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The map label for this gene is wzxC [H]

Identifier: 182682000

GI number: 182682000

Start: 1626100

End: 1627632

Strand: Reverse

Name: wzxC [H]

Synonym: XfasM23_1475

Alternate gene names: 182682000

Gene position: 1627632-1626100 (Counterclockwise)

Preceding gene: 182682001

Following gene: 182681999

Centisome position: 64.19

GC content: 46.64

Gene sequence:

>1533_bases
ATGAGTGACGGTGTGGTGACTGTATCTACGGTGTCCGAGCGTAGTTTGGCTTCACGTGCGGTTGGCGGTGCCGTGGTGAC
GATGCTTGGGCAGGGGGCGAGGGTAGTTATCCAATTTTCCATTATCGTGCTATTGGCGCGGTTGTTGAATCCGCATGATT
ATGGTCTGATGGCGATGGTCACTGCGATTGTGGGTGTTGCTGATATTCTTCGTGATTTTGGCCTTTCTTCGGCGGCGATC
CAGGCAAAGCAGATTACAAACGCGCAGCGCGATAATCTATTCTGGATTAATAGTGCGATTGGATTGGCACTGTCTTTGGT
GGTATTCGTTGCGGCACAGGTAATTGCTGATTTTTATCGTGAGCCTGCATTAGTGACGATTACGCAGGTATTGGCGATTA
ATTTTTTACTTAATGGGATGGCAACTCAGTATCGCGCCAATCTTAGCCGTGAGATGCGTTTCGGTCAGCTTGCATTGAGT
GATATTGGTGCGCAGGTGTTAGGTCTTTTAGTTGGTGTTGGTGTGGCGCTAGTCGGATGGGGCGTTTGGGCGTTGGTGTT
GCAGCAGGTGGTGCAAGCTGTGGCGAATCTTGTAATTGCAATGGTCTGTGCGCGTTGGCTGCCAGGTGGTTATCGCCGTG
GTGTGCCGATGGGGAGTTTTCTCAGTTTTGGTTGGAATCTGATGGTTGCGCAATTGCTAAGCTATGCCAATCGCAGTGTT
GGTCAAGTGATTATCGGTTATCGGCTTGGTCCTAATGTACTTGGTTTATATAACCGTGCATTCCAGTTGTTGATGATGCC
ATTGAATCAGGTGATTGCGCCGGCAAGTTCAGTGGCGTTGCCGGTGCTTTCTCAGTTGCAAGATGATCGTGCTCGTTTCG
ATAGCTTCTTATTGCGTGGGCAAACGATGATGTTGCATGTGATTGTTCCGTTGTTTGCATTTGCTTGTGCGCAGGCAACT
CCATTAATTGTATTGGTCCTTGGTGAAAAGTGGCGTTCTGCGGTGTTGTTATTTCAAATTTTGACATTGGCTGGTATGAC
GCAGAGTGCTAGTTATGCAAGTTATTGGCTATTTTTAGCACGCGGTTTGATACGCGATCATCTTTTATTTTCTATTGTCA
GTCATGTGTTTTTGGTGTTGTGTGTGTGCATTGGTGCTTATTGGGGTGTATTTGGTGTGGCTATTGGTTACAGCATTAGT
TTGGCTTTGATATGGCCATTGTCGATTATTTGGGCGGCACGTATTACACCTGTTCCTGGTTGGGAAATATTTTTTAATGG
GATGCGTGCGATCGTAGGTTACGGGGTGTGTGCATTTGCTTCTATGTATGCTTCGCAGTGGTGTGACGAGTCGAATCTTT
GGAAGCAATTGATAGTTGGTGCTTTGGCAATGTTGGTAGTTTTTGCAGTGTTATCCTTGTTATGGCCAGCATTTCGTCGT
GATGTGCTGTCTATCATTAAGATCGGTATGTCTTCTTCAGCTGTATCTTCTTTTCTTCTAAGGATCATGAGGAGAGTGAG
GAAGGGATCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGCTTGGGGCATTGTGGATTCTATGCCTCAGTTACATTAAATGGATGTTGCCAATGTCGTGTTTAGTTCAGGTGCTGTGG
CACAAGGATAAGGTGATGAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTCATCGGTTCTTAGGATTTTTTTGAAAATTAATGGAATACGTTAATTCAGTGAATAACGAGCGAGCTTATGAATGCTTC
TACAAGTGCGGTATTAAGCC

Product: polysaccharide biosynthesis protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 510; Mature: 509

Protein sequence:

>510_residues
MSDGVVTVSTVSERSLASRAVGGAVVTMLGQGARVVIQFSIIVLLARLLNPHDYGLMAMVTAIVGVADILRDFGLSSAAI
QAKQITNAQRDNLFWINSAIGLALSLVVFVAAQVIADFYREPALVTITQVLAINFLLNGMATQYRANLSREMRFGQLALS
DIGAQVLGLLVGVGVALVGWGVWALVLQQVVQAVANLVIAMVCARWLPGGYRRGVPMGSFLSFGWNLMVAQLLSYANRSV
GQVIIGYRLGPNVLGLYNRAFQLLMMPLNQVIAPASSVALPVLSQLQDDRARFDSFLLRGQTMMLHVIVPLFAFACAQAT
PLIVLVLGEKWRSAVLLFQILTLAGMTQSASYASYWLFLARGLIRDHLLFSIVSHVFLVLCVCIGAYWGVFGVAIGYSIS
LALIWPLSIIWAARITPVPGWEIFFNGMRAIVGYGVCAFASMYASQWCDESNLWKQLIVGALAMLVVFAVLSLLWPAFRR
DVLSIIKIGMSSSAVSSFLLRIMRRVRKGS

Sequences:

>Translated_510_residues
MSDGVVTVSTVSERSLASRAVGGAVVTMLGQGARVVIQFSIIVLLARLLNPHDYGLMAMVTAIVGVADILRDFGLSSAAI
QAKQITNAQRDNLFWINSAIGLALSLVVFVAAQVIADFYREPALVTITQVLAINFLLNGMATQYRANLSREMRFGQLALS
DIGAQVLGLLVGVGVALVGWGVWALVLQQVVQAVANLVIAMVCARWLPGGYRRGVPMGSFLSFGWNLMVAQLLSYANRSV
GQVIIGYRLGPNVLGLYNRAFQLLMMPLNQVIAPASSVALPVLSQLQDDRARFDSFLLRGQTMMLHVIVPLFAFACAQAT
PLIVLVLGEKWRSAVLLFQILTLAGMTQSASYASYWLFLARGLIRDHLLFSIVSHVFLVLCVCIGAYWGVFGVAIGYSIS
LALIWPLSIIWAARITPVPGWEIFFNGMRAIVGYGVCAFASMYASQWCDESNLWKQLIVGALAMLVVFAVLSLLWPAFRR
DVLSIIKIGMSSSAVSSFLLRIMRRVRKGS
>Mature_509_residues
SDGVVTVSTVSERSLASRAVGGAVVTMLGQGARVVIQFSIIVLLARLLNPHDYGLMAMVTAIVGVADILRDFGLSSAAIQ
AKQITNAQRDNLFWINSAIGLALSLVVFVAAQVIADFYREPALVTITQVLAINFLLNGMATQYRANLSREMRFGQLALSD
IGAQVLGLLVGVGVALVGWGVWALVLQQVVQAVANLVIAMVCARWLPGGYRRGVPMGSFLSFGWNLMVAQLLSYANRSVG
QVIIGYRLGPNVLGLYNRAFQLLMMPLNQVIAPASSVALPVLSQLQDDRARFDSFLLRGQTMMLHVIVPLFAFACAQATP
LIVLVLGEKWRSAVLLFQILTLAGMTQSASYASYWLFLARGLIRDHLLFSIVSHVFLVLCVCIGAYWGVFGVAIGYSISL
ALIWPLSIIWAARITPVPGWEIFFNGMRAIVGYGVCAFASMYASQWCDESNLWKQLIVGALAMLVVFAVLSLLWPAFRRD
VLSIIKIGMSSSAVSSFLLRIMRRVRKGS

Specific function: Lipopolysaccharide biosynthesis. [C]

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the polysaccharide synthase family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788359, Length=396, Percent_Identity=22.979797979798, Blast_Score=129, Evalue=4e-31,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002797 [H]

Pfam domain/function: PF01943 Polysacc_synt [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55458; Mature: 55327

Theoretical pI: Translated: 10.27; Mature: 10.27

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
3.7 %Met     (Translated Protein)
4.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
3.5 %Met     (Mature Protein)
4.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSDGVVTVSTVSERSLASRAVGGAVVTMLGQGARVVIQFSIIVLLARLLNPHDYGLMAMV
CCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH
TAIVGVADILRDFGLSSAAIQAKQITNAQRDNLFWINSAIGLALSLVVFVAAQVIADFYR
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EPALVTITQVLAINFLLNGMATQYRANLSREMRFGQLALSDIGAQVLGLLVGVGVALVGW
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GVWALVLQQVVQAVANLVIAMVCARWLPGGYRRGVPMGSFLSFGWNLMVAQLLSYANRSV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
GQVIIGYRLGPNVLGLYNRAFQLLMMPLNQVIAPASSVALPVLSQLQDDRARFDSFLLRG
HHEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
QTMMLHVIVPLFAFACAQATPLIVLVLGEKWRSAVLLFQILTLAGMTQSASYASYWLFLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH
RGLIRDHLLFSIVSHVFLVLCVCIGAYWGVFGVAIGYSISLALIWPLSIIWAARITPVPG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
WEIFFNGMRAIVGYGVCAFASMYASQWCDESNLWKQLIVGALAMLVVFAVLSLLWPAFRR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DVLSIIKIGMSSSAVSSFLLRIMRRVRKGS
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
SDGVVTVSTVSERSLASRAVGGAVVTMLGQGARVVIQFSIIVLLARLLNPHDYGLMAMV
CCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH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HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8759852; 9097040; 9278503 [H]