 222526819
Following gene: 222526817
Centisome position: 84.85
GC content: 58.55
Gene sequence:
>3684_bases ATGAGTGAACGGAGCGCCAAACGTCCTGAACTTCATTTCGTGCCGCGTGCGCTCCGTGATATTTTCTTGCCGCGCCGACT ACCCCGTGAAGTACGCAGCACAATCGAGCAGTGGCTGGATGCAGAACCGCTGCATCGGGTGTTGCCGGGGGCACTCGATT TGCCGTTTGCCATCGATCTTGAGCCGGCTTCTATCCTGGCCGACACCCGCCATCTGGCGCTGCTGGGACCACCGGCCAGT GGACGGAGTCTGGCCCTGGCTCAAATTGCTCACCGCTGGCTTGCCGGTCAGACCACGGTGCCGCTGATACGTCTACTCCT CAGCGAGATTGATACACCGAGTCTGACCCCGCGGGCTATTGTTGTCCGCACGCTGGCCCGACGGAATCTGGCCCCAAATC CGTTAGAACACAACCTGCCCTGTCTCCTCCTTGTCGATGATTGGGAAGACCTGCCGCTGGCTCGTCGTTCTATCTGGCAA CGGTTTCTAACGAGTCTTTCTGAACGCTGGCCGCAGGCGCGAGCCGTCATTACGCTCCCACCGGGAGAGTTGTGGCCTGG CTTCCGCCACCATGCTCTCACACCATTGCCATCGGAACTGCTCAGTTCATGGCTTCAGGCACTCTTTCCACATACCGACA CCCAAACCCTGCTACCACTGTTTGAGCGCGATCCGCTGATTTTGCTACGCGAACGTCCGGCAGAGCTTATCATGCTGGCG TTAACGCAGCCACTGAGCGGCTGGCCGGTCTCTCGTGCAGCACTCTACGAGCGGATAGCCGCTTTCGCGGCACCAATTCT GGCGACAAGTAATGATCAGGCCGGCTGGCGGATTGGATACAGTGCCTATCGTGCGTATCAGCAGGCACTGACACTGGCAG CCCAACCGCAACTCGACGCCACGAGTATTCGCAATGCCGGTACGCAATGGCGTGCCCTATGCCTGCCCTTAACCTTTGGG ATCATTCCCGATCCCCAACCGCTGATCACTGCCCTCGCCGAAGCCAATATCCCAACCGGCGAACGACTGTTTCTGATCGC CCGTGCGCTACGGGAACGACCTCGGCTTGATCCGGCCCTGAGTCGCCCAATTCTGGAAGAGCTTTGTCAGTACGGAGGAG AAGCACTCAATACCCTCGTACCGGCACTACCCATCATTTTGATCGACATCGGTCGCACCCAGCCGGCTCAGGTAAACACC TTGCTGGAACGAATTGTCGGTCAACTGGCACCGACTGCCGCTATCACATTGCTAACCGACCTGCTCGATGCCGGCGACGC CCCACCCGCGCTTCGCTGGCAAGCGATAGATTTGCTCTGTCAACGACGGACGCTACCACCACCGTTACCGCCACACACCG ACCTGATAGGTCAGGCCGGACGCTGTTTACTGGCTGTGGTGCATAACGATACCCTCTCCTGGCTGGCACATCCGTCGCTA CAGCTTGGCCTGCGTCTGCTGCTCAGTGGCGCCGCAGGTGAAGAGCGTCAGCAGACTATCGCTCATCATCTGCTCCACCA CCTCGATCTACCACCATCAGTTCGCGCCCTGGCACCGGCTGCGCTGCCCCTTGCCGATCTGGTGCAAGCCGCTGCCGACC CTATGGCCGAAGTCCGACAGGCGGCCCGTTCCGTCTGGCTAAGGTCGGGGCACGTGGATCAACTGGCTCGTTTCGTAACA CAACCCCATCAGCCATGGGTGGCTCGTGATGAAGCATTGACCGATCTGGCAGCCCATCCTGCCGGCGCTACCTTTCTTGC CGGTTTTGCGTTGAGTCAGCGATTGACGCTTGATCTCAGACTTCGGGCAATCCGGTTACTCCACCGCCTGAGCAATGGTC TCTCCCTGCTCAAGCGGTTGTTGCAAACCGAAACAGAGCCGGTGATCGTGCGTGCAGCAGCGGCCTATCAACTTACCCAC TACCCACAGGCAGTATCGGTTCTGACACCGTTTCTCAGTCCTCATCACCCACCGCTCCTGCGGCGCGCCGCAGGATACGC CCTCGGTCAGATCGCTGCGCAGAACCATCCCGCAGCAGTGGCAGCACGTACCGCTCTGATCCAACACCTGCATCAACCCG ACATCGATACCGGCTTTACCATCACCATCATCACTGCGCCTGGCCTGTGCGGGAGCCGTCAGGCGTTATCGGCACTCGGT CACCTGATAACCCCAACCTTTGGTGTTCAATTGCTGGATGCCTGGCTCAGTGCTCTACCGGCGTTGATCGGCCCTGTCGA ACAGTGGTTCCAGGAAGCCGACGATATACGCCGTGCTGTACTGGCCGATCTCTTTATCACATCAGGTACAACTATCGATA ACGGTAACAACCTGCTAGATCGACCTTCAGCACTGATTGCCTTGCAGGTATTGCAGATCAGGAGCGCGGCAGTACGAGCG ATTAATCTGATTGGCAGGCAACAACCCGCCCTTGAACCGGCCGTGCGCGCTTTGTTCGACGTTACCCTGCTGGATAGTAG CGCACCGCGCCCGTTCGCCGATCTGCTCGGTATCTATGCAACCAACGATCTTGTGCACATTGCCCGCAATGCGGCTGATG ATCCGCTACTCCGGAGCGCTGCCCTGAATACGATTGCCGAACGTCCAGACGGTACGCAAGCTCTCATCCAACTGGCCAGC CAGGCCGATACAAACCTGGCGTGTGCGGCACTCGATCAGGTACGGCCACCATTTTCGGCAGAGACCATCGAAATCCTATT GACTATGGCCGGCGCAGAACATTCTGAGCCGATTCGTTTTATGGCCCTGCACGTGTTGGGGCGTGGTGCTGATCCTTCAA CAACCCCGCAATTGATGAATATTGTCAACAACGATCAGGAGTCACCCGCACTCCGGGCCGCAGCGCTTGACGCGGTTGCC AGCGCACCCATTGATCGGGTGATCGAACTGATGACCACCCAGCCTGATCCACTGCGGAGTGCCGCATTGCGCGCCCTGAG TCGCAGTGATCGCCCCGCGCCGATCAATCTTCTGCATCGCATGGCATTTGATGCTGACCGGGCTTGTGGATTGGCCGCCG TGAATGCACTCGCCACCCAGATCGATACTGCTGCACCGATCCTCATGCGGATTATTCGCAGCCATCCCGATCTGACGATT CGACTGGCCGCGGCAGCAGCGTTGCGCGATATGGCCGGCCCTGAAGCAGTTACCGTGTTTGTTGAAGGACTGCTCTCGCC CTACCCGGCATTGCAAACACAGGCATTTGCCCTGCTGGCCGCAGCCGATCCGCAACATCCGCTCTTACGACAACTTATTA TCGATCCAAAGATGCCTGACATTCTGAGACTGCTGGCATTGCAGCATCTTTGTACCGTAGCTCCGACCGATGCCATGATC CGCGAGATCGCCTGCGATACCAGCACCTCTGAACGATTGCGCTGCTTTGCCATCAGGGCGCTCGCGCAACAAACCGATAA AGAGACTATAGCGTGTCTGGCTCAGTTGGCAAACGAGCCTGGTGAGCAATCATTGGCCATCCGCTACGCGGCGATTACGG CGCTTACCCAACAATGCCAGGATTTCAACACCTGTGCACGTAGCGCACTCACAACACTAGCCACTTCCCCCATCCCCGAA GTTGCGCTGTGGGCCGGTACTGCGCTGCTCGATTGTCTGACGTTGCCGATCAGTGTTGATGCGAAGGATAGGTTGCAAGG TTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases GACGCGGCTTCTTCTAAACCAGAGTCTCACAGTAAGCCGGCACTCATCTTGAAGAATAGTAGTCTATCGTGATGCGTCTA CCGGTAGTTGGGAAACGAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases AGGTTTGCAGGAGTTTATGTATGTCCCACACCGATTTTGTTACCACCAGCCGTGGCCTGAATCGCAACAGTCCGCCAATG CGACTCTTCGAGAAGGCCAA
Product: PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1227; Mature: 1226
Protein sequence:
>1227_residues MSERSAKRPELHFVPRALRDIFLPRRLPREVRSTIEQWLDAEPLHRVLPGALDLPFAIDLEPASILADTRHLALLGPPAS GRSLALAQIAHRWLAGQTTVPLIRLLLSEIDTPSLTPRAIVVRTLARRNLAPNPLEHNLPCLLLVDDWEDLPLARRSIWQ RFLTSLSERWPQARAVITLPPGELWPGFRHHALTPLPSELLSSWLQALFPHTDTQTLLPLFERDPLILLRERPAELIMLA LTQPLSGWPVSRAALYERIAAFAAPILATSNDQAGWRIGYSAYRAYQQALTLAAQPQLDATSIRNAGTQWRALCLPLTFG IIPDPQPLITALAEANIPTGERLFLIARALRERPRLDPALSRPILEELCQYGGEALNTLVPALPIILIDIGRTQPAQVNT LLERIVGQLAPTAAITLLTDLLDAGDAPPALRWQAIDLLCQRRTLPPPLPPHTDLIGQAGRCLLAVVHNDTLSWLAHPSL QLGLRLLLSGAAGEERQQTIAHHLLHHLDLPPSVRALAPAALPLADLVQAAADPMAEVRQAARSVWLRSGHVDQLARFVT QPHQPWVARDEALTDLAAHPAGATFLAGFALSQRLTLDLRLRAIRLLHRLSNGLSLLKRLLQTETEPVIVRAAAAYQLTH YPQAVSVLTPFLSPHHPPLLRRAAGYALGQIAAQNHPAAVAARTALIQHLHQPDIDTGFTITIITAPGLCGSRQALSALG HLITPTFGVQLLDAWLSALPALIGPVEQWFQEADDIRRAVLADLFITSGTTIDNGNNLLDRPSALIALQVLQIRSAAVRA INLIGRQQPALEPAVRALFDVTLLDSSAPRPFADLLGIYATNDLVHIARNAADDPLLRSAALNTIAERPDGTQALIQLAS QADTNLACAALDQVRPPFSAETIEILLTMAGAEHSEPIRFMALHVLGRGADPSTTPQLMNIVNNDQESPALRAAALDAVA SAPIDRVIELMTTQPDPLRSAALRALSRSDRPAPINLLHRMAFDADRACGLAAVNALATQIDTAAPILMRIIRSHPDLTI RLAAAAALRDMAGPEAVTVFVEGLLSPYPALQTQAFALLAAADPQHPLLRQLIIDPKMPDILRLLALQHLCTVAPTDAMI REIACDTSTSERLRCFAIRALAQQTDKETIACLAQLANEPGEQSLAIRYAAITALTQQCQDFNTCARSALTTLATSPIPE VALWAGTALLDCLTLPISVDAKDRLQG
Sequences:
>Translated_1227_residues MSERSAKRPELHFVPRALRDIFLPRRLPREVRSTIEQWLDAEPLHRVLPGALDLPFAIDLEPASILADTRHLALLGPPAS GRSLALAQIAHRWLAGQTTVPLIRLLLSEIDTPSLTPRAIVVRTLARRNLAPNPLEHNLPCLLLVDDWEDLPLARRSIWQ RFLTSLSERWPQARAVITLPPGELWPGFRHHALTPLPSELLSSWLQALFPHTDTQTLLPLFERDPLILLRERPAELIMLA LTQPLSGWPVSRAALYERIAAFAAPILATSNDQAGWRIGYSAYRAYQQALTLAAQPQLDATSIRNAGTQWRALCLPLTFG IIPDPQPLITALAEANIPTGERLFLIARALRERPRLDPALSRPILEELCQYGGEALNTLVPALPIILIDIGRTQPAQVNT LLERIVGQLAPTAAITLLTDLLDAGDAPPALRWQAIDLLCQRRTLPPPLPPHTDLIGQAGRCLLAVVHNDTLSWLAHPSL QLGLRLLLSGAAGEERQQTIAHHLLHHLDLPPSVRALAPAALPLADLVQAAADPMAEVRQAARSVWLRSGHVDQLARFVT QPHQPWVARDEALTDLAAHPAGATFLAGFALSQRLTLDLRLRAIRLLHRLSNGLSLLKRLLQTETEPVIVRAAAAYQLTH YPQAVSVLTPFLSPHHPPLLRRAAGYALGQIAAQNHPAAVAARTALIQHLHQPDIDTGFTITIITAPGLCGSRQALSALG HLITPTFGVQLLDAWLSALPALIGPVEQWFQEADDIRRAVLADLFITSGTTIDNGNNLLDRPSALIALQVLQIRSAAVRA INLIGRQQPALEPAVRALFDVTLLDSSAPRPFADLLGIYATNDLVHIARNAADDPLLRSAALNTIAERPDGTQALIQLAS QADTNLACAALDQVRPPFSAETIEILLTMAGAEHSEPIRFMALHVLGRGADPSTTPQLMNIVNNDQESPALRAAALDAVA SAPIDRVIELMTTQPDPLRSAALRALSRSDRPAPINLLHRMAFDADRACGLAAVNALATQIDTAAPILMRIIRSHPDLTI RLAAAAALRDMAGPEAVTVFVEGLLSPYPALQTQAFALLAAADPQHPLLRQLIIDPKMPDILRLLALQHLCTVAPTDAMI REIACDTSTSERLRCFAIRALAQQTDKETIACLAQLANEPGEQSLAIRYAAITALTQQCQDFNTCARSALTTLATSPIPE VALWAGTALLDCLTLPISVDAKDRLQG >Mature_1226_residues SERSAKRPELHFVPRALRDIFLPRRLPREVRSTIEQWLDAEPLHRVLPGALDLPFAIDLEPASILADTRHLALLGPPASG RSLALAQIAHRWLAGQTTVPLIRLLLSEIDTPSLTPRAIVVRTLARRNLAPNPLEHNLPCLLLVDDWEDLPLARRSIWQR FLTSLSERWPQARAVITLPPGELWPGFRHHALTPLPSELLSSWLQALFPHTDTQTLLPLFERDPLILLRERPAELIMLAL TQPLSGWPVSRAALYERIAAFAAPILATSNDQAGWRIGYSAYRAYQQALTLAAQPQLDATSIRNAGTQWRALCLPLTFGI IPDPQPLITALAEANIPTGERLFLIARALRERPRLDPALSRPILEELCQYGGEALNTLVPALPIILIDIGRTQPAQVNTL LERIVGQLAPTAAITLLTDLLDAGDAPPALRWQAIDLLCQRRTLPPPLPPHTDLIGQAGRCLLAVVHNDTLSWLAHPSLQ LGLRLLLSGAAGEERQQTIAHHLLHHLDLPPSVRALAPAALPLADLVQAAADPMAEVRQAARSVWLRSGHVDQLARFVTQ PHQPWVARDEALTDLAAHPAGATFLAGFALSQRLTLDLRLRAIRLLHRLSNGLSLLKRLLQTETEPVIVRAAAAYQLTHY PQAVSVLTPFLSPHHPPLLRRAAGYALGQIAAQNHPAAVAARTALIQHLHQPDIDTGFTITIITAPGLCGSRQALSALGH LITPTFGVQLLDAWLSALPALIGPVEQWFQEADDIRRAVLADLFITSGTTIDNGNNLLDRPSALIALQVLQIRSAAVRAI NLIGRQQPALEPAVRALFDVTLLDSSAPRPFADLLGIYATNDLVHIARNAADDPLLRSAALNTIAERPDGTQALIQLASQ ADTNLACAALDQVRPPFSAETIEILLTMAGAEHSEPIRFMALHVLGRGADPSTTPQLMNIVNNDQESPALRAAALDAVAS APIDRVIELMTTQPDPLRSAALRALSRSDRPAPINLLHRMAFDADRACGLAAVNALATQIDTAAPILMRIIRSHPDLTIR LAAAAALRDMAGPEAVTVFVEGLLSPYPALQTQAFALLAAADPQHPLLRQLIIDPKMPDILRLLALQHLCTVAPTDAMIR EIACDTSTSERLRCFAIRALAQQTDKETIACLAQLANEPGEQSLAIRYAAITALTQQCQDFNTCARSALTTLATSPIPEV ALWAGTALLDCLTLPISVDAKDRLQG
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 133292; Mature: 133161
Theoretical pI: Translated: 6.79; Mature: 6.79
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.2 %Cys (Translated Protein) 1.0 %Met (Translated Protein) 2.2 %Cys+Met (Translated Protein) 1.2 %Cys (Mature Protein) 0.9 %Met (Mature Protein) 2.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSERSAKRPELHFVPRALRDIFLPRRLPREVRSTIEQWLDAEPLHRVLPGALDLPFAIDL CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCCCEEECC EPASILADTRHLALLGPPASGRSLALAQIAHRWLAGQTTVPLIRLLLSEIDTPSLTPRAI CHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHH VVRTLARRNLAPNPLEHNLPCLLLVDDWEDLPLARRSIWQRFLTSLSERWPQARAVITLP HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECC PGELWPGFRHHALTPLPSELLSSWLQALFPHTDTQTLLPLFERDPLILLRERPAELIMLA CCHHCCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHH LTQPLSGWPVSRAALYERIAAFAAPILATSNDQAGWRIGYSAYRAYQQALTLAAQPQLDA HHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH TSIRNAGTQWRALCLPLTFGIIPDPQPLITALAEANIPTGERLFLIARALRERPRLDPAL HHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH SRPILEELCQYGGEALNTLVPALPIILIDIGRTQPAQVNTLLERIVGQLAPTAAITLLTD CCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHH LLDAGDAPPALRWQAIDLLCQRRTLPPPLPPHTDLIGQAGRCLLAVVHNDTLSWLAHPSL 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PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA