| Definition | Orientia tsutsugamushi str. Ikeda, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010793 |
| Length | 2,008,987 |
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The map label for this gene is 189183529
Identifier: 189183529
GI number: 189183529
Start: 641860
End: 644685
Strand: Direct
Name: 189183529
Synonym: OTT_0622
Alternate gene names: NA
Gene position: 641860-644685 (Clockwise)
Preceding gene: 189183528
Following gene: 189183533
Centisome position: 31.95
GC content: 30.47
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases CACAAGTTTGATATAAGAAATAGAGCATAAAGTAGATGGATTAAGCATTACAGCAATTTTAAAATAACTAATTATGTTTA AGTATTCCTTACACAAAAAC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 941; Mature: 941
Protein sequence:
>941_residues MKIKLKNAVEKALDHLLKNQEQTAACIIYSISNNDSVVFQILLKEMKVRQYNTLILPQNQWKALIEHFAMQDKYHWSLRA LSRLFPSLITDYAYEAVHYAAYFKANKNLKLLLNPKFNLDLNALSPGNGNTILGNAILGGNLEGVKLLLKMNSVDYTKPN SCNFRPIHVAIWKDEIDVQSPQCIYTTTLRIHYRLKGQTKLLNTHCKFKAQSLQMQLFSRQLCENPFQIEDHNQNDFQTC TILFIKVLSCKSQKYFLKLLESTSKILTSSSFGLDHKGHVLNFLSFSATCFELTDKAQTALENLLNTVIIPQNETLIQID KLHALYCYMISRACNELNVDKASYYAELLFNPAAVVNPEDKAEACISLAFLYESLYISRKAISYLDKAIEICRSSLLPRL ATKCFRALVNKINIYQACNKEQDANECIQHGSLPKSLKDLCLITQQLKFKQHTSFKVTDLVKEVAELEELSRINFNDAAS IVKHNELKENLGWKYQYFVNTYVFICTHAQDLQTLTHAIQIAESGLNLFPDPAVAFSIIKNTLSIYAKAELYDEGIQFLQ KYSTQYPTSQPHILYHKYVLYSNSANSANNDNSAKHAKHAKHAKRKLASKFLKELEQKSQNSKVCSILYSKAKELDQIVM QKKIKHQSDNEDTILAALQALFQQEVNSEEEEEEEVDKYSLQENVEYQSSDEDSILEALAGLFQAESQNEIEVDLNITHW HIDDQRIISSNNTTSIANSSSFINSNGLFAIIDEKILRQLDIVTKQQCQAALEKGIIHRQKKCSGIKILNLKDNKVIELK LVSRDLRLIATTLYINPENKILIIFNKLATHSTLQKNIVKSKYITKNSICPVNCSEEDKFKNRTEKSFIQPEESTATAQS CSLSEQIHAKVETKCMIDEFTTLDITDTSDLAESHCEDNEDREIVGSSEDEGFLLSGRSLL
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 107210; Mature: 107210
Theoretical pI: Translated: 7.00; Mature: 7.00
Prosite motif: PS50297 ANK_REP_REGION
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.7 %Cys (Translated Protein) 0.9 %Met (Translated Protein) 3.5 %Cys+Met (Translated Protein) 2.7 %Cys (Mature Protein) 0.9 %Met (Mature Protein) 3.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKIKLKNAVEKALDHLLKNQEQTAACIIYSISNNDSVVFQILLKEMKVRQYNTLILPQNQ CEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEECCHH WKALIEHFAMQDKYHWSLRALSRLFPSLITDYAYEAVHYAAYFKANKNLKLLLNPKFNLD HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEEEEECCCCCEE LNALSPGNGNTILGNAILGGNLEGVKLLLKMNSVDYTKPNSCNFRPIHVAIWKDEIDVQS EEEECCCCCCEEEECCEECCCCHHEEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCC PQCIYTTTLRIHYRLKGQTKLLNTHCKFKAQSLQMQLFSRQLCENPFQIEDHNQNDFQTC CCEEEEEEEEEEEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCCCHHHHH TILFIKVLSCKSQKYFLKLLESTSKILTSSSFGLDHKGHVLNFLSFSATCFELTDKAQTA HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LENLLNTVIIPQNETLIQIDKLHALYCYMISRACNELNVDKASYYAELLFNPAAVVNPED HHHHHHEEEECCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCEEECCCH KAEACISLAFLYESLYISRKAISYLDKAIEICRSSLLPRLATKCFRALVNKINIYQACNK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC EQDANECIQHGSLPKSLKDLCLITQQLKFKQHTSFKVTDLVKEVAELEELSRINFNDAAS CCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH IVKHNELKENLGWKYQYFVNTYVFICTHAQDLQTLTHAIQIAESGLNLFPDPAVAFSIIK HHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHH NTLSIYAKAELYDEGIQFLQKYSTQYPTSQPHILYHKYVLYSNSANSANNDNSAKHAKHA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHH KHAKRKLASKFLKELEQKSQNSKVCSILYSKAKELDQIVMQKKIKHQSDNEDTILAALQA HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH LFQQEVNSEEEEEEEVDKYSLQENVEYQSSDEDSILEALAGLFQAESQNEIEVDLNITHW HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEE HIDDQRIISSNNTTSIANSSSFINSNGLFAIIDEKILRQLDIVTKQQCQAALEKGIIHRQ ECCCCEEECCCCCCEECCCCCEECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KKCSGIKILNLKDNKVIELKLVSRDLRLIATTLYINPENKILIIFNKLATHSTLQKNIVK HCCCCEEEEEECCCCEEEEEEEHHCCEEEEEEEEECCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHH SKYITKNSICPVNCSEEDKFKNRTEKSFIQPEESTATAQSCSLSEQIHAKVETKCMIDEF HHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHEEEECC TTLDITDTSDLAESHCEDNEDREIVGSSEDEGFLLSGRSLL EEEEECCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCC >Mature Secondary Structure MKIKLKNAVEKALDHLLKNQEQTAACIIYSISNNDSVVFQILLKEMKVRQYNTLILPQNQ CEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEECCHH WKALIEHFAMQDKYHWSLRALSRLFPSLITDYAYEAVHYAAYFKANKNLKLLLNPKFNLD HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEEEEECCCCCEE LNALSPGNGNTILGNAILGGNLEGVKLLLKMNSVDYTKPNSCNFRPIHVAIWKDEIDVQS EEEECCCCCCEEEECCEECCCCHHEEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCC PQCIYTTTLRIHYRLKGQTKLLNTHCKFKAQSLQMQLFSRQLCENPFQIEDHNQNDFQTC CCEEEEEEEEEEEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCCCHHHHH TILFIKVLSCKSQKYFLKLLESTSKILTSSSFGLDHKGHVLNFLSFSATCFELTDKAQTA HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LENLLNTVIIPQNETLIQIDKLHALYCYMISRACNELNVDKASYYAELLFNPAAVVNPED HHHHHHEEEECCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCEEECCCH KAEACISLAFLYESLYISRKAISYLDKAIEICRSSLLPRLATKCFRALVNKINIYQACNK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC EQDANECIQHGSLPKSLKDLCLITQQLKFKQHTSFKVTDLVKEVAELEELSRINFNDAAS CCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH IVKHNELKENLGWKYQYFVNTYVFICTHAQDLQTLTHAIQIAESGLNLFPDPAVAFSIIK HHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHH NTLSIYAKAELYDEGIQFLQKYSTQYPTSQPHILYHKYVLYSNSANSANNDNSAKHAKHA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHH KHAKRKLASKFLKELEQKSQNSKVCSILYSKAKELDQIVMQKKIKHQSDNEDTILAALQA HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH LFQQEVNSEEEEEEEVDKYSLQENVEYQSSDEDSILEALAGLFQAESQNEIEVDLNITHW HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEE HIDDQRIISSNNTTSIANSSSFINSNGLFAIIDEKILRQLDIVTKQQCQAALEKGIIHRQ ECCCCEEECCCCCCEECCCCCEECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KKCSGIKILNLKDNKVIELKLVSRDLRLIATTLYINPENKILIIFNKLATHSTLQKNIVK HCCCCEEEEEECCCCEEEEEEEHHCCEEEEEEEEECCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHH SKYITKNSICPVNCSEEDKFKNRTEKSFIQPEESTATAQSCSLSEQIHAKVETKCMIDEF HHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHEEEECC TTLDITDTSDLAESHCEDNEDREIVGSSEDEGFLLSGRSLL EEEEECCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA