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The map label for this gene is lolC [C]

Identifier: 159897992

GI number: 159897992

Start: 1710323

End: 1712872

Strand: Reverse

Name: lolC [C]

Synonym: Haur_1467

Alternate gene names: 159897992

Gene position: 1712872-1710323 (Counterclockwise)

Preceding gene: 159897993

Following gene: 159897991

Centisome position: 26.99

GC content: 51.53

Gene sequence:

>2550_bases
ATGAAGTTGCTCTATCGCAGTAGTTTGCGCTATTTACTCCGCCACCCCGCCCAGGTTTTGCTGGCAATTTTAGGCGTGGC
CTTGGGCGTGGCGGTGGTGATCGCGATTGATTTAGCCAATGGCAGTGCCCAACGGGCCTTTATGCTCTCCACCGAGAGCG
TCACTGGCAAAACCACCGATCAAATTCTGGCGGGGCAAAATGGCTTGTCCAGCGATTTATACGCTCAGTTGCGCACTGAA
TTAGGCTTATCAGCGGTCGCGCCAGTCGTTGATCGCACAATCAGTCTGCCCAATCAGCCAGGCCGTTCATTTCGTTTATT
TGGCATCGACCCATTTGCCGAACAGCCGTTTCGACCATATTTGGCAACTCTCTTCAATAACCAAACCGATCTGCAAGCGC
TATTGACTGAGCCAAATACTGGCTTGATTTCGGCGCAAACTGCCCAAACTCTTGCTTTGACCGTCGGCCAAACCCTTGAA
ACGCGGATCGACGGCCAGCGCCGCAACATTACGATTATTGGGTTGATCGCTGGAGGCGATCAATTAAGTCAAGAAGCTTT
GGCCGATTTGATTTTAGTTGATATTGCGACCGCGCAGGAGTTAGTTGGTCAACCAGATCGGATTAGTCGCATCGATTTGA
TTTTGCCTGAGGAGCAACGCAGCGCAATCCTTGAGCAAATCAAGCCGTTGTTGCCTGCTGATGCGACCCTGACGACCCCC
GCCGCCCGCAGCGAAACCCTGCAACAGATGACCCGCGCCTTTGAACTCAATTTACAAGCACTCAGTTTATTGGCCTTGAT
CGTCGGGGTTTTCCTGATTTACAACACCATGACTTTTTCGGTGGTGCAGCGGCGTGGTTTGTTTGGCATTTTGCGCTCGT
TGGGCGTGACACGGCGCGAACTATTCAGCCAAATTCTGATCGAGGCCGCCGTGATTGGCACCATCGGGGCAATCCTCGGG
GTGCTATTGGGCATCGTGCTTGGCCGTGGTTTGGTGCGACTGGTCACCCAAACGATCAACGACCTCTATTTCAGCGTCAA
TGTACAAAACATTGCGATTGACAACATCCAATTAATTAAAGGTTTTGGGCTGGGCTTGGGCGCAACCTTGATTGCCGCCA
GCATTCCAGCACTTGAAGCTATGTTCTCACCGCCACGCACGGTGCTACGACGTTCCTCAATCGAAGAACGAATTCAACGG
ATTGTGCCACGCTTGACCTTGGCAGGCTTGGGTTTAGCAGGTTTGGGCGTGGCTTTGCTGCAAATTCCATCGCGCAGCTT
GTTCCTCAGTTTTTCAGCCATGTTTGGGGTGATCATTGGCTGTGCCTTGTTCACGCCATTTGTCACCTTGCAGATGATGC
GATTGTTGCAAATTCCACTCAACCGCATGTTTGGGCTGCTTGGTAAGATGGCCGCTCGTGATGTGGTTGCCGCCTTGAGC
CGCACTGGCGTAGCAATTGCTGCCTTGATGGTGGCGGTTTCGGTCACGGTTGGCGCTGGCACGATGATTGGCTCGTTTCG
CACAACGGTCGTTCGCTGGCTTGATCAATCGTTGCAGGCTGATGTGTTTGTGTCGGCTCCCAGTTTGAGCGCTAATCGTG
CTGACACCGCGATTGATCTACGCTTAGTCGAACAAATCGATCAATTACCCAGTGTTGCCTCGATGACGACCCTGCTGAAC
TTACGGGTCGAAAGTGAGCTTGGGCCAGTTCAATTAGCCGTCGCCAATTATCAAGATTCAAGTTTGAGTCGGCGGGCATT
GAGCTTTATCACCGATGCTGAGCAGGCTTGGCAAGGCTTTGCCGAACAAGGCCAAGTTTGGGTTTCCGAGCCATTTAGCT
ATCGTTATGGGCGAGGGCTTGGCGATAGTATCACCTTACAAACCGAACGCGGCCCACAACAATTTACGATCGCCGGAGTG
TACTACGATTATGCCTCGGATCAAGGCTACATCTCCATGAATCGGCGTGATTTTGCCAAATATTGGGATGTTGATACGGT
GCATTCGATCACGATTTGGCTGGCTGAGAACGCTGATAGTGCCACGACGATCAGTCAAATTCAGGCTTTAGCTGCACCAA
TTCAAGATTTGAAGGTGCAATCGAACCAAGCTTTGCGCCAAAGCACCTTGGAAATTTTCGACCGCACCTTTGCAATCACG
GCAGTTTTGCAGTTATTGGCCACAATTGTTGCCTTTATCGGCATTTTAAGCGCATTAATGGCCTTACAATTAGAACGAAG
CCGCGAACTTGGAGTTTTACGCGCCAATGGCATGACCCCACGCCAATTGTGGTTGAGCGTGCTCAGCCAAACTGGTTTAA
TGGGGCTAACTGCTGGATTATTGGCCTTGCCAGTCGGCTTGATTTTAGCGGTCGTACTAGTCTATGTGATCAATAAACGA
TCATTTGGCTGGACGATGCAGCTGATTCTCGACCCCAACTTATTGCTGCAAGCCTTGATTGTAGCAGTTGTGGCAGCGCT
GTTGGCAGGCTTGTATCCAGCGTGGAAAATGGGGCGTACCTCGCCAGCGTTGGCGTTGCGGGAAGAATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGATGGTCACCCACTCGCTCGAAGTCGCTCGCCGCGCCGATCGGTTGTTGAGCATGGTCGATGGGCAGTTGGTCGAACAT
AGCTTGGCTGAGGTTGAACT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CATTCGGGCACAGGCGTGCTCAAAAGGAGGCCAATGAGCACAGAAAGCATTTTTGTCATCGCCGGAAGTTTGGTGCTAAT
TAGCATTATTGTCAGCACCT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 849; Mature: 849

Protein sequence:

>849_residues
MKLLYRSSLRYLLRHPAQVLLAILGVALGVAVVIAIDLANGSAQRAFMLSTESVTGKTTDQILAGQNGLSSDLYAQLRTE
LGLSAVAPVVDRTISLPNQPGRSFRLFGIDPFAEQPFRPYLATLFNNQTDLQALLTEPNTGLISAQTAQTLALTVGQTLE
TRIDGQRRNITIIGLIAGGDQLSQEALADLILVDIATAQELVGQPDRISRIDLILPEEQRSAILEQIKPLLPADATLTTP
AARSETLQQMTRAFELNLQALSLLALIVGVFLIYNTMTFSVVQRRGLFGILRSLGVTRRELFSQILIEAAVIGTIGAILG
VLLGIVLGRGLVRLVTQTINDLYFSVNVQNIAIDNIQLIKGFGLGLGATLIAASIPALEAMFSPPRTVLRRSSIEERIQR
IVPRLTLAGLGLAGLGVALLQIPSRSLFLSFSAMFGVIIGCALFTPFVTLQMMRLLQIPLNRMFGLLGKMAARDVVAALS
RTGVAIAALMVAVSVTVGAGTMIGSFRTTVVRWLDQSLQADVFVSAPSLSANRADTAIDLRLVEQIDQLPSVASMTTLLN
LRVESELGPVQLAVANYQDSSLSRRALSFITDAEQAWQGFAEQGQVWVSEPFSYRYGRGLGDSITLQTERGPQQFTIAGV
YYDYASDQGYISMNRRDFAKYWDVDTVHSITIWLAENADSATTISQIQALAAPIQDLKVQSNQALRQSTLEIFDRTFAIT
AVLQLLATIVAFIGILSALMALQLERSRELGVLRANGMTPRQLWLSVLSQTGLMGLTAGLLALPVGLILAVVLVYVINKR
SFGWTMQLILDPNLLLQALIVAVVAALLAGLYPAWKMGRTSPALALREE

Sequences:

>Translated_849_residues
MKLLYRSSLRYLLRHPAQVLLAILGVALGVAVVIAIDLANGSAQRAFMLSTESVTGKTTDQILAGQNGLSSDLYAQLRTE
LGLSAVAPVVDRTISLPNQPGRSFRLFGIDPFAEQPFRPYLATLFNNQTDLQALLTEPNTGLISAQTAQTLALTVGQTLE
TRIDGQRRNITIIGLIAGGDQLSQEALADLILVDIATAQELVGQPDRISRIDLILPEEQRSAILEQIKPLLPADATLTTP
AARSETLQQMTRAFELNLQALSLLALIVGVFLIYNTMTFSVVQRRGLFGILRSLGVTRRELFSQILIEAAVIGTIGAILG
VLLGIVLGRGLVRLVTQTINDLYFSVNVQNIAIDNIQLIKGFGLGLGATLIAASIPALEAMFSPPRTVLRRSSIEERIQR
IVPRLTLAGLGLAGLGVALLQIPSRSLFLSFSAMFGVIIGCALFTPFVTLQMMRLLQIPLNRMFGLLGKMAARDVVAALS
RTGVAIAALMVAVSVTVGAGTMIGSFRTTVVRWLDQSLQADVFVSAPSLSANRADTAIDLRLVEQIDQLPSVASMTTLLN
LRVESELGPVQLAVANYQDSSLSRRALSFITDAEQAWQGFAEQGQVWVSEPFSYRYGRGLGDSITLQTERGPQQFTIAGV
YYDYASDQGYISMNRRDFAKYWDVDTVHSITIWLAENADSATTISQIQALAAPIQDLKVQSNQALRQSTLEIFDRTFAIT
AVLQLLATIVAFIGILSALMALQLERSRELGVLRANGMTPRQLWLSVLSQTGLMGLTAGLLALPVGLILAVVLVYVINKR
SFGWTMQLILDPNLLLQALIVAVVAALLAGLYPAWKMGRTSPALALREE
>Mature_849_residues
MKLLYRSSLRYLLRHPAQVLLAILGVALGVAVVIAIDLANGSAQRAFMLSTESVTGKTTDQILAGQNGLSSDLYAQLRTE
LGLSAVAPVVDRTISLPNQPGRSFRLFGIDPFAEQPFRPYLATLFNNQTDLQALLTEPNTGLISAQTAQTLALTVGQTLE
TRIDGQRRNITIIGLIAGGDQLSQEALADLILVDIATAQELVGQPDRISRIDLILPEEQRSAILEQIKPLLPADATLTTP
AARSETLQQMTRAFELNLQALSLLALIVGVFLIYNTMTFSVVQRRGLFGILRSLGVTRRELFSQILIEAAVIGTIGAILG
VLLGIVLGRGLVRLVTQTINDLYFSVNVQNIAIDNIQLIKGFGLGLGATLIAASIPALEAMFSPPRTVLRRSSIEERIQR
IVPRLTLAGLGLAGLGVALLQIPSRSLFLSFSAMFGVIIGCALFTPFVTLQMMRLLQIPLNRMFGLLGKMAARDVVAALS
RTGVAIAALMVAVSVTVGAGTMIGSFRTTVVRWLDQSLQADVFVSAPSLSANRADTAIDLRLVEQIDQLPSVASMTTLLN
LRVESELGPVQLAVANYQDSSLSRRALSFITDAEQAWQGFAEQGQVWVSEPFSYRYGRGLGDSITLQTERGPQQFTIAGV
YYDYASDQGYISMNRRDFAKYWDVDTVHSITIWLAENADSATTISQIQALAAPIQDLKVQSNQALRQSTLEIFDRTFAIT
AVLQLLATIVAFIGILSALMALQLERSRELGVLRANGMTPRQLWLSVLSQTGLMGLTAGLLALPVGLILAVVLVYVINKR
SFGWTMQLILDPNLLLQALIVAVVAALLAGLYPAWKMGRTSPALALREE

Specific function: Part Of An ATP-Dependent Transport System Lolcde Responsible For The Release Of Lipoproteins Targeted To The Outer Membrane From The Inner Membrane. Such A Release Is Dependent Of The Sorting-Signal (Absence Of An Asp At Position 2 Of The Mature Lipoprot

COG id: COG0577

COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Integral Membrane Protein. Inner Membrane [C]

Metaboloic importance: Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 91903; Mature: 91903

Theoretical pI: Translated: 8.76; Mature: 8.76

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKLLYRSSLRYLLRHPAQVLLAILGVALGVAVVIAIDLANGSAQRAFMLSTESVTGKTTD
CCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCEEEEEEECCCCCCCHH
QILAGQNGLSSDLYAQLRTELGLSAVAPVVDRTISLPNQPGRSFRLFGIDPFAEQPFRPY
HHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCHHCCCCCHHH
LATLFNNQTDLQALLTEPNTGLISAQTAQTLALTVGQTLETRIDGQRRNITIIGLIAGGD
HHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEECCC
QLSQEALADLILVDIATAQELVGQPDRISRIDLILPEEQRSAILEQIKPLLPADATLTTP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
AARSETLQQMTRAFELNLQALSLLALIVGVFLIYNTMTFSVVQRRGLFGILRSLGVTRRE
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
LFSQILIEAAVIGTIGAILGVLLGIVLGRGLVRLVTQTINDLYFSVNVQNIAIDNIQLIK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEECCCCEEH
GFGLGLGATLIAASIPALEAMFSPPRTVLRRSSIEERIQRIVPRLTLAGLGLAGLGVALL
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH
QIPSRSLFLSFSAMFGVIIGCALFTPFVTLQMMRLLQIPLNRMFGLLGKMAARDVVAALS
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RTGVAIAALMVAVSVTVGAGTMIGSFRTTVVRWLDQSLQADVFVSAPSLSANRADTAIDL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHH
RLVEQIDQLPSVASMTTLLNLRVESELGPVQLAVANYQDSSLSRRALSFITDAEQAWQGF
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHEEECCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AEQGQVWVSEPFSYRYGRGLGDSITLQTERGPQQFTIAGVYYDYASDQGYISMNRRDFAK
HHCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCEEEEEEEEEEECCCCCEEEECHHHHHH
YWDVDTVHSITIWLAENADSATTISQIQALAAPIQDLKVQSNQALRQSTLEIFDRTFAIT
HCCCCCEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AVLQLLATIVAFIGILSALMALQLERSRELGVLRANGMTPRQLWLSVLSQTGLMGLTAGL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
LALPVGLILAVVLVYVINKRSFGWTMQLILDPNLLLQALIVAVVAALLAGLYPAWKMGRT
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCC
SPALALREE
CCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKLLYRSSLRYLLRHPAQVLLAILGVALGVAVVIAIDLANGSAQRAFMLSTESVTGKTTD
CCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCEEEEEEECCCCCCCHH
QILAGQNGLSSDLYAQLRTELGLSAVAPVVDRTISLPNQPGRSFRLFGIDPFAEQPFRPY
HHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCHHCCCCCHHH
LATLFNNQTDLQALLTEPNTGLISAQTAQTLALTVGQTLETRIDGQRRNITIIGLIAGGD
HHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEECCC
QLSQEALADLILVDIATAQELVGQPDRISRIDLILPEEQRSAILEQIKPLLPADATLTTP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
AARSETLQQMTRAFELNLQALSLLALIVGVFLIYNTMTFSVVQRRGLFGILRSLGVTRRE
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
LFSQILIEAAVIGTIGAILGVLLGIVLGRGLVRLVTQTINDLYFSVNVQNIAIDNIQLIK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEECCCCEEH
GFGLGLGATLIAASIPALEAMFSPPRTVLRRSSIEERIQRIVPRLTLAGLGLAGLGVALL
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH
QIPSRSLFLSFSAMFGVIIGCALFTPFVTLQMMRLLQIPLNRMFGLLGKMAARDVVAALS
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RTGVAIAALMVAVSVTVGAGTMIGSFRTTVVRWLDQSLQADVFVSAPSLSANRADTAIDL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHH
RLVEQIDQLPSVASMTTLLNLRVESELGPVQLAVANYQDSSLSRRALSFITDAEQAWQGF
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHEEECCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AEQGQVWVSEPFSYRYGRGLGDSITLQTERGPQQFTIAGVYYDYASDQGYISMNRRDFAK
HHCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCEEEEEEEEEEECCCCCEEEECHHHHHH
YWDVDTVHSITIWLAENADSATTISQIQALAAPIQDLKVQSNQALRQSTLEIFDRTFAIT
HCCCCCEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AVLQLLATIVAFIGILSALMALQLERSRELGVLRANGMTPRQLWLSVLSQTGLMGLTAGL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
LALPVGLILAVVLVYVINKRSFGWTMQLILDPNLLLQALIVAVVAALLAGLYPAWKMGRT
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCC
SPALALREE
CCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA