Definition | Shewanella pealeana ATCC 700345 chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_009901 |
Length | 5,174,581 |
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The map label for this gene is 157961093
Identifier: 157961093
GI number: 157961093
Start: 1535209
End: 1538001
Strand: Direct
Name: 157961093
Synonym: Spea_1265
Alternate gene names: NA
Gene position: 1535209-1538001 (Clockwise)
Preceding gene: 157961092
Following gene: 157961094
Centisome position: 29.67
GC content: 41.1
Gene sequence:
>2793_bases ATGTTAAATTATGGCTTTCAACGCCTAGCATTAATTGGCAGTGCAGGGTACCAAAGGGCTGAGTTACCTCTGGATGACTC TGTTTCCTTAATTGCGCCCAATAATCACGGCAAAACAAGTTTGATCAATGCCCTCCAGTTTTTGCTCATAATTGATAAAA GAAGGATGGATTTTGGGTCTCATACACTTGAAAAAGCACGCCGCTTCTATTTTCCAAACAATAGCGCTTATATCCTGCTT GAAGTCATTTTGCCACAAAGCGGTACTGTCGTCTTCGGTTGTGTCGGCAAAGGTGTTGGTTATGACTATGAATTCTTTGC CTACAAAGGTGAATTGAATCTGGATGACTACCGTCTGGCTGATGGCAACATTGTTACCCAACCAAAGCTAGTTAATCACC TAGCTAGTAAGGGGTATATGGCCTATCGTTACAATGATAATGATTTTAGCCATTTGATATACGGTGGCGTGAAAAGTAAA AAAACAAGCGATACTGACTTCACAGTATTTAAGCTCGAACATGCCAGCGATGCGCGCTCATTTCAACAAGTGCTCACTAA GACACTAAGGCTTGATAAGCTTAACTCCAGTGACGTTAAAGACTACTTACTGAAAATTTTTCGTCGAGAACTACCCAACG CCAGCATCGACTTTAAGCAAGAGTGGGAAAAAGCATTTCAGGACATAAATCTAGAACGAGAACAGTATTTTGCTGCACTG AATAATCTACCTATTATTCAGGAGTTAGAGCAGAAGTTTGAGCGTGCTCTTATGCTAAGAGGAAAGGTTGTTGCATACCA GCCTAAAGTTAATGAGTTTCTGCAAGACTGGCATGGTCACGTTAAATCCAGAACAGATAACTATAATCAGCAAAAAGAAC AAGTAGCTCAGCAGCAAGTTAATCTGCAAAAGCAGGATAGGGAAAATGTTGAAAAACGAAGTATCCTCAACAGCAAAATT AGCGATATCCTTAAAGCTGATAAACAGCATGAAGAGTTAGATGCTCATTTCGCCTTGGTTCTAGATAGGTCATACCTAGA TGAGCAGTTGAAGTTCGCAAAACGAGAATACGAAGCTCAAGCTACATTGTGTGTACGATCACAGCGCTCTTCCTCAAAGG TGCTTAGTAAACAGCGGCAAGAGCGCGAGACGGAACTTATGAGAGTGGAGTCTCAAATTAAAACGCTGGGAGATAACCTA TATCTTCACCTTTCTAATCAGCTAGATGCACAAGAGCTTGATAAGCTTAATAAAGTACTAAATTCACAAGTAATGCAGCT TTCAGCTAGTAAATACTCTTTAGATATCAACACGCTTCGTCAGTTATTAAAGAGCGAGGAAACTGAGCAATTCTCACTAC TTGGTTTAACTGTATCTCTTGATGAGTTAATTCCTCAGCACATTCAAAAAACAGAACAAGAGCTGTTGGAGGAAAGGCAA AGCCTGACTGAGCAAATAGCTGACCTAAAAGGTTTAGTGGAAGCGAGTAAACAAGGAGAGTTAGCCGAAAAGAAAAAGGA CCAATTAGAAAGGGCAGTAAAGAAGTGTGAACAGGACCTTACTGATTACCAACAGCTTCAGAAGCTGAGAGATAAACAGG CAGAACGCTCTGAACAAAAAGAAGTATTTGAGCAAGATTTAAAAGCCATCAATACTGAACTGTCTAATGCGGAGCAAAAG CACAAAGAATTAACTGATCAAATCAATGAGATTGCAGGTAAGCTCACTAAGTTAATAGCGGCTAATGAAAGTGTCGATAA TCTGAAAAAACAGAGAATTGATGACCTGGCGATGTTTTCTGCACTATCAGAACAACCTCACACACCTTGGTTAATGACTG AGGAATGGTCCTTGGATCTCTTACCAATCAAGCTTGATTATTTTAATGCTGATTGTAGAGAATTAGAGAAGGTAGCTAAA GATCTGCGTCAGATGAAAAATGAGTTAGTACAAAAAGGGCTAACCAAGTTTCAAATAGCTCAAACTCAGGATGAAGAGCT AAAAGGTATAATTCAGTTTAGTCATTGTTTGGAAGATGAGAAGAAAGCTCTAGAAAGGCGCGCTCGATCTGCAGTGGTTA ACGTGACAGCGAGTTTAAGAGAACTCCGTAGTGGTCTCTTGGCACTGCAAAGCAAAATGAAAGAGTTCAATCGATTAATA AGCCACAGGCAGTTGTCAGACTTAAAAACTTTCAAAATTGAGCCTGTCGAGGAAGGTCAGCTTGTTGATGCAATGAACGT GTTGATACAGCAAGCCGAACAGACTGAAAGTGGACAGAGCTTCGAGTTATTTGATCAAGCCAGTATTTTGGATGATGCTG ATTTAGACAGAGCAAAGAGTCTGCTTATAGAAGAAGGCAATGCTCGCCAAGGGTTAAGGGTTGCAGACCTGTTTAGACTT GAGTTTGTTGTGGCTAAGCAGGGCCAACAACAAGAGTCGTTTGAGGATATTGATAGCGCCGCTTCTAACGGTACAGTCTT GATGGCTAAGCTTGTAACTGGCCTTGCTATGTTGCACTTAATGCAAGATAAACGTCATCAGATGAAAGCAGTATGCTATC TAGATGAGGCGCTGGCACTAGACACCAGAAACCAAGCTAACTTGATAGAAATTGCTGACCAGTTTGGTTTTGCTTTGATT TTTGCCTCGCCGGCCCCGTTAACAACTGCGAGGTATTGTGTGCCGATCCATCAAGCGAACGGTAAGAATCACATCAGCCG TAATAGCTGGCAGATTTTCGAGGCTATAGAGAACTCGAAAATTGAGCAGTTGCTAGCGGAGTCAATATTATGA
Upstream 100 bases:
>100_bases GGCGTTTATTACCTTCTGTTTATCGATACCTAGATCATTTTGAAGCCATTACTGAACAAGCATCAAACAGTGGTGTAGCA ACTTATGAGGGAGATGAATC
Downstream 100 bases:
>100_bases GCCAGGCATTAGCTAAAGCACTAATGCGATTGCGGGACGCACACCCTGAATCAGTAGCGGCAAGTACGATGACGCAACCT CAAAGAAAGCAATTGGAAGA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 930; Mature: 930
Protein sequence:
>930_residues MLNYGFQRLALIGSAGYQRAELPLDDSVSLIAPNNHGKTSLINALQFLLIIDKRRMDFGSHTLEKARRFYFPNNSAYILL EVILPQSGTVVFGCVGKGVGYDYEFFAYKGELNLDDYRLADGNIVTQPKLVNHLASKGYMAYRYNDNDFSHLIYGGVKSK KTSDTDFTVFKLEHASDARSFQQVLTKTLRLDKLNSSDVKDYLLKIFRRELPNASIDFKQEWEKAFQDINLEREQYFAAL NNLPIIQELEQKFERALMLRGKVVAYQPKVNEFLQDWHGHVKSRTDNYNQQKEQVAQQQVNLQKQDRENVEKRSILNSKI SDILKADKQHEELDAHFALVLDRSYLDEQLKFAKREYEAQATLCVRSQRSSSKVLSKQRQERETELMRVESQIKTLGDNL YLHLSNQLDAQELDKLNKVLNSQVMQLSASKYSLDINTLRQLLKSEETEQFSLLGLTVSLDELIPQHIQKTEQELLEERQ SLTEQIADLKGLVEASKQGELAEKKKDQLERAVKKCEQDLTDYQQLQKLRDKQAERSEQKEVFEQDLKAINTELSNAEQK HKELTDQINEIAGKLTKLIAANESVDNLKKQRIDDLAMFSALSEQPHTPWLMTEEWSLDLLPIKLDYFNADCRELEKVAK DLRQMKNELVQKGLTKFQIAQTQDEELKGIIQFSHCLEDEKKALERRARSAVVNVTASLRELRSGLLALQSKMKEFNRLI SHRQLSDLKTFKIEPVEEGQLVDAMNVLIQQAEQTESGQSFELFDQASILDDADLDRAKSLLIEEGNARQGLRVADLFRL EFVVAKQGQQQESFEDIDSAASNGTVLMAKLVTGLAMLHLMQDKRHQMKAVCYLDEALALDTRNQANLIEIADQFGFALI FASPAPLTTARYCVPIHQANGKNHISRNSWQIFEAIENSKIEQLLAESIL
Sequences:
>Translated_930_residues MLNYGFQRLALIGSAGYQRAELPLDDSVSLIAPNNHGKTSLINALQFLLIIDKRRMDFGSHTLEKARRFYFPNNSAYILL EVILPQSGTVVFGCVGKGVGYDYEFFAYKGELNLDDYRLADGNIVTQPKLVNHLASKGYMAYRYNDNDFSHLIYGGVKSK KTSDTDFTVFKLEHASDARSFQQVLTKTLRLDKLNSSDVKDYLLKIFRRELPNASIDFKQEWEKAFQDINLEREQYFAAL NNLPIIQELEQKFERALMLRGKVVAYQPKVNEFLQDWHGHVKSRTDNYNQQKEQVAQQQVNLQKQDRENVEKRSILNSKI SDILKADKQHEELDAHFALVLDRSYLDEQLKFAKREYEAQATLCVRSQRSSSKVLSKQRQERETELMRVESQIKTLGDNL YLHLSNQLDAQELDKLNKVLNSQVMQLSASKYSLDINTLRQLLKSEETEQFSLLGLTVSLDELIPQHIQKTEQELLEERQ SLTEQIADLKGLVEASKQGELAEKKKDQLERAVKKCEQDLTDYQQLQKLRDKQAERSEQKEVFEQDLKAINTELSNAEQK HKELTDQINEIAGKLTKLIAANESVDNLKKQRIDDLAMFSALSEQPHTPWLMTEEWSLDLLPIKLDYFNADCRELEKVAK DLRQMKNELVQKGLTKFQIAQTQDEELKGIIQFSHCLEDEKKALERRARSAVVNVTASLRELRSGLLALQSKMKEFNRLI SHRQLSDLKTFKIEPVEEGQLVDAMNVLIQQAEQTESGQSFELFDQASILDDADLDRAKSLLIEEGNARQGLRVADLFRL EFVVAKQGQQQESFEDIDSAASNGTVLMAKLVTGLAMLHLMQDKRHQMKAVCYLDEALALDTRNQANLIEIADQFGFALI FASPAPLTTARYCVPIHQANGKNHISRNSWQIFEAIENSKIEQLLAESIL >Mature_930_residues MLNYGFQRLALIGSAGYQRAELPLDDSVSLIAPNNHGKTSLINALQFLLIIDKRRMDFGSHTLEKARRFYFPNNSAYILL EVILPQSGTVVFGCVGKGVGYDYEFFAYKGELNLDDYRLADGNIVTQPKLVNHLASKGYMAYRYNDNDFSHLIYGGVKSK KTSDTDFTVFKLEHASDARSFQQVLTKTLRLDKLNSSDVKDYLLKIFRRELPNASIDFKQEWEKAFQDINLEREQYFAAL NNLPIIQELEQKFERALMLRGKVVAYQPKVNEFLQDWHGHVKSRTDNYNQQKEQVAQQQVNLQKQDRENVEKRSILNSKI SDILKADKQHEELDAHFALVLDRSYLDEQLKFAKREYEAQATLCVRSQRSSSKVLSKQRQERETELMRVESQIKTLGDNL YLHLSNQLDAQELDKLNKVLNSQVMQLSASKYSLDINTLRQLLKSEETEQFSLLGLTVSLDELIPQHIQKTEQELLEERQ SLTEQIADLKGLVEASKQGELAEKKKDQLERAVKKCEQDLTDYQQLQKLRDKQAERSEQKEVFEQDLKAINTELSNAEQK HKELTDQINEIAGKLTKLIAANESVDNLKKQRIDDLAMFSALSEQPHTPWLMTEEWSLDLLPIKLDYFNADCRELEKVAK DLRQMKNELVQKGLTKFQIAQTQDEELKGIIQFSHCLEDEKKALERRARSAVVNVTASLRELRSGLLALQSKMKEFNRLI SHRQLSDLKTFKIEPVEEGQLVDAMNVLIQQAEQTESGQSFELFDQASILDDADLDRAKSLLIEEGNARQGLRVADLFRL EFVVAKQGQQQESFEDIDSAASNGTVLMAKLVTGLAMLHLMQDKRHQMKAVCYLDEALALDTRNQANLIEIADQFGFALI FASPAPLTTARYCVPIHQANGKNHISRNSWQIFEAIENSKIEQLLAESIL
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 106697; Mature: 106697
Theoretical pI: Translated: 5.64; Mature: 5.64
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 1.6 %Met (Translated Protein) 2.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 1.6 %Met (Mature Protein) 2.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLNYGFQRLALIGSAGYQRAELPLDDSVSLIAPNNHGKTSLINALQFLLIIDKRRMDFGS CCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH HTLEKARRFYFPNNSAYILLEVILPQSGTVVFGCVGKGVGYDYEFFAYKGELNLDDYRLA HHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEECCCCCEEEEECCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEC DGNIVTQPKLVNHLASKGYMAYRYNDNDFSHLIYGGVKSKKTSDTDFTVFKLEHASDARS CCCEECCCHHHHHHHHCCEEEEEECCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECHHHHHH FQQVLTKTLRLDKLNSSDVKDYLLKIFRRELPNASIDFKQEWEKAFQDINLEREQYFAAL HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH NNLPIIQELEQKFERALMLRGKVVAYQPKVNEFLQDWHGHVKSRTDNYNQQKEQVAQQQV CCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH NLQKQDRENVEKRSILNSKISDILKADKQHEELDAHFALVLDRSYLDEQLKFAKREYEAQ CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ATLCVRSQRSSSKVLSKQRQERETELMRVESQIKTLGDNLYLHLSNQLDAQELDKLNKVL HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHH NSQVMQLSASKYSLDINTLRQLLKSEETEQFSLLGLTVSLDELIPQHIQKTEQELLEERQ HHHHHHHHHHHHEECHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SLTEQIADLKGLVEASKQGELAEKKKDQLERAVKKCEQDLTDYQQLQKLRDKQAERSEQK HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EVFEQDLKAINTELSNAEQKHKELTDQINEIAGKLTKLIAANESVDNLKKQRIDDLAMFS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH ALSEQPHTPWLMTEEWSLDLLPIKLDYFNADCRELEKVAKDLRQMKNELVQKGLTKFQIA HHHCCCCCCEEEECCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEC QTQDEELKGIIQFSHCLEDEKKALERRARSAVVNVTASLRELRSGLLALQSKMKEFNRLI CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SHRQLSDLKTFKIEPVEEGQLVDAMNVLIQQAEQTESGQSFELFDQASILDDADLDRAKS HHHHHHHCHHEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHCCCCCHHHHHH LLIEEGNARQGLRVADLFRLEFVVAKQGQQQESFEDIDSAASNGTVLMAKLVTGLAMLHL HHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH MQDKRHQMKAVCYLDEALALDTRNQANLIEIADQFGFALIFASPAPLTTARYCVPIHQAN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCC GKNHISRNSWQIFEAIENSKIEQLLAESIL CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MLNYGFQRLALIGSAGYQRAELPLDDSVSLIAPNNHGKTSLINALQFLLIIDKRRMDFGS CCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH HTLEKARRFYFPNNSAYILLEVILPQSGTVVFGCVGKGVGYDYEFFAYKGELNLDDYRLA HHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEECCCCCEEEEECCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEC DGNIVTQPKLVNHLASKGYMAYRYNDNDFSHLIYGGVKSKKTSDTDFTVFKLEHASDARS CCCEECCCHHHHHHHHCCEEEEEECCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECHHHHHH FQQVLTKTLRLDKLNSSDVKDYLLKIFRRELPNASIDFKQEWEKAFQDINLEREQYFAAL HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH NNLPIIQELEQKFERALMLRGKVVAYQPKVNEFLQDWHGHVKSRTDNYNQQKEQVAQQQV CCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH NLQKQDRENVEKRSILNSKISDILKADKQHEELDAHFALVLDRSYLDEQLKFAKREYEAQ CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ATLCVRSQRSSSKVLSKQRQERETELMRVESQIKTLGDNLYLHLSNQLDAQELDKLNKVL HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHH NSQVMQLSASKYSLDINTLRQLLKSEETEQFSLLGLTVSLDELIPQHIQKTEQELLEERQ HHHHHHHHHHHHEECHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SLTEQIADLKGLVEASKQGELAEKKKDQLERAVKKCEQDLTDYQQLQKLRDKQAERSEQK HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EVFEQDLKAINTELSNAEQKHKELTDQINEIAGKLTKLIAANESVDNLKKQRIDDLAMFS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH ALSEQPHTPWLMTEEWSLDLLPIKLDYFNADCRELEKVAKDLRQMKNELVQKGLTKFQIA HHHCCCCCCEEEECCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEC QTQDEELKGIIQFSHCLEDEKKALERRARSAVVNVTASLRELRSGLLALQSKMKEFNRLI CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SHRQLSDLKTFKIEPVEEGQLVDAMNVLIQQAEQTESGQSFELFDQASILDDADLDRAKS HHHHHHHCHHEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHCCCCCHHHHHH LLIEEGNARQGLRVADLFRLEFVVAKQGQQQESFEDIDSAASNGTVLMAKLVTGLAMLHL HHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH MQDKRHQMKAVCYLDEALALDTRNQANLIEIADQFGFALIFASPAPLTTARYCVPIHQAN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCC GKNHISRNSWQIFEAIENSKIEQLLAESIL CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA