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Definition Clostridium botulinum A str. ATCC 3502, complete genome.
Accession NC_009495
Length 3,886,916

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The map label for this gene is 148380636

Identifier: 148380636

GI number: 148380636

Start: 2825493

End: 2826923

Strand: Reverse

Name: 148380636

Synonym: CBO2678

Alternate gene names: NA

Gene position: 2826923-2825493 (Counterclockwise)

Preceding gene: 148380637

Following gene: 148380635

Centisome position: 72.73

GC content: 19.29

Gene sequence:

>1431_bases
ATGTTAACAAAATTTAAAAATATATTAAAAAACAATAAATTTAATGTGATTTTCAAATATTCTTTTATCAAGTATATTGC
ATTAGTAATAGGTTTCTTAAAAGAAATAGTAAATGCCAAAGTTTTGGGCCCAGAGTTATTAGGGGTTTTAGGAAATTTAT
TATTAATATTAAATTATTTGTCCTATGCCAATTTAGGTATTTTATATTCTATGAATAGAGAATATATACTTTATAAGGAT
AAAGATGAAAGAAAGGCTAGGCAGGTTATTTATACTTCTTTTACAAGTTTATTTATACTCTCTATTTTTTTTATACTATG
TGGCTTTTTATCAAAATTATTTATTTTTAAGGATGCTACAGGAGAATATTTGATATATATTTTTCTTATTGCTATTTTCC
AACAGTTTAAAATGTTTTTTATTAATTATTTTAGATTAGTTGACAATTTTACAAAAATTAATATTATTGAATTGATTAAT
AATGCAGGAACGTTTTTATTAATAATGTTATTTATAAAGAATTATAAAATAAATGCAGTATTGTATTCTATGATTATTTG
TGGATTTATAACTTTAATATATGGCATTATTAATTGTGAAAAGCTAAAAATTAATATAAATTACAATATATTAAAAGATT
TAATTTATGTAGGAATACCTTTATTGATTTATAATTTAGGATTTTATATTTTAACAACAGTGGATAGAATAATGATTTTA
AAATATTTAAAATATGAAGAATTAGGTTATTATACATTTTCAAATCAAATAGTTAGTGCAACATTAGTTTTTATAACATC
TATTTTATTCTTATATTACCCCAAAGCTATAAAAATACTAAATATAAATGAAAATTTTAATGTAAAAAAGGTTTATAATA
GCATAGAAAAGTATACTAAATATGTGGAATTATTAGGGGTTTTATTGTGTATAGTAGGCGTAATTTTTATAAAGCCTTTT
GTAAATATTGTTGTACCTAATTATGAAGCTAGTATAAATATTTATAGAGTATTAGTACTAGGTGCAATAGCCTCACAAGT
TTCATATTTTGCAAATGTTTTTATAGTGTCAAATAAGAAACAAATGTATTTAATTTTTCTTCAATTTTTAACTATAATAT
TATCCATAATATTAAATTATATATTTTTAAAATTAGGTTTTAAGGTTATGGGCGTATCTATAGCTACTATGATTACTAAT
ATAATATATTCTGCAATGCAGTATTTAATCTTCTTAAAAATATTAAATCAGAGAAAAGATTATTTTAATATAATGTTAAA
AACTTATTATAAATTTATTTTATTTGTAATTATATTATTAATTATAAGTACTTTGAAAATAAATTATTACATATATATAA
TGATTTTGTTGGCATCTGTATTTATGTTATATAAAAAAGATATTAATGATGTTGTCAAAAAGTATATTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAATATAGTTTACAAAAGGGGCTTATAAAAACTATAAATTATTATAAAAACAATATATAAGATAATGCTTATTTAAGGG
TGTTACATAAGGTGATAAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAAAATGGGATAAGTTTACTAAATAATAATATATTATTAATATAAGAGTAAAAAGAGTGTGTTAAAATAATATAATATTT
CTGTTAATCATATTATGATG

Product: polysaccharide biosynthesis protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 476; Mature: 476

Protein sequence:

>476_residues
MLTKFKNILKNNKFNVIFKYSFIKYIALVIGFLKEIVNAKVLGPELLGVLGNLLLILNYLSYANLGILYSMNREYILYKD
KDERKARQVIYTSFTSLFILSIFFILCGFLSKLFIFKDATGEYLIYIFLIAIFQQFKMFFINYFRLVDNFTKINIIELIN
NAGTFLLIMLFIKNYKINAVLYSMIICGFITLIYGIINCEKLKININYNILKDLIYVGIPLLIYNLGFYILTTVDRIMIL
KYLKYEELGYYTFSNQIVSATLVFITSILFLYYPKAIKILNINENFNVKKVYNSIEKYTKYVELLGVLLCIVGVIFIKPF
VNIVVPNYEASINIYRVLVLGAIASQVSYFANVFIVSNKKQMYLIFLQFLTIILSIILNYIFLKLGFKVMGVSIATMITN
IIYSAMQYLIFLKILNQRKDYFNIMLKTYYKFILFVIILLIISTLKINYYIYIMILLASVFMLYKKDINDVVKKYI

Sequences:

>Translated_476_residues
MLTKFKNILKNNKFNVIFKYSFIKYIALVIGFLKEIVNAKVLGPELLGVLGNLLLILNYLSYANLGILYSMNREYILYKD
KDERKARQVIYTSFTSLFILSIFFILCGFLSKLFIFKDATGEYLIYIFLIAIFQQFKMFFINYFRLVDNFTKINIIELIN
NAGTFLLIMLFIKNYKINAVLYSMIICGFITLIYGIINCEKLKININYNILKDLIYVGIPLLIYNLGFYILTTVDRIMIL
KYLKYEELGYYTFSNQIVSATLVFITSILFLYYPKAIKILNINENFNVKKVYNSIEKYTKYVELLGVLLCIVGVIFIKPF
VNIVVPNYEASINIYRVLVLGAIASQVSYFANVFIVSNKKQMYLIFLQFLTIILSIILNYIFLKLGFKVMGVSIATMITN
IIYSAMQYLIFLKILNQRKDYFNIMLKTYYKFILFVIILLIISTLKINYYIYIMILLASVFMLYKKDINDVVKKYI
>Mature_476_residues
MLTKFKNILKNNKFNVIFKYSFIKYIALVIGFLKEIVNAKVLGPELLGVLGNLLLILNYLSYANLGILYSMNREYILYKD
KDERKARQVIYTSFTSLFILSIFFILCGFLSKLFIFKDATGEYLIYIFLIAIFQQFKMFFINYFRLVDNFTKINIIELIN
NAGTFLLIMLFIKNYKINAVLYSMIICGFITLIYGIINCEKLKININYNILKDLIYVGIPLLIYNLGFYILTTVDRIMIL
KYLKYEELGYYTFSNQIVSATLVFITSILFLYYPKAIKILNINENFNVKKVYNSIEKYTKYVELLGVLLCIVGVIFIKPF
VNIVVPNYEASINIYRVLVLGAIASQVSYFANVFIVSNKKQMYLIFLQFLTIILSIILNYIFLKLGFKVMGVSIATMITN
IIYSAMQYLIFLKILNQRKDYFNIMLKTYYKFILFVIILLIISTLKINYYIYIMILLASVFMLYKKDINDVVKKYI

Specific function: Unknown

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55847; Mature: 55847

Theoretical pI: Translated: 9.94; Mature: 9.94

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
3.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
3.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLTKFKNILKNNKFNVIFKYSFIKYIALVIGFLKEIVNAKVLGPELLGVLGNLLLILNYL
CCCHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
SYANLGILYSMNREYILYKDKDERKARQVIYTSFTSLFILSIFFILCGFLSKLFIFKDAT
HHHCCCEEEECCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
GEYLIYIFLIAIFQQFKMFFINYFRLVDNFTKINIIELINNAGTFLLIMLFIKNYKINAV
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHHH
LYSMIICGFITLIYGIINCEKLKININYNILKDLIYVGIPLLIYNLGFYILTTVDRIMIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KYLKYEELGYYTFSNQIVSATLVFITSILFLYYPKAIKILNINENFNVKKVYNSIEKYTK
HHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHH
YVELLGVLLCIVGVIFIKPFVNIVVPNYEASINIYRVLVLGAIASQVSYFANVFIVSNKK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCC
QMYLIFLQFLTIILSIILNYIFLKLGFKVMGVSIATMITNIIYSAMQYLIFLKILNQRKD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
YFNIMLKTYYKFILFVIILLIISTLKINYYIYIMILLASVFMLYKKDINDVVKKYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MLTKFKNILKNNKFNVIFKYSFIKYIALVIGFLKEIVNAKVLGPELLGVLGNLLLILNYL
CCCHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
SYANLGILYSMNREYILYKDKDERKARQVIYTSFTSLFILSIFFILCGFLSKLFIFKDAT
HHHCCCEEEECCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
GEYLIYIFLIAIFQQFKMFFINYFRLVDNFTKINIIELINNAGTFLLIMLFIKNYKINAV
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHHH
LYSMIICGFITLIYGIINCEKLKININYNILKDLIYVGIPLLIYNLGFYILTTVDRIMIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KYLKYEELGYYTFSNQIVSATLVFITSILFLYYPKAIKILNINENFNVKKVYNSIEKYTK
HHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHH
YVELLGVLLCIVGVIFIKPFVNIVVPNYEASINIYRVLVLGAIASQVSYFANVFIVSNKK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCC
QMYLIFLQFLTIILSIILNYIFLKLGFKVMGVSIATMITNIIYSAMQYLIFLKILNQRKD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
YFNIMLKTYYKFILFVIILLIISTLKINYYIYIMILLASVFMLYKKDINDVVKKYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA