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Definition Orientia tsutsugamushi str. Ikeda, complete genome.
Accession NC_010793
Length 2,008,987

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The map label for this gene is 189183596

Identifier: 189183596

GI number: 189183596

Start: 714880

End: 717465

Strand: Direct

Name: 189183596

Synonym: OTT_0689

Alternate gene names: NA

Gene position: 714880-717465 (Clockwise)

Preceding gene: 189183595

Following gene: 189183597

Centisome position: 35.58

GC content: 27.38

Gene sequence:

>2586_bases
GTGTCTAAAAGAAAAAACGAAAATCAGATTTCTAGTACAAGTAATGATAATGTATATAAAAAAAGGAAGTATGATGAAAA
AGAGAACTCTATAACAAAGAATACTAATCTACAAAAGAAAAGAAAGTATGGTGAAGATGAGAATTCCGTAACAAATGATG
ACAATATACAAAGTCTTAGTTCTCATAAAAAACAACGTATACAACAAAGTAATTTACTAGATGAGAATATATTTAAAGAT
TGGTTTATGGTGCCACTCAAACACATCGCTTCAACCAATATCGTTATTCGCTTATGGATAAATCAAAGTACTATAAATCA
GATAAGCAATTTATTTAATCATTCTGCTGATATATTACGCGACTGGCGTAAACTGAAAAATAGTATAAATGATAAAATAC
TAATGTTGCAGTTGCCTGAATCTATAACTCAACAATTGGTAAGTATCAATAAATTCATAGGAACAGAGCTATATAAGTGG
ATAAAATATCATGATAACGATGTCCTTTACAATGACAAATCTGAGTATTTAGCAATAAATTATATCTGTAATATAGAATG
GACTCCAAGAGGAACAATTAACTATCTACAAACAGCTAGGAATATTTTAGCAAGAGATGATAATGGTTTGAGTAATGATC
AAAAATATCGACTTGCTTGTAATTATTGTTTAGAGGATAGTATTACAAATTATGCTCAAAAAGTTAATCTAGCAAGTTAT
TTACAAACCATTAGTATTTATAGCAAGCCTATGGTTTATTTTTGGACTTCTCATACGTACTCTACTAATATTGATAGTAC
AACTGCTGATGTAAAGACAATTGATGCATTAGTGAGTGATTATAATAATCGCAATAGAACCAACATAGACACAAATACGT
ATATATTCAATATTCTTATTGAGGATAACTGTCATAAAGCCATGAATTGTGTGCCAATAGAGTACATTTGGAATAGACTT
AGTTATGAAGAGCAATTAAAAAAGATAACATTAGCAATAAACAAAATAAATAATCGAGAGTTTAGATCTTTATTATTATC
TCAACTTGATTACGAACAGCAGAAAAAAATTTTTCAGAATAGTTATTTTTTAAGTATTACGCTAATGAGGTTTTTGAATG
ATTTATTATTGAGTGATTACTTCTTACCTATAGCATATAATGCATTAAATATCATGCCAGAAAAATCATTCTTTTACTTA
ATAGAGGCAGTAGCTGATAGAATTGGTCCAAGCTTGTATTCAAAAATTTATGACGATAATCATTATAAATTTATATTCAA
GGAATTATGGCAGTTTGCTCCAAAGCGGTTAAAGGAATATGTACTTGAATGCAATAATACAGACCTAATACAAAATTTTA
TTGTATTCAAGTTATTTTTGAATGATGAGATTAATAATGATATAGATATAGCAAAGTTAGTATTAGCTGACGCAAATGCT
ACGCACAAAAATAATATAATGTTTTGCGGCTCACTGCAATGCGGAGTTAAGAAATGCAGTGATTTAATTATCAAGAACCA
ATGGAATTTTTTAGATACATTTATTAAGCTGCTTATATCGTCTACAGAAGATATAAACACGCTTAAACAAGAACTTATAA
AAGATCATGGATATCAGATAACAATACATTTTTATCAAAAGCAAGAATATGATAAAGCTGAACATTTTCTCAAGTGGTGT
CTAGAATCAGATGAAAAAATAAAAACTTTCAAAAAAGAATTAGCAAGCAAGGAATTTTCTTGCAAAATATTAGAGTCGAT
TGTTACAAGCAACAAATCTGATTTTATAGAGATAGAACACTATTTTCAGTGGTGTGCTTCAAATGATTTAAAAATAATTA
ATGAGTTAAAGGAATCAATTCCACAAAAATGGTTTCAGGAAGTAATTTTTAAATTAATAGAACAAGATCAGTATGAATTA
TTAGACCAAATTTTAAATTGGTGTTTTTCAAATGATCAAGAAAAAATTAATAATTGTAAAAATAGTTTCTATACAACAAA
GAGAAGCAATTCATATTATTGTTTTAGCTATTTAATTTATAGGTTAATAGAGAAAGATGATTCATTTCAATTATTAGATA
AATTTGTTAAGTGGTGTTTTACTGATATACAAAAAATAAATCAGTTTAAAAAATGGATACTTTGTCCTCAAGATGATATC
TACAGTGTTTGTATATATCAATTGCAAAAATATAAATTTGAATTAGCTGACAAAAGTGTCAGCTGGGCTGCGCTTTCTCA
TGAAGAAATTGCTTTATTTAAAAATAAGTTACTTGGTTCTGAAGACATAAAATATATTGTAACTTATTACCTGGCAGAAC
CAGATAAATTACAATTGCTTATTAAATGGTTTAGTCCATCAATATACGCAATAACAAATTTTAAAGAGATAATCTCTAAC
AAGTCTTATTATAGTTATTGTAGTGAATCATTAGATAGATATTTGCAAGAATGTGAGAATATAGATCATAGCATAAAAAA
TGATGTTAAAGATATTGTAGAAAACTTACTACTTAATGTGGAAAACATTACTTCTAATGATCAGTCAGCAGTGAATGCTA
TAGGAGAATTAGCTCTTAACATTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCGAAAGAGATCTATTACAACCTAAACAGGCATTTATAATGAATAGCAAAGTAGTAGATATTATGTTAATATCTTGATAA
ATCTTTTTGGAGAAGGAAGC

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTTAGTGTAATAGTAATATAAAATTAAAATATATAAAAAATGGGCAATAAATCAGAGTTAATTGAGATTTTTTTGAATG
ACTATAACAACTTTGAAAAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 861; Mature: 860

Protein sequence:

>861_residues
MSKRKNENQISSTSNDNVYKKRKYDEKENSITKNTNLQKKRKYGEDENSVTNDDNIQSLSSHKKQRIQQSNLLDENIFKD
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LDQILNWCFSNDQEKINNCKNSFYTTKRSNSYYCFSYLIYRLIEKDDSFQLLDKFVKWCFTDIQKINQFKKWILCPQDDI
YSVCIYQLQKYKFELADKSVSWAALSHEEIALFKNKLLGSEDIKYIVTYYLAEPDKLQLLIKWFSPSIYAITNFKEIISN
KSYYSYCSESLDRYLQECENIDHSIKNDVKDIVENLLLNVENITSNDQSAVNAIGELALNI

Sequences:

>Translated_861_residues
MSKRKNENQISSTSNDNVYKKRKYDEKENSITKNTNLQKKRKYGEDENSVTNDDNIQSLSSHKKQRIQQSNLLDENIFKD
WFMVPLKHIASTNIVIRLWINQSTINQISNLFNHSADILRDWRKLKNSINDKILMLQLPESITQQLVSINKFIGTELYKW
IKYHDNDVLYNDKSEYLAINYICNIEWTPRGTINYLQTARNILARDDNGLSNDQKYRLACNYCLEDSITNYAQKVNLASY
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SYEEQLKKITLAINKINNREFRSLLLSQLDYEQQKKIFQNSYFLSITLMRFLNDLLLSDYFLPIAYNALNIMPEKSFFYL
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LESDEKIKTFKKELASKEFSCKILESIVTSNKSDFIEIEHYFQWCASNDLKIINELKESIPQKWFQEVIFKLIEQDQYEL
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KSYYSYCSESLDRYLQECENIDHSIKNDVKDIVENLLLNVENITSNDQSAVNAIGELALNI
>Mature_860_residues
SKRKNENQISSTSNDNVYKKRKYDEKENSITKNTNLQKKRKYGEDENSVTNDDNIQSLSSHKKQRIQQSNLLDENIFKDW
FMVPLKHIASTNIVIRLWINQSTINQISNLFNHSADILRDWRKLKNSINDKILMLQLPESITQQLVSINKFIGTELYKWI
KYHDNDVLYNDKSEYLAINYICNIEWTPRGTINYLQTARNILARDDNGLSNDQKYRLACNYCLEDSITNYAQKVNLASYL
QTISIYSKPMVYFWTSHTYSTNIDSTTADVKTIDALVSDYNNRNRTNIDTNTYIFNILIEDNCHKAMNCVPIEYIWNRLS
YEEQLKKITLAINKINNREFRSLLLSQLDYEQQKKIFQNSYFLSITLMRFLNDLLLSDYFLPIAYNALNIMPEKSFFYLI
EAVADRIGPSLYSKIYDDNHYKFIFKELWQFAPKRLKEYVLECNNTDLIQNFIVFKLFLNDEINNDIDIAKLVLADANAT
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ESDEKIKTFKKELASKEFSCKILESIVTSNKSDFIEIEHYFQWCASNDLKIINELKESIPQKWFQEVIFKLIEQDQYELL
DQILNWCFSNDQEKINNCKNSFYTTKRSNSYYCFSYLIYRLIEKDDSFQLLDKFVKWCFTDIQKINQFKKWILCPQDDIY
SVCIYQLQKYKFELADKSVSWAALSHEEIALFKNKLLGSEDIKYIVTYYLAEPDKLQLLIKWFSPSIYAITNFKEIISNK
SYYSYCSESLDRYLQECENIDHSIKNDVKDIVENLLLNVENITSNDQSAVNAIGELALNI

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 101944; Mature: 101813

Theoretical pI: Translated: 6.30; Mature: 6.30

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.3 %Cys     (Translated Protein)
0.9 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
2.3 %Cys     (Mature Protein)
0.8 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSKRKNENQISSTSNDNVYKKRKYDEKENSITKNTNLQKKRKYGEDENSVTNDDNIQSLS
CCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCHHCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHH
SHKKQRIQQSNLLDENIFKDWFMVPLKHIASTNIVIRLWINQSTINQISNLFNHSADILR
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHCHHHHHH
DWRKLKNSINDKILMLQLPESITQQLVSINKFIGTELYKWIKYHDNDVLYNDKSEYLAIN
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HHHHHHHCCCEEEEEECCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEEE
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CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHHHHHCCCCC
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CCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEE
TIHFYQKQEYDKAEHFLKWCLESDEKIKTFKKELASKEFSCKILESIVTSNKSDFIEIEH
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NSFYTTKRSNSYYCFSYLIYRLIEKDDSFQLLDKFVKWCFTDIQKINQFKKWILCPQDDI
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ENITSNDQSAVNAIGELALNI
HHCCCCCHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
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HHHHCCCEEEEECHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ENITSNDQSAVNAIGELALNI
HHCCCCCHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA