Definition | Psychromonas ingrahamii 37, complete genome. |
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Accession | NC_008709 |
Length | 4,559,598 |
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The map label for this gene is 119944216
Identifier: 119944216
GI number: 119944216
Start: 554907
End: 556457
Strand: Direct
Name: 119944216
Synonym: Ping_0438
Alternate gene names: NA
Gene position: 554907-556457 (Clockwise)
Preceding gene: 119944215
Following gene: 119944217
Centisome position: 12.17
GC content: 36.56
Gene sequence:
>1551_bases ATGACGACAGATTCACTTGGGAAGACCAAAGAAGATTTAACAGGGCAAGATCGCTTTGCTTGGAATTTAATGGTGAGTTG GGTTAGTCAGCTTGTCCTTGTTTTTTCTGGTTTTATTATGCCACGTTTAGTGGATGATAAAGTTGGGCAAGATTTACTTG GAATTTGGGATTTTGGTTGGTCTTTTGTTAGTTATTTAAGTTTAGTTGGCTTGGGAATGGGGGCATGTTTCAATCGCTAT ATTGCAAAGCATCGTTCATCTGGTGACTTTTTTTCACTTAACAAAGTGGCAAACTCAGCTGTTTTTGTGCAATTAATTTT TTCTACTGTTACTGCTCTATGTACCATCTCTTTCTACTTGCTATTACCAATTTATTTTAGTGATGTGCTACAAGAAAATA TCGCAACTGCACAGTGGGTGGTGTTGTTTTTAGGGTTGAGTGTATCGGTACAAATGATAGCAGGCTCAGCAAGCGGGTTA TTAACAGGTTACCACCGTTGGGATATTCACAATGCCTTACATGCAGGAGACAGCTTTTTTTCATTAATTTTGATGGTTAT TGCGCTGTATTTTACAGATCTAAATGTTGCTGGGATGGCAATTGGTTATTTGCTTTCAACCATTTTATTTGAAACTTTAC GCTTTGTTTTTGTTAATAAGTTATGTAAAGAATTTAAGTTTGATTTACGTATGGCTAATTTTATAAGTTGCAAAGAGATG CTGGTGTTTGGCATTAAAAGCATGCTTTCGAATGTTCCACCCATTCTCTTATTACAAACAATTAGCATTATGCTAGTGAG TGCTATCGGGCCTGCTGCATTAGCTGTTTTTGCAAGACCAATGGCATTAACTAAGCAAGTCAAAACCTTTATGACTAAGT TTACGTTAATGCTCACACCTACTACTAGTTCTATGCAGGGATCTGGCGATATTAAGGCTATCCAGTCTCTTTTTATCAGT ACAACAAAACTCAGTTTTGCGTTTACGTTACCTAGTTTAGGGTTTTTATTTATTTATGGTGATGTCGTTTTATACTACTG GATGGGTAGTGAATATGCACTATCCTCGTTAGTAATGATTTTAGCTCTTGGTCAGGTACTGCCAATGGGACAAGATACCT CTATTCGAATCTTGATGGGCATGAACCAACATGGAAGAATTTCTCTTTTTGCTTTCATCTCTGTATTTGCTTTTTTCGCG GTAGGTCTTCTTTTTTCCGGTGTCAATGATTGGGAATTAACCACTGCTGCCCTATTATTTGTTGTGCCGATGAATATTGT TTATGGCCTTATTGTGCCAATTTATACATGTCGGGAATTAGAATTGTCATGGTTCAGTTATGTGCAAAGCAGCTTTATCA GGCCAGTTATATATGTTATTCCATTTTTGGCCTTACTTTATTGGTCTCGTCAAGCTTTTGAGGCTAAAGATATTATTACA GCATCAGTAACTTTTTTCTTTGCGGGTATAGTCACCATCATTATCTATTTCGTTTATTTAGTTCCCAATAAAATGCAGCA AAAACTTCTGCTTCGTTGTAAATTTCAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TGACCGCTGGAAAGAACAGTTGAGTAAAACGGAGCTTAAGTGTTTTTATGATGTGGTCGGTGAGTACCATAATTCACTCG GCTACACGGAATAGAAAATA
Downstream 100 bases:
>100_bases TGAATTATTTTAAAATATATTTATTAAGGTTAACTAAATATGGATGTTAGTTTACGAAAGTACCCGTACCCTTATAGTGC AATGCTGGCTATTTGTAGTG
Product: transporter of NadC family protein
Products: NA
Alternate protein names: Transporter Of NADC Family Protein
Number of amino acids: Translated: 516; Mature: 515
Protein sequence:
>516_residues MTTDSLGKTKEDLTGQDRFAWNLMVSWVSQLVLVFSGFIMPRLVDDKVGQDLLGIWDFGWSFVSYLSLVGLGMGACFNRY IAKHRSSGDFFSLNKVANSAVFVQLIFSTVTALCTISFYLLLPIYFSDVLQENIATAQWVVLFLGLSVSVQMIAGSASGL LTGYHRWDIHNALHAGDSFFSLILMVIALYFTDLNVAGMAIGYLLSTILFETLRFVFVNKLCKEFKFDLRMANFISCKEM LVFGIKSMLSNVPPILLLQTISIMLVSAIGPAALAVFARPMALTKQVKTFMTKFTLMLTPTTSSMQGSGDIKAIQSLFIS TTKLSFAFTLPSLGFLFIYGDVVLYYWMGSEYALSSLVMILALGQVLPMGQDTSIRILMGMNQHGRISLFAFISVFAFFA VGLLFSGVNDWELTTAALLFVVPMNIVYGLIVPIYTCRELELSWFSYVQSSFIRPVIYVIPFLALLYWSRQAFEAKDIIT ASVTFFFAGIVTIIIYFVYLVPNKMQQKLLLRCKFQ
Sequences:
>Translated_516_residues MTTDSLGKTKEDLTGQDRFAWNLMVSWVSQLVLVFSGFIMPRLVDDKVGQDLLGIWDFGWSFVSYLSLVGLGMGACFNRY IAKHRSSGDFFSLNKVANSAVFVQLIFSTVTALCTISFYLLLPIYFSDVLQENIATAQWVVLFLGLSVSVQMIAGSASGL LTGYHRWDIHNALHAGDSFFSLILMVIALYFTDLNVAGMAIGYLLSTILFETLRFVFVNKLCKEFKFDLRMANFISCKEM LVFGIKSMLSNVPPILLLQTISIMLVSAIGPAALAVFARPMALTKQVKTFMTKFTLMLTPTTSSMQGSGDIKAIQSLFIS TTKLSFAFTLPSLGFLFIYGDVVLYYWMGSEYALSSLVMILALGQVLPMGQDTSIRILMGMNQHGRISLFAFISVFAFFA VGLLFSGVNDWELTTAALLFVVPMNIVYGLIVPIYTCRELELSWFSYVQSSFIRPVIYVIPFLALLYWSRQAFEAKDIIT ASVTFFFAGIVTIIIYFVYLVPNKMQQKLLLRCKFQ >Mature_515_residues TTDSLGKTKEDLTGQDRFAWNLMVSWVSQLVLVFSGFIMPRLVDDKVGQDLLGIWDFGWSFVSYLSLVGLGMGACFNRYI AKHRSSGDFFSLNKVANSAVFVQLIFSTVTALCTISFYLLLPIYFSDVLQENIATAQWVVLFLGLSVSVQMIAGSASGLL TGYHRWDIHNALHAGDSFFSLILMVIALYFTDLNVAGMAIGYLLSTILFETLRFVFVNKLCKEFKFDLRMANFISCKEML VFGIKSMLSNVPPILLLQTISIMLVSAIGPAALAVFARPMALTKQVKTFMTKFTLMLTPTTSSMQGSGDIKAIQSLFIST TKLSFAFTLPSLGFLFIYGDVVLYYWMGSEYALSSLVMILALGQVLPMGQDTSIRILMGMNQHGRISLFAFISVFAFFAV GLLFSGVNDWELTTAALLFVVPMNIVYGLIVPIYTCRELELSWFSYVQSSFIRPVIYVIPFLALLYWSRQAFEAKDIITA SVTFFFAGIVTIIIYFVYLVPNKMQQKLLLRCKFQ
Specific function: Unknown
COG id: COG2244
COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 57761; Mature: 57630
Theoretical pI: Translated: 8.69; Mature: 8.69
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.2 %Cys (Translated Protein) 4.3 %Met (Translated Protein) 5.4 %Cys+Met (Translated Protein) 1.2 %Cys (Mature Protein) 4.1 %Met (Mature Protein) 5.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTTDSLGKTKEDLTGQDRFAWNLMVSWVSQLVLVFSGFIMPRLVDDKVGQDLLGIWDFGW CCCCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHH SFVSYLSLVGLGMGACFNRYIAKHRSSGDFFSLNKVANSAVFVQLIFSTVTALCTISFYL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLPIYFSDVLQENIATAQWVVLFLGLSVSVQMIAGSASGLLTGYHRWDIHNALHAGDSFF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHH SLILMVIALYFTDLNVAGMAIGYLLSTILFETLRFVFVNKLCKEFKFDLRMANFISCKEM HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LVFGIKSMLSNVPPILLLQTISIMLVSAIGPAALAVFARPMALTKQVKTFMTKFTLMLTP HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEC TTSSMQGSGDIKAIQSLFISTTKLSFAFTLPSLGFLFIYGDVVLYYWMGSEYALSSLVMI CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH LALGQVLPMGQDTSIRILMGMNQHGRISLFAFISVFAFFAVGLLFSGVNDWELTTAALLF HHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH VVPMNIVYGLIVPIYTCRELELSWFSYVQSSFIRPVIYVIPFLALLYWSRQAFEAKDIIT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ASVTFFFAGIVTIIIYFVYLVPNKMQQKLLLRCKFQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure TTDSLGKTKEDLTGQDRFAWNLMVSWVSQLVLVFSGFIMPRLVDDKVGQDLLGIWDFGW CCCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHH SFVSYLSLVGLGMGACFNRYIAKHRSSGDFFSLNKVANSAVFVQLIFSTVTALCTISFYL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLPIYFSDVLQENIATAQWVVLFLGLSVSVQMIAGSASGLLTGYHRWDIHNALHAGDSFF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHH SLILMVIALYFTDLNVAGMAIGYLLSTILFETLRFVFVNKLCKEFKFDLRMANFISCKEM HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LVFGIKSMLSNVPPILLLQTISIMLVSAIGPAALAVFARPMALTKQVKTFMTKFTLMLTP HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEC TTSSMQGSGDIKAIQSLFISTTKLSFAFTLPSLGFLFIYGDVVLYYWMGSEYALSSLVMI CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH LALGQVLPMGQDTSIRILMGMNQHGRISLFAFISVFAFFAVGLLFSGVNDWELTTAALLF HHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH VVPMNIVYGLIVPIYTCRELELSWFSYVQSSFIRPVIYVIPFLALLYWSRQAFEAKDIIT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ASVTFFFAGIVTIIIYFVYLVPNKMQQKLLLRCKFQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA