| Definition | Geobacillus thermodenitrificans NG80-2 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009328 |
| Length | 3,550,319 |
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The map label for this gene is 138894432
Identifier: 138894432
GI number: 138894432
Start: 831077
End: 833890
Strand: Direct
Name: 138894432
Synonym: GTNG_0760
Alternate gene names: NA
Gene position: 831077-833890 (Clockwise)
Preceding gene: 138894431
Following gene: 138894433
Centisome position: 23.41
GC content: 27.58
Gene sequence:
>2814_bases TTGTATGATATTGCTAAAGACGCAATTAATTCTAATCGGAATAATGCTTATTTATTTATTCTTTGGGCTGCCTTTAAACA TATTGATAAAGGTGGAAAAATCAGCAAATATATTAAAGACGAATTAGCTAATCTGGAATTAGAAAAATTTGATTTTGATC AAAGAAAAAAGAAAGCATCGAGAATTCTTGAGAAAATTGGCAAAAGAGAAAAAAGTGTATTAACAACTAAAAAAGATTTA CGTATAAATAGTGTTCAAATAAAAAATTTTAAAGGATTTGGGCAAATCAGCGATGAAGACAGGGGTGTGTTATTTGAATT TAATAAGTATAAAAATATTCTGTTCGCACCGAATGGTGGAGGAAAAACTTCTTTTTGTGAGGCGCTTGAATATGCATTAA CAAATAATATTAAAGAATGTGTTCGAAGAAATATTCCTTTAAAACGTTATATCAGTAGAGACAATAAGAATCCTAAAATA GAAATAAAATTCAATAAAAGAGATATTTGCACCGATAATTTTACAAGAGAGGATCATGCTTTTTTTGAACAGTGTTTTAT CGAGAGAAACCGTTTAAATGAATTTGCTTTTCTTGGCTCGAAGGATACTAAAACAAACGAAAGAGATATAATGGCTATTA TTTTAGGACTAAATGAACTTGAGGAATTAATTAATTCCTTTGTTCAACCCAAACAATTTAATTTAGATGAATACAAGAAA TTTCAAATAAATAATCGAATCAGTGAATTAGAAGCAAAAAAAATTAATTTACAAAAACAAATAGAATTGTTTAATGACAA AATAAAAAAATTATTTAATCAATATGACATTCAGTCGATTGATCAGATCTCTGAATTAATTATTTCAAAAGAAAGAGAAT TGGAAATCTTGAATAAAGAAATTAATTCATATAGTGAAGGGCTAAAGGAGCAAAACTTCGAAGAATTAGTTTCAAAACTA AAAGAAAAAATTTCCCATTTTGAAATGTTACAAAAGCAGATTGAGAAAGATATAGTTTCTTTAAATTTAGAAGAGTTTTA TAATGCATTATTAAAAATAGAATCTGGTGATTTTTGTCCAGCATGCAATACACCGCTTAGTCAGACTGTTAACGATCCTT TTTTAAAGGCTAGAAAAGAGTTAGAAAATCTTAAGTCTATTCGAGAAGCAAAATTAAAAATGAACAGTTTAATGTCAGAA ATAGATAAATTTTTTATTTATTTAATCACAGAGTTAGACAATTATAATAACAACATTAAGATTAATTCAGATTTAAGAAC AGATTCTCTAGACAATTTGATTCATAATTTTTATATTCAATCTAAGCAAAGAACTGATGATAAATTGAATGTCTGTAAGG AATTCATTGAATTGTATTCAAGTAACCACGATCAGTTTCTTAAATACAAGGAAAAGTTGGATCATTTGTTAACAAAAGCA ATAGAAGAAAAAGCACTAGTGGAACAGAAAAAAGAAAAATTAGATAAGATTTCAAATGAAATTGATGATTTAAAAAGAGT AAAAACGCTGTATGAAAGTTATGTAGACAATATAGATGAATTAAATAATGAAATGATCAATAACGAGAAAGAACATGAAA TGTTAAAAATTCAGAAAATGAAAGAAGATGAATTTAACCAATTTGTTGATCAAGTGCAAATACAGTATGTAACATTTCTA AATGATTTAAAAGAATACAAAAGGAGATTAGAGCAACAAAAATTAGACAGTATTGAAAAAGAAGTGGTTTATTATTATCA ACAAATTAACAAATTTGATCAAGATTTTGAATTTGTTACTGATATTGAATTTAAAGAAAATGGAGATAAATACAGTATTG TATTGAGAACTAAACAAGAGAAAGAAGTTAATGCGTCCTCATTTTTAAGTGAAGGACATATGAGAGCATTAGGGTTCTCA ATTATGTTAGCCATAGCCAAGAAATACGAATTACCTTTTTTAATATTTGATGATGTAGTTAACGCTATCGATTCCGATCA TAGAGCTAACATCATTGACTTGATGTATAATGATGACTATCTTAACAAAACCCAGCTAATAATTACTACCCATGATCGAT TGTTTTGGGAGAGGTTTTCTAATACATATGCACAGTTTAAAAATGTTAAAGGTGATGGCACTGAACTAGTTAGCATTATT TTAAACAATACGAATAAAGGAATTGTTGGGATCCAATATAACGTAAGTTTTCAAGATAAAATTGAAAAAGCACTACAAAA TTATGATATTAGACAAGCTTTGATTTATTGCCGTATTTGGTTTGAAACCTTAGCTGTACAATTTTGTGTAGAAAGAGGGG AAGAAATAAAGGGTAAGTTCAGGAGGGATCAAAAGAGTAATTTATTAAAACCTTCATTAGAAAGTGTATATGGGGTATTA GAGAGGTCATTCCCCAATAGTAAGAATTTGGAAGTCATCAGAAAGGATTTGATAAACTGGCAAGGACAGAATCAAGAGCA TCATACTTTCGATGAGAATAGTTTTAATTTTGTACATTCTAAAAACAGCAATGAGGTGCAAATTATTTATGATGCGGTAA GGAGATTTTCTTATGAATTAAATAAGGAATTGTCAATAGAACGTTTAGAAAAAGAGTTATCTGAATTAGAGGAAAGAAAG TTAAATAAACAAACCTTATTATCAAATTCTAATTTTATAAATAAAGCCCCTGCAAGCTTGGTAGAAAAATATAAATTTGA ATTGGAATTAATAGAAAATAAAATCGAGCAAATTCGTATAGATTTATTTGAATTGAATAATCAGGAAGCACAAACTGGGG TAGAGATGACTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATCTATTTATTTTAAATATTCAGTCAATTTATGTGTATAAAAGATCCCATTAGACATGTAATATACCAGATTTATTGGGG GGATTTAATTGAGAAAATAT
Downstream 100 bases:
>100_bases GTACCTTAGATAAACGAAGGCTGGACGGCGTATTGGTATCAACGGATTTTACGGAAAATGGATCTAACGAGCGACGAGGC GATTGAATTTGCGAAATTAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: DNA Repair ATPase-Like Protein; SMC Domain Protein
Number of amino acids: Translated: 937; Mature: 937
Protein sequence:
>937_residues MYDIAKDAINSNRNNAYLFILWAAFKHIDKGGKISKYIKDELANLELEKFDFDQRKKKASRILEKIGKREKSVLTTKKDL RINSVQIKNFKGFGQISDEDRGVLFEFNKYKNILFAPNGGGKTSFCEALEYALTNNIKECVRRNIPLKRYISRDNKNPKI EIKFNKRDICTDNFTREDHAFFEQCFIERNRLNEFAFLGSKDTKTNERDIMAIILGLNELEELINSFVQPKQFNLDEYKK FQINNRISELEAKKINLQKQIELFNDKIKKLFNQYDIQSIDQISELIISKERELEILNKEINSYSEGLKEQNFEELVSKL KEKISHFEMLQKQIEKDIVSLNLEEFYNALLKIESGDFCPACNTPLSQTVNDPFLKARKELENLKSIREAKLKMNSLMSE IDKFFIYLITELDNYNNNIKINSDLRTDSLDNLIHNFYIQSKQRTDDKLNVCKEFIELYSSNHDQFLKYKEKLDHLLTKA IEEKALVEQKKEKLDKISNEIDDLKRVKTLYESYVDNIDELNNEMINNEKEHEMLKIQKMKEDEFNQFVDQVQIQYVTFL NDLKEYKRRLEQQKLDSIEKEVVYYYQQINKFDQDFEFVTDIEFKENGDKYSIVLRTKQEKEVNASSFLSEGHMRALGFS IMLAIAKKYELPFLIFDDVVNAIDSDHRANIIDLMYNDDYLNKTQLIITTHDRLFWERFSNTYAQFKNVKGDGTELVSII LNNTNKGIVGIQYNVSFQDKIEKALQNYDIRQALIYCRIWFETLAVQFCVERGEEIKGKFRRDQKSNLLKPSLESVYGVL ERSFPNSKNLEVIRKDLINWQGQNQEHHTFDENSFNFVHSKNSNEVQIIYDAVRRFSYELNKELSIERLEKELSELEERK LNKQTLLSNSNFINKAPASLVEKYKFELELIENKIEQIRIDLFELNNQEAQTGVEMT
Sequences:
>Translated_937_residues MYDIAKDAINSNRNNAYLFILWAAFKHIDKGGKISKYIKDELANLELEKFDFDQRKKKASRILEKIGKREKSVLTTKKDL RINSVQIKNFKGFGQISDEDRGVLFEFNKYKNILFAPNGGGKTSFCEALEYALTNNIKECVRRNIPLKRYISRDNKNPKI EIKFNKRDICTDNFTREDHAFFEQCFIERNRLNEFAFLGSKDTKTNERDIMAIILGLNELEELINSFVQPKQFNLDEYKK FQINNRISELEAKKINLQKQIELFNDKIKKLFNQYDIQSIDQISELIISKERELEILNKEINSYSEGLKEQNFEELVSKL KEKISHFEMLQKQIEKDIVSLNLEEFYNALLKIESGDFCPACNTPLSQTVNDPFLKARKELENLKSIREAKLKMNSLMSE IDKFFIYLITELDNYNNNIKINSDLRTDSLDNLIHNFYIQSKQRTDDKLNVCKEFIELYSSNHDQFLKYKEKLDHLLTKA IEEKALVEQKKEKLDKISNEIDDLKRVKTLYESYVDNIDELNNEMINNEKEHEMLKIQKMKEDEFNQFVDQVQIQYVTFL NDLKEYKRRLEQQKLDSIEKEVVYYYQQINKFDQDFEFVTDIEFKENGDKYSIVLRTKQEKEVNASSFLSEGHMRALGFS IMLAIAKKYELPFLIFDDVVNAIDSDHRANIIDLMYNDDYLNKTQLIITTHDRLFWERFSNTYAQFKNVKGDGTELVSII LNNTNKGIVGIQYNVSFQDKIEKALQNYDIRQALIYCRIWFETLAVQFCVERGEEIKGKFRRDQKSNLLKPSLESVYGVL ERSFPNSKNLEVIRKDLINWQGQNQEHHTFDENSFNFVHSKNSNEVQIIYDAVRRFSYELNKELSIERLEKELSELEERK LNKQTLLSNSNFINKAPASLVEKYKFELELIENKIEQIRIDLFELNNQEAQTGVEMT >Mature_937_residues MYDIAKDAINSNRNNAYLFILWAAFKHIDKGGKISKYIKDELANLELEKFDFDQRKKKASRILEKIGKREKSVLTTKKDL RINSVQIKNFKGFGQISDEDRGVLFEFNKYKNILFAPNGGGKTSFCEALEYALTNNIKECVRRNIPLKRYISRDNKNPKI EIKFNKRDICTDNFTREDHAFFEQCFIERNRLNEFAFLGSKDTKTNERDIMAIILGLNELEELINSFVQPKQFNLDEYKK FQINNRISELEAKKINLQKQIELFNDKIKKLFNQYDIQSIDQISELIISKERELEILNKEINSYSEGLKEQNFEELVSKL KEKISHFEMLQKQIEKDIVSLNLEEFYNALLKIESGDFCPACNTPLSQTVNDPFLKARKELENLKSIREAKLKMNSLMSE IDKFFIYLITELDNYNNNIKINSDLRTDSLDNLIHNFYIQSKQRTDDKLNVCKEFIELYSSNHDQFLKYKEKLDHLLTKA IEEKALVEQKKEKLDKISNEIDDLKRVKTLYESYVDNIDELNNEMINNEKEHEMLKIQKMKEDEFNQFVDQVQIQYVTFL NDLKEYKRRLEQQKLDSIEKEVVYYYQQINKFDQDFEFVTDIEFKENGDKYSIVLRTKQEKEVNASSFLSEGHMRALGFS IMLAIAKKYELPFLIFDDVVNAIDSDHRANIIDLMYNDDYLNKTQLIITTHDRLFWERFSNTYAQFKNVKGDGTELVSII LNNTNKGIVGIQYNVSFQDKIEKALQNYDIRQALIYCRIWFETLAVQFCVERGEEIKGKFRRDQKSNLLKPSLESVYGVL ERSFPNSKNLEVIRKDLINWQGQNQEHHTFDENSFNFVHSKNSNEVQIIYDAVRRFSYELNKELSIERLEKELSELEERK LNKQTLLSNSNFINKAPASLVEKYKFELELIENKIEQIRIDLFELNNQEAQTGVEMT
Specific function: Unknown
COG id: COG0419
COG function: function code L; ATPase involved in DNA repair
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 110945; Mature: 110945
Theoretical pI: Translated: 5.66; Mature: 5.66
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.0 %Cys (Translated Protein) 1.3 %Met (Translated Protein) 2.2 %Cys+Met (Translated Protein) 1.0 %Cys (Mature Protein) 1.3 %Met (Mature Protein) 2.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MYDIAKDAINSNRNNAYLFILWAAFKHIDKGGKISKYIKDELANLELEKFDFDQRKKKAS CCCCHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHCCCHHHHHHHH RILEKIGKREKSVLTTKKDLRINSVQIKNFKGFGQISDEDRGVLFEFNKYKNILFAPNGG HHHHHHCCHHHHHHCCHHCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCEEECCCCC GKTSFCEALEYALTNNIKECVRRNIPLKRYISRDNKNPKIEIKFNKRDICTDNFTREDHA CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCHHHH FFEQCFIERNRLNEFAFLGSKDTKTNERDIMAIILGLNELEELINSFVQPKQFNLDEYKK HHHHHHHHHHCCCHHHEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHH FQINNRISELEAKKINLQKQIELFNDKIKKLFNQYDIQSIDQISELIISKERELEILNKE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH INSYSEGLKEQNFEELVSKLKEKISHFEMLQKQIEKDIVSLNLEEFYNALLKIESGDFCP HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHEECCCCCCC ACNTPLSQTVNDPFLKARKELENLKSIREAKLKMNSLMSEIDKFFIYLITELDNYNNNIK CCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEE INSDLRTDSLDNLIHNFYIQSKQRTDDKLNVCKEFIELYSSNHDQFLKYKEKLDHLLTKA ECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH IEEKALVEQKKEKLDKISNEIDDLKRVKTLYESYVDNIDELNNEMINNEKEHEMLKIQKM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH KEDEFNQFVDQVQIQYVTFLNDLKEYKRRLEQQKLDSIEKEVVYYYQQINKFDQDFEFVT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHC DIEFKENGDKYSIVLRTKQEKEVNASSFLSEGHMRALGFSIMLAIAKKYELPFLIFDDVV CCEECCCCCEEEEEEEECCHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHH NAIDSDHRANIIDLMYNDDYLNKTQLIITTHDRLFWERFSNTYAQFKNVKGDGTELVSII HHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH LNNTNKGIVGIQYNVSFQDKIEKALQNYDIRQALIYCRIWFETLAVQFCVERGEEIKGKF CCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH RRDQKSNLLKPSLESVYGVLERSFPNSKNLEVIRKDLINWQGQNQEHHTFDENSFNFVHS HCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEC KNSNEVQIIYDAVRRFSYELNKELSIERLEKELSELEERKLNKQTLLSNSNFINKAPASL CCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCCCHHHH VEKYKFELELIENKIEQIRIDLFELNNQEAQTGVEMT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCCCCC >Mature Secondary Structure MYDIAKDAINSNRNNAYLFILWAAFKHIDKGGKISKYIKDELANLELEKFDFDQRKKKAS CCCCHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHCCCHHHHHHHH RILEKIGKREKSVLTTKKDLRINSVQIKNFKGFGQISDEDRGVLFEFNKYKNILFAPNGG HHHHHHCCHHHHHHCCHHCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCEEECCCCC GKTSFCEALEYALTNNIKECVRRNIPLKRYISRDNKNPKIEIKFNKRDICTDNFTREDHA CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCHHHH FFEQCFIERNRLNEFAFLGSKDTKTNERDIMAIILGLNELEELINSFVQPKQFNLDEYKK HHHHHHHHHHCCCHHHEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHH FQINNRISELEAKKINLQKQIELFNDKIKKLFNQYDIQSIDQISELIISKERELEILNKE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH INSYSEGLKEQNFEELVSKLKEKISHFEMLQKQIEKDIVSLNLEEFYNALLKIESGDFCP HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHEECCCCCCC ACNTPLSQTVNDPFLKARKELENLKSIREAKLKMNSLMSEIDKFFIYLITELDNYNNNIK CCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEE INSDLRTDSLDNLIHNFYIQSKQRTDDKLNVCKEFIELYSSNHDQFLKYKEKLDHLLTKA ECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH IEEKALVEQKKEKLDKISNEIDDLKRVKTLYESYVDNIDELNNEMINNEKEHEMLKIQKM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH KEDEFNQFVDQVQIQYVTFLNDLKEYKRRLEQQKLDSIEKEVVYYYQQINKFDQDFEFVT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHC DIEFKENGDKYSIVLRTKQEKEVNASSFLSEGHMRALGFSIMLAIAKKYELPFLIFDDVV CCEECCCCCEEEEEEEECCHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHH NAIDSDHRANIIDLMYNDDYLNKTQLIITTHDRLFWERFSNTYAQFKNVKGDGTELVSII HHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH LNNTNKGIVGIQYNVSFQDKIEKALQNYDIRQALIYCRIWFETLAVQFCVERGEEIKGKF CCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH RRDQKSNLLKPSLESVYGVLERSFPNSKNLEVIRKDLINWQGQNQEHHTFDENSFNFVHS HCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEC KNSNEVQIIYDAVRRFSYELNKELSIERLEKELSELEERKLNKQTLLSNSNFINKAPASL CCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCCCHHHH VEKYKFELELIENKIEQIRIDLFELNNQEAQTGVEMT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA