Definition | Orientia tsutsugamushi str. Ikeda, complete genome. |
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Accession | NC_010793 |
Length | 2,008,987 |
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The map label for this gene is 189184649
Identifier: 189184649
GI number: 189184649
Start: 1765315
End: 1766790
Strand: Reverse
Name: 189184649
Synonym: OTT_1742
Alternate gene names: NA
Gene position: 1766790-1765315 (Counterclockwise)
Preceding gene: 189184650
Following gene: 189184647
Centisome position: 87.94
GC content: 28.32
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases CAATTACAAGACGGAGTACGACAAGCTACAATTGATTCTTAATTGATATTAGCTGCATTTTTTACTGTTTAAAATTTTAT GTGATTATTAAGCTTATATT
Downstream 100 bases:
>100_bases TCAAGAACTCGATATGAGTAGAATGATGTAAAGTCGGTAGAACATAGATTAATATCGAACTCTGGATCATATACTTGCTA AAGTATAAAAGCTAAAAATT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 491; Mature: 490
Protein sequence:
>491_residues MSHYKSTLFILLLLCLLAFTQNQGYAQLQLERFNLRLGIESESISNTDIAIASEIAAKMHVSLFLKHVPADQKLNALSDG VVDIISSSEIPPDIKEYAYLSSIPHRYENYSLFVLGEKNLEFSDSSEFADLIRFHGFRLGVMKNYVYKDNEISKLIQSPD NQDIIFEYETNDEALKALLNNEIDGWITITSSGVASVVQCYHAINRIKHIVITNKVPVYFMFNKKTLPIGLITDLKREIE KFEAKTVKSRIYLFLLIESIHSSWFYGLSIIAGILFTLPSIILALTNNSSLFSIIMLALLPASFSNIALDIIMHKQSQGV FSNPIYIYCNLIIVLIGFFLVRLLGWQGSKIKCDQNFLSYLFVICDALVQSIFMIVGIIVSLMIPMYPIMLWGPVFVLLF SSIGCIVRSVLCRYNAIQDVYSEINFMVIVIWTVIFLNCLDYQYNELNLEKMQYDIVIAILGVFITSTAIHYLLWKKRLL NNKICNWASFR
Sequences:
>Translated_491_residues MSHYKSTLFILLLLCLLAFTQNQGYAQLQLERFNLRLGIESESISNTDIAIASEIAAKMHVSLFLKHVPADQKLNALSDG VVDIISSSEIPPDIKEYAYLSSIPHRYENYSLFVLGEKNLEFSDSSEFADLIRFHGFRLGVMKNYVYKDNEISKLIQSPD NQDIIFEYETNDEALKALLNNEIDGWITITSSGVASVVQCYHAINRIKHIVITNKVPVYFMFNKKTLPIGLITDLKREIE KFEAKTVKSRIYLFLLIESIHSSWFYGLSIIAGILFTLPSIILALTNNSSLFSIIMLALLPASFSNIALDIIMHKQSQGV FSNPIYIYCNLIIVLIGFFLVRLLGWQGSKIKCDQNFLSYLFVICDALVQSIFMIVGIIVSLMIPMYPIMLWGPVFVLLF SSIGCIVRSVLCRYNAIQDVYSEINFMVIVIWTVIFLNCLDYQYNELNLEKMQYDIVIAILGVFITSTAIHYLLWKKRLL NNKICNWASFR >Mature_490_residues SHYKSTLFILLLLCLLAFTQNQGYAQLQLERFNLRLGIESESISNTDIAIASEIAAKMHVSLFLKHVPADQKLNALSDGV VDIISSSEIPPDIKEYAYLSSIPHRYENYSLFVLGEKNLEFSDSSEFADLIRFHGFRLGVMKNYVYKDNEISKLIQSPDN QDIIFEYETNDEALKALLNNEIDGWITITSSGVASVVQCYHAINRIKHIVITNKVPVYFMFNKKTLPIGLITDLKREIEK FEAKTVKSRIYLFLLIESIHSSWFYGLSIIAGILFTLPSIILALTNNSSLFSIIMLALLPASFSNIALDIIMHKQSQGVF SNPIYIYCNLIIVLIGFFLVRLLGWQGSKIKCDQNFLSYLFVICDALVQSIFMIVGIIVSLMIPMYPIMLWGPVFVLLFS SIGCIVRSVLCRYNAIQDVYSEINFMVIVIWTVIFLNCLDYQYNELNLEKMQYDIVIAILGVFITSTAIHYLLWKKRLLN NKICNWASFR
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 56102; Mature: 55971
Theoretical pI: Translated: 6.84; Mature: 6.84
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.8 %Cys (Translated Protein) 2.4 %Met (Translated Protein) 4.3 %Cys+Met (Translated Protein) 1.8 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 4.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSHYKSTLFILLLLCLLAFTQNQGYAQLQLERFNLRLGIESESISNTDIAIASEIAAKMH CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH VSLFLKHVPADQKLNALSDGVVDIISSSEIPPDIKEYAYLSSIPHRYENYSLFVLGEKNL HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCC EFSDSSEFADLIRFHGFRLGVMKNYVYKDNEISKLIQSPDNQDIIFEYETNDEALKALLN CCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHC NEIDGWITITSSGVASVVQCYHAINRIKHIVITNKVPVYFMFNKKTLPIGLITDLKREIE CCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHH KFEAKTVKSRIYLFLLIESIHSSWFYGLSIIAGILFTLPSIILALTNNSSLFSIIMLALL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH PASFSNIALDIIMHKQSQGVFSNPIYIYCNLIIVLIGFFLVRLLGWQGSKIKCDQNFLSY HCCHHHHEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHH LFVICDALVQSIFMIVGIIVSLMIPMYPIMLWGPVFVLLFSSIGCIVRSVLCRYNAIQDV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YSEINFMVIVIWTVIFLNCLDYQYNELNLEKMQYDIVIAILGVFITSTAIHYLLWKKRLL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NNKICNWASFR HCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure SHYKSTLFILLLLCLLAFTQNQGYAQLQLERFNLRLGIESESISNTDIAIASEIAAKMH CCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH VSLFLKHVPADQKLNALSDGVVDIISSSEIPPDIKEYAYLSSIPHRYENYSLFVLGEKNL HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCC EFSDSSEFADLIRFHGFRLGVMKNYVYKDNEISKLIQSPDNQDIIFEYETNDEALKALLN CCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHC NEIDGWITITSSGVASVVQCYHAINRIKHIVITNKVPVYFMFNKKTLPIGLITDLKREIE CCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHH KFEAKTVKSRIYLFLLIESIHSSWFYGLSIIAGILFTLPSIILALTNNSSLFSIIMLALL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH PASFSNIALDIIMHKQSQGVFSNPIYIYCNLIIVLIGFFLVRLLGWQGSKIKCDQNFLSY HCCHHHHEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHH LFVICDALVQSIFMIVGIIVSLMIPMYPIMLWGPVFVLLFSSIGCIVRSVLCRYNAIQDV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YSEINFMVIVIWTVIFLNCLDYQYNELNLEKMQYDIVIAILGVFITSTAIHYLLWKKRLL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NNKICNWASFR HCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA