| Definition | Geobacillus thermodenitrificans NG80-2 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009328 |
| Length | 3,550,319 |
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The map label for this gene is yhgE [H]
Identifier: 138894247
GI number: 138894247
Start: 634285
End: 636669
Strand: Direct
Name: yhgE [H]
Synonym: GTNG_0573
Alternate gene names: 138894247
Gene position: 634285-636669 (Clockwise)
Preceding gene: 138894246
Following gene: 138894248
Centisome position: 17.87
GC content: 51.82
Gene sequence:
>2385_bases ATGTTGATAAAAGAACTGCGCACGATTATCTTCCGCCCGAAAGTGCTCATTCCGATTCTAGCGATTTTGCTCATTCCTCT TCTTTATAGCGGATCGTTTTTATGGGCGTTTTGGGATCCGTACGGCCATGTAGATCAGCTGCCGGTGGCGGTCGTCAATG AAGATAAGGGAGCGGTGCTTGACGGCAAGAAAATTAACCTTGGCGACGATGTGGTAAAGCGGCTGAAAGAAAATGGAACG TTTGATTGGCAGTTCGTCAGTCGCAAGCAAGTGGATGATGGTTTGAAGAACCAAAGGTATTACATGGCCGTCATTATTCC CAGTGATTTTTCTGCTAACGCAACAACGGTGCAAAGCGGCAACCCAAAGCCGCTGAGACTCGTATACATCCCAAATGAAG GGGCGAATTATTTAGCTGGAAAGATTGGCGATTCTGCCATTGAGGCAATAAAAGAAGAAATTTCGAAAAATGTAACAAAA ACGTATGCAGAAACAATGTTGACGAACATGAAGGCAGCAGCCGACGGGCTCGATAAGGCAAGTCAAGGAGCAAATCAGCT GCACGATGGGCTCCGAACAGCGGGACAAGGAAGCCGTTCACTTTCCGACGGAATGGAAGCGGCGGAGCGAGGAAGCGCTA GTTTGGCCGCTGGAGCGGAAAAAGTCAAGGACGGGGCGTCTGATTTGTCCCATTATTTAACCGAGTTAGCTGAGAAATCA TTGACGTTTGAAAACGGGTTACAAGAGGCGAGTGACGGGGCAAAACAACTACAAACTGGAGCGACGGCACTTCAGGATGG GCTTGGAAAATTGGCAGTCGGCAGCCAAAAACTTGCTTCTGGCGCTGTAGAAGCTCAAAATGGGGCATCGTCGCTCGCGA ATGGATTGCACACTTCGCTTCATAGTATGAAAGAACTGCAATCACAATTGCCATCTCTCACTAGTGGGGCGAACGAGCTT CGTGACGGGGCGGCTGAGCTGGGTGAAGGAATTCAAGCGTGGCAACAAAAGGCGGGTGAGGCGGCTGACGGAGCGAGTGA AGTGAACATAGGGCTGCAGCAGTATGCGGCTCAACTTGAAAGGCTGATTGAGCAAACGGACGATCCGCAGCAAAAAGCAA CTTTGCAGACGCTTTATGAGCAGCTTCAACCGCTTGTAAAGGGAAGCGAGAGTGTAGCAACTGGCATTCGCGGGCTAGCT GACCAAGCGGGACGCATCAAAAACGGTGCTTCTCAGCTTGCTGACGGTGCAGCGGCGTTCGCTTCGGGGCAGCAGGCAGT GCAAGAAGGCATCGGAAAGCTCGTTAACGGACAACAGCAGCTTGTCGATGGCGCTGATCGCTTAGTGGCCGGCCAACAAA CACTGGTCGATGGTGCGAAGGAGCTTGAAAACCAGCTTCAATCCGCTTATCAAGGGGCACAAACAGTCGCAGTCGGCAGC AGCAAGCTGGCTGATGGAGTCAACCAACTTGCTACTGGTTCCAGCCAGCTTGTTTCCGGAACAAGTGAGTTGGCGGACGG GGCGAACAAACTTTCCGACGGCGTTTCTGCTGTGGCTGAAGGTGCGACTTCGCTCCATCAAGGATTTGATAGTCTTCTCC GCGGTGGACGATCGCTGTCAACCGGACTCGTACGGCTTGAACAAGGAGCGGGTGAGTTGGCTGACCGCTTAAGCGAAGGA GCGGAAAAGGCAGATAGTATTCAAGCGAACGAGCGTGTATCCGAGATGATCGCAGATCCAGTACAAAACGACAAACGGCC ACTCCACCACGTGCCGAATTATGGAACTGGCTTTGCTCCGTACTTTTTATCGCTTGGCTTGTTTGTTGGGGCTCTGCTAT TGACGATCGTCTTTCCGTTGCGTGAACCAGTCGAACGGCCGTCGTCCGGGGTGGCTTGGTTTTTTGGAAAATGGGGAGTA TTGGCTATTGTGTCGGCGGCACAAACACTGTTGGCCGATGCATGGGTGTTGTACGGGCTTGACTTGCATGTACAAAGCGT TTGGCGCTTCCTGCTGTTTACGTGGATCATTAGTATGGCATTTATGATGATTGTCCAATTTCTCGTCACCTTGTTTGACA ATCCGGGCCGGTTCCTGGCCATTTTGCTGCTCATCGCCCAGCTTATAGGAAGCGCCGGCACGTACCCACTTGAGCTCATT CCGGACGCACTGCAATCGCTTCATCCGTGGTTGCCGATGACCCATGCCATCCATGGGCTGCGGACCGTTATTTCGGGCGG TGATTTCGTGTTAATGTGGAAGGAGGCGGCGATATTGGCTATAGTGGCGACAGTCTTTGCTTTAGGGACACTTGCGTATT TCTGCCTTCTTTATCGCCGCCGCTATGCGGTATGGACAGAAACTGAAACAACGGTTGAAGCGTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATTTTTTACAAGGATTGTCCAAGTAGATAATCCTATCTTTTTTTGATCTTTTTGACTAAATGAACGAATTGGTCATTTAT TTAAAGGAGGGAGCCACTCT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTGGTTTTGACTTGAAGAGCGTCATTTCATGAGCAAAGGGTTGATCCCAAAAGGTTGTAAAACGTCCTTTTGAGATCAGC CCTTTTGTTTGATTTTCATT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: ORFB [H]
Number of amino acids: Translated: 794; Mature: 794
Protein sequence:
>794_residues MLIKELRTIIFRPKVLIPILAILLIPLLYSGSFLWAFWDPYGHVDQLPVAVVNEDKGAVLDGKKINLGDDVVKRLKENGT FDWQFVSRKQVDDGLKNQRYYMAVIIPSDFSANATTVQSGNPKPLRLVYIPNEGANYLAGKIGDSAIEAIKEEISKNVTK TYAETMLTNMKAAADGLDKASQGANQLHDGLRTAGQGSRSLSDGMEAAERGSASLAAGAEKVKDGASDLSHYLTELAEKS LTFENGLQEASDGAKQLQTGATALQDGLGKLAVGSQKLASGAVEAQNGASSLANGLHTSLHSMKELQSQLPSLTSGANEL RDGAAELGEGIQAWQQKAGEAADGASEVNIGLQQYAAQLERLIEQTDDPQQKATLQTLYEQLQPLVKGSESVATGIRGLA DQAGRIKNGASQLADGAAAFASGQQAVQEGIGKLVNGQQQLVDGADRLVAGQQTLVDGAKELENQLQSAYQGAQTVAVGS SKLADGVNQLATGSSQLVSGTSELADGANKLSDGVSAVAEGATSLHQGFDSLLRGGRSLSTGLVRLEQGAGELADRLSEG AEKADSIQANERVSEMIADPVQNDKRPLHHVPNYGTGFAPYFLSLGLFVGALLLTIVFPLREPVERPSSGVAWFFGKWGV LAIVSAAQTLLADAWVLYGLDLHVQSVWRFLLFTWIISMAFMMIVQFLVTLFDNPGRFLAILLLIAQLIGSAGTYPLELI PDALQSLHPWLPMTHAIHGLRTVISGGDFVLMWKEAAILAIVATVFALGTLAYFCLLYRRRYAVWTETETTVEA
Sequences:
>Translated_794_residues MLIKELRTIIFRPKVLIPILAILLIPLLYSGSFLWAFWDPYGHVDQLPVAVVNEDKGAVLDGKKINLGDDVVKRLKENGT FDWQFVSRKQVDDGLKNQRYYMAVIIPSDFSANATTVQSGNPKPLRLVYIPNEGANYLAGKIGDSAIEAIKEEISKNVTK TYAETMLTNMKAAADGLDKASQGANQLHDGLRTAGQGSRSLSDGMEAAERGSASLAAGAEKVKDGASDLSHYLTELAEKS LTFENGLQEASDGAKQLQTGATALQDGLGKLAVGSQKLASGAVEAQNGASSLANGLHTSLHSMKELQSQLPSLTSGANEL RDGAAELGEGIQAWQQKAGEAADGASEVNIGLQQYAAQLERLIEQTDDPQQKATLQTLYEQLQPLVKGSESVATGIRGLA DQAGRIKNGASQLADGAAAFASGQQAVQEGIGKLVNGQQQLVDGADRLVAGQQTLVDGAKELENQLQSAYQGAQTVAVGS SKLADGVNQLATGSSQLVSGTSELADGANKLSDGVSAVAEGATSLHQGFDSLLRGGRSLSTGLVRLEQGAGELADRLSEG AEKADSIQANERVSEMIADPVQNDKRPLHHVPNYGTGFAPYFLSLGLFVGALLLTIVFPLREPVERPSSGVAWFFGKWGV LAIVSAAQTLLADAWVLYGLDLHVQSVWRFLLFTWIISMAFMMIVQFLVTLFDNPGRFLAILLLIAQLIGSAGTYPLELI PDALQSLHPWLPMTHAIHGLRTVISGGDFVLMWKEAAILAIVATVFALGTLAYFCLLYRRRYAVWTETETTVEA >Mature_794_residues MLIKELRTIIFRPKVLIPILAILLIPLLYSGSFLWAFWDPYGHVDQLPVAVVNEDKGAVLDGKKINLGDDVVKRLKENGT FDWQFVSRKQVDDGLKNQRYYMAVIIPSDFSANATTVQSGNPKPLRLVYIPNEGANYLAGKIGDSAIEAIKEEISKNVTK TYAETMLTNMKAAADGLDKASQGANQLHDGLRTAGQGSRSLSDGMEAAERGSASLAAGAEKVKDGASDLSHYLTELAEKS LTFENGLQEASDGAKQLQTGATALQDGLGKLAVGSQKLASGAVEAQNGASSLANGLHTSLHSMKELQSQLPSLTSGANEL RDGAAELGEGIQAWQQKAGEAADGASEVNIGLQQYAAQLERLIEQTDDPQQKATLQTLYEQLQPLVKGSESVATGIRGLA DQAGRIKNGASQLADGAAAFASGQQAVQEGIGKLVNGQQQLVDGADRLVAGQQTLVDGAKELENQLQSAYQGAQTVAVGS SKLADGVNQLATGSSQLVSGTSELADGANKLSDGVSAVAEGATSLHQGFDSLLRGGRSLSTGLVRLEQGAGELADRLSEG AEKADSIQANERVSEMIADPVQNDKRPLHHVPNYGTGFAPYFLSLGLFVGALLLTIVFPLREPVERPSSGVAWFFGKWGV LAIVSAAQTLLADAWVLYGLDLHVQSVWRFLLFTWIISMAFMMIVQFLVTLFDNPGRFLAILLLIAQLIGSAGTYPLELI PDALQSLHPWLPMTHAIHGLRTVISGGDFVLMWKEAAILAIVATVFALGTLAYFCLLYRRRYAVWTETETTVEA
Specific function: Unknown
COG id: COG1511
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: To L.lactis phage infection protein (PIP) [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR013525 - InterPro: IPR022703 - InterPro: IPR017501 - InterPro: IPR017500 [H]
Pfam domain/function: PF01061 ABC2_membrane; PF12051 DUF3533 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 84656; Mature: 84656
Theoretical pI: Translated: 4.88; Mature: 4.88
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 1.5 %Met (Translated Protein) 1.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 1.5 %Met (Mature Protein) 1.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLIKELRTIIFRPKVLIPILAILLIPLLYSGSFLWAFWDPYGHVDQLPVAVVNEDKGAVL CCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCCEEEEECCCCCEE DGKKINLGDDVVKRLKENGTFDWQFVSRKQVDDGLKNQRYYMAVIIPSDFSANATTVQSG CCCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCEECCC NPKPLRLVYIPNEGANYLAGKIGDSAIEAIKEEISKNVTKTYAETMLTNMKAAADGLDKA CCCCEEEEEECCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SQGANQLHDGLRTAGQGSRSLSDGMEAAERGSASLAAGAEKVKDGASDLSHYLTELAEKS HCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LTFENGLQEASDGAKQLQTGATALQDGLGKLAVGSQKLASGAVEAQNGASSLANGLHTSL CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH HSMKELQSQLPSLTSGANELRDGAAELGEGIQAWQQKAGEAADGASEVNIGLQQYAAQLE HHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH RLIEQTDDPQQKATLQTLYEQLQPLVKGSESVATGIRGLADQAGRIKNGASQLADGAAAF HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH ASGQQAVQEGIGKLVNGQQQLVDGADRLVAGQQTLVDGAKELENQLQSAYQGAQTVAVGS HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCC SKLADGVNQLATGSSQLVSGTSELADGANKLSDGVSAVAEGATSLHQGFDSLLRGGRSLS HHHHHHHHHHHCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH TGLVRLEQGAGELADRLSEGAEKADSIQANERVSEMIADPVQNDKRPLHHVPNYGTGFAP HHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCCCCCCCHHH YFLSLGLFVGALLLTIVFPLREPVERPSSGVAWFFGKWGVLAIVSAAQTLLADAWVLYGL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DLHVQSVWRFLLFTWIISMAFMMIVQFLVTLFDNPGRFLAILLLIAQLIGSAGTYPLELI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH PDALQSLHPWLPMTHAIHGLRTVISGGDFVLMWKEAAILAIVATVFALGTLAYFCLLYRR HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RYAVWTETETTVEA HHHEEECCCCCCCC >Mature Secondary Structure MLIKELRTIIFRPKVLIPILAILLIPLLYSGSFLWAFWDPYGHVDQLPVAVVNEDKGAVL CCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCCEEEEECCCCCEE DGKKINLGDDVVKRLKENGTFDWQFVSRKQVDDGLKNQRYYMAVIIPSDFSANATTVQSG CCCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCEECCC NPKPLRLVYIPNEGANYLAGKIGDSAIEAIKEEISKNVTKTYAETMLTNMKAAADGLDKA CCCCEEEEEECCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SQGANQLHDGLRTAGQGSRSLSDGMEAAERGSASLAAGAEKVKDGASDLSHYLTELAEKS HCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LTFENGLQEASDGAKQLQTGATALQDGLGKLAVGSQKLASGAVEAQNGASSLANGLHTSL CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH HSMKELQSQLPSLTSGANELRDGAAELGEGIQAWQQKAGEAADGASEVNIGLQQYAAQLE HHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH RLIEQTDDPQQKATLQTLYEQLQPLVKGSESVATGIRGLADQAGRIKNGASQLADGAAAF HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH ASGQQAVQEGIGKLVNGQQQLVDGADRLVAGQQTLVDGAKELENQLQSAYQGAQTVAVGS HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCC SKLADGVNQLATGSSQLVSGTSELADGANKLSDGVSAVAEGATSLHQGFDSLLRGGRSLS HHHHHHHHHHHCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH TGLVRLEQGAGELADRLSEGAEKADSIQANERVSEMIADPVQNDKRPLHHVPNYGTGFAP HHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCCCCCCCHHH YFLSLGLFVGALLLTIVFPLREPVERPSSGVAWFFGKWGVLAIVSAAQTLLADAWVLYGL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DLHVQSVWRFLLFTWIISMAFMMIVQFLVTLFDNPGRFLAILLLIAQLIGSAGTYPLELI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH PDALQSLHPWLPMTHAIHGLRTVISGGDFVLMWKEAAILAIVATVFALGTLAYFCLLYRR HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RYAVWTETETTVEA HHHEEECCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9579061; 9384377; 1459957 [H]