| Definition | Shewanella baltica OS195 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009997 |
| Length | 5,347,283 |
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The map label for this gene is 160874517
Identifier: 160874517
GI number: 160874517
Start: 1674924
End: 1677086
Strand: Reverse
Name: 160874517
Synonym: Sbal195_1399
Alternate gene names: NA
Gene position: 1677086-1674924 (Counterclockwise)
Preceding gene: 160874519
Following gene: 160874516
Centisome position: 31.36
GC content: 45.72
Gene sequence:
>2163_bases ATGCAAAAACTCACGGTTATTTTATTTACTTTGTTGCTGTCACTGCCTTTTAGCGTTCAAAGCCGAGATCTCGAAGCTGA TGAGGTGGAGTTAAGAGAATCGCCACAGCAAATGTATGATGTACTCAACAAATCCATTTCCTTCCCCCTTGCGTTCCAAA ACCGTGACCAATTTGAGCGTGCAGCCCAAGAACAAGGCTACAGCCCAATCGAATTTGAACAGATTTTGTATCTGCTGACT CGGCTGAATATGGAGCCGAACGTGAAAACTAAGGTCGGTTTTCAAGACGCAAAAAGCTTGATTGAACTCTTATCCACTGC GGCGCAATCGCCCTACGAACTGGCTATGGTCGCCATGTTGAATGGTCGTTACCTTGGCCGTACCGAACAGAAATATCAAG AAGCGATTGGCCTATATAATGAAGCGCTCACTCGCATCAACGACAGTTATGACATCGAAGCATTGATTCTTAAGCACAAT ATTCATGAGCACTTAGGCGGCTTACATTTATTGATCCGTCAAGAAGTACCGGCGCTGATGCACTTCCATACATACCGCGA CATTGCCTATAAGCTCAGAAACGATTACTTAATCGCGGCGGCTGAAGCAAGACTGGGGTTCTATTACAATTTTAATCAGC AGCTCACCAAATCATTGCAGCATTACAATGAAGCGATTCGGATCTCCAATCGTTCTAATTACCCGGCGATGAAAACCAAT CTGCAATTGCAACTTTCTAAGGTATATCGCGATTTAAAGCAGTGGGATGAAGCCCTTAAAAATGCCCACGAAGCCGCTGC CGGTTTTAAAAAAATGGGCAATGACACCTATCTTTCAAGCTGTATGACAGTAATCGCTATGGTGTATGGCGAACAAGGGG ATTGGAATAAAGCGATTGATTACTACCTTAATGCCCAGCAATTAGATGCCAAACGCGGTAACTATATTGCCCAAGGCCTT AATTTCCACAATCTTGGGCAAGCCTACTCAAATATTAATGACAATGTTAACGCCCTAAAATATTTACTGATGGCCAATCA AATATTCAAAGAAAAACAAAGCCATCACTATCAGGTTTATAACGAACTCTTAATTGGCGAAATCGCACAAACCAACCAAG ATTGGCCGCTAATGATGACCCATGCCGACATCGCATTGGCATTGGCTATCGACTTAAAACTCGTCAATGAACAAAAAGCC GCGCTCACACTGATTGCCTCGGCGTCGCAAAAATTAGGGGAATTAACCAAAACCATCGATGCCCAAACCCGTATCATAGA GCTAGGTAACACCCTTGCAGAGAAAGAGAAAGACTCCCCAGTGTCGACCTCAGCCCTTGCGGAGCAACAGCTCAAACTTG AGCTCAACATGGTTCAGGGAAAACTTGCCGAGACAGTGAAGGAAAGCAACAGCACCCACACGCTACTGCTCATCAGCTGC CTCATTGCCGGACTCTTACTGCTGGTGATTGCGTATATGTTGCATCATCGCCGCAAAACCATGGCAAAAAACGCCGCATT AACTCAATTGAGCCTACAGGAACCCTTCACCCATAACTTAGGCTATGCGGCGCTATTAGCGCACTTAAGCTATAATCAAA CTCAAGCGTCGACGACTGCCCTAGGGATTATCGCCTTCCCCGCCCAGCTCACGACCGACCTCGACTATGGCCAATATTTT AGTGATGCAGTAACAGCGCAACTGGCCACTCATCTAACCGATGCGCTCGCAGCACCTGTGTATGTGATACGCCAAGGGGT ATTTGCAGTGCGTTTCACCCAAGCCGTTGAGCCAACGCACGTGCTCAGCCAAATACGCCAGAAACTCGACCAACAGCACA TCGTCCATCATTTCCGGCTTGGTTTTGCCAACTTGCCACTGTTAGCGAAATCAGAAATCAAAATGGCCGCAAAATTAAAG TTCGAAACCGTGCAGATGGCGCTCGCCTGTGCCCGCAGTTTAGAGGGCAATAACGATTATTTTGTCGCCCTCAGAGCACT CGATTTTGTCCCTCTAAGCTTATTTGCCAATCCGTTATTTTTACACCTTGAAAAAGGCATTGAGCGCGGGTTAATCAGAT TAGATACCAACGGAAATAAAGAAGATGTTCGCTGGCCTTGCTGGGAAAATAACCAAGATAGGCAATTACTGGAAAATATT TGA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTTTCCAAGTATAACAAGTCGATGTAGCATCCTCATTAGGCGCTAACAAAAGCTAACAAAATAAGTTCCTTGACTTAAGG AATGAGGAATCACAGTTCAA
Downstream 100 bases:
>100_bases TCAATATCAGCAATTAATCACAGAGTCATAGGAAAATCGCATTTGCACTCTACGCCCAGTGTTATAACATTAGTATCATA TGAGTTAACAGCTAATCTGG
Product: TPR repeat-containing protein
Products: NA
Alternate protein names: TPR Domain-Containing Protein; Tetratricopeptide Domain-Containing Protein
Number of amino acids: Translated: 720; Mature: 720
Protein sequence:
>720_residues MQKLTVILFTLLLSLPFSVQSRDLEADEVELRESPQQMYDVLNKSISFPLAFQNRDQFERAAQEQGYSPIEFEQILYLLT RLNMEPNVKTKVGFQDAKSLIELLSTAAQSPYELAMVAMLNGRYLGRTEQKYQEAIGLYNEALTRINDSYDIEALILKHN IHEHLGGLHLLIRQEVPALMHFHTYRDIAYKLRNDYLIAAAEARLGFYYNFNQQLTKSLQHYNEAIRISNRSNYPAMKTN LQLQLSKVYRDLKQWDEALKNAHEAAAGFKKMGNDTYLSSCMTVIAMVYGEQGDWNKAIDYYLNAQQLDAKRGNYIAQGL NFHNLGQAYSNINDNVNALKYLLMANQIFKEKQSHHYQVYNELLIGEIAQTNQDWPLMMTHADIALALAIDLKLVNEQKA ALTLIASASQKLGELTKTIDAQTRIIELGNTLAEKEKDSPVSTSALAEQQLKLELNMVQGKLAETVKESNSTHTLLLISC LIAGLLLLVIAYMLHHRRKTMAKNAALTQLSLQEPFTHNLGYAALLAHLSYNQTQASTTALGIIAFPAQLTTDLDYGQYF SDAVTAQLATHLTDALAAPVYVIRQGVFAVRFTQAVEPTHVLSQIRQKLDQQHIVHHFRLGFANLPLLAKSEIKMAAKLK FETVQMALACARSLEGNNDYFVALRALDFVPLSLFANPLFLHLEKGIERGLIRLDTNGNKEDVRWPCWENNQDRQLLENI
Sequences:
>Translated_720_residues MQKLTVILFTLLLSLPFSVQSRDLEADEVELRESPQQMYDVLNKSISFPLAFQNRDQFERAAQEQGYSPIEFEQILYLLT RLNMEPNVKTKVGFQDAKSLIELLSTAAQSPYELAMVAMLNGRYLGRTEQKYQEAIGLYNEALTRINDSYDIEALILKHN IHEHLGGLHLLIRQEVPALMHFHTYRDIAYKLRNDYLIAAAEARLGFYYNFNQQLTKSLQHYNEAIRISNRSNYPAMKTN LQLQLSKVYRDLKQWDEALKNAHEAAAGFKKMGNDTYLSSCMTVIAMVYGEQGDWNKAIDYYLNAQQLDAKRGNYIAQGL NFHNLGQAYSNINDNVNALKYLLMANQIFKEKQSHHYQVYNELLIGEIAQTNQDWPLMMTHADIALALAIDLKLVNEQKA ALTLIASASQKLGELTKTIDAQTRIIELGNTLAEKEKDSPVSTSALAEQQLKLELNMVQGKLAETVKESNSTHTLLLISC LIAGLLLLVIAYMLHHRRKTMAKNAALTQLSLQEPFTHNLGYAALLAHLSYNQTQASTTALGIIAFPAQLTTDLDYGQYF SDAVTAQLATHLTDALAAPVYVIRQGVFAVRFTQAVEPTHVLSQIRQKLDQQHIVHHFRLGFANLPLLAKSEIKMAAKLK FETVQMALACARSLEGNNDYFVALRALDFVPLSLFANPLFLHLEKGIERGLIRLDTNGNKEDVRWPCWENNQDRQLLENI >Mature_720_residues MQKLTVILFTLLLSLPFSVQSRDLEADEVELRESPQQMYDVLNKSISFPLAFQNRDQFERAAQEQGYSPIEFEQILYLLT RLNMEPNVKTKVGFQDAKSLIELLSTAAQSPYELAMVAMLNGRYLGRTEQKYQEAIGLYNEALTRINDSYDIEALILKHN IHEHLGGLHLLIRQEVPALMHFHTYRDIAYKLRNDYLIAAAEARLGFYYNFNQQLTKSLQHYNEAIRISNRSNYPAMKTN LQLQLSKVYRDLKQWDEALKNAHEAAAGFKKMGNDTYLSSCMTVIAMVYGEQGDWNKAIDYYLNAQQLDAKRGNYIAQGL NFHNLGQAYSNINDNVNALKYLLMANQIFKEKQSHHYQVYNELLIGEIAQTNQDWPLMMTHADIALALAIDLKLVNEQKA ALTLIASASQKLGELTKTIDAQTRIIELGNTLAEKEKDSPVSTSALAEQQLKLELNMVQGKLAETVKESNSTHTLLLISC LIAGLLLLVIAYMLHHRRKTMAKNAALTQLSLQEPFTHNLGYAALLAHLSYNQTQASTTALGIIAFPAQLTTDLDYGQYF SDAVTAQLATHLTDALAAPVYVIRQGVFAVRFTQAVEPTHVLSQIRQKLDQQHIVHHFRLGFANLPLLAKSEIKMAAKLK FETVQMALACARSLEGNNDYFVALRALDFVPLSLFANPLFLHLEKGIERGLIRLDTNGNKEDVRWPCWENNQDRQLLENI
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 81600; Mature: 81600
Theoretical pI: Translated: 6.78; Mature: 6.78
Prosite motif: PS50005 TPR L=RR ; PS50293 TPR_REGION
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 2.5 %Met (Translated Protein) 3.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 2.5 %Met (Mature Protein) 3.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MQKLTVILFTLLLSLPFSVQSRDLEADEVELRESPQQMYDVLNKSISFPLAFQNRDQFER CCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHHHH AAQEQGYSPIEFEQILYLLTRLNMEPNVKTKVGFQDAKSLIELLSTAAQSPYELAMVAML HHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH NGRYLGRTEQKYQEAIGLYNEALTRINDSYDIEALILKHNIHEHLGGLHLLIRQEVPALM CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHH HFHTYRDIAYKLRNDYLIAAAEARLGFYYNFNQQLTKSLQHYNEAIRISNRSNYPAMKTN HHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCCC LQLQLSKVYRDLKQWDEALKNAHEAAAGFKKMGNDTYLSSCMTVIAMVYGEQGDWNKAID HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH YYLNAQQLDAKRGNYIAQGLNFHNLGQAYSNINDNVNALKYLLMANQIFKEKQSHHYQVY HHCCHHHHHCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NELLIGEIAQTNQDWPLMMTHADIALALAIDLKLVNEQKAALTLIASASQKLGELTKTID HHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AQTRIIELGNTLAEKEKDSPVSTSALAEQQLKLELNMVQGKLAETVKESNSTHTLLLISC HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH LIAGLLLLVIAYMLHHRRKTMAKNAALTQLSLQEPFTHNLGYAALLAHLSYNQTQASTTA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHE LGIIAFPAQLTTDLDYGQYFSDAVTAQLATHLTDALAAPVYVIRQGVFAVRFTQAVEPTH EEHEEECHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHH VLSQIRQKLDQQHIVHHFRLGFANLPLLAKSEIKMAAKLKFETVQMALACARSLEGNNDY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCE FVALRALDFVPLSLFANPLFLHLEKGIERGLIRLDTNGNKEDVRWPCWENNQDRQLLENI EEEEEHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MQKLTVILFTLLLSLPFSVQSRDLEADEVELRESPQQMYDVLNKSISFPLAFQNRDQFER CCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHHHH AAQEQGYSPIEFEQILYLLTRLNMEPNVKTKVGFQDAKSLIELLSTAAQSPYELAMVAML HHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH NGRYLGRTEQKYQEAIGLYNEALTRINDSYDIEALILKHNIHEHLGGLHLLIRQEVPALM CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHH HFHTYRDIAYKLRNDYLIAAAEARLGFYYNFNQQLTKSLQHYNEAIRISNRSNYPAMKTN HHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCCC LQLQLSKVYRDLKQWDEALKNAHEAAAGFKKMGNDTYLSSCMTVIAMVYGEQGDWNKAID HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH YYLNAQQLDAKRGNYIAQGLNFHNLGQAYSNINDNVNALKYLLMANQIFKEKQSHHYQVY HHCCHHHHHCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NELLIGEIAQTNQDWPLMMTHADIALALAIDLKLVNEQKAALTLIASASQKLGELTKTID HHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AQTRIIELGNTLAEKEKDSPVSTSALAEQQLKLELNMVQGKLAETVKESNSTHTLLLISC HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH LIAGLLLLVIAYMLHHRRKTMAKNAALTQLSLQEPFTHNLGYAALLAHLSYNQTQASTTA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHE LGIIAFPAQLTTDLDYGQYFSDAVTAQLATHLTDALAAPVYVIRQGVFAVRFTQAVEPTH EEHEEECHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHH VLSQIRQKLDQQHIVHHFRLGFANLPLLAKSEIKMAAKLKFETVQMALACARSLEGNNDY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCE FVALRALDFVPLSLFANPLFLHLEKGIERGLIRLDTNGNKEDVRWPCWENNQDRQLLENI EEEEEHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA