Definition | Borrelia hermsii DAH chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_010673 |
Length | 922,307 |
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The map label for this gene is 187918085
Identifier: 187918085
GI number: 187918085
Start: 216347
End: 217387
Strand: Direct
Name: 187918085
Synonym: BH0212
Alternate gene names: NA
Gene position: 216347-217387 (Clockwise)
Preceding gene: 187918084
Following gene: 187918088
Centisome position: 23.46
GC content: 23.15
Gene sequence:
>1041_bases ATGATAAAAACTCTTAAATCGAAAATTAAAAAACTAATACCACAAAGAGATAAAAAATTAGTTGAACTTGGGAAGGCGCT TAAAAACAGCAACGTAATAGAGCTTAAAAAATTAGAATCTTATACATCTTTAAAGCTAATTGAAAAAGAAATATCTCAAC TTAAAGCAAATTTAAACAAAGCAGAAGATGATGAGAGTAAACTAAAAGAACTATATAAAAAGGAAAAAGACTACAAAGAA AGCAAAAAACATATCCTAAAAGGATACGAAATAAAACTTAAAAAAATTACTGAAATAATAATAAACAAATATCCAAATAA TCTCTCAGCAATTTTAGAATACAAAATGAATTTTGCCAAATCGGCACTTCAAAAACATAAATACAAAATTACAGAAATAA CAAAATTCAATGAAAAAATCAATTTCTTCAAAAAGCTTATTATAAACACCAAACTAATACTAAAAAACATCATAAATAAA ATAAACATAAAAAAAATAGCAAAAGAATTCGAGAAAAAAATATTAAAAGAACATTTATTCTCAGAAAATTTAGAAAATTT AGTTGATGAATTTGTAGGAAACAAAGAGTTAAGCAAAGAAATTATTGAAAAATACAAGTTAATGAATGAAATTCAATCAG AAATTGTAAAAATAAATAATGCAATAAAACATAAAAATATAAAAGACAACATTAATATTAGGAATAAAGTAGAACGCGCT ATTAATGTTGCTCAAATAAATAAAGAATTGATTTTAAAAAAAATTGCCGAAGAATTTTTTGAAATGTCAAAGACAGAAAA GGGATTAAATAAAAACGGAACAATTAATTCATTATTAGAAACAATCAAAAATATAAATCAACAAATATCCAAATTGAACG ACGCTCTAATAAAAGCAATAAAAATAGAGGAAATCGCAAAAGTGCGAACAAAAATGCAACAACTCATAAAAAATAAAGAA TCAATTGAGACCAAATTAAACGAACTAAATTCAAAAATAGAAACCATACAAAACGAAATCGATGAACTTGACAATCAATA A
Upstream 100 bases:
>100_bases TAAAACATTGTCCACATGGAAGAAAAATTTACCATAAAATCTCTAAATTTGAGCTTGAAAAAAATGTTAACAGAAAATAA AATAAACATGGAAGCCGGTA
Downstream 100 bases:
>100_bases AAAATCAATATAATGATTTAAGGTATTTCAAGCTTTAATTGGCATAAAAGGTATTTAATCACTCTTAAAGACCTTTTAAG CTTGTCTTTACTTATGGGGC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 346; Mature: 346
Protein sequence:
>346_residues MIKTLKSKIKKLIPQRDKKLVELGKALKNSNVIELKKLESYTSLKLIEKEISQLKANLNKAEDDESKLKELYKKEKDYKE SKKHILKGYEIKLKKITEIIINKYPNNLSAILEYKMNFAKSALQKHKYKITEITKFNEKINFFKKLIINTKLILKNIINK INIKKIAKEFEKKILKEHLFSENLENLVDEFVGNKELSKEIIEKYKLMNEIQSEIVKINNAIKHKNIKDNINIRNKVERA INVAQINKELILKKIAEEFFEMSKTEKGLNKNGTINSLLETIKNINQQISKLNDALIKAIKIEEIAKVRTKMQQLIKNKE SIETKLNELNSKIETIQNEIDELDNQ
Sequences:
>Translated_346_residues MIKTLKSKIKKLIPQRDKKLVELGKALKNSNVIELKKLESYTSLKLIEKEISQLKANLNKAEDDESKLKELYKKEKDYKE SKKHILKGYEIKLKKITEIIINKYPNNLSAILEYKMNFAKSALQKHKYKITEITKFNEKINFFKKLIINTKLILKNIINK INIKKIAKEFEKKILKEHLFSENLENLVDEFVGNKELSKEIIEKYKLMNEIQSEIVKINNAIKHKNIKDNINIRNKVERA INVAQINKELILKKIAEEFFEMSKTEKGLNKNGTINSLLETIKNINQQISKLNDALIKAIKIEEIAKVRTKMQQLIKNKE SIETKLNELNSKIETIQNEIDELDNQ >Mature_346_residues MIKTLKSKIKKLIPQRDKKLVELGKALKNSNVIELKKLESYTSLKLIEKEISQLKANLNKAEDDESKLKELYKKEKDYKE SKKHILKGYEIKLKKITEIIINKYPNNLSAILEYKMNFAKSALQKHKYKITEITKFNEKINFFKKLIINTKLILKNIINK INIKKIAKEFEKKILKEHLFSENLENLVDEFVGNKELSKEIIEKYKLMNEIQSEIVKINNAIKHKNIKDNINIRNKVERA INVAQINKELILKKIAEEFFEMSKTEKGLNKNGTINSLLETIKNINQQISKLNDALIKAIKIEEIAKVRTKMQQLIKNKE SIETKLNELNSKIETIQNEIDELDNQ
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 40572; Mature: 40572
Theoretical pI: Translated: 10.36; Mature: 10.36
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 1.4 %Met (Translated Protein) 1.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 1.4 %Met (Mature Protein) 1.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIKTLKSKIKKLIPQRDKKLVELGKALKNSNVIELKKLESYTSLKLIEKEISQLKANLNK CCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC AEDDESKLKELYKKEKDYKESKKHILKGYEIKLKKITEIIINKYPNNLSAILEYKMNFAK CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH SALQKHKYKITEITKFNEKINFFKKLIINTKLILKNIINKINIKKIAKEFEKKILKEHLF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SENLENLVDEFVGNKELSKEIIEKYKLMNEIQSEIVKINNAIKHKNIKDNINIRNKVERA HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHH INVAQINKELILKKIAEEFFEMSKTEKGLNKNGTINSLLETIKNINQQISKLNDALIKAI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KIEEIAKVRTKMQQLIKNKESIETKLNELNSKIETIQNEIDELDNQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MIKTLKSKIKKLIPQRDKKLVELGKALKNSNVIELKKLESYTSLKLIEKEISQLKANLNK CCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC AEDDESKLKELYKKEKDYKESKKHILKGYEIKLKKITEIIINKYPNNLSAILEYKMNFAK CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH SALQKHKYKITEITKFNEKINFFKKLIINTKLILKNIINKINIKKIAKEFEKKILKEHLF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SENLENLVDEFVGNKELSKEIIEKYKLMNEIQSEIVKINNAIKHKNIKDNINIRNKVERA HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHH INVAQINKELILKKIAEEFFEMSKTEKGLNKNGTINSLLETIKNINQQISKLNDALIKAI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KIEEIAKVRTKMQQLIKNKESIETKLNELNSKIETIQNEIDELDNQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA