| Definition | Bacillus thuringiensis str. Al Hakam chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008600 |
| Length | 5,257,091 |
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The map label for this gene is pip [H]
Identifier: 118476127
GI number: 118476127
Start: 426716
End: 429553
Strand: Direct
Name: pip [H]
Synonym: BALH_0372
Alternate gene names: 118476127
Gene position: 426716-429553 (Clockwise)
Preceding gene: 118476126
Following gene: 118476129
Centisome position: 8.12
GC content: 34.85
Gene sequence:
>2838_bases GTGATAACTTCTATGAAACAAATTTGGCGTATTTATAAGACAGATTTACGGAATGTAGCCAAACATTGGGCTGCAATTGT TATTGTTGTAGGGTTAATGATTTTACCATCGTTATATGCATGGTTTAACATTAAAGCTTCTTGGGATCCGTATGGAAATA CAAAAGAGGTTCCCATTGCAGTTTCTAACCAAGATGCAGGCTCTAATTTAAGAGGGAAAGATATTAATATCGGGGACGAG ATTGTAGATTCCCTTAAGAAAAACAAAAATCTTGGCTGGAAATTTGTAGATGAAAAACAAGCAATTTACGGAGTTGAACG TGGGGATTACTATGCAAGCATTACAATCCCAAAAGACTTCTCTGAAAAGATTGCAACTGTTCTGGATGAAAATCCACAGA AACCAGAACTTGATTACTATGTAAATGAAAAGGTAAACGCGATTGCACCGAAAATTACAGCAAAAGGTGCATCAGGTATT ACAGAAGAAATTAGTAAAAACTTTGTTAAAACAGCGAACGGTGAGATTTTTAAAATCTTCAATGACCTTGGAATCGATTT AGAAACAAACTTACCAAGTATTGAGAAAGTAAAAGATCTTGTATTTAAGTTAGAAGCGCAGTTCCCAGAAATGAATACAC TGATGGATAAGGCGTTAGATGATGCGACTCGAGCAGAGGATATTGTAAAAGTGGCGCAGAAAGAGTTACCAGTTGTAGAG AGTGTTATTAATGATGGTCAAGAAGCGTTAACAAATTTAGATAAGTTCTTTGCAAACAATGATCAAACATTGCAAAATGC ACCTGGGACGATACGAAATCATTTAACAGCGGCTAAAAATGTAATGGATAAAGCTAATGCTTTTACGGATTTTTTAATGC ATCCAGGAATAGACTTTTCTGGTATGAAAGGATTGCCTGAGTTTCCAGCGCGTCCGGATCTTTCAAAGTTGAACGATGAA GGTTATAAAAATATTGCAAGAAATATTAATCAAACAGTGAATAACGTTTTAAACTCGGCACGTGCAGGAACAACATACGG TAAAAGTGTTGTAAACGGATTGCAAAATGGTCAATTTGATCCAGAAAAGGCAAAACAAGATCTTAATGCGGTTTCTGAAA ATCTTCAAGGTCGTACAGATAGTATTGCATATCTTATTAATGTATTTACTGAACTACAAAAATCAGCGACGACTGATTTT GGTCAAAGCTTTTTCCAAGGCCGTGTGGATCGCTTAACTAAGCTTAAAAGCGGTATGGAAAATGCAAACAACGGTATTAA AGATATTGTAAATGTTATTGGCACAGGACAAGAAGTAAAGAAAGACGTAACAGATGTAGCAAATCAAAAATTAGATGCAG CAAATGGATTAATTGATCAAGCAGAAAAAGATTATAATGAAACATTTGTAGCAGATTATAAAAAAGCAGTTAGCACAGTC GATCAAGCTAAAGCTGATGCAAATGAAGCGTATGATAGTGTGAAAAATGAATATGATAAGTTCAAAAATGGTGTTGAAGA TGCTAAAGCAAACATATCAAATAAAGGTGTAACTGATTTAGAATGGGCAAAAGTATCTTTAAACGATTTAAATGGTCAAT TACAAGCTACTAATAATCTAATTGGTGATGCGATTCCGGTTTTAGAAAGCACAAATAAGGTATTAGCAGATGTAAATAGC GGAAAAAACCTTAATGGCGGAATTGCAAAATTGAACAAAATACAAAATTCTGTTCAAAAAGGTATAGATGCAACGAATAA GGCAACTACACTAATTAACAATGGACAGAAGCCTACAAAAGAGGTTGTAGAAAGTATTAATGAAGCAACTCAAAATGCTT CAGCTCAATTAGGAGATTTCTTAGCAACATATGATTCAGAAATCGTTCCAAACTTTAACACAGCAATTGAACGTACGAAA CGTATGTCTAAAAACACATCTCAAATTTTAAAAGAAGCAGACAAAAAGCTTCCAGATGTTAAAAAATTACTAGAAGATTC ATCAAAAGGCTTAGTAGACGGTAGAAAGAAATTAGCAGATATTAAAGCTGAAATGCCAGCTACTGAGAAAAAGATTAAAG AATTAGCAGATAAAATTCGTGATTTTGAATCTGAAGAGGATTTAAAAGACATCATCCGTTTGTTGAAAAACGATGTTGAG AAGCAAAGTGATTACTTTGCAAATCCAGTAAATTTAAAAGAGAATAAATTATTTGCAATGCCGAACTATGGTTCAGCAAT GTCACCATTCTATACAGTGCTTGCATTATGGGTAGGCGCATTATTAATGGTTTCGTTATTAACAGTAGAAGTACATGAAG AGGGCGCGAATTATAAGAGCCATGAAATTTACTTCGGACGTTTATTAACATTCTTAACGATAGGTCTTTCACAGGCGTTT ATCGTATCGATGGGAGATATATTCTTACTCGGTACGTACGTAGTCGATAAGTTCTGGTTTGTATTATTTAGTTTATTTAT AGGTGGAGTATTTGTTTGTATCGTGTACTCACTCGTTTCTATTTTCGGAAACGTAGGGAAATCGATGGCGATCATTTTAC TTGTACTGCAAGTAGCAGGATCGGGCGGAACATTCCCAATTCAAATGACACCGGCGTTCTTCCAAGCGATTTATCCGTTC TTACCGTTCACATACGCAATTAGTGCAATTCGTGAAACAGTAGGCGGAATGCTATGGGATATTGTAATGCGAGATTTACT TGTGTTAAGTGCTTTCGTAGTAGTTATGATTGTTGCTGCGTTATTACTGAAAACACCAATTAACAAATCAAGTGAAAAAT TCGTTGAGAATGCAAAAGGAAGTAAAATCATTCACTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AGGAAAAAATAGTTCGTTTTCGGTTAATCCACGATGTAGAAAGTGATATAATTGCAAAATGTATGTATCATTTTCTAAAG AAGGAAAAATATATAATTAG
Downstream 100 bases:
>100_bases CATAAAAGGTTCCTACCGATAGAGGTAGGAACCTTTTTGTTTAATCAAATTTTAATTTCTTTAATGCTTCTGCGAATGGG TTATTTAATGGTTCTTCTTC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 945; Mature: 945
Protein sequence:
>945_residues MITSMKQIWRIYKTDLRNVAKHWAAIVIVVGLMILPSLYAWFNIKASWDPYGNTKEVPIAVSNQDAGSNLRGKDINIGDE IVDSLKKNKNLGWKFVDEKQAIYGVERGDYYASITIPKDFSEKIATVLDENPQKPELDYYVNEKVNAIAPKITAKGASGI TEEISKNFVKTANGEIFKIFNDLGIDLETNLPSIEKVKDLVFKLEAQFPEMNTLMDKALDDATRAEDIVKVAQKELPVVE SVINDGQEALTNLDKFFANNDQTLQNAPGTIRNHLTAAKNVMDKANAFTDFLMHPGIDFSGMKGLPEFPARPDLSKLNDE GYKNIARNINQTVNNVLNSARAGTTYGKSVVNGLQNGQFDPEKAKQDLNAVSENLQGRTDSIAYLINVFTELQKSATTDF GQSFFQGRVDRLTKLKSGMENANNGIKDIVNVIGTGQEVKKDVTDVANQKLDAANGLIDQAEKDYNETFVADYKKAVSTV DQAKADANEAYDSVKNEYDKFKNGVEDAKANISNKGVTDLEWAKVSLNDLNGQLQATNNLIGDAIPVLESTNKVLADVNS GKNLNGGIAKLNKIQNSVQKGIDATNKATTLINNGQKPTKEVVESINEATQNASAQLGDFLATYDSEIVPNFNTAIERTK RMSKNTSQILKEADKKLPDVKKLLEDSSKGLVDGRKKLADIKAEMPATEKKIKELADKIRDFESEEDLKDIIRLLKNDVE KQSDYFANPVNLKENKLFAMPNYGSAMSPFYTVLALWVGALLMVSLLTVEVHEEGANYKSHEIYFGRLLTFLTIGLSQAF IVSMGDIFLLGTYVVDKFWFVLFSLFIGGVFVCIVYSLVSIFGNVGKSMAIILLVLQVAGSGGTFPIQMTPAFFQAIYPF LPFTYAISAIRETVGGMLWDIVMRDLLVLSAFVVVMIVAALLLKTPINKSSEKFVENAKGSKIIH
Sequences:
>Translated_945_residues MITSMKQIWRIYKTDLRNVAKHWAAIVIVVGLMILPSLYAWFNIKASWDPYGNTKEVPIAVSNQDAGSNLRGKDINIGDE IVDSLKKNKNLGWKFVDEKQAIYGVERGDYYASITIPKDFSEKIATVLDENPQKPELDYYVNEKVNAIAPKITAKGASGI TEEISKNFVKTANGEIFKIFNDLGIDLETNLPSIEKVKDLVFKLEAQFPEMNTLMDKALDDATRAEDIVKVAQKELPVVE SVINDGQEALTNLDKFFANNDQTLQNAPGTIRNHLTAAKNVMDKANAFTDFLMHPGIDFSGMKGLPEFPARPDLSKLNDE GYKNIARNINQTVNNVLNSARAGTTYGKSVVNGLQNGQFDPEKAKQDLNAVSENLQGRTDSIAYLINVFTELQKSATTDF GQSFFQGRVDRLTKLKSGMENANNGIKDIVNVIGTGQEVKKDVTDVANQKLDAANGLIDQAEKDYNETFVADYKKAVSTV DQAKADANEAYDSVKNEYDKFKNGVEDAKANISNKGVTDLEWAKVSLNDLNGQLQATNNLIGDAIPVLESTNKVLADVNS GKNLNGGIAKLNKIQNSVQKGIDATNKATTLINNGQKPTKEVVESINEATQNASAQLGDFLATYDSEIVPNFNTAIERTK RMSKNTSQILKEADKKLPDVKKLLEDSSKGLVDGRKKLADIKAEMPATEKKIKELADKIRDFESEEDLKDIIRLLKNDVE KQSDYFANPVNLKENKLFAMPNYGSAMSPFYTVLALWVGALLMVSLLTVEVHEEGANYKSHEIYFGRLLTFLTIGLSQAF IVSMGDIFLLGTYVVDKFWFVLFSLFIGGVFVCIVYSLVSIFGNVGKSMAIILLVLQVAGSGGTFPIQMTPAFFQAIYPF LPFTYAISAIRETVGGMLWDIVMRDLLVLSAFVVVMIVAALLLKTPINKSSEKFVENAKGSKIIH >Mature_945_residues MITSMKQIWRIYKTDLRNVAKHWAAIVIVVGLMILPSLYAWFNIKASWDPYGNTKEVPIAVSNQDAGSNLRGKDINIGDE IVDSLKKNKNLGWKFVDEKQAIYGVERGDYYASITIPKDFSEKIATVLDENPQKPELDYYVNEKVNAIAPKITAKGASGI TEEISKNFVKTANGEIFKIFNDLGIDLETNLPSIEKVKDLVFKLEAQFPEMNTLMDKALDDATRAEDIVKVAQKELPVVE SVINDGQEALTNLDKFFANNDQTLQNAPGTIRNHLTAAKNVMDKANAFTDFLMHPGIDFSGMKGLPEFPARPDLSKLNDE GYKNIARNINQTVNNVLNSARAGTTYGKSVVNGLQNGQFDPEKAKQDLNAVSENLQGRTDSIAYLINVFTELQKSATTDF GQSFFQGRVDRLTKLKSGMENANNGIKDIVNVIGTGQEVKKDVTDVANQKLDAANGLIDQAEKDYNETFVADYKKAVSTV DQAKADANEAYDSVKNEYDKFKNGVEDAKANISNKGVTDLEWAKVSLNDLNGQLQATNNLIGDAIPVLESTNKVLADVNS GKNLNGGIAKLNKIQNSVQKGIDATNKATTLINNGQKPTKEVVESINEATQNASAQLGDFLATYDSEIVPNFNTAIERTK RMSKNTSQILKEADKKLPDVKKLLEDSSKGLVDGRKKLADIKAEMPATEKKIKELADKIRDFESEEDLKDIIRLLKNDVE KQSDYFANPVNLKENKLFAMPNYGSAMSPFYTVLALWVGALLMVSLLTVEVHEEGANYKSHEIYFGRLLTFLTIGLSQAF IVSMGDIFLLGTYVVDKFWFVLFSLFIGGVFVCIVYSLVSIFGNVGKSMAIILLVLQVAGSGGTFPIQMTPAFFQAIYPF LPFTYAISAIRETVGGMLWDIVMRDLLVLSAFVVVMIVAALLLKTPINKSSEKFVENAKGSKIIH
Specific function: Required for phage infection [H]
COG id: COG1511
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 ABC transmembrane type-2 domain [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR013525 - InterPro: IPR017501 - InterPro: IPR017500 [H]
Pfam domain/function: PF01061 ABC2_membrane [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 104343; Mature: 104343
Theoretical pI: Translated: 5.26; Mature: 5.26
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 2.1 %Met (Translated Protein) 2.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 2.1 %Met (Mature Protein) 2.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MITSMKQIWRIYKTDLRNVAKHWAAIVIVVGLMILPSLYAWFNIKASWDPYGNTKEVPIA CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCCCCCCCCEE VSNQDAGSNLRGKDINIGDEIVDSLKKNKNLGWKFVDEKQAIYGVERGDYYASITIPKDF ECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCHHHHHCCCCCCEEEEEECCCHH SEKIATVLDENPQKPELDYYVNEKVNAIAPKITAKGASGITEEISKNFVKTANGEIFKIF HHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHCCCHHHHCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHEEHH NDLGIDLETNLPSIEKVKDLVFKLEAQFPEMNTLMDKALDDATRAEDIVKVAQKELPVVE HHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SVINDGQEALTNLDKFFANNDQTLQNAPGTIRNHLTAAKNVMDKANAFTDFLMHPGIDFS HHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC GMKGLPEFPARPDLSKLNDEGYKNIARNINQTVNNVLNSARAGTTYGKSVVNGLQNGQFD CCCCCCCCCCCCCHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCC PEKAKQDLNAVSENLQGRTDSIAYLINVFTELQKSATTDFGQSFFQGRVDRLTKLKSGME HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NANNGIKDIVNVIGTGQEVKKDVTDVANQKLDAANGLIDQAEKDYNETFVADYKKAVSTV HCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DQAKADANEAYDSVKNEYDKFKNGVEDAKANISNKGVTDLEWAKVSLNDLNGQLQATNNL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH IGDAIPVLESTNKVLADVNSGKNLNGGIAKLNKIQNSVQKGIDATNKATTLINNGQKPTK HHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCCCCCHH EVVESINEATQNASAQLGDFLATYDSEIVPNFNTAIERTKRMSKNTSQILKEADKKLPDV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHH KKLLEDSSKGLVDGRKKLADIKAEMPATEKKIKELADKIRDFESEEDLKDIIRLLKNDVE HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH KQSDYFANPVNLKENKLFAMPNYGSAMSPFYTVLALWVGALLMVSLLTVEVHEEGANYKS HHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH HEIYFGRLLTFLTIGLSQAFIVSMGDIFLLGTYVVDKFWFVLFSLFIGGVFVCIVYSLVS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IFGNVGKSMAIILLVLQVAGSGGTFPIQMTPAFFQAIYPFLPFTYAISAIRETVGGMLWD HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IVMRDLLVLSAFVVVMIVAALLLKTPINKSSEKFVENAKGSKIIH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MITSMKQIWRIYKTDLRNVAKHWAAIVIVVGLMILPSLYAWFNIKASWDPYGNTKEVPIA CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCCCCCCCCEE VSNQDAGSNLRGKDINIGDEIVDSLKKNKNLGWKFVDEKQAIYGVERGDYYASITIPKDF ECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCHHHHHCCCCCCEEEEEECCCHH SEKIATVLDENPQKPELDYYVNEKVNAIAPKITAKGASGITEEISKNFVKTANGEIFKIF HHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHCCCHHHHCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHEEHH NDLGIDLETNLPSIEKVKDLVFKLEAQFPEMNTLMDKALDDATRAEDIVKVAQKELPVVE HHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SVINDGQEALTNLDKFFANNDQTLQNAPGTIRNHLTAAKNVMDKANAFTDFLMHPGIDFS HHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC GMKGLPEFPARPDLSKLNDEGYKNIARNINQTVNNVLNSARAGTTYGKSVVNGLQNGQFD CCCCCCCCCCCCCHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCC PEKAKQDLNAVSENLQGRTDSIAYLINVFTELQKSATTDFGQSFFQGRVDRLTKLKSGME HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NANNGIKDIVNVIGTGQEVKKDVTDVANQKLDAANGLIDQAEKDYNETFVADYKKAVSTV HCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DQAKADANEAYDSVKNEYDKFKNGVEDAKANISNKGVTDLEWAKVSLNDLNGQLQATNNL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH IGDAIPVLESTNKVLADVNSGKNLNGGIAKLNKIQNSVQKGIDATNKATTLINNGQKPTK HHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCCCCCHH EVVESINEATQNASAQLGDFLATYDSEIVPNFNTAIERTKRMSKNTSQILKEADKKLPDV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHH KKLLEDSSKGLVDGRKKLADIKAEMPATEKKIKELADKIRDFESEEDLKDIIRLLKNDVE HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH KQSDYFANPVNLKENKLFAMPNYGSAMSPFYTVLALWVGALLMVSLLTVEVHEEGANYKS HHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH HEIYFGRLLTFLTIGLSQAFIVSMGDIFLLGTYVVDKFWFVLFSLFIGGVFVCIVYSLVS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IFGNVGKSMAIILLVLQVAGSGGTFPIQMTPAFFQAIYPFLPFTYAISAIRETVGGMLWD HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IVMRDLLVLSAFVVVMIVAALLLKTPINKSSEKFVENAKGSKIIH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8366036 [H]