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The map label for this gene is yueF [H]

Identifier: 187935233

GI number: 187935233

Start: 2667501

End: 2668613

Strand: Reverse

Name: yueF [H]

Synonym: CLL_A2561

Alternate gene names: 187935233

Gene position: 2668613-2667501 (Counterclockwise)

Preceding gene: 187933796

Following gene: 187932551

Centisome position: 70.22

GC content: 26.24

Gene sequence:

>1113_bases
ATGACTATAAATAAAAATGTAAAATATAAGGATATATTAATAATGGCTATTGTTGGAATTGTTCTGTACAAAATAATAGA
TAATTATCAGTTTTTCTTTAATATAGTTAAACATTTTTTTTCTATTATGTCACCATTTACATATGCTTTGATTTTTGCAT
ATATATTGAATCCTATAATGATGATTTTTGAAAAAAGATTTAAATTTTCAAGAGGAAAATCTATATTAGTAACCTATGCA
ATTATAACAGGAATAATAATAATGTTTTTCTTTTTTACAATACCTAGTTTAGTTGATAGCATAGCTAGTATAATTAAAGA
AGTTCCTAATTATATGGAAACAATTCAAGAATGGATTAATACAGCAATTAAAAATCCTAAATTAAGTGAATTGATAATTG
ATGCAGGGTTAGTTGATAAAATTGAACTTTTATCTATTAAAATGGGAAACTTTACAATAACTATATTACAAGGAATGTTA
GGATATTTATTATCTCTTACAGGAAACTTAGTTAAAATAGTATTCGGATTTTTAATAGCTATTTATGTATTAAGCGATAA
AGATGGATTACTGCATGGTTTAAAAACTATAACTTATATAATATTAAAAGAGAAGAAGGCAAGTGAGCTAATTAAAGTTT
GCAATACCTATAGTAAAATGATAGGTGTATATATAGGAACAAAAGCTATAGATTCAGCAATAATAGGGCTTATATCATTG
ATTGGTTTAGTAATAGTTAAAGCTCCATATGCTCTTTTATTATCGATCATAGTTGCTATTACTAATATGATACCTTACTT
TGGTCCATTTATAGGAGAAGTAGTTGGTGCGGGAGTATGTATTTTTGTTTCACCTATGAAGGCTCTTATAGTATTTATAC
TTTTACTTCTAATTCAACAATTTGATGCTTGGTATCTTGATCCTAAGCTTATAGGAGCAAAAGTAGGTGTAAAACCATTT
TGGATAATTATGGGCGTGATAATAGGCGGTGCATTCTGGGGACCTATTGGAATGCTATTAGCGTCACCTACAATTGCAAC
TATTAATATTTATTATATTAGATTGGTAAAATTCTATAAGTCTAAAAATCCAAGCTTATTTAAGAATTTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGATACATAATTAATTTAACAAAGAATTAATCTTTATAAAAATAATATATGATATAATATTTTGTAATACGCAAGAATAT
TTTAAGTAAGGAGGATAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTAATATTCTATGTTTTTTCATGTATTTATATATGCAATAAATGAAGTCGCATTCATATGTTCAATTATTCATTCTAGGG
CTTATACAAATACAATTCTA

Product: permease

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 370; Mature: 369

Protein sequence:

>370_residues
MTINKNVKYKDILIMAIVGIVLYKIIDNYQFFFNIVKHFFSIMSPFTYALIFAYILNPIMMIFEKRFKFSRGKSILVTYA
IITGIIIMFFFFTIPSLVDSIASIIKEVPNYMETIQEWINTAIKNPKLSELIIDAGLVDKIELLSIKMGNFTITILQGML
GYLLSLTGNLVKIVFGFLIAIYVLSDKDGLLHGLKTITYIILKEKKASELIKVCNTYSKMIGVYIGTKAIDSAIIGLISL
IGLVIVKAPYALLLSIIVAITNMIPYFGPFIGEVVGAGVCIFVSPMKALIVFILLLLIQQFDAWYLDPKLIGAKVGVKPF
WIIMGVIIGGAFWGPIGMLLASPTIATINIYYIRLVKFYKSKNPSLFKNL

Sequences:

>Translated_370_residues
MTINKNVKYKDILIMAIVGIVLYKIIDNYQFFFNIVKHFFSIMSPFTYALIFAYILNPIMMIFEKRFKFSRGKSILVTYA
IITGIIIMFFFFTIPSLVDSIASIIKEVPNYMETIQEWINTAIKNPKLSELIIDAGLVDKIELLSIKMGNFTITILQGML
GYLLSLTGNLVKIVFGFLIAIYVLSDKDGLLHGLKTITYIILKEKKASELIKVCNTYSKMIGVYIGTKAIDSAIIGLISL
IGLVIVKAPYALLLSIIVAITNMIPYFGPFIGEVVGAGVCIFVSPMKALIVFILLLLIQQFDAWYLDPKLIGAKVGVKPF
WIIMGVIIGGAFWGPIGMLLASPTIATINIYYIRLVKFYKSKNPSLFKNL
>Mature_369_residues
TINKNVKYKDILIMAIVGIVLYKIIDNYQFFFNIVKHFFSIMSPFTYALIFAYILNPIMMIFEKRFKFSRGKSILVTYAI
ITGIIIMFFFFTIPSLVDSIASIIKEVPNYMETIQEWINTAIKNPKLSELIIDAGLVDKIELLSIKMGNFTITILQGMLG
YLLSLTGNLVKIVFGFLIAIYVLSDKDGLLHGLKTITYIILKEKKASELIKVCNTYSKMIGVYIGTKAIDSAIIGLISLI
GLVIVKAPYALLLSIIVAITNMIPYFGPFIGEVVGAGVCIFVSPMKALIVFILLLLIQQFDAWYLDPKLIGAKVGVKPFW
IIMGVIIGGAFWGPIGMLLASPTIATINIYYIRLVKFYKSKNPSLFKNL

Specific function: Unknown

COG id: COG0628

COG function: function code R; Predicted permease

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the UPF0118 (perM) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788838, Length=315, Percent_Identity=24.1269841269841, Blast_Score=88, Evalue=1e-18,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002549 [H]

Pfam domain/function: PF01594 UPF0118 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 41447; Mature: 41316

Theoretical pI: Translated: 9.99; Mature: 9.99

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
3.8 %Met     (Translated Protein)
4.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
3.5 %Met     (Mature Protein)
4.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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CCCCHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
TINKNVKYKDILIMAIVGIVLYKIIDNYQFFFNIVKHFFSIMSPFTYALIFAYILNPIM
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH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CCCCHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]