Definition | Bacteroides vulgatus ATCC 8482 chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_009614 |
Length | 5,163,189 |
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The map label for this gene is 150006119
Identifier: 150006119
GI number: 150006119
Start: 4496748
End: 4498235
Strand: Direct
Name: 150006119
Synonym: BVU_3630
Alternate gene names: NA
Gene position: 4496748-4498235 (Clockwise)
Preceding gene: 150006118
Following gene: 150006120
Centisome position: 87.09
GC content: 41.33
Gene sequence:
>1488_bases ATGCTTCTATCTATTATAAGACAGAATCAAAAACTTGCGGCCAAGCGGAATCCTGCATTTGACAGGAACCGCTTCGCCAA GTTTTTAATTTACTTTATGGTCGCTTTTTGGGCAGCATACCTCATCTTTATCGGGGTCATGCTGTCCTTTGCTTTTGAAG ATATCTTTCCCAGCATGGAACCTTACCATATTATGAACCAAGGATTGATTTATCTTCTGATACTTGATTTCCTGTTACGC TTCATGCTCCAACCGGCCATGTCGCAAGAGATCAAGCCCTATCTGCTTATGCCGGTAAAAAAGAATAAGCTGGTGGATAC CCTGTTACTACAATCCGGAATCAGCAGTTACAATTTCTTCTGGTTTTTCCTGATCATACCTTTTGCTCTGCTTACGATTA TCCGTTTCTACGGACTCACGGGCATCCTATGCTATCTGTGCGGCATTTGGCTTCTGATGGTTATGAACAGTTATTGGTAT TTGATATGCAAAACTTTACTGAATGAGAAACTGCTTTATATACTTCTCCCGATCGGAGTATACGGATTATTAGCGGGAAC TGAATTTATTCCCGAAGGAAACCCGGTTTCCACGTTCATGATGAATTTGGGAGAAGGATTTATAGAAGGAAACATACTCG CCTTTCTAGGTGTCATAGCAGCCATTCTGTTACTTCTGCTAGTAAATCGCAAGCTACAGCTACACTTCATCTATAATGAA ATAGCCAAAGTGGAAGACACCAAGATGAAGCATGTATCCGAATATAAATTCCTGGACCGCTATGGTGACGTAGGTGAATA TCTACGTCTGGAACTAAAACTGTGTTTCCGTAACAAAACCGTAAAGACACAATTCCGCATGGGATTTATCATCATGCTGG CTTTTTCGGCACTGATTGCCTTCACGGATGTGTATGACGGAACAGGAATGATAAATTTTATCTGCATATACAATTTTGCC ATTTTAAGTATCATGACCCTGGGGCAAGTGATGTCTTTTGAGGGCAACTATCTGGATGGTCTTATGAGCCGTAAGGAATC TATCTATAACTTGCTTCGTGCCAAGTATTACCTGAACTGCATCATCGTGTTCATCCCTTTCCTGATTATGATGATCCCTG TAGCTAAGGGCAAGATACCCTTCCTCATGGCTCTATCCTATATGCTGTTTACAACAGGATTCGTATTCGCCATGATGCTG CAACTGGCTGTGTACAATAAAAAGACACTCCCGTTAAACGCCAATGTCATGCGAAGCAATCGGGGAAGTTCCTTATTCCA GACCATTATCATCTCATGTGCTTTTTTCCTGCCCTTGATTATCAACAAAGCTCTGACAGCTTTCTTTGAACAGGATACAG CCTGCATCATCATGATGATTATAGGGTTGTTACTGATTGCAACCCACAATATTTGGATAAAAAATATCTATAACCGTTTC ATGAAGCGCCGTTATGAGAATATGGAAGGCTTCCGTGACTCACGTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TACCGCTAAAGATCTGCAAGAATTTACCAAAGCCTTGTTGGAACAGAATAACCGTGTAGAAGTAAGCATGACCTCGGAAG AAACAAAATAATCCAAGCCT
Downstream 100 bases:
>100_bases AACGAATTGCGTATGAATATCATAATAAACCAATTACAAAAGAACTTTGGCCCGAAAGTGGCTGTAGACATAGAAAATTA CTCCATTCAAAGCGGTAACA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 495; Mature: 495
Protein sequence:
>495_residues MLLSIIRQNQKLAAKRNPAFDRNRFAKFLIYFMVAFWAAYLIFIGVMLSFAFEDIFPSMEPYHIMNQGLIYLLILDFLLR FMLQPAMSQEIKPYLLMPVKKNKLVDTLLLQSGISSYNFFWFFLIIPFALLTIIRFYGLTGILCYLCGIWLLMVMNSYWY LICKTLLNEKLLYILLPIGVYGLLAGTEFIPEGNPVSTFMMNLGEGFIEGNILAFLGVIAAILLLLLVNRKLQLHFIYNE IAKVEDTKMKHVSEYKFLDRYGDVGEYLRLELKLCFRNKTVKTQFRMGFIIMLAFSALIAFTDVYDGTGMINFICIYNFA ILSIMTLGQVMSFEGNYLDGLMSRKESIYNLLRAKYYLNCIIVFIPFLIMMIPVAKGKIPFLMALSYMLFTTGFVFAMML QLAVYNKKTLPLNANVMRSNRGSSLFQTIIISCAFFLPLIINKALTAFFEQDTACIIMMIIGLLLIATHNIWIKNIYNRF MKRRYENMEGFRDSR
Sequences:
>Translated_495_residues MLLSIIRQNQKLAAKRNPAFDRNRFAKFLIYFMVAFWAAYLIFIGVMLSFAFEDIFPSMEPYHIMNQGLIYLLILDFLLR FMLQPAMSQEIKPYLLMPVKKNKLVDTLLLQSGISSYNFFWFFLIIPFALLTIIRFYGLTGILCYLCGIWLLMVMNSYWY LICKTLLNEKLLYILLPIGVYGLLAGTEFIPEGNPVSTFMMNLGEGFIEGNILAFLGVIAAILLLLLVNRKLQLHFIYNE IAKVEDTKMKHVSEYKFLDRYGDVGEYLRLELKLCFRNKTVKTQFRMGFIIMLAFSALIAFTDVYDGTGMINFICIYNFA ILSIMTLGQVMSFEGNYLDGLMSRKESIYNLLRAKYYLNCIIVFIPFLIMMIPVAKGKIPFLMALSYMLFTTGFVFAMML QLAVYNKKTLPLNANVMRSNRGSSLFQTIIISCAFFLPLIINKALTAFFEQDTACIIMMIIGLLLIATHNIWIKNIYNRF MKRRYENMEGFRDSR >Mature_495_residues MLLSIIRQNQKLAAKRNPAFDRNRFAKFLIYFMVAFWAAYLIFIGVMLSFAFEDIFPSMEPYHIMNQGLIYLLILDFLLR FMLQPAMSQEIKPYLLMPVKKNKLVDTLLLQSGISSYNFFWFFLIIPFALLTIIRFYGLTGILCYLCGIWLLMVMNSYWY LICKTLLNEKLLYILLPIGVYGLLAGTEFIPEGNPVSTFMMNLGEGFIEGNILAFLGVIAAILLLLLVNRKLQLHFIYNE IAKVEDTKMKHVSEYKFLDRYGDVGEYLRLELKLCFRNKTVKTQFRMGFIIMLAFSALIAFTDVYDGTGMINFICIYNFA ILSIMTLGQVMSFEGNYLDGLMSRKESIYNLLRAKYYLNCIIVFIPFLIMMIPVAKGKIPFLMALSYMLFTTGFVFAMML QLAVYNKKTLPLNANVMRSNRGSSLFQTIIISCAFFLPLIINKALTAFFEQDTACIIMMIIGLLLIATHNIWIKNIYNRF MKRRYENMEGFRDSR
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 57444; Mature: 57444
Theoretical pI: Translated: 9.59; Mature: 9.59
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.6 %Cys (Translated Protein) 6.1 %Met (Translated Protein) 7.7 %Cys+Met (Translated Protein) 1.6 %Cys (Mature Protein) 6.1 %Met (Mature Protein) 7.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLLSIIRQNQKLAAKRNPAFDRNRFAKFLIYFMVAFWAAYLIFIGVMLSFAFEDIFPSME CCHHHHHCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC PYHIMNQGLIYLLILDFLLRFMLQPAMSQEIKPYLLMPVKKNKLVDTLLLQSGISSYNFF CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH WFFLIIPFALLTIIRFYGLTGILCYLCGIWLLMVMNSYWYLICKTLLNEKLLYILLPIGV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH YGLLAGTEFIPEGNPVSTFMMNLGEGFIEGNILAFLGVIAAILLLLLVNRKLQLHFIYNE HHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEHHHH IAKVEDTKMKHVSEYKFLDRYGDVGEYLRLELKLCFRNKTVKTQFRMGFIIMLAFSALIA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FTDVYDGTGMINFICIYNFAILSIMTLGQVMSFEGNYLDGLMSRKESIYNLLRAKYYLNC HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IIVFIPFLIMMIPVAKGKIPFLMALSYMLFTTGFVFAMMLQLAVYNKKTLPLNANVMRSN HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHCCC RGSSLFQTIIISCAFFLPLIINKALTAFFEQDTACIIMMIIGLLLIATHNIWIKNIYNRF CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MKRRYENMEGFRDSR HHHHHHHHCCCCCCC >Mature Secondary Structure MLLSIIRQNQKLAAKRNPAFDRNRFAKFLIYFMVAFWAAYLIFIGVMLSFAFEDIFPSME CCHHHHHCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC PYHIMNQGLIYLLILDFLLRFMLQPAMSQEIKPYLLMPVKKNKLVDTLLLQSGISSYNFF CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH WFFLIIPFALLTIIRFYGLTGILCYLCGIWLLMVMNSYWYLICKTLLNEKLLYILLPIGV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH YGLLAGTEFIPEGNPVSTFMMNLGEGFIEGNILAFLGVIAAILLLLLVNRKLQLHFIYNE HHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEHHHH IAKVEDTKMKHVSEYKFLDRYGDVGEYLRLELKLCFRNKTVKTQFRMGFIIMLAFSALIA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FTDVYDGTGMINFICIYNFAILSIMTLGQVMSFEGNYLDGLMSRKESIYNLLRAKYYLNC HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IIVFIPFLIMMIPVAKGKIPFLMALSYMLFTTGFVFAMMLQLAVYNKKTLPLNANVMRSN HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHCCC RGSSLFQTIIISCAFFLPLIINKALTAFFEQDTACIIMMIIGLLLIATHNIWIKNIYNRF CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MKRRYENMEGFRDSR HHHHHHHHCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA