Definition | Prochlorococcus marinus str. MIT 9301, complete genome. |
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Accession | NC_009091 |
Length | 1,641,879 |
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The map label for this gene is 126696282
Identifier: 126696282
GI number: 126696282
Start: 811785
End: 813284
Strand: Reverse
Name: 126696282
Synonym: P9301_09441
Alternate gene names: NA
Gene position: 813284-811785 (Counterclockwise)
Preceding gene: 126696283
Following gene: 126696279
Centisome position: 49.53
GC content: 25.6
Gene sequence:
>1500_bases ATGAATTACTTGAAATTAAAGTACATAAAGTATGTAGTATTGATATTATTTCTTTATATTTTATTTTCTATATTTGTAAG AATAGTAAATATTTATACTCTTTTATTTTTAATTATAATTATTTATACTTTTTATAATATTGATAAAAAATTATTTAAAA AAATAGTTTATAAAGTTATATATAAAAATAAAAAAAATACACTTTCATTCAAAAATGCATATGGGGCTGCCAAGATAAGT TTGGAAGGAGTCGAGAAAATTAACAAAAAAATTAGCGATAAAGTAAAAGCTGAATTGTTAAATTACCAAAAAAATAAACT AGAGTCCCAATTAAAAACAGGAGATTATAAAGTTACTCTTTTTGGAGCAGGTTCCTCAGGAAAAACATCTATAGCAAGAT CCTTATTGAAAAATATTGTAGGAGAAACCTCAGCAAAAATAGGTACAACTAAGCAAATTAATAGCTATAAAATTCGTATA CCGATTTTAAAAAGAAATATTAATATTTTAGATACTCCAGGTTTATTTGAACCATCTAAATTAGGTGAAGAAAGAGAAAA AGCAACAATAATACAAGCATCAAATTCTGACTTAGTTCTTTTTGTGTTAGATCAGGACATAAATAAATACGAAAACTATT TAATTAAAGAATTATTGAAATTAAGGAAAAAAATAATAATAGTTCTAAATAAATGTGATTTGAGGTCTAGAGATGAAAAT AACCTTATCAAAGAAAATATAATTTCCATAACATCCGCTATAAAAAATAAAATATCCGTCGTTCAAACAATTGCGGTCCC TCAAAAATCTACCTATACAAAATCTGATTCTTTAAATTTAATCCCTGAGGTAGGAAGTTTATTTAGAGAAATAATTGAAA CCCTCGATAATAATGGTGAAGAGTTATTGGCTGATAATATTCTTTTTCGCTCAAATAAGTTAGGTATTAAAAGTAAAAAT TTCGTACAAGAACAAAGATATTTAATGTCCAATAAAGTTATTAAAAAATATATGTGGATAACAGGAGGCGTAATACTAGT TAATCCATTACCAGCTGTTGATTTTCTTACTACTACCTCCGTAAACCTTCAAATGATAATGGAGTTATCAAAAATATATG AAATAAAACTTACAAAAAAAGATGCAAAAGATTTGGCGACTTCATTGCTAAGTGTATTGGCTAAACAAGGAATATTAAAA GGGGGTCTCGCCATTCTTTCTCCTGCTTTAGCTACAAGCTTGACTAAAATAATATTATCTAAATCTATACAATCAGTTAC AGCAGGCTGGTTAATAAGAATAGTAGGATTAAGTTTGATTGAATATTTTAAAAATGGTCAAGATTGGGGTGATGGAGGAA TTCAAGAAGTAGTAGATAAGATCTATAGAATAAGTAAAAGAGAGGATATTTTAAATAATTTCGTAAAAGAAGCTATTTCA AAAATTGAAATGAAAAAATATTTTAAATCAAATAAAAGTTTACCTCCATTTACTAATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTAAATATTATAAATTTTCCAGTATTTAATATTGCTGATATATCTATTAATATTGGGTTCATTATTTTACTGTATAACAT TTTTAAAAATAATCGATAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases TATTGGATAATTGATCATTTAGATAAGTTCTGAAATCAAAGATGGTTATTAATAGTAAATAAGCAATGCAAATAGCTATA GAGATAAACCCTGTTACTTT
Product: GTPase SAR1 and related small G protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 499; Mature: 499
Protein sequence:
>499_residues MNYLKLKYIKYVVLILFLYILFSIFVRIVNIYTLLFLIIIIYTFYNIDKKLFKKIVYKVIYKNKKNTLSFKNAYGAAKIS LEGVEKINKKISDKVKAELLNYQKNKLESQLKTGDYKVTLFGAGSSGKTSIARSLLKNIVGETSAKIGTTKQINSYKIRI PILKRNINILDTPGLFEPSKLGEEREKATIIQASNSDLVLFVLDQDINKYENYLIKELLKLRKKIIIVLNKCDLRSRDEN NLIKENIISITSAIKNKISVVQTIAVPQKSTYTKSDSLNLIPEVGSLFREIIETLDNNGEELLADNILFRSNKLGIKSKN FVQEQRYLMSNKVIKKYMWITGGVILVNPLPAVDFLTTTSVNLQMIMELSKIYEIKLTKKDAKDLATSLLSVLAKQGILK GGLAILSPALATSLTKIILSKSIQSVTAGWLIRIVGLSLIEYFKNGQDWGDGGIQEVVDKIYRISKREDILNNFVKEAIS KIEMKKYFKSNKSLPPFTN
Sequences:
>Translated_499_residues MNYLKLKYIKYVVLILFLYILFSIFVRIVNIYTLLFLIIIIYTFYNIDKKLFKKIVYKVIYKNKKNTLSFKNAYGAAKIS LEGVEKINKKISDKVKAELLNYQKNKLESQLKTGDYKVTLFGAGSSGKTSIARSLLKNIVGETSAKIGTTKQINSYKIRI PILKRNINILDTPGLFEPSKLGEEREKATIIQASNSDLVLFVLDQDINKYENYLIKELLKLRKKIIIVLNKCDLRSRDEN NLIKENIISITSAIKNKISVVQTIAVPQKSTYTKSDSLNLIPEVGSLFREIIETLDNNGEELLADNILFRSNKLGIKSKN FVQEQRYLMSNKVIKKYMWITGGVILVNPLPAVDFLTTTSVNLQMIMELSKIYEIKLTKKDAKDLATSLLSVLAKQGILK GGLAILSPALATSLTKIILSKSIQSVTAGWLIRIVGLSLIEYFKNGQDWGDGGIQEVVDKIYRISKREDILNNFVKEAIS KIEMKKYFKSNKSLPPFTN >Mature_499_residues MNYLKLKYIKYVVLILFLYILFSIFVRIVNIYTLLFLIIIIYTFYNIDKKLFKKIVYKVIYKNKKNTLSFKNAYGAAKIS LEGVEKINKKISDKVKAELLNYQKNKLESQLKTGDYKVTLFGAGSSGKTSIARSLLKNIVGETSAKIGTTKQINSYKIRI PILKRNINILDTPGLFEPSKLGEEREKATIIQASNSDLVLFVLDQDINKYENYLIKELLKLRKKIIIVLNKCDLRSRDEN NLIKENIISITSAIKNKISVVQTIAVPQKSTYTKSDSLNLIPEVGSLFREIIETLDNNGEELLADNILFRSNKLGIKSKN FVQEQRYLMSNKVIKKYMWITGGVILVNPLPAVDFLTTTSVNLQMIMELSKIYEIKLTKKDAKDLATSLLSVLAKQGILK GGLAILSPALATSLTKIILSKSIQSVTAGWLIRIVGLSLIEYFKNGQDWGDGGIQEVVDKIYRISKREDILNNFVKEAIS KIEMKKYFKSNKSLPPFTN
Specific function: Unknown
COG id: COG1100
COG function: function code R; GTPase SAR1 and related small G proteins
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 56660; Mature: 56660
Theoretical pI: Translated: 10.37; Mature: 10.37
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 1.2 %Met (Translated Protein) 1.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 1.2 %Met (Mature Protein) 1.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNYLKLKYIKYVVLILFLYILFSIFVRIVNIYTLLFLIIIIYTFYNIDKKLFKKIVYKVI CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH YKNKKNTLSFKNAYGAAKISLEGVEKINKKISDKVKAELLNYQKNKLESQLKTGDYKVTL HCCCCCCEEEHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEE FGAGSSGKTSIARSLLKNIVGETSAKIGTTKQINSYKIRIPILKRNINILDTPGLFEPSK EECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCEECCCCCCCCHH LGEEREKATIIQASNSDLVLFVLDQDINKYENYLIKELLKLRKKIIIVLNKCDLRSRDEN HCCHHHHEEEEEECCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCC NLIKENIISITSAIKNKISVVQTIAVPQKSTYTKSDSLNLIPEVGSLFREIIETLDNNGE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCH ELLADNILFRSNKLGIKSKNFVQEQRYLMSNKVIKKYMWITGGVILVNPLPAVDFLTTTS HHHHHHHHEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCHHHHHCCC VNLQMIMELSKIYEIKLTKKDAKDLATSLLSVLAKQGILKGGLAILSPALATSLTKIILS CHHHHHHHHHHHHHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH KSIQSVTAGWLIRIVGLSLIEYFKNGQDWGDGGIQEVVDKIYRISKREDILNNFVKEAIS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KIEMKKYFKSNKSLPPFTN HHHHHHHHHCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MNYLKLKYIKYVVLILFLYILFSIFVRIVNIYTLLFLIIIIYTFYNIDKKLFKKIVYKVI CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH YKNKKNTLSFKNAYGAAKISLEGVEKINKKISDKVKAELLNYQKNKLESQLKTGDYKVTL HCCCCCCEEEHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEE FGAGSSGKTSIARSLLKNIVGETSAKIGTTKQINSYKIRIPILKRNINILDTPGLFEPSK EECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCEECCCCCCCCHH LGEEREKATIIQASNSDLVLFVLDQDINKYENYLIKELLKLRKKIIIVLNKCDLRSRDEN HCCHHHHEEEEEECCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCC NLIKENIISITSAIKNKISVVQTIAVPQKSTYTKSDSLNLIPEVGSLFREIIETLDNNGE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCH ELLADNILFRSNKLGIKSKNFVQEQRYLMSNKVIKKYMWITGGVILVNPLPAVDFLTTTS HHHHHHHHEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCHHHHHCCC VNLQMIMELSKIYEIKLTKKDAKDLATSLLSVLAKQGILKGGLAILSPALATSLTKIILS CHHHHHHHHHHHHHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH KSIQSVTAGWLIRIVGLSLIEYFKNGQDWGDGGIQEVVDKIYRISKREDILNNFVKEAIS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KIEMKKYFKSNKSLPPFTN HHHHHHHHHCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA