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The map label for this gene is 138895297

Identifier: 138895297

GI number: 138895297

Start: 1728128

End: 1729540

Strand: Reverse

Name: 138895297

Synonym: GTNG_1641

Alternate gene names: NA

Gene position: 1729540-1728128 (Counterclockwise)

Preceding gene: 138895298

Following gene: 138895296

Centisome position: 48.72

GC content: 53.08

Gene sequence:

>1413_bases
GTGGAAGGAACATGGTGGTCGCTATTGCCTTTTCTTCTCATCATTCCACTCGCTATTTGGCTGAAAGAAATTTTGCCTGG
GTTGGTGGTCGGCCTGCTCGTAGGGGCGCTCTGTCTGGAACAGTCGGTCATTGGTGCTATCGAGCGGGCTGTTTCCGCCA
TTCTTCGTTCTCTCAGCGATCTTGAACATATAAAAATCGCTGCGTTTCTCTATTTGTTCGGTTCGCTTGTCGGCATGATG
CAAATTACCGGCGGGGTCAAAGGATTCGTCGAGAGGCTTTCCGGGCGCATCCACACGAAGCGTGGACTGCTTTTATTTGT
TTGGCTGACGGTGCCAGTGACGTTTTTCATGCCGATGTTCCGCATTATGCTGCTTGGTCCAGTGATGAAAGCCGTGCTTC
GCCAGTTTCGCATCGACCGCCGCCGCATGGCGTACATCATCGATGTTTCGACCGAGCCGATCATCGTGCTTTTGCCGGCA
GCGACGGCGTTTGTCGGTTTTATGACTTCGGTCGTGGCGGCAGCGCTGGCACAAAACGATATTGGTGAATCGGCATATGA
TATCTTTTTGCGTAGCTTGCCGTACAACTTGTTTGCCATCATCGCTCTTATTGTCGGGTTGTTGACGACGATGTTGAACA
TTCGGATTGGTAAACCGCGGGCGAAAAAAGGGGAAGGGGAAACGAATGAATTGCACGGTCTCGGGCTGCGCAAAGAACTG
GCACTGATCGCCGGAGAGCCGCTTCATCTCTTCGTGCCGTTAGCGTTGTTGCTTGGATTGACGTTTGCCTTTTTTGTCTA
TGACGGACGGCAACGCGGGGCAAGTGATTGGCTTGAGGCGTTTTCCGAAGCCGATGCGACATGGGCGATGTTGCTGGCAC
TGTTTGTGACGATTCTTTTGTCGATGGTGTTTTATTTGTGGCGCAGGCAGTCGCTCTCGGAGCTGATTTATCATTTTTTT
GCCGGAGGCAACGAGCTCATGGCGCCGATCGGCATGTTGATTCTCGTTTGGGCTGTATCGGCGGTGGCGGGTGAGCTCGG
ATTTACCACTTACGTGGCATCGACGTTCGGCACGTGGATTCCGGGGCCGTTCGTGCCGGCGGCGGTGTTTTTAGCCGGTT
CGTTTCTGTCTTATTTTATCGGATCGTCATGGGGGACATGGGGCATTTTTATGCCGCTTGGCGTCACACTTGCCCATGCG
ACCGGAGCGCCGCTTGAGATGACGGTCGGCGCCGTGTTTGCAAGTGGAACGTTCGGGGCATTCGCTTCGCCGCTTGGCGA
TACAACGATTACGACCGCAGCAATTATGGATATGGATTTAATGGGCTATGCCAAATACAAACTGCGCATCTCTCTTATTT
GCGCTGGTTTATCGCTTGCCGGATACGTATTTTTGCCGCTTTGGGCCGGTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAAAAAATAAAACTATGTTCTAAATAATCAATTAAAATCATAAACAATCACAGTTATGGCTATCCTTGTTAACAGCGGCA
TCAGAAAGGGGGACGCCGAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAGGAGCAGGTTCCGGCCCATTCTTTTCTAACATTTATAAAATAAAACCATGTTCTAAATAATCAATGAAAACAAAACAG
TTGCATTCCATAAGCAAGTC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 470; Mature: 470

Protein sequence:

>470_residues
MEGTWWSLLPFLLIIPLAIWLKEILPGLVVGLLVGALCLEQSVIGAIERAVSAILRSLSDLEHIKIAAFLYLFGSLVGMM
QITGGVKGFVERLSGRIHTKRGLLLFVWLTVPVTFFMPMFRIMLLGPVMKAVLRQFRIDRRRMAYIIDVSTEPIIVLLPA
ATAFVGFMTSVVAAALAQNDIGESAYDIFLRSLPYNLFAIIALIVGLLTTMLNIRIGKPRAKKGEGETNELHGLGLRKEL
ALIAGEPLHLFVPLALLLGLTFAFFVYDGRQRGASDWLEAFSEADATWAMLLALFVTILLSMVFYLWRRQSLSELIYHFF
AGGNELMAPIGMLILVWAVSAVAGELGFTTYVASTFGTWIPGPFVPAAVFLAGSFLSYFIGSSWGTWGIFMPLGVTLAHA
TGAPLEMTVGAVFASGTFGAFASPLGDTTITTAAIMDMDLMGYAKYKLRISLICAGLSLAGYVFLPLWAG

Sequences:

>Translated_470_residues
MEGTWWSLLPFLLIIPLAIWLKEILPGLVVGLLVGALCLEQSVIGAIERAVSAILRSLSDLEHIKIAAFLYLFGSLVGMM
QITGGVKGFVERLSGRIHTKRGLLLFVWLTVPVTFFMPMFRIMLLGPVMKAVLRQFRIDRRRMAYIIDVSTEPIIVLLPA
ATAFVGFMTSVVAAALAQNDIGESAYDIFLRSLPYNLFAIIALIVGLLTTMLNIRIGKPRAKKGEGETNELHGLGLRKEL
ALIAGEPLHLFVPLALLLGLTFAFFVYDGRQRGASDWLEAFSEADATWAMLLALFVTILLSMVFYLWRRQSLSELIYHFF
AGGNELMAPIGMLILVWAVSAVAGELGFTTYVASTFGTWIPGPFVPAAVFLAGSFLSYFIGSSWGTWGIFMPLGVTLAHA
TGAPLEMTVGAVFASGTFGAFASPLGDTTITTAAIMDMDLMGYAKYKLRISLICAGLSLAGYVFLPLWAG
>Mature_470_residues
MEGTWWSLLPFLLIIPLAIWLKEILPGLVVGLLVGALCLEQSVIGAIERAVSAILRSLSDLEHIKIAAFLYLFGSLVGMM
QITGGVKGFVERLSGRIHTKRGLLLFVWLTVPVTFFMPMFRIMLLGPVMKAVLRQFRIDRRRMAYIIDVSTEPIIVLLPA
ATAFVGFMTSVVAAALAQNDIGESAYDIFLRSLPYNLFAIIALIVGLLTTMLNIRIGKPRAKKGEGETNELHGLGLRKEL
ALIAGEPLHLFVPLALLLGLTFAFFVYDGRQRGASDWLEAFSEADATWAMLLALFVTILLSMVFYLWRRQSLSELIYHFF
AGGNELMAPIGMLILVWAVSAVAGELGFTTYVASTFGTWIPGPFVPAAVFLAGSFLSYFIGSSWGTWGIFMPLGVTLAHA
TGAPLEMTVGAVFASGTFGAFASPLGDTTITTAAIMDMDLMGYAKYKLRISLICAGLSLAGYVFLPLWAG

Specific function: Unknown

COG id: COG1757

COG function: function code C; Na+/H+ antiporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR018461 [H]

Pfam domain/function: PF03553 Na_H_antiporter [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 51158; Mature: 51158

Theoretical pI: Translated: 8.19; Mature: 8.19

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
4.0 %Met     (Translated Protein)
4.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
4.0 %Met     (Mature Protein)
4.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEGTWWSLLPFLLIIPLAIWLKEILPGLVVGLLVGALCLEQSVIGAIERAVSAILRSLSD
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LEHIKIAAFLYLFGSLVGMMQITGGVKGFVERLSGRIHTKRGLLLFVWLTVPVTFFMPMF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RIMLLGPVMKAVLRQFRIDRRRMAYIIDVSTEPIIVLLPAATAFVGFMTSVVAAALAQND
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHEEEEEEECCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
IGESAYDIFLRSLPYNLFAIIALIVGLLTTMLNIRIGKPRAKKGEGETNELHGLGLRKEL
CCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCHHHHH
ALIAGEPLHLFVPLALLLGLTFAFFVYDGRQRGASDWLEAFSEADATWAMLLALFVTILL
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH
SMVFYLWRRQSLSELIYHFFAGGNELMAPIGMLILVWAVSAVAGELGFTTYVASTFGTWI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
PGPFVPAAVFLAGSFLSYFIGSSWGTWGIFMPLGVTLAHATGAPLEMTVGAVFASGTFGA
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHH
FASPLGDTTITTAAIMDMDLMGYAKYKLRISLICAGLSLAGYVFLPLWAG
HHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHEECCC
>Mature Secondary Structure
MEGTWWSLLPFLLIIPLAIWLKEILPGLVVGLLVGALCLEQSVIGAIERAVSAILRSLSD
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LEHIKIAAFLYLFGSLVGMMQITGGVKGFVERLSGRIHTKRGLLLFVWLTVPVTFFMPMF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RIMLLGPVMKAVLRQFRIDRRRMAYIIDVSTEPIIVLLPAATAFVGFMTSVVAAALAQND
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHEEEEEEECCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
IGESAYDIFLRSLPYNLFAIIALIVGLLTTMLNIRIGKPRAKKGEGETNELHGLGLRKEL
CCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCHHHHH
ALIAGEPLHLFVPLALLLGLTFAFFVYDGRQRGASDWLEAFSEADATWAMLLALFVTILL
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH
SMVFYLWRRQSLSELIYHFFAGGNELMAPIGMLILVWAVSAVAGELGFTTYVASTFGTWI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
PGPFVPAAVFLAGSFLSYFIGSSWGTWGIFMPLGVTLAHATGAPLEMTVGAVFASGTFGA
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHH
FASPLGDTTITTAAIMDMDLMGYAKYKLRISLICAGLSLAGYVFLPLWAG
HHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHEECCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]