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The map label for this gene is 170762228

Identifier: 170762228

GI number: 170762228

Start: 140216

End: 142252

Strand: Direct

Name: 170762228

Synonym: UPA3_0113

Alternate gene names: NA

Gene position: 140216-142252 (Clockwise)

Preceding gene: 170762006

Following gene: 170761868

Centisome position: 18.65

GC content: 24.5

Gene sequence:

>2037_bases
ATGAAAATTAATAAAAAATTATTAAAAATTTTTGCTGGAATTACTAGTTTGTTAGTTTTTATACCTATAATTACAGCTTG
TAGTCAAAAATCAAAACTTGTAGTTGGTAATTTTGATTCTTATATGGATCCAGATGTTGCTAATGAGCAAGCAAAACGAT
TTCGTAAAAATAATTTATCATATAGTTTTTATGATAATAATGAAATTTTAAGTTCATTAATTAAAGCAAAAATTTCAGAT
GTACAAGTTGCTTCAGCATATGAAGTAGCTAAATTAGCAAAAAATGGATTAATTAAGAAAATTAATTGAGCAAAATTTAA
TTTGAAAGATGAAAATAACCAAACAATTACTTCAATTGAAGGTTTAAAAAAAATTTTCACAAAGCAAGTTTGAGCAATTT
CAAATGCTTATTCATCATATTTAGGAGATTTAGATAAGGATGGTAAAAATGACCAATTATTAGAATATATGATTCCTTAT
TTTTACCAAGATTTAATTTTTGCTTATCGTGGTAAAAAAATTCCTAATTTGGATGATAATAAAAAAGATGTTTATTGAAG
TGATGTTTTTAAAGAATTAACACGTAATGATGGCACACCCAATCGTTTTTTATATGAACAAAAAGCTAATTTAGGATTTG
GTGTAGATAAAAGAACTCCGATTACAATTGCTAAAAATAAAACAAAAATTATAGCTATTGATGATGCGAGAACAATTTAT
GATATTGCTAAAATTATGCAATTAGAAGGGGATAATAAAAATAACATTATTAAAATTATTAATCATGAAATTCTAGGAAT
TGATAATAGTATTAGTCAAATTTTACATATTTTAAAAAATCCGAATATAAAAGAAGATATTAAAGAAGAAAATATTAAAA
AATTAAAGCGTTTGCAAAAACAATTAGAAGATAGACAAAAAGAATTAAAAACGAATGTGTTCTTACCAGATAGTAGTAGT
GTATCTTATATTGAAGATAAATTAAACAATATTAGTAATATGTTTAAAAATCTACATCCTAACTCTATGTATTTAAAAGC
AAATTCAAACGATGTATTAAATGATTTAGCAATGGCTAATGTTGCTGGAGCAATTGCTTATAGTGGCGATATTGCTTTTG
CTGCTAATGGGGGCGAGTATACAACTGAAGCTGATTCAAATTATGCAAACATGAAGCCAACATCAGATAATTTTCATGTT
GTACGACCTAAAGATACGATGAGTGTTTTAGATGGTTTTACAATTAGTAACTCAATTAATAAACAAAACGAACAAGCAGC
CTATGAATATTTAAATGAATTATGTTTTGCTGGTCTTAATGAAAAAAACACAGATGGAGAATCTAAAATTTTAGACTATG
GTTTGAAAATTCATCGTAATAAAACACCAAAAGAAATTGCTGATTACGAAAATAGTTTAGATGATCAAAATGAAGTTGGT
GACGTTTTAGAAGATAGTGGATATTTGTATACGCCAATGCGTAATTTTGATTATGTTCAATATTCGCCAACACTAAATAC
AATTGCTGATTATGTTTTAGATGAAAACAATGGATTTTATGGAAAAACTGGTTTTGAAAGTGATTTATTAAGACAAAAAA
TGGTTGAAATCTTTGAAATTGATACAAAATATAAAACAAAAAAAGAGCGCCAACGTAAACATAAATATATTTCATTATTA
AATGAAATTATTAATCACATTTATAATACTTATCAAAAAGATAAAAAATTTATTTTTAATCCTACGTTAATTAATGATAT
ATACGAACAAAAACCGATTAAAAATTTAATATATGAGTGTTTAAATAATTTAAATATTAAAATTGAATCACATGTTTTTA
ATAATTATCTTTTATTAAAATTAGAAGCTATTTTTAATAACATCAATGAAGAGGTTGAAGAACACGCTGCTTTAAACGCG
ACATTAAGAAAAATTTTTAATGTTCGTTTAAATATTAATACTTTAGAATTTCCCACAAATGATTTATCAATTTCTAATTT
AAAATTAGCATACCTTGCCTTCCGTGAAAAGATTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGCTGCATTAATTAGTGCTAATAAAATTATTAAGTTAAAATTAATTAATAAACAAACTAATAAACGCAAATTAAAAATTT
GAAATAGACAGGTTTAAATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAATATTAATTTAAGGTTGTTAAAAGGTTCTCATTTTTCAATATAAACGTTAGTTTATTATATAATTAATATATAAGAAT
TTTATAATGGGGTAGTTATG

Product: putative lipoprotein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 678; Mature: 678

Protein sequence:

>678_residues
MKINKKLLKIFAGITSLLVFIPIITACSQKSKLVVGNFDSYMDPDVANEQAKRFRKNNLSYSFYDNNEILSSLIKAKISD
VQVASAYEVAKLAKNGLIKKINWAKFNLKDENNQTITSIEGLKKIFTKQVWAISNAYSSYLGDLDKDGKNDQLLEYMIPY
FYQDLIFAYRGKKIPNLDDNKKDVYWSDVFKELTRNDGTPNRFLYEQKANLGFGVDKRTPITIAKNKTKIIAIDDARTIY
DIAKIMQLEGDNKNNIIKIINHEILGIDNSISQILHILKNPNIKEDIKEENIKKLKRLQKQLEDRQKELKTNVFLPDSSS
VSYIEDKLNNISNMFKNLHPNSMYLKANSNDVLNDLAMANVAGAIAYSGDIAFAANGGEYTTEADSNYANMKPTSDNFHV
VRPKDTMSVLDGFTISNSINKQNEQAAYEYLNELCFAGLNEKNTDGESKILDYGLKIHRNKTPKEIADYENSLDDQNEVG
DVLEDSGYLYTPMRNFDYVQYSPTLNTIADYVLDENNGFYGKTGFESDLLRQKMVEIFEIDTKYKTKKERQRKHKYISLL
NEIINHIYNTYQKDKKFIFNPTLINDIYEQKPIKNLIYECLNNLNIKIESHVFNNYLLLKLEAIFNNINEEVEEHAALNA
TLRKIFNVRLNINTLEFPTNDLSISNLKLAYLAFREKI

Sequences:

>Translated_678_residues
MKINKKLLKIFAGITSLLVFIPIITACSQKSKLVVGNFDSYMDPDVANEQAKRFRKNNLSYSFYDNNEILSSLIKAKISD
VQVASAYEVAKLAKNGLIKKIN*AKFNLKDENNQTITSIEGLKKIFTKQV*AISNAYSSYLGDLDKDGKNDQLLEYMIPY
FYQDLIFAYRGKKIPNLDDNKKDVY*SDVFKELTRNDGTPNRFLYEQKANLGFGVDKRTPITIAKNKTKIIAIDDARTIY
DIAKIMQLEGDNKNNIIKIINHEILGIDNSISQILHILKNPNIKEDIKEENIKKLKRLQKQLEDRQKELKTNVFLPDSSS
VSYIEDKLNNISNMFKNLHPNSMYLKANSNDVLNDLAMANVAGAIAYSGDIAFAANGGEYTTEADSNYANMKPTSDNFHV
VRPKDTMSVLDGFTISNSINKQNEQAAYEYLNELCFAGLNEKNTDGESKILDYGLKIHRNKTPKEIADYENSLDDQNEVG
DVLEDSGYLYTPMRNFDYVQYSPTLNTIADYVLDENNGFYGKTGFESDLLRQKMVEIFEIDTKYKTKKERQRKHKYISLL
NEIINHIYNTYQKDKKFIFNPTLINDIYEQKPIKNLIYECLNNLNIKIESHVFNNYLLLKLEAIFNNINEEVEEHAALNA
TLRKIFNVRLNINTLEFPTNDLSISNLKLAYLAFREKI
>Mature_678_residues
MKINKKLLKIFAGITSLLVFIPIITACSQKSKLVVGNFDSYMDPDVANEQAKRFRKNNLSYSFYDNNEILSSLIKAKISD
VQVASAYEVAKLAKNGLIKKIN*AKFNLKDENNQTITSIEGLKKIFTKQV*AISNAYSSYLGDLDKDGKNDQLLEYMIPY
FYQDLIFAYRGKKIPNLDDNKKDVY*SDVFKELTRNDGTPNRFLYEQKANLGFGVDKRTPITIAKNKTKIIAIDDARTIY
DIAKIMQLEGDNKNNIIKIINHEILGIDNSISQILHILKNPNIKEDIKEENIKKLKRLQKQLEDRQKELKTNVFLPDSSS
VSYIEDKLNNISNMFKNLHPNSMYLKANSNDVLNDLAMANVAGAIAYSGDIAFAANGGEYTTEADSNYANMKPTSDNFHV
VRPKDTMSVLDGFTISNSINKQNEQAAYEYLNELCFAGLNEKNTDGESKILDYGLKIHRNKTPKEIADYENSLDDQNEVG
DVLEDSGYLYTPMRNFDYVQYSPTLNTIADYVLDENNGFYGKTGFESDLLRQKMVEIFEIDTKYKTKKERQRKHKYISLL
NEIINHIYNTYQKDKKFIFNPTLINDIYEQKPIKNLIYECLNNLNIKIESHVFNNYLLLKLEAIFNNINEEVEEHAALNA
TLRKIFNVRLNINTLEFPTNDLSISNLKLAYLAFREKI

Specific function: Unknown

COG id: COG0687

COG function: function code E; Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Lipid-anchor (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000044 [H]

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 77436; Mature: 77436

Theoretical pI: Translated: 7.29; Mature: 7.29

Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
2.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
2.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKINKKLLKIFAGITSLLVFIPIITACSQKSKLVVGNFDSYMDPDVANEQAKRFRKNNLS
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCC
YSFYDNNEILSSLIKAKISDVQVASAYEVAKLAKNGLIKKINAKFNLKDENNQTITSIEG
EEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCEEEECCCCCCHHHHHHH
LKKIFTKQVAISNAYSSYLGDLDKDGKNDQLLEYMIPYFYQDLIFAYRGKKIPNLDDNKK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHH
DVYSDVFKELTRNDGTPNRFLYEQKANLGFGVDKRTPITIAKNKTKIIAIDDARTIYDIA
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEECCCEEEEEECCCHHHHHHH
KIMQLEGDNKNNIIKIINHEILGIDNSISQILHILKNPNIKEDIKEENIKKLKRLQKQLE
HHHHHCCCCCCCEEEEECCHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DRQKELKTNVFLPDSSSVSYIEDKLNNISNMFKNLHPNSMYLKANSNDVLNDLAMANVAG
HHHHHHHCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHH
AIAYSGDIAFAANGGEYTTEADSNYANMKPTSDNFHVVRPKDTMSVLDGFTISNSINKQN
HEEECCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHCCCHHCCCCCCCH
EQAAYEYLNELCFAGLNEKNTDGESKILDYGLKIHRNKTPKEIADYENSLDDQNEVGDVL
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHCHHEECCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
EDSGYLYTPMRNFDYVQYSPTLNTIADYVLDENNGFYGKTGFESDLLRQKMVEIFEIDTK
HCCCEEEECCCCCCCEEECCCHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCH
YKTKKERQRKHKYISLLNEIINHIYNTYQKDKKFIFNPTLINDIYEQKPIKNLIYECLNN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCC
LNIKIESHVFNNYLLLKLEAIFNNINEEVEEHAALNATLRKIFNVRLNINTLEFPTNDLS
CCEEEEEEECCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEECCCCCCC
ISNLKLAYLAFREKI
CCCHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MKINKKLLKIFAGITSLLVFIPIITACSQKSKLVVGNFDSYMDPDVANEQAKRFRKNNLS
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCC
YSFYDNNEILSSLIKAKISDVQVASAYEVAKLAKNGLIKKINAKFNLKDENNQTITSIEG
EEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCEEEECCCCCCHHHHHHH
LKKIFTKQVAISNAYSSYLGDLDKDGKNDQLLEYMIPYFYQDLIFAYRGKKIPNLDDNKK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHH
DVYSDVFKELTRNDGTPNRFLYEQKANLGFGVDKRTPITIAKNKTKIIAIDDARTIYDIA
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEECCCEEEEEECCCHHHHHHH
KIMQLEGDNKNNIIKIINHEILGIDNSISQILHILKNPNIKEDIKEENIKKLKRLQKQLE
HHHHHCCCCCCCEEEEECCHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DRQKELKTNVFLPDSSSVSYIEDKLNNISNMFKNLHPNSMYLKANSNDVLNDLAMANVAG
HHHHHHHCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHH
AIAYSGDIAFAANGGEYTTEADSNYANMKPTSDNFHVVRPKDTMSVLDGFTISNSINKQN
HEEECCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHCCCHHCCCCCCCH
EQAAYEYLNELCFAGLNEKNTDGESKILDYGLKIHRNKTPKEIADYENSLDDQNEVGDVL
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHCHHEECCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
EDSGYLYTPMRNFDYVQYSPTLNTIADYVLDENNGFYGKTGFESDLLRQKMVEIFEIDTK
HCCCEEEECCCCCCCEEECCCHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCH
YKTKKERQRKHKYISLLNEIINHIYNTYQKDKKFIFNPTLINDIYEQKPIKNLIYECLNN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCC
LNIKIESHVFNNYLLLKLEAIFNNINEEVEEHAALNATLRKIFNVRLNINTLEFPTNDLS
CCEEEEEEECCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEECCCCCCC
ISNLKLAYLAFREKI
CCCHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8948633 [H]