| Definition | Vibrio splendidus LGP32 chromosome 1, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011753 |
| Length | 3,299,303 |
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The map label for this gene is mukB [H]
Identifier: 218709090
GI number: 218709090
Start: 1153450
End: 1157904
Strand: Direct
Name: mukB [H]
Synonym: VS_1096
Alternate gene names: 218709090
Gene position: 1153450-1157904 (Clockwise)
Preceding gene: 218709089
Following gene: 218709098
Centisome position: 34.96
GC content: 47.09
Gene sequence:
>4455_bases ATGATTGAAAGAGGTAAGTATCAATCATTAACCATGATCAACTGGAACGGTTTCTTTGCACGTACTTTTGATATCGATGG ATTGGTTACAACGCTTTCTGGCGGTAACGGTGCGGGTAAGTCGACCACAATGGCGGCATTCATCACTGCACTTATTCCTG ACCAAAGCCTTCTGCATTTCCGTAACACAACGGAAGCGGGTAGCTCACAGTCATCACGCGATAAAGGCCTTTACGGTAAG CTTCAGCCGGGTGCATGTTATGCCGCGCTAGATGTTGTGAACTCTCGTAATCAACGCCTATTGTTTGCAGTAAAACTGCA GCAAGTTGCGGGTCGTGATAAGAAGGTCGACATCAAACCGTTTGTAATCCAAGGCCTTCCAAGCCATGTGAAGCCAACGG ATGTATTGATTCAGAACGTTTCAGACAGCCACGCTCGTGTGTGTCAACTGAACGACGTGAAAGCAGCGGTAGCGCAATAT GAAGGGGCGCACTTTAAAGCTTTCTCTTCTATTGTTGATTACCACTCACAGATGTTTGAGTACGGTGTTGTTCCTAAGAA ACTGCGTAACAGCAGTGACCGTTCTAAGTTCTACCGTTTGATTGAAGCATCACTTTACGGCGGTATCTCAAGTGCGATTA CACGTTCTCTGCGTGATTACCTTCTGCCGCAAAATGGCGGTGTGAAGAAAGCATTCCAAGATATGGAATCAGCACTGCGT GAAAACCGCATGACGCTAGAAGCGATCAAAACGACTCAGTCGGATCGTGACCTGTTCAAGCACTTGATCACTGAATCTAC GAACTACGTGGCAGCAGATTACATGCGCCATGCCAACGATCGTCGTAACAAGCTTGATCAAACCATGAAGTTCCGTGGTG AACTGTTTGGTTCTCGCGAGACCTTGCTTGATCAAAACAACTTGTTGAACCGCGTTCAAGAAGAGCTTGAGTTGTTGGTC GATCAAGAATCGGCACTAGAGCAAGACTATCAAGCGGCTTCGGATCATCTTCAATTGGTTCAAACAGCACTTCGTCAGCA AGAGAAAATTGCTCGTTACAGCGAAGATCTAGAAGAGCTTAATGAGCGTCTAGAAGAGCAGATGATGGTGGTTGAAGAAG CTCAAGAGCGAGTACTTCTTGCTGAAGAACAGGCAACCATAACTGAAGAAGAAGTGGATAGCCTGAAAACTCAGCTTGCT GACTACCAACAAGCGTTGGATGTTCAGCAGACTCGTGCGCTTCAATACCAACAAGCGGTTCAAGCATTAGAGAAAACTAA GCAGCTACTTGATGATGAGTCTATTACGGCAGAAAGCGCATTAACTCTGGTTTCTGAGCTAAAAGCACAAGAAGAATCAA GCACTCAAACGTTACTGTCGACTAAGCATAAACTAGACATGTCTTCTGCTGCGTCTGCGCAGTTCGACAAAGCGCTCGCT CTTGTTAAAAGCATCGTTGGTGACGTTGAGCGTAAAGAAGCGTCTCACAGCGCTAAGCAAGCTCTAGAAAAAGGTCGTAA CGCTAAACACGTTGTTGAGAACGAACAGCAATGGCGTGCTCAGCATCGCGACATGGCTCGTGATGTAGCGCAGCAACGTC AAGCAAAAGAGCTTGCGACTGAATACCAAAAGCAACACAACATTTCACTGACTGACGAAGCGGTTTTCGACGAAGAACGC GAACGTCATGCAATGCAGATCGAAACGCTTGAGTACGCTCAAGAAGAGTTACGTGAAGCGAAAAGTGAACAACGTCGTGT GCAACAAAATCACGACCAAGAGATTCAAAAACTAGAGTCTATTGCTCCTGCTTGGATCACAGCAAACGATGCGCTTGAAG CATTAAGAGATCAAACCGAAGCTGAGCTAGAAGATAGCCAAGCGGTAATGACTCAAATGCAGCAAGTGCTTGAAGATGAG AAATCTCAAGCGGTTGCTAAAGATCAATTGGCAACGCGCCGTGCTGAACTTGAGCAAGAAATTGAGCGCCTAGCATCTCC AGGTGGTTCTAATGATCCTCGCCTGAAAGGCCTAGCGGATACGCTTGGTGGTGTATTGCTTTCTGAGATCTACGATGACA TCACGATTGGCGATGCGCCGTACTTCAGTGCGATGTACGGCCCGGCTCGTCACGCAATTGTAGTTTCGGACCTTGATGGC ATCAAAGAGAAGCTGGTGGATCTTGATGATTGTCCAGAAGACCTTTACATCTTAGAAGGTGATGTAGACGCGTTTGATGA CAGCTCATTCAATGCCGATGAGCTTGAAGGTGCGGTGTGTGTTCAGTTGAACGATCGTCAAATGCGTTACTCGCGCTTCC CTGAGATTCCATTGTTTGGCCGTGCGGCTCGTGAGCAACGCCTAGAGAAATTGCGTGAAGAGCGTGACGTTGTGGTAGAA AACCACGCCAAAGCTGCGTTTGACTCTCAAAAATTGAATCGTTTATACCAAGCATTCAACAGCTTTGTTGCTAAGCATCT GTACGTTGTGTTTAACGCAGATCCAGAGCAGGCGCTAGCGTCTATTCGTGATAAGGGTAATCAAATTGTTCGTTCTCTGG CTGAGCTTGACTCTAAAGAGCAACAACAACGCAGTCAGCTTCTACAAAGCAAGCAGGCACTTGGTGCTCTGGACAAACTG GCACCAATGGTTCGTATTCTTGAAGACGAAACATTAGCTGAGCGTCTCGCTGAATTGGAAGCACAATTAGAGCGTTTAAG CGAAGCTAAGTCTTACTTGAACACTCATGGCAAAGCGCTTACTTCATTAGAGCAAATCGTTTCTGCACTCGATGCTGACC CAGAGCAGTTCGAAGCTTTGGAAGCCGAGTATCGTCAGGCGGACAGCGCGTTACAAACTCTAAAAGGTAAAGTGTTTGCT CTTTCTGACTTAATCGAACGTCGTCACTACTTTGCTTACGCAGATTCTGTTGACCTGCTTAACAAGAGCAGCGAACTTAG CGAGCAACTGAAAGCGAAGTTGGTTCAAGCAGAACAAGCACGAGCTAAAGGCCGCGATGGCTTGAAGCAAGCTCGCGAAC AGATGAACCAATACAACCAAGTATTGGCAGCACTGAAGAGCTCGCATCAAGCGAAGCAAGAGACCGTTCAGGAATTCAAA CAAGAGCTTCAAGAGTTCGGTGTTAACGCTGATGAAGGTGCTGAAGAGCGCGCGGTTCGTCGTCGTGACGAGCTTCAAGA GCGTTTGCATACTTCTCGTAGCCGTAAGAGTGAATACGAACGCACGATTACCTCAACTGAACTTGAGATGAAAGCGCTGG CTAAGCGTCTTAAGAAAGTTCAGAAAGAGTACACAGAGCTTCGTACCTTCGTTGTTGCAGCAAAAGCAGGCTGGTGTTCA GTACTGCGTTTAGCGCGTGAGAATGACGTTGAACGTCGTCTGCACAAACGTGAACTGGCTTATCTAACGGCGGGCGAACT TCGCTCTATGTCGGATAAATCACTGGGTGCGCTACGTCTGGCTGTAGCCGACAATGACGATCTGCGTGATTCGCTGCGTC TCTCTGAAGACAACGCACATCCAGAGCGTAAGGTTCTGTTTTACATTGCGGTTTACCAACACCTTCGTGAGCGTATTCGC CAAGACATCATTCATACCGATGATCCGGTTGAAGCAATCGAAGAGATGGAAGTTGAACTTGCTCGACTAACTGAAGAACT GACGCAGCGTGAAAACCGCTTAGCGATCAGCTCTGAGTCGGTAGCAAGTATCATAAAGAAAACGATTCAGCGCGAGCAGA ACCGTATTCGTATGCTCAACCAAGGTCTGTCGAATATCTACTTTGGTCAGGTTAAGGGCGTGCGTCTGAACGTTAAGATC CGTGAAAGCCACGAGATTTTGCTATCAGGGCTAGCGACTCAACAAGATCAACACAAAGATTTGTTTGAATCAACGCGCTT TACCTTCTCTGAAGCGATGGCGAAGTTGTTCCAACGTGTCAATCCACATATCGATATGGGTCAACGTTCTCCGCAAGTTC TTGGTGAAGAGTTACTGGATTACCGTAACTACCTAGAGCTGAGTGTTGAAGTTAACCGTGGTTCAGACGGTTGGTTACAA GCGGAATCGGGTGCATTGTCTACGGGTGAGGCGATCGGTACGGGTCAGTCAATCCTATTGATGGTTATTCAGAGCTGGGA AGAGGAATCTCGTCGACTTCGTAGTAAAGACATCGTTCCATGTCGTTTGTTGTTCCTTGATGAAGCCGCTCGTCTGGATT CTAAGTCGATCTCTACGCTGTTTGAACTGTGTGACCGTTTAGGTATGCAACTTCTGATTGCTGCGCCAGAGAACATTAGC CCAGAGAAAGGTACAACCTACAAACTGGTTCGTAAGGTTTTCAAAGACCACGAACACGTACACGTTGTTGGTCTGCGTGG TTTTGCTCAAAACAAACCGGTATCTCCTGTTCAAGAGCTTATCGAAACCCCTTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TAGACGTAGACGAAAACGGTCAACAAGATATTTTTAACGATCAAGCCGGCTTTGACCTTGAGTCAAGCGATGGCGAACAA ACAAAAGTAGAAGGTGAAGC
Downstream 100 bases:
>100_bases AAGCGTAATCTATCTACCGTAAATTAATGGCCTCGAAGTATATACTTCGGGGCTTTTTTTGTTTGGCAGCTTCACGGGTC TCGTATTCTTTTGGTGAGGG
Product: cell division protein MukB
Products: NA
Alternate protein names: Structural maintenance of chromosome-related protein [H]
Number of amino acids: Translated: 1484; Mature: 1484
Protein sequence:
>1484_residues MIERGKYQSLTMINWNGFFARTFDIDGLVTTLSGGNGAGKSTTMAAFITALIPDQSLLHFRNTTEAGSSQSSRDKGLYGK LQPGACYAALDVVNSRNQRLLFAVKLQQVAGRDKKVDIKPFVIQGLPSHVKPTDVLIQNVSDSHARVCQLNDVKAAVAQY EGAHFKAFSSIVDYHSQMFEYGVVPKKLRNSSDRSKFYRLIEASLYGGISSAITRSLRDYLLPQNGGVKKAFQDMESALR ENRMTLEAIKTTQSDRDLFKHLITESTNYVAADYMRHANDRRNKLDQTMKFRGELFGSRETLLDQNNLLNRVQEELELLV DQESALEQDYQAASDHLQLVQTALRQQEKIARYSEDLEELNERLEEQMMVVEEAQERVLLAEEQATITEEEVDSLKTQLA DYQQALDVQQTRALQYQQAVQALEKTKQLLDDESITAESALTLVSELKAQEESSTQTLLSTKHKLDMSSAASAQFDKALA LVKSIVGDVERKEASHSAKQALEKGRNAKHVVENEQQWRAQHRDMARDVAQQRQAKELATEYQKQHNISLTDEAVFDEER ERHAMQIETLEYAQEELREAKSEQRRVQQNHDQEIQKLESIAPAWITANDALEALRDQTEAELEDSQAVMTQMQQVLEDE KSQAVAKDQLATRRAELEQEIERLASPGGSNDPRLKGLADTLGGVLLSEIYDDITIGDAPYFSAMYGPARHAIVVSDLDG IKEKLVDLDDCPEDLYILEGDVDAFDDSSFNADELEGAVCVQLNDRQMRYSRFPEIPLFGRAAREQRLEKLREERDVVVE NHAKAAFDSQKLNRLYQAFNSFVAKHLYVVFNADPEQALASIRDKGNQIVRSLAELDSKEQQQRSQLLQSKQALGALDKL APMVRILEDETLAERLAELEAQLERLSEAKSYLNTHGKALTSLEQIVSALDADPEQFEALEAEYRQADSALQTLKGKVFA LSDLIERRHYFAYADSVDLLNKSSELSEQLKAKLVQAEQARAKGRDGLKQAREQMNQYNQVLAALKSSHQAKQETVQEFK QELQEFGVNADEGAEERAVRRRDELQERLHTSRSRKSEYERTITSTELEMKALAKRLKKVQKEYTELRTFVVAAKAGWCS VLRLARENDVERRLHKRELAYLTAGELRSMSDKSLGALRLAVADNDDLRDSLRLSEDNAHPERKVLFYIAVYQHLRERIR QDIIHTDDPVEAIEEMEVELARLTEELTQRENRLAISSESVASIIKKTIQREQNRIRMLNQGLSNIYFGQVKGVRLNVKI RESHEILLSGLATQQDQHKDLFESTRFTFSEAMAKLFQRVNPHIDMGQRSPQVLGEELLDYRNYLELSVEVNRGSDGWLQ AESGALSTGEAIGTGQSILLMVIQSWEEESRRLRSKDIVPCRLLFLDEAARLDSKSISTLFELCDRLGMQLLIAAPENIS PEKGTTYKLVRKVFKDHEHVHVVGLRGFAQNKPVSPVQELIETP
Sequences:
>Translated_1484_residues MIERGKYQSLTMINWNGFFARTFDIDGLVTTLSGGNGAGKSTTMAAFITALIPDQSLLHFRNTTEAGSSQSSRDKGLYGK LQPGACYAALDVVNSRNQRLLFAVKLQQVAGRDKKVDIKPFVIQGLPSHVKPTDVLIQNVSDSHARVCQLNDVKAAVAQY EGAHFKAFSSIVDYHSQMFEYGVVPKKLRNSSDRSKFYRLIEASLYGGISSAITRSLRDYLLPQNGGVKKAFQDMESALR ENRMTLEAIKTTQSDRDLFKHLITESTNYVAADYMRHANDRRNKLDQTMKFRGELFGSRETLLDQNNLLNRVQEELELLV DQESALEQDYQAASDHLQLVQTALRQQEKIARYSEDLEELNERLEEQMMVVEEAQERVLLAEEQATITEEEVDSLKTQLA DYQQALDVQQTRALQYQQAVQALEKTKQLLDDESITAESALTLVSELKAQEESSTQTLLSTKHKLDMSSAASAQFDKALA LVKSIVGDVERKEASHSAKQALEKGRNAKHVVENEQQWRAQHRDMARDVAQQRQAKELATEYQKQHNISLTDEAVFDEER ERHAMQIETLEYAQEELREAKSEQRRVQQNHDQEIQKLESIAPAWITANDALEALRDQTEAELEDSQAVMTQMQQVLEDE KSQAVAKDQLATRRAELEQEIERLASPGGSNDPRLKGLADTLGGVLLSEIYDDITIGDAPYFSAMYGPARHAIVVSDLDG IKEKLVDLDDCPEDLYILEGDVDAFDDSSFNADELEGAVCVQLNDRQMRYSRFPEIPLFGRAAREQRLEKLREERDVVVE NHAKAAFDSQKLNRLYQAFNSFVAKHLYVVFNADPEQALASIRDKGNQIVRSLAELDSKEQQQRSQLLQSKQALGALDKL APMVRILEDETLAERLAELEAQLERLSEAKSYLNTHGKALTSLEQIVSALDADPEQFEALEAEYRQADSALQTLKGKVFA LSDLIERRHYFAYADSVDLLNKSSELSEQLKAKLVQAEQARAKGRDGLKQAREQMNQYNQVLAALKSSHQAKQETVQEFK QELQEFGVNADEGAEERAVRRRDELQERLHTSRSRKSEYERTITSTELEMKALAKRLKKVQKEYTELRTFVVAAKAGWCS VLRLARENDVERRLHKRELAYLTAGELRSMSDKSLGALRLAVADNDDLRDSLRLSEDNAHPERKVLFYIAVYQHLRERIR QDIIHTDDPVEAIEEMEVELARLTEELTQRENRLAISSESVASIIKKTIQREQNRIRMLNQGLSNIYFGQVKGVRLNVKI RESHEILLSGLATQQDQHKDLFESTRFTFSEAMAKLFQRVNPHIDMGQRSPQVLGEELLDYRNYLELSVEVNRGSDGWLQ AESGALSTGEAIGTGQSILLMVIQSWEEESRRLRSKDIVPCRLLFLDEAARLDSKSISTLFELCDRLGMQLLIAAPENIS PEKGTTYKLVRKVFKDHEHVHVVGLRGFAQNKPVSPVQELIETP >Mature_1484_residues MIERGKYQSLTMINWNGFFARTFDIDGLVTTLSGGNGAGKSTTMAAFITALIPDQSLLHFRNTTEAGSSQSSRDKGLYGK LQPGACYAALDVVNSRNQRLLFAVKLQQVAGRDKKVDIKPFVIQGLPSHVKPTDVLIQNVSDSHARVCQLNDVKAAVAQY EGAHFKAFSSIVDYHSQMFEYGVVPKKLRNSSDRSKFYRLIEASLYGGISSAITRSLRDYLLPQNGGVKKAFQDMESALR ENRMTLEAIKTTQSDRDLFKHLITESTNYVAADYMRHANDRRNKLDQTMKFRGELFGSRETLLDQNNLLNRVQEELELLV DQESALEQDYQAASDHLQLVQTALRQQEKIARYSEDLEELNERLEEQMMVVEEAQERVLLAEEQATITEEEVDSLKTQLA DYQQALDVQQTRALQYQQAVQALEKTKQLLDDESITAESALTLVSELKAQEESSTQTLLSTKHKLDMSSAASAQFDKALA LVKSIVGDVERKEASHSAKQALEKGRNAKHVVENEQQWRAQHRDMARDVAQQRQAKELATEYQKQHNISLTDEAVFDEER ERHAMQIETLEYAQEELREAKSEQRRVQQNHDQEIQKLESIAPAWITANDALEALRDQTEAELEDSQAVMTQMQQVLEDE KSQAVAKDQLATRRAELEQEIERLASPGGSNDPRLKGLADTLGGVLLSEIYDDITIGDAPYFSAMYGPARHAIVVSDLDG IKEKLVDLDDCPEDLYILEGDVDAFDDSSFNADELEGAVCVQLNDRQMRYSRFPEIPLFGRAAREQRLEKLREERDVVVE NHAKAAFDSQKLNRLYQAFNSFVAKHLYVVFNADPEQALASIRDKGNQIVRSLAELDSKEQQQRSQLLQSKQALGALDKL APMVRILEDETLAERLAELEAQLERLSEAKSYLNTHGKALTSLEQIVSALDADPEQFEALEAEYRQADSALQTLKGKVFA LSDLIERRHYFAYADSVDLLNKSSELSEQLKAKLVQAEQARAKGRDGLKQAREQMNQYNQVLAALKSSHQAKQETVQEFK QELQEFGVNADEGAEERAVRRRDELQERLHTSRSRKSEYERTITSTELEMKALAKRLKKVQKEYTELRTFVVAAKAGWCS VLRLARENDVERRLHKRELAYLTAGELRSMSDKSLGALRLAVADNDDLRDSLRLSEDNAHPERKVLFYIAVYQHLRERIR QDIIHTDDPVEAIEEMEVELARLTEELTQRENRLAISSESVASIIKKTIQREQNRIRMLNQGLSNIYFGQVKGVRLNVKI RESHEILLSGLATQQDQHKDLFESTRFTFSEAMAKLFQRVNPHIDMGQRSPQVLGEELLDYRNYLELSVEVNRGSDGWLQ AESGALSTGEAIGTGQSILLMVIQSWEEESRRLRSKDIVPCRLLFLDEAARLDSKSISTLFELCDRLGMQLLIAAPENIS PEKGTTYKLVRKVFKDHEHVHVVGLRGFAQNKPVSPVQELIETP
Specific function: Plays a central role in chromosome condensation, segregation and cell cycle progression. Functions as a homodimer, which is essential for chromosome partition. Involved in negative DNA supercoiling in vivo, and by this means organize and compact chromosom
COG id: COG3096
COG function: function code D; Uncharacterized protein involved in chromosome partitioning
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasm, nucleoid. Note=Restricted to the nucleoid region (By similarity) [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the SMC family. MukB subfamily [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1787154, Length=1476, Percent_Identity=57.8590785907859, Blast_Score=1714, Evalue=0.0,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR012090 - InterPro: IPR007406 [H]
Pfam domain/function: PF04310 MukB [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 168412; Mature: 168412
Theoretical pI: Translated: 5.08; Mature: 5.08
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 1.8 %Met (Translated Protein) 2.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 1.8 %Met (Mature Protein) 2.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIERGKYQSLTMINWNGFFARTFDIDGLVTTLSGGNGAGKSTTMAAFITALIPDQSLLHF CCCCCCCCEEEEEECCCEEEEEEECCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH RNTTEAGSSQSSRDKGLYGKLQPGACYAALDVVNSRNQRLLFAVKLQQVAGRDKKVDIKP CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEHHEEHHHHCCCCCCCCCCH FVIQGLPSHVKPTDVLIQNVSDSHARVCQLNDVKAAVAQYEGAHFKAFSSIVDYHSQMFE HHCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHEEHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH YGVVPKKLRNSSDRSKFYRLIEASLYGGISSAITRSLRDYLLPQNGGVKKAFQDMESALR HCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHH ENRMTLEAIKTTQSDRDLFKHLITESTNYVAADYMRHANDRRNKLDQTMKFRGELFGSRE HCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH TLLDQNNLLNRVQEELELLVDQESALEQDYQAASDHLQLVQTALRQQEKIARYSEDLEEL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NERLEEQMMVVEEAQERVLLAEEQATITEEEVDSLKTQLADYQQALDVQQTRALQYQQAV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QALEKTKQLLDDESITAESALTLVSELKAQEESSTQTLLSTKHKLDMSSAASAQFDKALA 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PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 12620739 [H]