| Definition | Flavobacterium johnsoniae UW101 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009441 |
| Length | 6,096,872 |
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The map label for this gene is 146300444
Identifier: 146300444
GI number: 146300444
Start: 3203874
End: 3206420
Strand: Reverse
Name: 146300444
Synonym: Fjoh_2693
Alternate gene names: NA
Gene position: 3206420-3203874 (Counterclockwise)
Preceding gene: 146300445
Following gene: 146300443
Centisome position: 52.59
GC content: 27.05
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TCAAACATAGAACATTATGTCTATTCGCAAACCACAAATAGAAAATGATCAAACATTTACTTTATATTTAAATTTCTTAA AAACAGTATAAATACCTGCT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 848; Mature: 848
Protein sequence:
>848_residues MMKNYSFFELINQYIIEIPIIQRDYAQGREQENVTYIREKFVSNLVSSIIKGEPIHLGFIYGKVEGKDELEKMKLHSEAV EKLLSTVKQYANQFNINVDSTISTEVITLKNTLRFIPLDGQQRLTTLFLLYWYINMRKGNGHGNWLTNFKYNNRKSALAF FDELSSNDNILKIRSDIDSKNKINIKDQISKYIWYLSKWDYDATVNGAIVMLEQIHKEFSKSPELNFKEIELKTLSFTFD FFDLHELNQSDELYIKMNERGKQLTDFEHFKAWLQNFTEKKYDSGEQKIFLRDFWVKIDTIWLDFFWKNLDVDYTGLDDL YFNFLKTMALNYHLGSGKEREIPDFLKSLVQDIRNTDSYDREKVQYIPISKFLSKIKREDHNDFLFELFSYEALEFITDA FNALFKLSENMEFTVAITEVTTKPFASNSILNAYIKKSSFTLNLWDHAMYYAIIKYFQKVQSCKITHLKNWLRILRNIIY NTYIQNPENLYIALNTIDNLFNEHFLDSVLLSDIINADNFELRFFNQNQLNEEKTKGRLLKNEQWHSCIDKLEKHPYFYG QINFIFNLCQSDGGDNYNYEQFESYSKVLYLLFEKDTEEFLLQRALLSLGDYLIKVNSNWTFCKTDTDSLRSRNENWRRV FIQDDKLKILELLILEIIKRENIRLDFNSILIDIINSHQYNIDQWEYYFVESAYPLQQSKLMEIRWNNNDDIRLLPAKTI IGYHLELRTIFLLKFIYKKLINIEPFEKIEFLWDKGSTGHPGISITGYEFSNKTYRLDIRYSLNKNIYDFCFYNEADIIR NRLANQLIVNNLTDYNYDDNFKHYFKQIHFSNIVQEIQTLCTNLKTIS
Sequences:
>Translated_848_residues MMKNYSFFELINQYIIEIPIIQRDYAQGREQENVTYIREKFVSNLVSSIIKGEPIHLGFIYGKVEGKDELEKMKLHSEAV EKLLSTVKQYANQFNINVDSTISTEVITLKNTLRFIPLDGQQRLTTLFLLYWYINMRKGNGHGNWLTNFKYNNRKSALAF FDELSSNDNILKIRSDIDSKNKINIKDQISKYIWYLSKWDYDATVNGAIVMLEQIHKEFSKSPELNFKEIELKTLSFTFD FFDLHELNQSDELYIKMNERGKQLTDFEHFKAWLQNFTEKKYDSGEQKIFLRDFWVKIDTIWLDFFWKNLDVDYTGLDDL YFNFLKTMALNYHLGSGKEREIPDFLKSLVQDIRNTDSYDREKVQYIPISKFLSKIKREDHNDFLFELFSYEALEFITDA FNALFKLSENMEFTVAITEVTTKPFASNSILNAYIKKSSFTLNLWDHAMYYAIIKYFQKVQSCKITHLKNWLRILRNIIY NTYIQNPENLYIALNTIDNLFNEHFLDSVLLSDIINADNFELRFFNQNQLNEEKTKGRLLKNEQWHSCIDKLEKHPYFYG QINFIFNLCQSDGGDNYNYEQFESYSKVLYLLFEKDTEEFLLQRALLSLGDYLIKVNSNWTFCKTDTDSLRSRNENWRRV FIQDDKLKILELLILEIIKRENIRLDFNSILIDIINSHQYNIDQWEYYFVESAYPLQQSKLMEIRWNNNDDIRLLPAKTI IGYHLELRTIFLLKFIYKKLINIEPFEKIEFLWDKGSTGHPGISITGYEFSNKTYRLDIRYSLNKNIYDFCFYNEADIIR NRLANQLIVNNLTDYNYDDNFKHYFKQIHFSNIVQEIQTLCTNLKTIS >Mature_848_residues MMKNYSFFELINQYIIEIPIIQRDYAQGREQENVTYIREKFVSNLVSSIIKGEPIHLGFIYGKVEGKDELEKMKLHSEAV EKLLSTVKQYANQFNINVDSTISTEVITLKNTLRFIPLDGQQRLTTLFLLYWYINMRKGNGHGNWLTNFKYNNRKSALAF FDELSSNDNILKIRSDIDSKNKINIKDQISKYIWYLSKWDYDATVNGAIVMLEQIHKEFSKSPELNFKEIELKTLSFTFD FFDLHELNQSDELYIKMNERGKQLTDFEHFKAWLQNFTEKKYDSGEQKIFLRDFWVKIDTIWLDFFWKNLDVDYTGLDDL YFNFLKTMALNYHLGSGKEREIPDFLKSLVQDIRNTDSYDREKVQYIPISKFLSKIKREDHNDFLFELFSYEALEFITDA FNALFKLSENMEFTVAITEVTTKPFASNSILNAYIKKSSFTLNLWDHAMYYAIIKYFQKVQSCKITHLKNWLRILRNIIY NTYIQNPENLYIALNTIDNLFNEHFLDSVLLSDIINADNFELRFFNQNQLNEEKTKGRLLKNEQWHSCIDKLEKHPYFYG QINFIFNLCQSDGGDNYNYEQFESYSKVLYLLFEKDTEEFLLQRALLSLGDYLIKVNSNWTFCKTDTDSLRSRNENWRRV FIQDDKLKILELLILEIIKRENIRLDFNSILIDIINSHQYNIDQWEYYFVESAYPLQQSKLMEIRWNNNDDIRLLPAKTI IGYHLELRTIFLLKFIYKKLINIEPFEKIEFLWDKGSTGHPGISITGYEFSNKTYRLDIRYSLNKNIYDFCFYNEADIIR NRLANQLIVNNLTDYNYDDNFKHYFKQIHFSNIVQEIQTLCTNLKTIS
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 101489; Mature: 101489
Theoretical pI: Translated: 6.08; Mature: 6.08
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 1.2 %Met (Translated Protein) 1.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 1.2 %Met (Mature Protein) 1.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MMKNYSFFELINQYIIEIPIIQRDYAQGREQENVTYIREKFVSNLVSSIIKGEPIHLGFI CCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEECHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEE YGKVEGKDELEKMKLHSEAVEKLLSTVKQYANQFNINVDSTISTEVITLKNTLRFIPLDG EEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEECCEEEEECCC QQRLTTLFLLYWYINMRKGNGHGNWLTNFKYNNRKSALAFFDELSSNDNILKIRSDIDSK HHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCEECEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCC NKINIKDQISKYIWYLSKWDYDATVNGAIVMLEQIHKEFSKSPELNFKEIELKTLSFTFD CCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEEEEEE FFDLHELNQSDELYIKMNERGKQLTDFEHFKAWLQNFTEKKYDSGEQKIFLRDFWVKIDT HHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHH IWLDFFWKNLDVDYTGLDDLYFNFLKTMALNYHLGSGKEREIPDFLKSLVQDIRNTDSYD HEEEHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCC REKVQYIPISKFLSKIKREDHNDFLFELFSYEALEFITDAFNALFKLSENMEFTVAITEV CCCEEEECHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEE TTKPFASNSILNAYIKKSSFTLNLWDHAMYYAIIKYFQKVQSCKITHLKNWLRILRNIIY ECCCCCCCHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHH NTYIQNPENLYIALNTIDNLFNEHFLDSVLLSDIINADNFELRFFNQNQLNEEKTKGRLL HHHCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHCCCC KNEQWHSCIDKLEKHPYFYGQINFIFNLCQSDGGDNYNYEQFESYSKVLYLLFEKDTEEF CCCHHHHHHHHHHHCCEEEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHH LLQRALLSLGDYLIKVNSNWTFCKTDTDSLRSRNENWRRVFIQDDKLKILELLILEIIKR HHHHHHHHHCCEEEEECCCEEEEECCHHHHHCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCC ENIRLDFNSILIDIINSHQYNIDQWEYYFVESAYPLQQSKLMEIRWNNNDDIRLLPAKTI CCCEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEEECHHH IGYHLELRTIFLLKFIYKKLINIEPFEKIEFLWDKGSTGHPGISITGYEFSNKTYRLDIR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHEECCCCCCCCCEEEEEEEECCCEEEEEEE YSLNKNIYDFCFYNEADIIRNRLANQLIVNNLTDYNYDDNFKHYFKQIHFSNIVQEIQTL EECCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH CTNLKTIS HHHCCCCC >Mature Secondary Structure MMKNYSFFELINQYIIEIPIIQRDYAQGREQENVTYIREKFVSNLVSSIIKGEPIHLGFI CCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEECHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEE YGKVEGKDELEKMKLHSEAVEKLLSTVKQYANQFNINVDSTISTEVITLKNTLRFIPLDG EEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEECCEEEEECCC QQRLTTLFLLYWYINMRKGNGHGNWLTNFKYNNRKSALAFFDELSSNDNILKIRSDIDSK HHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCEECEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCC NKINIKDQISKYIWYLSKWDYDATVNGAIVMLEQIHKEFSKSPELNFKEIELKTLSFTFD CCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEEEEEE FFDLHELNQSDELYIKMNERGKQLTDFEHFKAWLQNFTEKKYDSGEQKIFLRDFWVKIDT HHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHH IWLDFFWKNLDVDYTGLDDLYFNFLKTMALNYHLGSGKEREIPDFLKSLVQDIRNTDSYD HEEEHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCC REKVQYIPISKFLSKIKREDHNDFLFELFSYEALEFITDAFNALFKLSENMEFTVAITEV CCCEEEECHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEE TTKPFASNSILNAYIKKSSFTLNLWDHAMYYAIIKYFQKVQSCKITHLKNWLRILRNIIY ECCCCCCCHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHH NTYIQNPENLYIALNTIDNLFNEHFLDSVLLSDIINADNFELRFFNQNQLNEEKTKGRLL HHHCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHCCCC KNEQWHSCIDKLEKHPYFYGQINFIFNLCQSDGGDNYNYEQFESYSKVLYLLFEKDTEEF CCCHHHHHHHHHHHCCEEEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHH LLQRALLSLGDYLIKVNSNWTFCKTDTDSLRSRNENWRRVFIQDDKLKILELLILEIIKR HHHHHHHHHCCEEEEECCCEEEEECCHHHHHCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCC ENIRLDFNSILIDIINSHQYNIDQWEYYFVESAYPLQQSKLMEIRWNNNDDIRLLPAKTI CCCEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEEECHHH IGYHLELRTIFLLKFIYKKLINIEPFEKIEFLWDKGSTGHPGISITGYEFSNKTYRLDIR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHEECCCCCCCCCEEEEEEEECCCEEEEEEE YSLNKNIYDFCFYNEADIIRNRLANQLIVNNLTDYNYDDNFKHYFKQIHFSNIVQEIQTL EECCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH CTNLKTIS HHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA