Definition | Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF, complete genome. |
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Accession | NC_010718 |
Length | 3,165,557 |
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The map label for this gene is spoIIE [H]
Identifier: 188584720
GI number: 188584720
Start: 92567
End: 95068
Strand: Direct
Name: spoIIE [H]
Synonym: Nther_0078
Alternate gene names: 188584720
Gene position: 92567-95068 (Clockwise)
Preceding gene: 188584719
Following gene: 188584721
Centisome position: 2.92
GC content: 34.41
Gene sequence:
>2502_bases TTGGCTTATGAAACTGAATATATTAAAACTTATGAAAGAACCTATAAACAAGCTTATCAACCTTTAGATACTTCTAAAAG TGCTACTCCACGTACAAAATTGTTGGTGACTTTTTGGGAAAAATTCCGTGAATTATTTATTAAATTATTTAACGGTGTCA CAAGTTTATCAACTCTATATTTATTAACGGGTTTTTTACTTGGACGAGCTGAGGTTAGAGGTGGTCTAATACCATTGGTG TTAGCATATTTACTAGCACTAAGGCTTGAAAAAGCCAGTTATTTTTCGGCTGCATTTATTGGGTCTCTAATAGGTATCCA ATTGACCCACGGGATAGAAGGAACTGTTACTGTTATTATACCAGCAATGATTTATTTACTGTGGGAAAGAAGAAGTCTTG GGAACAAACCAAAAATAGGAACTGTTATATTCGTTGCTTCTTTTATGGTAACTTCATGGTTTTACGGTGGACTGCCTGGA AGTTTTCCTTTTAACCTGCTACCTTTAGCCATAGAGGGTGGTTTATTGGTAATCTTTGCTGTCTTGCTAATGCCTGGTTT GCAATTTATTGAGTCAAAGAGGAAAACTGATAACATTGAAAAAGAAGAAATAGTTAGCATTATTTTGTTAGCATCCATGG CTTTTATGGGTTTACAAGGTATTATGATTGGCCCTTATTCAATTCCAAGATTGGTGAGTTTATTAGCTGTGCTAATTGTT GGATATAGGTATGGCGGAGGACAAGGTGCCGCGGCTGGCGCTATATTAGGCACTATAACTAGTTTCTATAGTCTGTCCCA AATTAGCATTGGAGCGTTAACTTTAAGCGGTCTATTGGCTGGTATTTTTAAAGATTTTGGGAAGTTGAGCTCGACTTTTG CATTCATTTTTTCATCTGGGTTAGTGGTATTTTACCTTGGAGAGCCCTTTGTTATGCTGCACTTTTTACAAGAAATTTTA ATTATTTCTGTAATATTCTTAGTAATTCCTGAAAGATTTTTCTATAAAATTACACCTTCTCCAATCTCTCATGGATCTAA AATGGTAAGTGATAGAAAGATGGATCAAATTATCAATCATAAATTTTATGAATTTGCTAGCTTATTCTCCGATATGGCTA AAGTATTTGAACCTAATTCAAATGAACAAGATTATCATGACAGTAGTGAAATTGAAGATTTTGTCCAAACTGTAGTCAAC CAGGTTTGTGGTGGATGTTCCAAAGTATCTTATTGTTGGGAGAAAAACTTTTTTGTAACTTATAAAAACTTTTTAAATGT GATAAGCAAGGTGGATAGTGGAAAAAAATTACACAGAGACGAATTACCCGAATACTTACAAGAATCTTGTATTAGACCGT CTTTACTATTGGAAAATGCTGGCAGTGTATTTGATGACTATCAATTAGAGCATAATAAGGCTAAAAGTAGTGCAGCAGAA AATAAAAAATTATTATCTGAACAAATGTTTGCACTATCAGAACTTTTTAATAAAATGGCCAAGTTTAAAGTTGTTGATTC CAGTAATAACAGGGAATTAGAACAAGAAATTAGATCGGCCATTGAAAACAAGAATTTTGTTTGTGAAGAAATTTGTGTAA CAGGTAAGGTTCAAGAAGATTTAACTATAGAGCTAATAATAAATTGTTCCGGGACTAAACAAGAAGATATTAAAGAAATA TCAACATTAGTATCAGAGGTCGTAGGTGAAAAACTGTCACCTGTAACTTGGGACCTATATCGTGAAGACTCCAAAATAAA TAACCATTACTTTATAAGGTTAAGAGCAGAACAACAGTTGCAAGTTATTACTGGTTGTATCCAGATCAATAAAGAAGGTG AACCTTTATCTGGAGATACTTACATGTCAAGGGAGCTATCAACTGGAGAACACTTGCTATTATTAAGTGATGGAATGGGG TCTGGGTCTAAAGCTAACGAGGAAAGTGAAGCCACTGTTAACTTAATTACTAAATTACTAAATTATGGTTATGATAAACA AATGGTGATAAGGTCGGTTAACTCGCTATTAGCTACTATCAATCGAGTAGATAGTTTTGCCACAGTAGATATGGCGTTAA TTGACTTGTATACTGGTATTGGGGAATTTTGCAAGGCGGGAGCTGTTTCTTCCTTTATTTCAACTGCTGAAGGGGTAGAA AAGGTAGAAGCTTCCTCGTTACCTGCTGGTATCATAGAGTCAGTTGAACCTAAAAAAATGACATATAGTTTAAAACCAGG CGATTATTTATATATGGTGAGTGATGGTGTCTTTGATATGGGTGACGGTGAAAAATGGTTTGAGAAAGCAATTTCTAATT TAAAATCAAAGGACCCCCAAGAAATGGCAGAAGAACTCCTGGAAAAAGTGAAGCGCAGATATAGTTATGGAGACTTCCCT GACGATGTAACTATTTTAATCGCTAAAATCACAAGTAATTCTAAGGAATCTGAATTGGACTCTCAAACTATGGGATTAGA TATATGGGAAAAGATAAATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AGAAAAAAATTTGACTTATACTAAAGTTTTGACATTCTTCCAGTTCCTCACCCTTTATAATTGTTAAGCACACAATCAAA GTTTAAGGTGGGTGAGGATT
Downstream 100 bases:
>100_bases TGAAAGCAGGAATTAAATAAAAAATGACGAATTAACGTATATATGAAAGGATAGTATGAGGGGATTACTATGAAAGAAAA AGTTTATCAAAACATTTTTG
Product: stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase
Products: NA
Alternate protein names: Stage II sporulation protein H [H]
Number of amino acids: Translated: 833; Mature: 832
Protein sequence:
>833_residues MAYETEYIKTYERTYKQAYQPLDTSKSATPRTKLLVTFWEKFRELFIKLFNGVTSLSTLYLLTGFLLGRAEVRGGLIPLV LAYLLALRLEKASYFSAAFIGSLIGIQLTHGIEGTVTVIIPAMIYLLWERRSLGNKPKIGTVIFVASFMVTSWFYGGLPG SFPFNLLPLAIEGGLLVIFAVLLMPGLQFIESKRKTDNIEKEEIVSIILLASMAFMGLQGIMIGPYSIPRLVSLLAVLIV GYRYGGGQGAAAGAILGTITSFYSLSQISIGALTLSGLLAGIFKDFGKLSSTFAFIFSSGLVVFYLGEPFVMLHFLQEIL IISVIFLVIPERFFYKITPSPISHGSKMVSDRKMDQIINHKFYEFASLFSDMAKVFEPNSNEQDYHDSSEIEDFVQTVVN QVCGGCSKVSYCWEKNFFVTYKNFLNVISKVDSGKKLHRDELPEYLQESCIRPSLLLENAGSVFDDYQLEHNKAKSSAAE NKKLLSEQMFALSELFNKMAKFKVVDSSNNRELEQEIRSAIENKNFVCEEICVTGKVQEDLTIELIINCSGTKQEDIKEI STLVSEVVGEKLSPVTWDLYREDSKINNHYFIRLRAEQQLQVITGCIQINKEGEPLSGDTYMSRELSTGEHLLLLSDGMG SGSKANEESEATVNLITKLLNYGYDKQMVIRSVNSLLATINRVDSFATVDMALIDLYTGIGEFCKAGAVSSFISTAEGVE KVEASSLPAGIIESVEPKKMTYSLKPGDYLYMVSDGVFDMGDGEKWFEKAISNLKSKDPQEMAEELLEKVKRRYSYGDFP DDVTILIAKITSNSKESELDSQTMGLDIWEKIN
Sequences:
>Translated_833_residues MAYETEYIKTYERTYKQAYQPLDTSKSATPRTKLLVTFWEKFRELFIKLFNGVTSLSTLYLLTGFLLGRAEVRGGLIPLV LAYLLALRLEKASYFSAAFIGSLIGIQLTHGIEGTVTVIIPAMIYLLWERRSLGNKPKIGTVIFVASFMVTSWFYGGLPG SFPFNLLPLAIEGGLLVIFAVLLMPGLQFIESKRKTDNIEKEEIVSIILLASMAFMGLQGIMIGPYSIPRLVSLLAVLIV GYRYGGGQGAAAGAILGTITSFYSLSQISIGALTLSGLLAGIFKDFGKLSSTFAFIFSSGLVVFYLGEPFVMLHFLQEIL IISVIFLVIPERFFYKITPSPISHGSKMVSDRKMDQIINHKFYEFASLFSDMAKVFEPNSNEQDYHDSSEIEDFVQTVVN QVCGGCSKVSYCWEKNFFVTYKNFLNVISKVDSGKKLHRDELPEYLQESCIRPSLLLENAGSVFDDYQLEHNKAKSSAAE NKKLLSEQMFALSELFNKMAKFKVVDSSNNRELEQEIRSAIENKNFVCEEICVTGKVQEDLTIELIINCSGTKQEDIKEI STLVSEVVGEKLSPVTWDLYREDSKINNHYFIRLRAEQQLQVITGCIQINKEGEPLSGDTYMSRELSTGEHLLLLSDGMG SGSKANEESEATVNLITKLLNYGYDKQMVIRSVNSLLATINRVDSFATVDMALIDLYTGIGEFCKAGAVSSFISTAEGVE KVEASSLPAGIIESVEPKKMTYSLKPGDYLYMVSDGVFDMGDGEKWFEKAISNLKSKDPQEMAEELLEKVKRRYSYGDFP DDVTILIAKITSNSKESELDSQTMGLDIWEKIN >Mature_832_residues AYETEYIKTYERTYKQAYQPLDTSKSATPRTKLLVTFWEKFRELFIKLFNGVTSLSTLYLLTGFLLGRAEVRGGLIPLVL AYLLALRLEKASYFSAAFIGSLIGIQLTHGIEGTVTVIIPAMIYLLWERRSLGNKPKIGTVIFVASFMVTSWFYGGLPGS FPFNLLPLAIEGGLLVIFAVLLMPGLQFIESKRKTDNIEKEEIVSIILLASMAFMGLQGIMIGPYSIPRLVSLLAVLIVG YRYGGGQGAAAGAILGTITSFYSLSQISIGALTLSGLLAGIFKDFGKLSSTFAFIFSSGLVVFYLGEPFVMLHFLQEILI ISVIFLVIPERFFYKITPSPISHGSKMVSDRKMDQIINHKFYEFASLFSDMAKVFEPNSNEQDYHDSSEIEDFVQTVVNQ VCGGCSKVSYCWEKNFFVTYKNFLNVISKVDSGKKLHRDELPEYLQESCIRPSLLLENAGSVFDDYQLEHNKAKSSAAEN KKLLSEQMFALSELFNKMAKFKVVDSSNNRELEQEIRSAIENKNFVCEEICVTGKVQEDLTIELIINCSGTKQEDIKEIS TLVSEVVGEKLSPVTWDLYREDSKINNHYFIRLRAEQQLQVITGCIQINKEGEPLSGDTYMSRELSTGEHLLLLSDGMGS GSKANEESEATVNLITKLLNYGYDKQMVIRSVNSLLATINRVDSFATVDMALIDLYTGIGEFCKAGAVSSFISTAEGVEK VEASSLPAGIIESVEPKKMTYSLKPGDYLYMVSDGVFDMGDGEKWFEKAISNLKSKDPQEMAEELLEKVKRRYSYGDFPD DVTILIAKITSNSKESELDSQTMGLDIWEKIN
Specific function: Normally needed for pro-sigma E processing during sporulation but can be bypassed in vegetative cells. Activates spoIIAA by dephosphorylation [H]
COG id: COG2208
COG function: function code TK; Serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein. Note=Polar septum [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 PP2C-like domain [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR001932 - InterPro: IPR014221 - InterPro: IPR010822 [H]
Pfam domain/function: PF07228 SpoIIE [H]
EC number: =3.1.3.16 [H]
Molecular weight: Translated: 93003; Mature: 92872
Theoretical pI: Translated: 4.94; Mature: 4.94
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.1 %Cys (Translated Protein) 2.6 %Met (Translated Protein) 3.7 %Cys+Met (Translated Protein) 1.1 %Cys (Mature Protein) 2.5 %Met (Mature Protein) 3.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MAYETEYIKTYERTYKQAYQPLDTSKSATPRTKLLVTFWEKFRELFIKLFNGVTSLSTLY CCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLTGFLLGRAEVRGGLIPLVLAYLLALRLEKASYFSAAFIGSLIGIQLTHGIEGTVTVII HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHH PAMIYLLWERRSLGNKPKIGTVIFVASFMVTSWFYGGLPGSFPFNLLPLAIEGGLLVIFA HHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEHHHHCCCHHHHHH VLLMPGLQFIESKRKTDNIEKEEIVSIILLASMAFMGLQGIMIGPYSIPRLVSLLAVLIV HHHHCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHH GYRYGGGQGAAAGAILGTITSFYSLSQISIGALTLSGLLAGIFKDFGKLSSTFAFIFSSG HHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC LVVFYLGEPFVMLHFLQEILIISVIFLVIPERFFYKITPSPISHGSKMVSDRKMDQIINH CEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH KFYEFASLFSDMAKVFEPNSNEQDYHDSSEIEDFVQTVVNQVCGGCSKVSYCWEKNFFVT HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCEEE YKNFLNVISKVDSGKKLHRDELPEYLQESCIRPSLLLENAGSVFDDYQLEHNKAKSSAAE HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH NKKLLSEQMFALSELFNKMAKFKVVDSSNNRELEQEIRSAIENKNFVCEEICVTGKVQED HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCCCCCC LTIELIINCSGTKQEDIKEISTLVSEVVGEKLSPVTWDLYREDSKINNHYFIRLRAEQQL CEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCEEEEEEECHHHH QVITGCIQINKEGEPLSGDTYMSRELSTGEHLLLLSDGMGSGSKANEESEATVNLITKLL HHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH NYGYDKQMVIRSVNSLLATINRVDSFATVDMALIDLYTGIGEFCKAGAVSSFISTAEGVE HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KVEASSLPAGIIESVEPKKMTYSLKPGDYLYMVSDGVFDMGDGEKWFEKAISNLKSKDPQ HHHHHCCCHHHHCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEECCCEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCHH EMAEELLEKVKRRYSYGDFPDDVTILIAKITSNSKESELDSQTMGLDIWEKIN HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHCC >Mature Secondary Structure AYETEYIKTYERTYKQAYQPLDTSKSATPRTKLLVTFWEKFRELFIKLFNGVTSLSTLY CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLTGFLLGRAEVRGGLIPLVLAYLLALRLEKASYFSAAFIGSLIGIQLTHGIEGTVTVII HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHH PAMIYLLWERRSLGNKPKIGTVIFVASFMVTSWFYGGLPGSFPFNLLPLAIEGGLLVIFA HHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEHHHHCCCHHHHHH VLLMPGLQFIESKRKTDNIEKEEIVSIILLASMAFMGLQGIMIGPYSIPRLVSLLAVLIV HHHHCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHH GYRYGGGQGAAAGAILGTITSFYSLSQISIGALTLSGLLAGIFKDFGKLSSTFAFIFSSG HHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC LVVFYLGEPFVMLHFLQEILIISVIFLVIPERFFYKITPSPISHGSKMVSDRKMDQIINH CEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH KFYEFASLFSDMAKVFEPNSNEQDYHDSSEIEDFVQTVVNQVCGGCSKVSYCWEKNFFVT HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCEEE YKNFLNVISKVDSGKKLHRDELPEYLQESCIRPSLLLENAGSVFDDYQLEHNKAKSSAAE HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH NKKLLSEQMFALSELFNKMAKFKVVDSSNNRELEQEIRSAIENKNFVCEEICVTGKVQED HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCCCCCC LTIELIINCSGTKQEDIKEISTLVSEVVGEKLSPVTWDLYREDSKINNHYFIRLRAEQQL CEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCEEEEEEECHHHH QVITGCIQINKEGEPLSGDTYMSRELSTGEHLLLLSDGMGSGSKANEESEATVNLITKLL HHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH NYGYDKQMVIRSVNSLLATINRVDSFATVDMALIDLYTGIGEFCKAGAVSSFISTAEGVE HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KVEASSLPAGIIESVEPKKMTYSLKPGDYLYMVSDGVFDMGDGEKWFEKAISNLKSKDPQ HHHHHCCCHHHHCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEECCCEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCHH EMAEELLEKVKRRYSYGDFPDDVTILIAKITSNSKESELDSQTMGLDIWEKIN HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 7584024; 8830262; 9384377; 2832371; 8113187; 7570023 [H]