Definition | Finegoldia magna ATCC 29328 chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_010376 |
Length | 1,797,577 |
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The map label for this gene is 169824154
Identifier: 169824154
GI number: 169824154
Start: 513297
End: 514523
Strand: Direct
Name: 169824154
Synonym: FMG_0457
Alternate gene names: NA
Gene position: 513297-514523 (Clockwise)
Preceding gene: 169824153
Following gene: 169824155
Centisome position: 28.55
GC content: 30.56
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases ATATCTTGTCATTGTCAATAGTTACGATTTGTCAAAATACGTGTATTATTGCGAATTTTTGATATTATATAATTAGAGGA TTTTGAATGAGAGGTGAGAT
Downstream 100 bases:
>100_bases AATAAAATTTACAAGATAGTTGGTAAAACTTGCCAGCTATCTTTTTTACTTTAAAAAAAATTCAATATCAATTATAATAT TAAATAAGGAGGATTTTTAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 408; Mature: 408
Protein sequence:
>408_residues MKSLYNRILNYSTDQKLILLTAITMFMPFYIGIGVLIVDMFYFVYQNKFKKIFDKSNLSVFGLIFGVYSLVVSIVFNNTY GILATVGMFVLFVFLLFIRKNMTEQFMEDCMLIIMMFASICFLITLTQYSIILKDNSFNYTQFMKYISENRTTVGTFFFN ANYYAMVCSLVGIISAYKYFSTESFERLFSFVVGVLSVLTLLITDSRGAMFASFIAVFALTIMMKKRKYTIAIISVFALA FVGIVALGRMDLIPRVDKIGFDMGLRRSIWISAIAAFKKNFIIGVGPLGIHNIYTTIRDRAILHSHNLYLDILVNYGLIG AGLLIPIIYQLFREIKSLYSQKYTKMIIAMVIMVMIHSMVDVTIFWTQTSFIFLTFVAGVGELSTVPVSEFSLFKAKKSF KTKNIYEK
Sequences:
>Translated_408_residues MKSLYNRILNYSTDQKLILLTAITMFMPFYIGIGVLIVDMFYFVYQNKFKKIFDKSNLSVFGLIFGVYSLVVSIVFNNTY GILATVGMFVLFVFLLFIRKNMTEQFMEDCMLIIMMFASICFLITLTQYSIILKDNSFNYTQFMKYISENRTTVGTFFFN ANYYAMVCSLVGIISAYKYFSTESFERLFSFVVGVLSVLTLLITDSRGAMFASFIAVFALTIMMKKRKYTIAIISVFALA FVGIVALGRMDLIPRVDKIGFDMGLRRSIWISAIAAFKKNFIIGVGPLGIHNIYTTIRDRAILHSHNLYLDILVNYGLIG AGLLIPIIYQLFREIKSLYSQKYTKMIIAMVIMVMIHSMVDVTIFWTQTSFIFLTFVAGVGELSTVPVSEFSLFKAKKSF KTKNIYEK >Mature_408_residues MKSLYNRILNYSTDQKLILLTAITMFMPFYIGIGVLIVDMFYFVYQNKFKKIFDKSNLSVFGLIFGVYSLVVSIVFNNTY GILATVGMFVLFVFLLFIRKNMTEQFMEDCMLIIMMFASICFLITLTQYSIILKDNSFNYTQFMKYISENRTTVGTFFFN ANYYAMVCSLVGIISAYKYFSTESFERLFSFVVGVLSVLTLLITDSRGAMFASFIAVFALTIMMKKRKYTIAIISVFALA FVGIVALGRMDLIPRVDKIGFDMGLRRSIWISAIAAFKKNFIIGVGPLGIHNIYTTIRDRAILHSHNLYLDILVNYGLIG AGLLIPIIYQLFREIKSLYSQKYTKMIIAMVIMVMIHSMVDVTIFWTQTSFIFLTFVAGVGELSTVPVSEFSLFKAKKSF KTKNIYEK
Specific function: Unknown
COG id: COG3307
COG function: function code M; Lipid A core - O-antigen ligase and related enzymes
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
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Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 46730; Mature: 46730
Theoretical pI: Translated: 10.00; Mature: 10.00
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 5.4 %Met (Translated Protein) 6.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 5.4 %Met (Mature Protein) 6.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKSLYNRILNYSTDQKLILLTAITMFMPFYIGIGVLIVDMFYFVYQNKFKKIFDKSNLSV CCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH FGLIFGVYSLVVSIVFNNTYGILATVGMFVLFVFLLFIRKNMTEQFMEDCMLIIMMFASI HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH CFLITLTQYSIILKDNSFNYTQFMKYISENRTTVGTFFFNANYYAMVCSLVGIISAYKYF HHHHHHHHHEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH STESFERLFSFVVGVLSVLTLLITDSRGAMFASFIAVFALTIMMKKRKYTIAIISVFALA CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH FVGIVALGRMDLIPRVDKIGFDMGLRRSIWISAIAAFKKNFIIGVGPLGIHNIYTTIRDR HHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHH AILHSHNLYLDILVNYGLIGAGLLIPIIYQLFREIKSLYSQKYTKMIIAMVIMVMIHSMV HHHHCCCHHEEHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DVTIFWTQTSFIFLTFVAGVGELSTVPVSEFSLFKAKKSFKTKNIYEK HEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MKSLYNRILNYSTDQKLILLTAITMFMPFYIGIGVLIVDMFYFVYQNKFKKIFDKSNLSV CCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH FGLIFGVYSLVVSIVFNNTYGILATVGMFVLFVFLLFIRKNMTEQFMEDCMLIIMMFASI HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH CFLITLTQYSIILKDNSFNYTQFMKYISENRTTVGTFFFNANYYAMVCSLVGIISAYKYF HHHHHHHHHEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH STESFERLFSFVVGVLSVLTLLITDSRGAMFASFIAVFALTIMMKKRKYTIAIISVFALA CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH FVGIVALGRMDLIPRVDKIGFDMGLRRSIWISAIAAFKKNFIIGVGPLGIHNIYTTIRDR HHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHH AILHSHNLYLDILVNYGLIGAGLLIPIIYQLFREIKSLYSQKYTKMIIAMVIMVMIHSMV HHHHCCCHHEEHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DVTIFWTQTSFIFLTFVAGVGELSTVPVSEFSLFKAKKSFKTKNIYEK HEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA