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The map label for this gene is spoVB [H]

Identifier: 220933036

GI number: 220933036

Start: 2399595

End: 2401148

Strand: Direct

Name: spoVB [H]

Synonym: Hore_22040

Alternate gene names: 220933036

Gene position: 2399595-2401148 (Clockwise)

Preceding gene: 220933035

Following gene: 220933037

Centisome position: 93.07

GC content: 40.41

Gene sequence:

>1554_bases
ATGGAAAAACAATCACTGTTAAAAGGGGCTTTTATCTTAATAATTGCGGGTTTTATAAACAGGGTGCTGGGTTTCATACT
AAGGATAATACTCGTCCAGATGATCGGTGATGAAGGACTGGGCCTTTTTCAGATGGTTTATCCCTTTTTTATAACCCTCC
TTCTTATCAGTACCGCCAGTTTTCCCACGGCAATATCAAAACTTATACCGGAAAGGCTGGCCCGAAATGATAAAAAAGGA
GTCTATCAATTACTCAAGACTTCATTACTTTTTGTTGGAGGGATGGGGCTACTTACCGGCACTCTTTTATACTTTTTATC
TGGTTTTGTATCACAGAACATATTCGGTGATCCCAGAACCAGGATTATTTTAATGACGTTAACCCCGGCCCTTTTTATAA
CCCCTCTGGCCTCAAGCCTCAGGGGGTTTTTTCAGGGACACCATACTATGATTCCTACTGCTGTATCACAGATTACAGAA
CAAATTAACAGGATGGGCTCCACCCTGGTTATGGTCAGTATAACCGGCTATCTCGGTCTTAAATATCAGGCAGCCAGTAT
TGGGCTGGGAATCAGTATCGGGGAACTATCCGGGTTAATTATCCTCCTATACTTTTTTGTTACACATATCAAGACCGATA
ATAAAAAGATAACCCCCCTGAGAATCAAAACCGGGGTCTTCCACTGCTTTAAAGAAATTACTAAAATTGCCTTTCCAATC
ACAGCAGGGCGTCTAATCAACTCTCTGATGTTAAGTGTGGAAGCTATTCTAATTCCCAGACAACTTCAAAACAGTGGTCT
GGGGGTCAGAGAAGCCACCTCCCTGTTCGGTCAATTGAGTGGTATGGTAGAACAGATTATCTTCTTTCCCACAGTGGTAA
CCATCGGTCTTACTACCAGCCTTATTCCAAATATATCAGATGCCCATGCCCGGAATAATATAACTAAAATAAGGAAAAAC
TATCAGGATGTTATCAGGGTAACAACGTATCTTGGTTTTCCACTGACGGTAATCTTTTTTCTAAGGGGACGGGAAATATG
TAATCTTTTATTCAACTTCCCTGCTGCTGGCCCTATTCTATCAGCTATGGCTCTGACCGCCACCTTTATCTATTATCTTC
ATGTCTCTTCAGGAATGCTCAATGGCCTCGGAAAACCTCAACTGGCCTTATTAAATCTGGGAATCGGCTCTGCCATAAAA
CTTACTGGAATTTACTTTTTAACCCCCAGACCAGAGCTTAGAATAATTGGCTCTATAATAAGTATAACTCTGGGTTATAT
TGCAGCTGCCATCCTTAATTTCTTTACCATAGGAAATACAATTGGTTATGACCTTGATATTAAACAGACCCTGGTAAAAC
CACTATTTTCCAGTTTTCTTATCTTCATAATAACTCCGTACCTGTCCCGTATTTTACATCCCCTTTATAACCTTTATAAT
ATCCGGTTGGTTACACTATTAGAACTTGTAATACTCGGCTTTGTTTACCTGATAACCATGTTTGCCATAAAAGCTATCAC
GGCAGATGATATCAAGAGGTTTACCGGTAACTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCAGTAGACAATAATTTTTACATAATGTGTACCAGGTGGCGGTAGTCCCAACGACTTCCGTTATTTTAAATTTAATAGTT
CGAGATAAAAAGGTGATGGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTTGTTTTATAAATGCTTTATTTATGTTATAATACAGGTAATGGTTAATTTTAAATAAAGGTAATACGCAGATAAAACT
GGAGGCAAAGTAGCTTAATA

Product: polysaccharide biosynthesis protein

Products: NA

Alternate protein names: Stage III sporulation protein F [H]

Number of amino acids: Translated: 517; Mature: 517

Protein sequence:

>517_residues
MEKQSLLKGAFILIIAGFINRVLGFILRIILVQMIGDEGLGLFQMVYPFFITLLLISTASFPTAISKLIPERLARNDKKG
VYQLLKTSLLFVGGMGLLTGTLLYFLSGFVSQNIFGDPRTRIILMTLTPALFITPLASSLRGFFQGHHTMIPTAVSQITE
QINRMGSTLVMVSITGYLGLKYQAASIGLGISIGELSGLIILLYFFVTHIKTDNKKITPLRIKTGVFHCFKEITKIAFPI
TAGRLINSLMLSVEAILIPRQLQNSGLGVREATSLFGQLSGMVEQIIFFPTVVTIGLTTSLIPNISDAHARNNITKIRKN
YQDVIRVTTYLGFPLTVIFFLRGREICNLLFNFPAAGPILSAMALTATFIYYLHVSSGMLNGLGKPQLALLNLGIGSAIK
LTGIYFLTPRPELRIIGSIISITLGYIAAAILNFFTIGNTIGYDLDIKQTLVKPLFSSFLIFIITPYLSRILHPLYNLYN
IRLVTLLELVILGFVYLITMFAIKAITADDIKRFTGN

Sequences:

>Translated_517_residues
MEKQSLLKGAFILIIAGFINRVLGFILRIILVQMIGDEGLGLFQMVYPFFITLLLISTASFPTAISKLIPERLARNDKKG
VYQLLKTSLLFVGGMGLLTGTLLYFLSGFVSQNIFGDPRTRIILMTLTPALFITPLASSLRGFFQGHHTMIPTAVSQITE
QINRMGSTLVMVSITGYLGLKYQAASIGLGISIGELSGLIILLYFFVTHIKTDNKKITPLRIKTGVFHCFKEITKIAFPI
TAGRLINSLMLSVEAILIPRQLQNSGLGVREATSLFGQLSGMVEQIIFFPTVVTIGLTTSLIPNISDAHARNNITKIRKN
YQDVIRVTTYLGFPLTVIFFLRGREICNLLFNFPAAGPILSAMALTATFIYYLHVSSGMLNGLGKPQLALLNLGIGSAIK
LTGIYFLTPRPELRIIGSIISITLGYIAAAILNFFTIGNTIGYDLDIKQTLVKPLFSSFLIFIITPYLSRILHPLYNLYN
IRLVTLLELVILGFVYLITMFAIKAITADDIKRFTGN
>Mature_517_residues
MEKQSLLKGAFILIIAGFINRVLGFILRIILVQMIGDEGLGLFQMVYPFFITLLLISTASFPTAISKLIPERLARNDKKG
VYQLLKTSLLFVGGMGLLTGTLLYFLSGFVSQNIFGDPRTRIILMTLTPALFITPLASSLRGFFQGHHTMIPTAVSQITE
QINRMGSTLVMVSITGYLGLKYQAASIGLGISIGELSGLIILLYFFVTHIKTDNKKITPLRIKTGVFHCFKEITKIAFPI
TAGRLINSLMLSVEAILIPRQLQNSGLGVREATSLFGQLSGMVEQIIFFPTVVTIGLTTSLIPNISDAHARNNITKIRKN
YQDVIRVTTYLGFPLTVIFFLRGREICNLLFNFPAAGPILSAMALTATFIYYLHVSSGMLNGLGKPQLALLNLGIGSAIK
LTGIYFLTPRPELRIIGSIISITLGYIAAAILNFFTIGNTIGYDLDIKQTLVKPLFSSFLIFIITPYLSRILHPLYNLYN
IRLVTLLELVILGFVYLITMFAIKAITADDIKRFTGN

Specific function: Involved, directly or indirectly, in spore cortex biosynthesis. Affects only indirectly the expression of late sporulation genes [H]

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the polysaccharide synthase family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528
- InterPro:   IPR002797
- InterPro:   IPR014249 [H]

Pfam domain/function: PF01943 Polysacc_synt [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 57055; Mature: 57055

Theoretical pI: Translated: 10.43; Mature: 10.43

Prosite motif: PS01039 SBP_BACTERIAL_3

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
2.5 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
2.5 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEKQSLLKGAFILIIAGFINRVLGFILRIILVQMIGDEGLGLFQMVYPFFITLLLISTAS
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
FPTAISKLIPERLARNDKKGVYQLLKTSLLFVGGMGLLTGTLLYFLSGFVSQNIFGDPRT
HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
RIILMTLTPALFITPLASSLRGFFQGHHTMIPTAVSQITEQINRMGSTLVMVSITGYLGL
EEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEHHHHCC
KYQAASIGLGISIGELSGLIILLYFFVTHIKTDNKKITPLRIKTGVFHCFKEITKIAFPI
EEEEHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCH
TAGRLINSLMLSVEAILIPRQLQNSGLGVREATSLFGQLSGMVEQIIFFPTVVTIGLTTS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIPNISDAHARNNITKIRKNYQDVIRVTTYLGFPLTVIFFLRGREICNLLFNFPAAGPIL
HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
SAMALTATFIYYLHVSSGMLNGLGKPQLALLNLGIGSAIKLTGIYFLTPRPELRIIGSII
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCEEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHH
SITLGYIAAAILNFFTIGNTIGYDLDIKQTLVKPLFSSFLIFIITPYLSRILHPLYNLYN
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IRLVTLLELVILGFVYLITMFAIKAITADDIKRFTGN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MEKQSLLKGAFILIIAGFINRVLGFILRIILVQMIGDEGLGLFQMVYPFFITLLLISTAS
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
FPTAISKLIPERLARNDKKGVYQLLKTSLLFVGGMGLLTGTLLYFLSGFVSQNIFGDPRT
HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
RIILMTLTPALFITPLASSLRGFFQGHHTMIPTAVSQITEQINRMGSTLVMVSITGYLGL
EEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEHHHHCC
KYQAASIGLGISIGELSGLIILLYFFVTHIKTDNKKITPLRIKTGVFHCFKEITKIAFPI
EEEEHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCH
TAGRLINSLMLSVEAILIPRQLQNSGLGVREATSLFGQLSGMVEQIIFFPTVVTIGLTTS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIPNISDAHARNNITKIRKNYQDVIRVTTYLGFPLTVIFFLRGREICNLLFNFPAAGPIL
HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
SAMALTATFIYYLHVSSGMLNGLGKPQLALLNLGIGSAIKLTGIYFLTPRPELRIIGSII
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCEEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHH
SITLGYIAAAILNFFTIGNTIGYDLDIKQTLVKPLFSSFLIFIITPYLSRILHPLYNLYN
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IRLVTLLELVILGFVYLITMFAIKAITADDIKRFTGN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 1744050; 9384377 [H]