| Definition | Clostridium botulinum A str. ATCC 3502, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009495 |
| Length | 3,886,916 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 148380636
Identifier: 148380636
GI number: 148380636
Start: 2825493
End: 2826923
Strand: Reverse
Name: 148380636
Synonym: CBO2678
Alternate gene names: NA
Gene position: 2826923-2825493 (Counterclockwise)
Preceding gene: 148380637
Following gene: 148380635
Centisome position: 72.73
GC content: 19.29
Gene sequence:
>1431_bases ATGTTAACAAAATTTAAAAATATATTAAAAAACAATAAATTTAATGTGATTTTCAAATATTCTTTTATCAAGTATATTGC ATTAGTAATAGGTTTCTTAAAAGAAATAGTAAATGCCAAAGTTTTGGGCCCAGAGTTATTAGGGGTTTTAGGAAATTTAT TATTAATATTAAATTATTTGTCCTATGCCAATTTAGGTATTTTATATTCTATGAATAGAGAATATATACTTTATAAGGAT AAAGATGAAAGAAAGGCTAGGCAGGTTATTTATACTTCTTTTACAAGTTTATTTATACTCTCTATTTTTTTTATACTATG TGGCTTTTTATCAAAATTATTTATTTTTAAGGATGCTACAGGAGAATATTTGATATATATTTTTCTTATTGCTATTTTCC AACAGTTTAAAATGTTTTTTATTAATTATTTTAGATTAGTTGACAATTTTACAAAAATTAATATTATTGAATTGATTAAT AATGCAGGAACGTTTTTATTAATAATGTTATTTATAAAGAATTATAAAATAAATGCAGTATTGTATTCTATGATTATTTG TGGATTTATAACTTTAATATATGGCATTATTAATTGTGAAAAGCTAAAAATTAATATAAATTACAATATATTAAAAGATT TAATTTATGTAGGAATACCTTTATTGATTTATAATTTAGGATTTTATATTTTAACAACAGTGGATAGAATAATGATTTTA AAATATTTAAAATATGAAGAATTAGGTTATTATACATTTTCAAATCAAATAGTTAGTGCAACATTAGTTTTTATAACATC TATTTTATTCTTATATTACCCCAAAGCTATAAAAATACTAAATATAAATGAAAATTTTAATGTAAAAAAGGTTTATAATA GCATAGAAAAGTATACTAAATATGTGGAATTATTAGGGGTTTTATTGTGTATAGTAGGCGTAATTTTTATAAAGCCTTTT GTAAATATTGTTGTACCTAATTATGAAGCTAGTATAAATATTTATAGAGTATTAGTACTAGGTGCAATAGCCTCACAAGT TTCATATTTTGCAAATGTTTTTATAGTGTCAAATAAGAAACAAATGTATTTAATTTTTCTTCAATTTTTAACTATAATAT TATCCATAATATTAAATTATATATTTTTAAAATTAGGTTTTAAGGTTATGGGCGTATCTATAGCTACTATGATTACTAAT ATAATATATTCTGCAATGCAGTATTTAATCTTCTTAAAAATATTAAATCAGAGAAAAGATTATTTTAATATAATGTTAAA AACTTATTATAAATTTATTTTATTTGTAATTATATTATTAATTATAAGTACTTTGAAAATAAATTATTACATATATATAA TGATTTTGTTGGCATCTGTATTTATGTTATATAAAAAAGATATTAATGATGTTGTCAAAAAGTATATTTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases AAAATATAGTTTACAAAAGGGGCTTATAAAAACTATAAATTATTATAAAAACAATATATAAGATAATGCTTATTTAAGGG TGTTACATAAGGTGATAAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases TAAAATGGGATAAGTTTACTAAATAATAATATATTATTAATATAAGAGTAAAAAGAGTGTGTTAAAATAATATAATATTT CTGTTAATCATATTATGATG
Product: polysaccharide biosynthesis protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 476; Mature: 476
Protein sequence:
>476_residues MLTKFKNILKNNKFNVIFKYSFIKYIALVIGFLKEIVNAKVLGPELLGVLGNLLLILNYLSYANLGILYSMNREYILYKD KDERKARQVIYTSFTSLFILSIFFILCGFLSKLFIFKDATGEYLIYIFLIAIFQQFKMFFINYFRLVDNFTKINIIELIN NAGTFLLIMLFIKNYKINAVLYSMIICGFITLIYGIINCEKLKININYNILKDLIYVGIPLLIYNLGFYILTTVDRIMIL KYLKYEELGYYTFSNQIVSATLVFITSILFLYYPKAIKILNINENFNVKKVYNSIEKYTKYVELLGVLLCIVGVIFIKPF VNIVVPNYEASINIYRVLVLGAIASQVSYFANVFIVSNKKQMYLIFLQFLTIILSIILNYIFLKLGFKVMGVSIATMITN IIYSAMQYLIFLKILNQRKDYFNIMLKTYYKFILFVIILLIISTLKINYYIYIMILLASVFMLYKKDINDVVKKYI
Sequences:
>Translated_476_residues MLTKFKNILKNNKFNVIFKYSFIKYIALVIGFLKEIVNAKVLGPELLGVLGNLLLILNYLSYANLGILYSMNREYILYKD KDERKARQVIYTSFTSLFILSIFFILCGFLSKLFIFKDATGEYLIYIFLIAIFQQFKMFFINYFRLVDNFTKINIIELIN NAGTFLLIMLFIKNYKINAVLYSMIICGFITLIYGIINCEKLKININYNILKDLIYVGIPLLIYNLGFYILTTVDRIMIL KYLKYEELGYYTFSNQIVSATLVFITSILFLYYPKAIKILNINENFNVKKVYNSIEKYTKYVELLGVLLCIVGVIFIKPF VNIVVPNYEASINIYRVLVLGAIASQVSYFANVFIVSNKKQMYLIFLQFLTIILSIILNYIFLKLGFKVMGVSIATMITN IIYSAMQYLIFLKILNQRKDYFNIMLKTYYKFILFVIILLIISTLKINYYIYIMILLASVFMLYKKDINDVVKKYI >Mature_476_residues MLTKFKNILKNNKFNVIFKYSFIKYIALVIGFLKEIVNAKVLGPELLGVLGNLLLILNYLSYANLGILYSMNREYILYKD KDERKARQVIYTSFTSLFILSIFFILCGFLSKLFIFKDATGEYLIYIFLIAIFQQFKMFFINYFRLVDNFTKINIIELIN NAGTFLLIMLFIKNYKINAVLYSMIICGFITLIYGIINCEKLKININYNILKDLIYVGIPLLIYNLGFYILTTVDRIMIL KYLKYEELGYYTFSNQIVSATLVFITSILFLYYPKAIKILNINENFNVKKVYNSIEKYTKYVELLGVLLCIVGVIFIKPF VNIVVPNYEASINIYRVLVLGAIASQVSYFANVFIVSNKKQMYLIFLQFLTIILSIILNYIFLKLGFKVMGVSIATMITN IIYSAMQYLIFLKILNQRKDYFNIMLKTYYKFILFVIILLIISTLKINYYIYIMILLASVFMLYKKDINDVVKKYI
Specific function: Unknown
COG id: COG2244
COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 55847; Mature: 55847
Theoretical pI: Translated: 9.94; Mature: 9.94
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 2.7 %Met (Translated Protein) 3.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 2.7 %Met (Mature Protein) 3.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLTKFKNILKNNKFNVIFKYSFIKYIALVIGFLKEIVNAKVLGPELLGVLGNLLLILNYL CCCHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH SYANLGILYSMNREYILYKDKDERKARQVIYTSFTSLFILSIFFILCGFLSKLFIFKDAT HHHCCCEEEECCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC GEYLIYIFLIAIFQQFKMFFINYFRLVDNFTKINIIELINNAGTFLLIMLFIKNYKINAV CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHHH LYSMIICGFITLIYGIINCEKLKININYNILKDLIYVGIPLLIYNLGFYILTTVDRIMIL HHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KYLKYEELGYYTFSNQIVSATLVFITSILFLYYPKAIKILNINENFNVKKVYNSIEKYTK HHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHH YVELLGVLLCIVGVIFIKPFVNIVVPNYEASINIYRVLVLGAIASQVSYFANVFIVSNKK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCC QMYLIFLQFLTIILSIILNYIFLKLGFKVMGVSIATMITNIIYSAMQYLIFLKILNQRKD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH YFNIMLKTYYKFILFVIILLIISTLKINYYIYIMILLASVFMLYKKDINDVVKKYI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MLTKFKNILKNNKFNVIFKYSFIKYIALVIGFLKEIVNAKVLGPELLGVLGNLLLILNYL CCCHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH SYANLGILYSMNREYILYKDKDERKARQVIYTSFTSLFILSIFFILCGFLSKLFIFKDAT HHHCCCEEEECCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC GEYLIYIFLIAIFQQFKMFFINYFRLVDNFTKINIIELINNAGTFLLIMLFIKNYKINAV CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHHH LYSMIICGFITLIYGIINCEKLKININYNILKDLIYVGIPLLIYNLGFYILTTVDRIMIL HHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KYLKYEELGYYTFSNQIVSATLVFITSILFLYYPKAIKILNINENFNVKKVYNSIEKYTK HHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHH YVELLGVLLCIVGVIFIKPFVNIVVPNYEASINIYRVLVLGAIASQVSYFANVFIVSNKK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCC QMYLIFLQFLTIILSIILNYIFLKLGFKVMGVSIATMITNIIYSAMQYLIFLKILNQRKD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH YFNIMLKTYYKFILFVIILLIISTLKINYYIYIMILLASVFMLYKKDINDVVKKYI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA