| Definition | Clostridium botulinum B1 str. Okra, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010516 |
| Length | 3,958,233 |
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The map label for this gene is 170756382
Identifier: 170756382
GI number: 170756382
Start: 1171619
End: 1172992
Strand: Reverse
Name: 170756382
Synonym: CLD_3505
Alternate gene names: NA
Gene position: 1172992-1171619 (Counterclockwise)
Preceding gene: 170757417
Following gene: 170756037
Centisome position: 29.63
GC content: 23.14
Gene sequence:
>1374_bases ATGGAAAAACAACAAATATTACAGATTTGTCGATTTTTATCAGGATACTCAACAATGATTTTTCTATATACAATCAAATA CTATTTCTATAAAAATTTTTTAGGATTTAAAAATAAAGTTTGGCATTTTACTTTATGTGCATTATTAGTAACAGTTATTG ATTTTTATATGATGAAAACAATATCCCTACTATGGAGTATAATTATAAATAATATAATTTGGCTACTAATTATATGTTTT TTATGTAATGGTAATTTCTTAATGAAATTTTATGCTGTTATTCTTGAAGAAGCAGCATTACTACTTATTAATCTAACTTT TTTAACCTTTGATTTTACAATTTTGCCTGCTATTCATAACATTAATGTATCTTTTAATAAACATATAATTATTAGTTTTA TGACTAACATTATTAATGATCTTATACGTTATACTATATTATTTGTATTTTTAAAAAACATTTGTAAATTTCTAAATTTG AAAGAAAAATCAATAAAATTATATGAAAACTTATTTTTGCTCATTCCTTGTTTATCAATTTATAGTTTAGGACTTATTTT TTATATCATTCAGCCTATTAATATTGATAATAAAAGATACTATTTACCTTATATTTTTCCTAAAATTTATTATACCCTCC CCTTTATAAGTTTTGCTTTATTAGTATCATTATTAATTATGGCCTATACCTTTAAAAAAATGCTTGAAGGCCAATTAGAA GAGAAGAAAAACCTTCTCATGGAACAACAATTTAAGCTACAGCTTACTCATAGCAACAACATAGAAATGCTTTATAAAGG GATAAGAGGCATAATCCACGATATGAATAATCATGTTTCCTGTTTGAAAAATTTAGCTGCTACTAATAACATTGAAGATA TAAAAAAGTATCTTATAAATATTGATGAAACCATAAGCAAACTTGATTTTAAAATAAAAACGGGGAATTCTATATCTGAT GCAGTAATAAATGAAAAATATAACATTGCTAAAACTAATAAAATAGAGTTTATATGCGATTTCCTATTACCCAAAGAAAC CCTATTAGAGCCTGTAGATTTATGCATTATTTTAAGTAACGCATTGGACAATGCCCTTGAAGCGTGTATGAGAATTACAG ATAGTAATCTTCAAAAAAAAATATGTATAAAATCTTACATAAAAAATATGTATTTAATAATTGAAATTTCTAACAGTGCT ACAGATAAAATTCAATATGCCGAAAATAAAATTATCAGCACAAAAACTGATAAAAATAACCATGGTATAGGAATTTCTAA CATAAAAACTGTTGCAAAAAAATATAATGGCATAGTTGATATACTAGAAGAAAAACATAAATTTATTATTAATATTATGC TTAAAATAAAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TAACCTTAATAAACTCAGATAAAATATATGTTTCAAAATATAGATTAGATGATTTTTCAAAGGCCTTTATGTATTATTTA AAAAATGAGGTTCAGTAATT
Downstream 100 bases:
>100_bases CAATAACATATAATGACTTATATAAAATTCATATATATATTCCTTAAAAATCATATAATAAGTATCTCTTTTATATAAAA ATCTACATAAAAAATAAAAG
Product: sensor histidine kinase
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 457; Mature: 457
Protein sequence:
>457_residues MEKQQILQICRFLSGYSTMIFLYTIKYYFYKNFLGFKNKVWHFTLCALLVTVIDFYMMKTISLLWSIIINNIIWLLIICF LCNGNFLMKFYAVILEEAALLLINLTFLTFDFTILPAIHNINVSFNKHIIISFMTNIINDLIRYTILFVFLKNICKFLNL KEKSIKLYENLFLLIPCLSIYSLGLIFYIIQPINIDNKRYYLPYIFPKIYYTLPFISFALLVSLLIMAYTFKKMLEGQLE EKKNLLMEQQFKLQLTHSNNIEMLYKGIRGIIHDMNNHVSCLKNLAATNNIEDIKKYLINIDETISKLDFKIKTGNSISD AVINEKYNIAKTNKIEFICDFLLPKETLLEPVDLCIILSNALDNALEACMRITDSNLQKKICIKSYIKNMYLIIEISNSA TDKIQYAENKIISTKTDKNNHGIGISNIKTVAKKYNGIVDILEEKHKFIINIMLKIK
Sequences:
>Translated_457_residues MEKQQILQICRFLSGYSTMIFLYTIKYYFYKNFLGFKNKVWHFTLCALLVTVIDFYMMKTISLLWSIIINNIIWLLIICF LCNGNFLMKFYAVILEEAALLLINLTFLTFDFTILPAIHNINVSFNKHIIISFMTNIINDLIRYTILFVFLKNICKFLNL KEKSIKLYENLFLLIPCLSIYSLGLIFYIIQPINIDNKRYYLPYIFPKIYYTLPFISFALLVSLLIMAYTFKKMLEGQLE EKKNLLMEQQFKLQLTHSNNIEMLYKGIRGIIHDMNNHVSCLKNLAATNNIEDIKKYLINIDETISKLDFKIKTGNSISD AVINEKYNIAKTNKIEFICDFLLPKETLLEPVDLCIILSNALDNALEACMRITDSNLQKKICIKSYIKNMYLIIEISNSA TDKIQYAENKIISTKTDKNNHGIGISNIKTVAKKYNGIVDILEEKHKFIINIMLKIK >Mature_457_residues MEKQQILQICRFLSGYSTMIFLYTIKYYFYKNFLGFKNKVWHFTLCALLVTVIDFYMMKTISLLWSIIINNIIWLLIICF LCNGNFLMKFYAVILEEAALLLINLTFLTFDFTILPAIHNINVSFNKHIIISFMTNIINDLIRYTILFVFLKNICKFLNL KEKSIKLYENLFLLIPCLSIYSLGLIFYIIQPINIDNKRYYLPYIFPKIYYTLPFISFALLVSLLIMAYTFKKMLEGQLE EKKNLLMEQQFKLQLTHSNNIEMLYKGIRGIIHDMNNHVSCLKNLAATNNIEDIKKYLINIDETISKLDFKIKTGNSISD AVINEKYNIAKTNKIEFICDFLLPKETLLEPVDLCIILSNALDNALEACMRITDSNLQKKICIKSYIKNMYLIIEISNSA TDKIQYAENKIISTKTDKNNHGIGISNIKTVAKKYNGIVDILEEKHKFIINIMLKIK
Specific function: Unknown
COG id: COG2972
COG function: function code T; Predicted signal transduction protein with a C-terminal ATPase domain
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 53427; Mature: 53427
Theoretical pI: Translated: 9.22; Mature: 9.22
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.4 %Cys (Translated Protein) 3.1 %Met (Translated Protein) 5.5 %Cys+Met (Translated Protein) 2.4 %Cys (Mature Protein) 3.1 %Met (Mature Protein) 5.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MEKQQILQICRFLSGYSTMIFLYTIKYYFYKNFLGFKNKVWHFTLCALLVTVIDFYMMKT CCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISLLWSIIINNIIWLLIICFLCNGNFLMKFYAVILEEAALLLINLTFLTFDFTILPAIHN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC INVSFNKHIIISFMTNIINDLIRYTILFVFLKNICKFLNLKEKSIKLYENLFLLIPCLSI CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YSLGLIFYIIQPINIDNKRYYLPYIFPKIYYTLPFISFALLVSLLIMAYTFKKMLEGQLE HHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EKKNLLMEQQFKLQLTHSNNIEMLYKGIRGIIHDMNNHVSCLKNLAATNNIEDIKKYLIN HHHHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH IDETISKLDFKIKTGNSISDAVINEKYNIAKTNKIEFICDFLLPKETLLEPVDLCIILSN HHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH ALDNALEACMRITDSNLQKKICIKSYIKNMYLIIEISNSATDKIQYAENKIISTKTDKNN HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCHHHHHHCCCEEECCCCCCC HGIGISNIKTVAKKYNGIVDILEEKHKFIINIMLKIK CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHEEEEEC >Mature Secondary Structure MEKQQILQICRFLSGYSTMIFLYTIKYYFYKNFLGFKNKVWHFTLCALLVTVIDFYMMKT CCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISLLWSIIINNIIWLLIICFLCNGNFLMKFYAVILEEAALLLINLTFLTFDFTILPAIHN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC INVSFNKHIIISFMTNIINDLIRYTILFVFLKNICKFLNLKEKSIKLYENLFLLIPCLSI CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YSLGLIFYIIQPINIDNKRYYLPYIFPKIYYTLPFISFALLVSLLIMAYTFKKMLEGQLE HHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EKKNLLMEQQFKLQLTHSNNIEMLYKGIRGIIHDMNNHVSCLKNLAATNNIEDIKKYLIN HHHHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH IDETISKLDFKIKTGNSISDAVINEKYNIAKTNKIEFICDFLLPKETLLEPVDLCIILSN HHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH ALDNALEACMRITDSNLQKKICIKSYIKNMYLIIEISNSATDKIQYAENKIISTKTDKNN HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCHHHHHHCCCEEECCCCCCC HGIGISNIKTVAKKYNGIVDILEEKHKFIINIMLKIK CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHEEEEEC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA