| Definition | Thermoanaerobacter sp. X514 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010320 |
| Length | 2,457,259 |
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The map label for this gene is 167039014
Identifier: 167039014
GI number: 167039014
Start: 356615
End: 358207
Strand: Direct
Name: 167039014
Synonym: Teth514_0347
Alternate gene names: NA
Gene position: 356615-358207 (Clockwise)
Preceding gene: 167039013
Following gene: 167039015
Centisome position: 14.51
GC content: 30.45
Gene sequence:
>1593_bases ATGACAGAAATAAAGGCTTTGCTTACATTGGACTTATTAAGATTTAAAAATTTTGTGAAGGATATAATCAAAAACCCCAA AAGAATATTTATATATCTTCTTCAATTTATCTGGTTTGTATTCATTTTAATACCCGTGATAACAAAGAGGGGAAAGACAT TCAATGAAATAAGTACGATAAAATTTGAAGTTTTTAATGCAGTTTTGATAGCGGTCATGCTTTTGGGAGTTTTTGCTTCT TTATTTACCTCCTTAAGACAGCCGGGAATTATATTGAGCCCAGGAGATACAGCTTTTTTGTTGTCTTCCCCGATAAGAGA AAGAATGATATTTTTCTGGTACATGGTAAGGAGCATTTTTAAAAATTTATTTATTGCTGTTCTATTTATCATATATCTGC CTTTTTTAAGTGTTACAATGGAAATTTTCAAATATTCACAGAACTTAATTTGGGGATACCTCGGAGTATTTACTTTTTAT CTTGCACTTAGTCCTTTAAGCTTTTTATTTTACTCCATTTCAATGAAGTTTAATGCAAAAGAGATAATAAAATACATTTT ATGGAGTGTATTAGTCTTGGTTCTCGGTTCTGCAGTGTATTTTGCCTATAAAGAGCAAAACATTTATGGTTTTATTGAAT ATTTTGACTTAAAAGGATGGGATTATGTTCCTATTATAGGACCTTCAAAAGGACTTATACTTTCATATTTTACTGGTAAT TCTCACAACGCAATAATACAGATAATTTTACAATTTGTAACAATAGTTTTGCTTGTATTTATAGGACTTTATTTTGCGAC AGACTATTATGAGGAAGTTGTCACTTACAATGAAAAGATAAGAAAGATAAGAGAAAAGGCCGATAAAGGTGACTTGTCAG GTACGGAAGAAAATGTAAAAAAGAAAAAAAGAAAAGTAGAAGTGAAATTTTCACCAAAAGGTCCATGGGCTTTTATATGG CTTAAAATGGTAGAAAATAAAAGACAGATAGGCTCTATATATTTTAATTTTTATAACCTCTTTTTGCTTGTAATTTCAAT TGCTTTTGGATATTTTCTTCCTAAAAATGATAGCACTATAATATTTGTTTTGGCTTTTATGTACGCTTATATGGCTTGGC TTTTGAGTATGGTCTCAACAATAGGGGCAGAATTAAATAGAATGTACATTTACATAATTCCGGGAGAAGGCATAGAAAAG CTTATTGCAGTAAACTTTGTACCTCTTTTAAAATCGTTTATAACAGCGATACTTCTTATAGTACCTGCTTCAATTTTTAT AAAACCCGGCTTGCTTAATACTATTGCAGCTATACTGTTTATAATAAGTCTTTCGGTTTTACAGAATTTTTCCTACGCTT TTTTGCTTACTTTTATGCCATCAAAAGAAGACATTAAAATAGCAATACCTTTTTTTAGGTTGTTTGGATTATTATTTGTG CTTATACCTGTAGGATTAGTTTCCATTCCTTTGGGTATTGCGACAAAAAGTATGGGAATAGGCATTTTATCAGCTTCTAT AATAATGCTTTTAGAAGCGGGAATGTTTTTGCTCTTTGCAAATTATATATTTGAGAGGTTGGAGCTGAAGTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases TAAAAGCGGGAAAGCTCATCTATGAAGGTACTCTTGAAGAGGTTATGGAAAAAGCAGGACCTAATGGCACATTAGAAGAC CTCTTTTTGGAGGTGACAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases GGGAAAATTTTGATGGGAGATATAAAGTCTAATGAAATACTTTTTTCTTATAAAAAGTGTCTGGAAATAGGACTTACAAA ATCGATAGTTACTCCATTAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 530; Mature: 529
Protein sequence:
>530_residues MTEIKALLTLDLLRFKNFVKDIIKNPKRIFIYLLQFIWFVFILIPVITKRGKTFNEISTIKFEVFNAVLIAVMLLGVFAS LFTSLRQPGIILSPGDTAFLLSSPIRERMIFFWYMVRSIFKNLFIAVLFIIYLPFLSVTMEIFKYSQNLIWGYLGVFTFY LALSPLSFLFYSISMKFNAKEIIKYILWSVLVLVLGSAVYFAYKEQNIYGFIEYFDLKGWDYVPIIGPSKGLILSYFTGN SHNAIIQIILQFVTIVLLVFIGLYFATDYYEEVVTYNEKIRKIREKADKGDLSGTEENVKKKKRKVEVKFSPKGPWAFIW LKMVENKRQIGSIYFNFYNLFLLVISIAFGYFLPKNDSTIIFVLAFMYAYMAWLLSMVSTIGAELNRMYIYIIPGEGIEK LIAVNFVPLLKSFITAILLIVPASIFIKPGLLNTIAAILFIISLSVLQNFSYAFLLTFMPSKEDIKIAIPFFRLFGLLFV LIPVGLVSIPLGIATKSMGIGILSASIIMLLEAGMFLLFANYIFERLELK
Sequences:
>Translated_530_residues MTEIKALLTLDLLRFKNFVKDIIKNPKRIFIYLLQFIWFVFILIPVITKRGKTFNEISTIKFEVFNAVLIAVMLLGVFAS LFTSLRQPGIILSPGDTAFLLSSPIRERMIFFWYMVRSIFKNLFIAVLFIIYLPFLSVTMEIFKYSQNLIWGYLGVFTFY LALSPLSFLFYSISMKFNAKEIIKYILWSVLVLVLGSAVYFAYKEQNIYGFIEYFDLKGWDYVPIIGPSKGLILSYFTGN SHNAIIQIILQFVTIVLLVFIGLYFATDYYEEVVTYNEKIRKIREKADKGDLSGTEENVKKKKRKVEVKFSPKGPWAFIW LKMVENKRQIGSIYFNFYNLFLLVISIAFGYFLPKNDSTIIFVLAFMYAYMAWLLSMVSTIGAELNRMYIYIIPGEGIEK LIAVNFVPLLKSFITAILLIVPASIFIKPGLLNTIAAILFIISLSVLQNFSYAFLLTFMPSKEDIKIAIPFFRLFGLLFV LIPVGLVSIPLGIATKSMGIGILSASIIMLLEAGMFLLFANYIFERLELK >Mature_529_residues TEIKALLTLDLLRFKNFVKDIIKNPKRIFIYLLQFIWFVFILIPVITKRGKTFNEISTIKFEVFNAVLIAVMLLGVFASL FTSLRQPGIILSPGDTAFLLSSPIRERMIFFWYMVRSIFKNLFIAVLFIIYLPFLSVTMEIFKYSQNLIWGYLGVFTFYL ALSPLSFLFYSISMKFNAKEIIKYILWSVLVLVLGSAVYFAYKEQNIYGFIEYFDLKGWDYVPIIGPSKGLILSYFTGNS HNAIIQIILQFVTIVLLVFIGLYFATDYYEEVVTYNEKIRKIREKADKGDLSGTEENVKKKKRKVEVKFSPKGPWAFIWL KMVENKRQIGSIYFNFYNLFLLVISIAFGYFLPKNDSTIIFVLAFMYAYMAWLLSMVSTIGAELNRMYIYIIPGEGIEKL IAVNFVPLLKSFITAILLIVPASIFIKPGLLNTIAAILFIISLSVLQNFSYAFLLTFMPSKEDIKIAIPFFRLFGLLFVL IPVGLVSIPLGIATKSMGIGILSASIIMLLEAGMFLLFANYIFERLELK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 60944; Mature: 60813
Theoretical pI: Translated: 10.00; Mature: 10.00
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 2.8 %Met (Translated Protein) 2.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 2.6 %Met (Mature Protein) 2.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTEIKALLTLDLLRFKNFVKDIIKNPKRIFIYLLQFIWFVFILIPVITKRGKTFNEISTI CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH KFEVFNAVLIAVMLLGVFASLFTSLRQPGIILSPGDTAFLLSSPIRERMIFFWYMVRSIF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KNLFIAVLFIIYLPFLSVTMEIFKYSQNLIWGYLGVFTFYLALSPLSFLFYSISMKFNAK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH EIIKYILWSVLVLVLGSAVYFAYKEQNIYGFIEYFDLKGWDYVPIIGPSKGLILSYFTGN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCEEEEEEEECCCCCEEEEECCCCCEEEEEEECC SHNAIIQIILQFVTIVLLVFIGLYFATDYYEEVVTYNEKIRKIREKADKGDLSGTEENVK CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHH KKKRKVEVKFSPKGPWAFIWLKMVENKRQIGSIYFNFYNLFLLVISIAFGYFLPKNDSTI HHHHHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH IFVLAFMYAYMAWLLSMVSTIGAELNRMYIYIIPGEGIEKLIAVNFVPLLKSFITAILLI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VPASIFIKPGLLNTIAAILFIISLSVLQNFSYAFLLTFMPSKEDIKIAIPFFRLFGLLFV HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHEEECCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHH LIPVGLVSIPLGIATKSMGIGILSASIIMLLEAGMFLLFANYIFERLELK HHHHHHHHHCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure TEIKALLTLDLLRFKNFVKDIIKNPKRIFIYLLQFIWFVFILIPVITKRGKTFNEISTI CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH KFEVFNAVLIAVMLLGVFASLFTSLRQPGIILSPGDTAFLLSSPIRERMIFFWYMVRSIF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KNLFIAVLFIIYLPFLSVTMEIFKYSQNLIWGYLGVFTFYLALSPLSFLFYSISMKFNAK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH EIIKYILWSVLVLVLGSAVYFAYKEQNIYGFIEYFDLKGWDYVPIIGPSKGLILSYFTGN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCEEEEEEEECCCCCEEEEECCCCCEEEEEEECC SHNAIIQIILQFVTIVLLVFIGLYFATDYYEEVVTYNEKIRKIREKADKGDLSGTEENVK CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHH KKKRKVEVKFSPKGPWAFIWLKMVENKRQIGSIYFNFYNLFLLVISIAFGYFLPKNDSTI HHHHHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH IFVLAFMYAYMAWLLSMVSTIGAELNRMYIYIIPGEGIEKLIAVNFVPLLKSFITAILLI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VPASIFIKPGLLNTIAAILFIISLSVLQNFSYAFLLTFMPSKEDIKIAIPFFRLFGLLFV HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHEEECCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHH LIPVGLVSIPLGIATKSMGIGILSASIIMLLEAGMFLLFANYIFERLELK HHHHHHHHHCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA