| Definition | Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009707 |
| Length | 1,845,106 |
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The map label for this gene is 153952509
Identifier: 153952509
GI number: 153952509
Start: 998546
End: 1000207
Strand: Direct
Name: 153952509
Synonym: JJD26997_1143
Alternate gene names: NA
Gene position: 998546-1000207 (Clockwise)
Preceding gene: 153951218
Following gene: 153951389
Centisome position: 54.12
GC content: 28.46
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases TCGCTTATTTAGAGGATAAAAAATGGCTTTTAGCTATGGATGATTTGCTTTTCTTTTGTGAAAAGAGGATTAAAGACAGT GATTATTACGAGGGTTAAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases AGAATGGCGATTTTAGAACGAGTTGCAAATGATTTAAATTTGGCATCACAAAGCTTGCAAGAGTTAAGAGAAAAATATGA TGGTGCTTTGGATTTACTGG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 553; Mature: 552
Protein sequence:
>553_residues MGTSLNELKTGREKLQIINQVLARISNVATALDNTRIEEIVGLKEQVNNFHTQILELKNSVIENSELTQSNADFVKSKKN EIERISNEINDTLNNIENIYNNMIESQRNINNGVNMVKEKYPELKEFNKNFEIIKIKLKEYDDIATHFNAGLEKIEENKN LTRSYLDLSIGLKEQILQELEHAQSIKDDLHSNIELVNNLVSNIRATKNEIVSISNDFKNVKSEIQDTVNDAETTIKLKI NTILFENQRLNQNMIDLLKRCTRLENQIVEKYEDILQVEDLINSSQSMINDLRQAVEQSEQISEDMRSFTAIIKDFKTEI ANLKADLESYNERLKGQLDLKATQINSSIDAKVSSIETLKNQIEAYVETHNNTIDTALANFIERSSIANEDLGRLVEVAR TELANDKTAIESYLLELKQSIINAMKKVSSDITDETSGILAQKNQIELIIAQGRSALDTLNNELNSNHQNKLNEFNLNAN EKLASIHSLREESIANIQSKTDENIGRLETLSEEKLAKFDEIIRDNLGVIYSRIFSIENVFLDKKIIKLSYKE
Sequences:
>Translated_553_residues MGTSLNELKTGREKLQIINQVLARISNVATALDNTRIEEIVGLKEQVNNFHTQILELKNSVIENSELTQSNADFVKSKKN EIERISNEINDTLNNIENIYNNMIESQRNINNGVNMVKEKYPELKEFNKNFEIIKIKLKEYDDIATHFNAGLEKIEENKN LTRSYLDLSIGLKEQILQELEHAQSIKDDLHSNIELVNNLVSNIRATKNEIVSISNDFKNVKSEIQDTVNDAETTIKLKI NTILFENQRLNQNMIDLLKRCTRLENQIVEKYEDILQVEDLINSSQSMINDLRQAVEQSEQISEDMRSFTAIIKDFKTEI ANLKADLESYNERLKGQLDLKATQINSSIDAKVSSIETLKNQIEAYVETHNNTIDTALANFIERSSIANEDLGRLVEVAR TELANDKTAIESYLLELKQSIINAMKKVSSDITDETSGILAQKNQIELIIAQGRSALDTLNNELNSNHQNKLNEFNLNAN EKLASIHSLREESIANIQSKTDENIGRLETLSEEKLAKFDEIIRDNLGVIYSRIFSIENVFLDKKIIKLSYKE >Mature_552_residues GTSLNELKTGREKLQIINQVLARISNVATALDNTRIEEIVGLKEQVNNFHTQILELKNSVIENSELTQSNADFVKSKKNE IERISNEINDTLNNIENIYNNMIESQRNINNGVNMVKEKYPELKEFNKNFEIIKIKLKEYDDIATHFNAGLEKIEENKNL TRSYLDLSIGLKEQILQELEHAQSIKDDLHSNIELVNNLVSNIRATKNEIVSISNDFKNVKSEIQDTVNDAETTIKLKIN TILFENQRLNQNMIDLLKRCTRLENQIVEKYEDILQVEDLINSSQSMINDLRQAVEQSEQISEDMRSFTAIIKDFKTEIA NLKADLESYNERLKGQLDLKATQINSSIDAKVSSIETLKNQIEAYVETHNNTIDTALANFIERSSIANEDLGRLVEVART ELANDKTAIESYLLELKQSIINAMKKVSSDITDETSGILAQKNQIELIIAQGRSALDTLNNELNSNHQNKLNEFNLNANE KLASIHSLREESIANIQSKTDENIGRLETLSEEKLAKFDEIIRDNLGVIYSRIFSIENVFLDKKIIKLSYKE
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 63192; Mature: 63061
Theoretical pI: Translated: 4.65; Mature: 4.65
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 1.3 %Met (Translated Protein) 1.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 1.1 %Met (Mature Protein) 1.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MGTSLNELKTGREKLQIINQVLARISNVATALDNTRIEEIVGLKEQVNNFHTQILELKNS CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VIENSELTQSNADFVKSKKNEIERISNEINDTLNNIENIYNNMIESQRNINNGVNMVKEK HHCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YPELKEFNKNFEIIKIKLKEYDDIATHFNAGLEKIEENKNLTRSYLDLSIGLKEQILQEL CCCHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH EHAQSIKDDLHSNIELVNNLVSNIRATKNEIVSISNDFKNVKSEIQDTVNDAETTIKLKI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEEEEE NTILFENQRLNQNMIDLLKRCTRLENQIVEKYEDILQVEDLINSSQSMINDLRQAVEQSE EEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH QISEDMRSFTAIIKDFKTEIANLKADLESYNERLKGQLDLKATQINSSIDAKVSSIETLK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH NQIEAYVETHNNTIDTALANFIERSSIANEDLGRLVEVARTELANDKTAIESYLLELKQS HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH IINAMKKVSSDITDETSGILAQKNQIELIIAQGRSALDTLNNELNSNHQNKLNEFNLNAN HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCH EKLASIHSLREESIANIQSKTDENIGRLETLSEEKLAKFDEIIRDNLGVIYSRIFSIENV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FLDKKIIKLSYKE HHHHHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure GTSLNELKTGREKLQIINQVLARISNVATALDNTRIEEIVGLKEQVNNFHTQILELKNS CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VIENSELTQSNADFVKSKKNEIERISNEINDTLNNIENIYNNMIESQRNINNGVNMVKEK HHCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YPELKEFNKNFEIIKIKLKEYDDIATHFNAGLEKIEENKNLTRSYLDLSIGLKEQILQEL CCCHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH EHAQSIKDDLHSNIELVNNLVSNIRATKNEIVSISNDFKNVKSEIQDTVNDAETTIKLKI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEEEEE NTILFENQRLNQNMIDLLKRCTRLENQIVEKYEDILQVEDLINSSQSMINDLRQAVEQSE EEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH QISEDMRSFTAIIKDFKTEIANLKADLESYNERLKGQLDLKATQINSSIDAKVSSIETLK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH NQIEAYVETHNNTIDTALANFIERSSIANEDLGRLVEVARTELANDKTAIESYLLELKQS HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH IINAMKKVSSDITDETSGILAQKNQIELIIAQGRSALDTLNNELNSNHQNKLNEFNLNAN HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCH EKLASIHSLREESIANIQSKTDENIGRLETLSEEKLAKFDEIIRDNLGVIYSRIFSIENV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FLDKKIIKLSYKE HHHHHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA