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The map label for this gene is 148361019

Identifier: 148361019

GI number: 148361019

Start: 458580

End: 461270

Strand: Reverse

Name: 148361019

Synonym: LPC_2979

Alternate gene names: NA

Gene position: 461270-458580 (Counterclockwise)

Preceding gene: 148361018

Following gene: 148361020

Centisome position: 12.9

GC content: 34.89

Gene sequence:

>2691_bases
GTGGTTGATTTTGATAAACCTGTCTCAAAAAATGATATTCTTGCCAGCTTATTACTTATCGCAGATTTAAATAGACCATC
TCTAAATCAAACTCTTTCCTGGGAGCAAGCTCTAAAATCATTTTTATCGCTTAATGATCCACTGATTAAAACGGAAATAT
TTATAAAATGGCTCAGTCAATTAAATCCTGATCAACTTCAATCGTCCCCAGAGATAGTCCTCATTTTGAAACACATTGTC
GAGCAAAAGCTGCTCCCCTATACCCTCAAAAAAATATTGATTCAGCGTAAAAACTTCACCACCTCACAAATCAATTGGCT
TTGCAATCATTGTCTTATAGTTGCACCTGATCAAACGACTTTACCTGATATTATTAAACTCGGCTCATGGAGCTGGCTGG
AGAATCATATGAAAAGAAATGAACTATTAAATTTTGATTTGTTAAAAATAGCCATCTTAAATAAGGATTATTTAGCCAGC
ATCAACAATAGTAAAGAAAGTCAGCTCGATTTTATCTATGCGTTAAACGCTAATAAATTTAACTACCAGCAAATACTTGA
ATTAATTGCTTTAGCGCAGGATAGCCAGATTAAATCATTATTAATTACCTGTCTATTAAGCAAAAAGGAGTACCTGGACA
ATTTAAAAGAAAAATCATTTCTAGCCCATTTAAATCAAAGTGAATTTCACTCGCCACCTCGGCTTAATGCACTAGTTCAC
CAATTAAACCTGAGTTGTTTGACTGTGGCACAAATAGAACTTCTACAACCTGAAGCATGTGTTACTTTACTCTGTTCGAT
CCCTCATTTTCATCAATTGTCAGAAAAACAGGTTGAAAAAATACTACTTAAGTATCCAAAGCCTGATATGATTGCCTATT
GGCTAAATCATTACTCATCCAGGCCAAATGCGCATTTTATTTTAGCCCATTTGATGAACCTGGTAGATGTTCATGTTGTT
GACGAACTTAATAAAATGGATTCCACAAAAAAGGAAACCATTATTATGAATATGGTGGAACATCTCGAATTATTTGATCC
GACTCATCCTCTTTTGATCAACCAAAATGAAGAAAAACGATTAATTACCGCTATTCAACGCTATCTCTATGGCCAACATC
ATGACGCGTATGTAACTTACATCAAGTTATTGGTTTATAAATTATTAAACCGTAATTACCAATTCTCACCTCAAGCGATG
CAACTCCTGATTTGTTTAAATAATCTGGAAGAGTTGAAAGAGTTAAATAATAAAATCGCCTATCTGACCAATTACTACTT
GCGAGCATCAGCACAATCCGGTGATTCGAGCTTATTTTATAATGATTCACGCATAAACATCACGAGCATGACACAACTGG
TCCAGCTAGCCCCAAAAATTCCAACTAAATCGAAAGAAAAAAGTCTTTTAAGCAGCCTCTTCTGCGGCATCAAAATTAGC
GAAAGCTCTGTAATGACACCGACCAATGATATACCTGAACACCCTTTAATTAATAAATTAATAAAAAGCAAAAGAACGGT
GAAATCGATAGATTATTTTTTAATGCATTATAAAGGCGACAAGCAAGTACTTTCCAAAATCATCAATGATTATTTAAGTT
ACTATGTTCAAGAAGGGTGCACTGAAATACATCGGCGTTCGATATATCATTTAATTGTTCTCATGTCTTTAAGCGATATA
TCAGCTTCTGTTAGAGAAGCTATATACACAGCGTTTCTAAACTATCCTGAATTACATGATGAGCAAATTAATTTTTCTTT
ATTTATCTATGATGCTAAAAGAACTATCCGGCATTTTGGGGCACAAGCTAGCGAAGACAGCTATGCCAGAGTTATTGATT
TATGCGAGGGAGCTCTAAAAAAATTAAATCCAAATAAACACAAGGAAATTATCAGTATAGCGACTCAAGCTTTAACTGAA
GCAAAAATCGAGTTAAGTTTTGGTGAAAATACCGGATTTATCGCTCAACTGATTTCACGATTGAAACGATGTTGGTATTA
TGGCTGGACTGGTTTTTTTTCCCCAAATCTACCTGCTTTTGTTGCAGCAATTGACTCGCCAATAAAGCAAAGCGAAAAAA
AAGCCTCCCCTCTTCTTCAACAAAGAAAATATTTCACTACCAAACTTGAAACAAATCTGTCGATTATCCTTGATGACATA
AAATCAGGTTACACCCAACAAAAACTTAATGAATTAATCGAAGCATTGAGTATATTTTCATTGCAATCCAATCCAAAAAA
CGAGCTTAAAATTCGTCAAAAACTCCATCGCCTATTTCACTATCTGTTACTAGAAAGCAAAAATGACTTAACATTGGATG
CCTGGCTTATAAAAAATCAGCAACTTTTAATCGCAAATCGCTTTCGTTTGCTAGAAATGCAACTAATGAAAGGGGCTCGT
AATGAGGTTGAATCTTTACTTAAGGAATTTGATGAAGACTCTACTCATTTCAGCCCTATCATTAAAGAGTTTACTCATTC
TTTACCCGAACAAAATCCGTATAGATGTGAATCTGTTTCTTCAAATCAAACTCCAGGCATCACTATCCTGGATTCAGCAA
CTGAGTTAGCTACTAGCCTAAAAAGCACATTAGGCAACTTGGGAGTATTTTTTAGCAACAACATCATGTCAGCTATTTAT
CCAAACAATAAATCCACGCCCCAATCGACATCAACAATGATTTCACCTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCGGGAGAATTTGTGAATATTATATTCCGTGGCTTAACATGAACGAAATGGGTATTAAAGTTGATTGAGTAGTTTTGACA
TTTCGGTCAAGGAGGATCAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTAATCTTCCGGCTGCGCATCTACAGCCGGATTGATTCATCTATCTTTTTATAATAACCTGAAACAAACAACCGTTCTAA
AATTTGGATACTTCCTATTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 896; Mature: 896

Protein sequence:

>896_residues
MVDFDKPVSKNDILASLLLIADLNRPSLNQTLSWEQALKSFLSLNDPLIKTEIFIKWLSQLNPDQLQSSPEIVLILKHIV
EQKLLPYTLKKILIQRKNFTTSQINWLCNHCLIVAPDQTTLPDIIKLGSWSWLENHMKRNELLNFDLLKIAILNKDYLAS
INNSKESQLDFIYALNANKFNYQQILELIALAQDSQIKSLLITCLLSKKEYLDNLKEKSFLAHLNQSEFHSPPRLNALVH
QLNLSCLTVAQIELLQPEACVTLLCSIPHFHQLSEKQVEKILLKYPKPDMIAYWLNHYSSRPNAHFILAHLMNLVDVHVV
DELNKMDSTKKETIIMNMVEHLELFDPTHPLLINQNEEKRLITAIQRYLYGQHHDAYVTYIKLLVYKLLNRNYQFSPQAM
QLLICLNNLEELKELNNKIAYLTNYYLRASAQSGDSSLFYNDSRINITSMTQLVQLAPKIPTKSKEKSLLSSLFCGIKIS
ESSVMTPTNDIPEHPLINKLIKSKRTVKSIDYFLMHYKGDKQVLSKIINDYLSYYVQEGCTEIHRRSIYHLIVLMSLSDI
SASVREAIYTAFLNYPELHDEQINFSLFIYDAKRTIRHFGAQASEDSYARVIDLCEGALKKLNPNKHKEIISIATQALTE
AKIELSFGENTGFIAQLISRLKRCWYYGWTGFFSPNLPAFVAAIDSPIKQSEKKASPLLQQRKYFTTKLETNLSIILDDI
KSGYTQQKLNELIEALSIFSLQSNPKNELKIRQKLHRLFHYLLLESKNDLTLDAWLIKNQQLLIANRFRLLEMQLMKGAR
NEVESLLKEFDEDSTHFSPIIKEFTHSLPEQNPYRCESVSSNQTPGITILDSATELATSLKSTLGNLGVFFSNNIMSAIY
PNNKSTPQSTSTMISP

Sequences:

>Translated_896_residues
MVDFDKPVSKNDILASLLLIADLNRPSLNQTLSWEQALKSFLSLNDPLIKTEIFIKWLSQLNPDQLQSSPEIVLILKHIV
EQKLLPYTLKKILIQRKNFTTSQINWLCNHCLIVAPDQTTLPDIIKLGSWSWLENHMKRNELLNFDLLKIAILNKDYLAS
INNSKESQLDFIYALNANKFNYQQILELIALAQDSQIKSLLITCLLSKKEYLDNLKEKSFLAHLNQSEFHSPPRLNALVH
QLNLSCLTVAQIELLQPEACVTLLCSIPHFHQLSEKQVEKILLKYPKPDMIAYWLNHYSSRPNAHFILAHLMNLVDVHVV
DELNKMDSTKKETIIMNMVEHLELFDPTHPLLINQNEEKRLITAIQRYLYGQHHDAYVTYIKLLVYKLLNRNYQFSPQAM
QLLICLNNLEELKELNNKIAYLTNYYLRASAQSGDSSLFYNDSRINITSMTQLVQLAPKIPTKSKEKSLLSSLFCGIKIS
ESSVMTPTNDIPEHPLINKLIKSKRTVKSIDYFLMHYKGDKQVLSKIINDYLSYYVQEGCTEIHRRSIYHLIVLMSLSDI
SASVREAIYTAFLNYPELHDEQINFSLFIYDAKRTIRHFGAQASEDSYARVIDLCEGALKKLNPNKHKEIISIATQALTE
AKIELSFGENTGFIAQLISRLKRCWYYGWTGFFSPNLPAFVAAIDSPIKQSEKKASPLLQQRKYFTTKLETNLSIILDDI
KSGYTQQKLNELIEALSIFSLQSNPKNELKIRQKLHRLFHYLLLESKNDLTLDAWLIKNQQLLIANRFRLLEMQLMKGAR
NEVESLLKEFDEDSTHFSPIIKEFTHSLPEQNPYRCESVSSNQTPGITILDSATELATSLKSTLGNLGVFFSNNIMSAIY
PNNKSTPQSTSTMISP
>Mature_896_residues
MVDFDKPVSKNDILASLLLIADLNRPSLNQTLSWEQALKSFLSLNDPLIKTEIFIKWLSQLNPDQLQSSPEIVLILKHIV
EQKLLPYTLKKILIQRKNFTTSQINWLCNHCLIVAPDQTTLPDIIKLGSWSWLENHMKRNELLNFDLLKIAILNKDYLAS
INNSKESQLDFIYALNANKFNYQQILELIALAQDSQIKSLLITCLLSKKEYLDNLKEKSFLAHLNQSEFHSPPRLNALVH
QLNLSCLTVAQIELLQPEACVTLLCSIPHFHQLSEKQVEKILLKYPKPDMIAYWLNHYSSRPNAHFILAHLMNLVDVHVV
DELNKMDSTKKETIIMNMVEHLELFDPTHPLLINQNEEKRLITAIQRYLYGQHHDAYVTYIKLLVYKLLNRNYQFSPQAM
QLLICLNNLEELKELNNKIAYLTNYYLRASAQSGDSSLFYNDSRINITSMTQLVQLAPKIPTKSKEKSLLSSLFCGIKIS
ESSVMTPTNDIPEHPLINKLIKSKRTVKSIDYFLMHYKGDKQVLSKIINDYLSYYVQEGCTEIHRRSIYHLIVLMSLSDI
SASVREAIYTAFLNYPELHDEQINFSLFIYDAKRTIRHFGAQASEDSYARVIDLCEGALKKLNPNKHKEIISIATQALTE
AKIELSFGENTGFIAQLISRLKRCWYYGWTGFFSPNLPAFVAAIDSPIKQSEKKASPLLQQRKYFTTKLETNLSIILDDI
KSGYTQQKLNELIEALSIFSLQSNPKNELKIRQKLHRLFHYLLLESKNDLTLDAWLIKNQQLLIANRFRLLEMQLMKGAR
NEVESLLKEFDEDSTHFSPIIKEFTHSLPEQNPYRCESVSSNQTPGITILDSATELATSLKSTLGNLGVFFSNNIMSAIY
PNNKSTPQSTSTMISP

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 103054; Mature: 103054

Theoretical pI: Translated: 8.16; Mature: 8.16

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVDFDKPVSKNDILASLLLIADLNRPSLNQTLSWEQALKSFLSLNDPLIKTEIFIKWLSQ
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH
LNPDQLQSSPEIVLILKHIVEQKLLPYTLKKILIQRKNFTTSQINWLCNHCLIVAPDQTT
CCHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCEEECCCCCC
LPDIIKLGSWSWLENHMKRNELLNFDLLKIAILNKDYLASINNSKESQLDFIYALNANKF
CHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEEEEECCHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCCC
NYQQILELIALAQDSQIKSLLITCLLSKKEYLDNLKEKSFLAHLNQSEFHSPPRLNALVH
CHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCHHHHHHH
QLNLSCLTVAQIELLQPEACVTLLCSIPHFHQLSEKQVEKILLKYPKPDMIAYWLNHYSS
HHCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCC
RPNAHFILAHLMNLVDVHVVDELNKMDSTKKETIIMNMVEHLELFDPTHPLLINQNEEKR
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCHHH
LITAIQRYLYGQHHDAYVTYIKLLVYKLLNRNYQFSPQAMQLLICLNNLEELKELNNKIA
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YLTNYYLRASAQSGDSSLFYNDSRINITSMTQLVQLAPKIPTKSKEKSLLSSLFCGIKIS
HHHHHHHEEECCCCCCCEEECCCEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCEEC
ESSVMTPTNDIPEHPLINKLIKSKRTVKSIDYFLMHYKGDKQVLSKIINDYLSYYVQEGC
CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TEIHRRSIYHLIVLMSLSDISASVREAIYTAFLNYPELHDEQINFSLFIYDAKRTIRHFG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHC
AQASEDSYARVIDLCEGALKKLNPNKHKEIISIATQALTEAKIELSFGENTGFIAQLISR
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCHHHHHHHH
LKRCWYYGWTGFFSPNLPAFVAAIDSPIKQSEKKASPLLQQRKYFTTKLETNLSIILDDI
HHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
KSGYTQQKLNELIEALSIFSLQSNPKNELKIRQKLHRLFHYLLLESKNDLTLDAWLIKNQ
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCC
QLLIANRFRLLEMQLMKGARNEVESLLKEFDEDSTHFSPIIKEFTHSLPEQNPYRCESVS
EEEHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
SNQTPGITILDSATELATSLKSTLGNLGVFFSNNIMSAIYPNNKSTPQSTSTMISP
CCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MVDFDKPVSKNDILASLLLIADLNRPSLNQTLSWEQALKSFLSLNDPLIKTEIFIKWLSQ
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH
LNPDQLQSSPEIVLILKHIVEQKLLPYTLKKILIQRKNFTTSQINWLCNHCLIVAPDQTT
CCHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCEEECCCCCC
LPDIIKLGSWSWLENHMKRNELLNFDLLKIAILNKDYLASINNSKESQLDFIYALNANKF
CHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEEEEECCHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCCC
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RPNAHFILAHLMNLVDVHVVDELNKMDSTKKETIIMNMVEHLELFDPTHPLLINQNEEKR
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCHHH
LITAIQRYLYGQHHDAYVTYIKLLVYKLLNRNYQFSPQAMQLLICLNNLEELKELNNKIA
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CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCHHHHHHHH
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KSGYTQQKLNELIEALSIFSLQSNPKNELKIRQKLHRLFHYLLLESKNDLTLDAWLIKNQ
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCC
QLLIANRFRLLEMQLMKGARNEVESLLKEFDEDSTHFSPIIKEFTHSLPEQNPYRCESVS
EEEHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
SNQTPGITILDSATELATSLKSTLGNLGVFFSNNIMSAIYPNNKSTPQSTSTMISP
CCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA