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The map label for this gene is secA

Identifier: 116515070

GI number: 116515070

Start: 149470

End: 152064

Strand: Direct

Name: secA

Synonym: BCc_130

Alternate gene names: 116515070

Gene position: 149470-152064 (Clockwise)

Preceding gene: 116515069

Following gene: 116515071

Centisome position: 35.9

GC content: 23.31

Gene sequence:

>2595_bases
ATGTTAGGTAAACTAATTAATAAATTTTTTCTTAGTCGTAATGAACGTATTTTAAAAAATTTAAATGATCTTGTGATCAA
AATTAATATTTTAGAAAAAGATCTTTTAAAATTATCTGATAAAGAACTAAAAAAAAAAACAAATGAGTTTAAATTAAGAT
TAAAGTACGGTGATTCTTTAGATTCTTTATTACCAGAAGCTTTTTCTGTAATTCGTGAAGCTAGTAAAAGAATTTTTGGT
ATGAGACATTTTGATGTACAAATTTTAGGAGGGATAATTTTACATAAACAGTGTATTGCCGAAATGCGAACTGGTGAAGG
AAAAACTTTAACTGCGACATTACCTGCATATTTAAATGCATTAACAGGTAAAGGTGTACATATTGTTACAATGAATGATT
ATTTAGCTCAGAGAGATGCTAATAAAAATCGTATTTTATTTGAATTTTTAGGATTGACTGTTGGTATAAATGTATCTGGA
ATGTCTAGATTAGATAAAAAAAATGCTTATTTAGCAGATATTACTTATGGTACGAATCATGAATATGGTTTTGATTATTT
ACGCGATAATATGGTTTTTAATAGCGAAAAAAAAGTTCAAAGAAAGTTATATTTTGCTTTGATTGATGAAGTTGATTCAA
TTTTAATAGATGAAGCTCGAACACCTCTTGTTATTTCCGGACCGATAGAAAATAGTAATATACTATATGATCGAATTAAT
TCTTTAGTATCTGATTTAATACCACAAAATAAAAAATATGATAATTCTTTTAATGAAATAGGAGATTTTTGTATTGATTA
TAAGCAACGTCAAGTAAATTTAACTGAAATGGGTTTAAAAAAAATAGAGAAATTATTGGTTAAGTATAAATTTATATCAA
AAGAAGAGTCATTATATTTATCTAAAAATATTTTTTTTATTCATCATATTCTTTTAGCGCTTAAAGCGCATTATTTATTT
TTAAAAAATGTAGATTATATTATAAAAGATGATCAAATAATTATTGTTGATGAACATACTGGAAGAATTATGTCTAGTAG
AAGATGGTCTGATGGTTTACATCAAGCTATTGAAGCTAAAGAAAATGTTTTTATACAAAATGATAATCAGACTTTAGCTA
CTATGACTTTACAAAATTATTTTCGTTTATATAAAAAATTATCTGGAATGACTGGAACTGCTTCTACAGAAGCATTTGAG
TTTAATTCAATTTATAATTTAGATACTGTAATTATCCCAACAAATAAACCTATGATTCGTAATGATCTTCCAGATTTAGT
TTTTGTATCTAAATCTGACAAAATGAATGCTATTATTTCTGATATAAAAAATTGTGTATTTCGTCAACAACCTGTTTTAG
TTGGTACTGTTTCTATTGAAAAATCTGAAAAAATTTCAAGATTATTAAATAAATTAAATATTAAACATAATGTTTTAAAT
GCTAAATTTCATTCTCAAGAAGCTGATATTATAGCTAAAGCTGGAGAACCTAATGCTGTAACTATAGCTACTAATATGGC
TGGTAGAGGTACAGATATTGTATTAGGAGGGATTTTAAAAAAAGAAAATAATGAAAAATTTTTTACTACTAAAAATAGTG
TTAAATTATTAAATATATGGAAAAAAAAAAATAGATTAGTTATTAAATCGGGTGGTTTACATATTATTGGTACTGAAAGA
CATGAATCACGTAGAATTGATAATCAATTACGTGGAAGATCAGGAAGACAAGGTGATCCTGGTTCTTCAAGATTTTATTT
ATCTTTAGAAGATACATTAATGAAGTTTTTCGCTTCAGAAAATGTTATTAAAATTATAAAAACTCTTGGATTAAAATCTA
ATCAATCAATTGAACATCCATGGTTAAATAGTGCTATTGAAAGAGCTCAAAAAAAAGTAGAGAATTGTAATTTTGATATT
AGAAAACAGTTATTAGAATATGATAATGTTATTAATGAACAACGTTCAGTAATATACAATGAAAGAAACAAATTAATTAA
TAAATTAGATATTCATGATCATATTTTATTTATTTTAAAAGATCGTATAAATTTTTGTATTAAACAATATATTTCTGGTA
ATTCAATGAATGTCGATAGTTTTTTTGCTCTAGAAAAAGAACTGAAAAATAATTTTTATTTTATAAAATCGATAAATAAA
TTTTTAGAACATGATACTACATTATACGAAAATGTAGATAAATTAATTGATTTAATTGTTACTACAATACAATTTAGTTA
TAATAAAAATACAGCAATAGTATCAAAAAAATACTCTAATATGATTGAAAAATCTGTTATGTTACAGATATTAGATATTT
TTTGGATAGAACATTTAAATGCTGTAGATTTTTTAAAACAAAGCATTCATTTACGAGGATATGCGCAACAAGATCCTCAG
CAAGAATATAAACGTGAATCTTTTTTTATGTTTCAATCTATGTTAGAAGCTATAAAAAATAATGTTATTAAGAGTTTAAT
TAATATTTTTTTTGTAGATTTTAAAAAAAATAAAAATATTTATATAAATTTTATTGATCAAAAAGATTATGATTCATTTC
ATTTTTTAATTATGAAATCAATAAATATTACATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTGTTATATAATTTTTTAAAGTTATTTTTTTTATAAAACACTTTTTCTAATTTTATATAAATTTTTTACATGTTGTATT
AACGAATATGAGATTGTAGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAAATTATTAAATAATTCTTTAATTACTTTTATTTTACAATAAAAATTGTATATTAAAAATTTTAATATATTTTTTATTT
TAATATTACAATTTTTATTG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 864; Mature: 864

Protein sequence:

>864_residues
MLGKLINKFFLSRNERILKNLNDLVIKINILEKDLLKLSDKELKKKTNEFKLRLKYGDSLDSLLPEAFSVIREASKRIFG
MRHFDVQILGGIILHKQCIAEMRTGEGKTLTATLPAYLNALTGKGVHIVTMNDYLAQRDANKNRILFEFLGLTVGINVSG
MSRLDKKNAYLADITYGTNHEYGFDYLRDNMVFNSEKKVQRKLYFALIDEVDSILIDEARTPLVISGPIENSNILYDRIN
SLVSDLIPQNKKYDNSFNEIGDFCIDYKQRQVNLTEMGLKKIEKLLVKYKFISKEESLYLSKNIFFIHHILLALKAHYLF
LKNVDYIIKDDQIIIVDEHTGRIMSSRRWSDGLHQAIEAKENVFIQNDNQTLATMTLQNYFRLYKKLSGMTGTASTEAFE
FNSIYNLDTVIIPTNKPMIRNDLPDLVFVSKSDKMNAIISDIKNCVFRQQPVLVGTVSIEKSEKISRLLNKLNIKHNVLN
AKFHSQEADIIAKAGEPNAVTIATNMAGRGTDIVLGGILKKENNEKFFTTKNSVKLLNIWKKKNRLVIKSGGLHIIGTER
HESRRIDNQLRGRSGRQGDPGSSRFYLSLEDTLMKFFASENVIKIIKTLGLKSNQSIEHPWLNSAIERAQKKVENCNFDI
RKQLLEYDNVINEQRSVIYNERNKLINKLDIHDHILFILKDRINFCIKQYISGNSMNVDSFFALEKELKNNFYFIKSINK
FLEHDTTLYENVDKLIDLIVTTIQFSYNKNTAIVSKKYSNMIEKSVMLQILDIFWIEHLNAVDFLKQSIHLRGYAQQDPQ
QEYKRESFFMFQSMLEAIKNNVIKSLINIFFVDFKKNKNIYINFIDQKDYDSFHFLIMKSINIT

Sequences:

>Translated_864_residues
MLGKLINKFFLSRNERILKNLNDLVIKINILEKDLLKLSDKELKKKTNEFKLRLKYGDSLDSLLPEAFSVIREASKRIFG
MRHFDVQILGGIILHKQCIAEMRTGEGKTLTATLPAYLNALTGKGVHIVTMNDYLAQRDANKNRILFEFLGLTVGINVSG
MSRLDKKNAYLADITYGTNHEYGFDYLRDNMVFNSEKKVQRKLYFALIDEVDSILIDEARTPLVISGPIENSNILYDRIN
SLVSDLIPQNKKYDNSFNEIGDFCIDYKQRQVNLTEMGLKKIEKLLVKYKFISKEESLYLSKNIFFIHHILLALKAHYLF
LKNVDYIIKDDQIIIVDEHTGRIMSSRRWSDGLHQAIEAKENVFIQNDNQTLATMTLQNYFRLYKKLSGMTGTASTEAFE
FNSIYNLDTVIIPTNKPMIRNDLPDLVFVSKSDKMNAIISDIKNCVFRQQPVLVGTVSIEKSEKISRLLNKLNIKHNVLN
AKFHSQEADIIAKAGEPNAVTIATNMAGRGTDIVLGGILKKENNEKFFTTKNSVKLLNIWKKKNRLVIKSGGLHIIGTER
HESRRIDNQLRGRSGRQGDPGSSRFYLSLEDTLMKFFASENVIKIIKTLGLKSNQSIEHPWLNSAIERAQKKVENCNFDI
RKQLLEYDNVINEQRSVIYNERNKLINKLDIHDHILFILKDRINFCIKQYISGNSMNVDSFFALEKELKNNFYFIKSINK
FLEHDTTLYENVDKLIDLIVTTIQFSYNKNTAIVSKKYSNMIEKSVMLQILDIFWIEHLNAVDFLKQSIHLRGYAQQDPQ
QEYKRESFFMFQSMLEAIKNNVIKSLINIFFVDFKKNKNIYINFIDQKDYDSFHFLIMKSINIT
>Mature_864_residues
MLGKLINKFFLSRNERILKNLNDLVIKINILEKDLLKLSDKELKKKTNEFKLRLKYGDSLDSLLPEAFSVIREASKRIFG
MRHFDVQILGGIILHKQCIAEMRTGEGKTLTATLPAYLNALTGKGVHIVTMNDYLAQRDANKNRILFEFLGLTVGINVSG
MSRLDKKNAYLADITYGTNHEYGFDYLRDNMVFNSEKKVQRKLYFALIDEVDSILIDEARTPLVISGPIENSNILYDRIN
SLVSDLIPQNKKYDNSFNEIGDFCIDYKQRQVNLTEMGLKKIEKLLVKYKFISKEESLYLSKNIFFIHHILLALKAHYLF
LKNVDYIIKDDQIIIVDEHTGRIMSSRRWSDGLHQAIEAKENVFIQNDNQTLATMTLQNYFRLYKKLSGMTGTASTEAFE
FNSIYNLDTVIIPTNKPMIRNDLPDLVFVSKSDKMNAIISDIKNCVFRQQPVLVGTVSIEKSEKISRLLNKLNIKHNVLN
AKFHSQEADIIAKAGEPNAVTIATNMAGRGTDIVLGGILKKENNEKFFTTKNSVKLLNIWKKKNRLVIKSGGLHIIGTER
HESRRIDNQLRGRSGRQGDPGSSRFYLSLEDTLMKFFASENVIKIIKTLGLKSNQSIEHPWLNSAIERAQKKVENCNFDI
RKQLLEYDNVINEQRSVIYNERNKLINKLDIHDHILFILKDRINFCIKQYISGNSMNVDSFFALEKELKNNFYFIKSINK
FLEHDTTLYENVDKLIDLIVTTIQFSYNKNTAIVSKKYSNMIEKSVMLQILDIFWIEHLNAVDFLKQSIHLRGYAQQDPQ
QEYKRESFFMFQSMLEAIKNNVIKSLINIFFVDFKKNKNIYINFIDQKDYDSFHFLIMKSINIT

Specific function: Part of the Sec protein translocase complex. Interacts with the secYEG preprotein conducting channel. Has a central role in coupling the hydrolysis of ATP to the transfer of proteins into and across the cell membrane, serving as an ATP-driven molecular mo

COG id: COG0653

COG function: function code U; Preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase)

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Peripheral membrane protein; Cytoplasmic side. Cytoplasm (By similarity). Note=Distribution is 50-50 (By similarity)

Metaboloic importance: Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the secA family

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786287, Length=831, Percent_Identity=59.6871239470517, Blast_Score=1028, Evalue=0.0,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): SECA_BUCCC (Q057U3)

Other databases:

- EMBL:   CP000263
- RefSeq:   YP_802699.1
- ProteinModelPortal:   Q057U3
- SMR:   Q057U3
- STRING:   Q057U3
- EnsemblBacteria:   EBBUCT00000001445
- GeneID:   4440840
- GenomeReviews:   CP000263_GR
- KEGG:   bcc:BCc_130
- eggNOG:   COG0653
- GeneTree:   EBGT00050000007857
- HOGENOM:   HBG284200
- OMA:   GGMVLHD
- BioCyc:   BAPH372461:BCC_130-MONOMER
- GO:   GO:0005737
- HAMAP:   MF_01382
- InterPro:   IPR000185
- InterPro:   IPR020937
- InterPro:   IPR011115
- InterPro:   IPR014018
- InterPro:   IPR011130
- InterPro:   IPR011116
- Gene3D:   G3DSA:1.10.3060.10
- PRINTS:   PR00906
- SMART:   SM00957
- SMART:   SM00958
- TIGRFAMs:   TIGR00963

Pfam domain/function: PF07517 SecA_DEAD; PF01043 SecA_PP_bind; PF07516 SecA_SW; SSF81767 SecA_PP_bd; SSF81886 SecA_SW

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 100128; Mature: 100128

Theoretical pI: Translated: 9.78; Mature: 9.78

Prosite motif: PS01312 SECA; PS51196 SECA_MOTOR_DEAD

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
2.3 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
2.3 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLGKLINKFFLSRNERILKNLNDLVIKINILEKDLLKLSDKELKKKTNEFKLRLKYGDSL
CHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCEEEEEEEEHHHHHHHCCHHHHHCCCCCEEEEEEECCCH
DSLLPEAFSVIREASKRIFGMRHFDVQILGGIILHKQCIAEMRTGEGKTLTATLPAYLNA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHH
LTGKGVHIVTMNDYLAQRDANKNRILFEFLGLTVGINVSGMSRLDKKNAYLADITYGTNH
HCCCCEEEEEECHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCEECCCCCHHHHCCCCCEEEEEEECCCC
EYGFDYLRDNMVFNSEKKVQRKLYFALIDEVDSILIDEARTPLVISGPIENSNILYDRIN
CCCHHHHHCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHH
SLVSDLIPQNKKYDNSFNEIGDFCIDYKQRQVNLTEMGLKKIEKLLVKYKFISKEESLYL
HHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEE
SKNIFFIHHILLALKAHYLFLKNVDYIIKDDQIIIVDEHTGRIMSSRRWSDGLHQAIEAK
ECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCEEEEEECCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHH
ENVFIQNDNQTLATMTLQNYFRLYKKLSGMTGTASTEAFEFNSIYNLDTVIIPTNKPMIR
CCEEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEECCCEECCCEEEECCCCCHHH
NDLPDLVFVSKSDKMNAIISDIKNCVFRQQPVLVGTVSIEKSEKISRLLNKLNIKHNVLN
CCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCHHHHCC
AKFHSQEADIIAKAGEPNAVTIATNMAGRGTDIVLGGILKKENNEKFFTTKNSVKLLNIW
CHHCCCCCCEEEECCCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEECCCCCEEEEECCCEEEEEEE
KKKNRLVIKSGGLHIIGTERHESRRIDNQLRGRSGRQGDPGSSRFYLSLEDTLMKFFASE
CCCCEEEEEECCEEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHCC
NVIKIIKTLGLKSNQSIEHPWLNSAIERAQKKVENCNFDIRKQLLEYDNVINEQRSVIYN
CHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ERNKLINKLDIHDHILFILKDRINFCIKQYISGNSMNVDSFFALEKELKNNFYFIKSINK
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHH
FLEHDTTLYENVDKLIDLIVTTIQFSYNKNTAIVSKKYSNMIEKSVMLQILDIFWIEHLN
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
AVDFLKQSIHLRGYAQQDPQQEYKRESFFMFQSMLEAIKNNVIKSLINIFFVDFKKNKNI
HHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCE
YINFIDQKDYDSFHFLIMKSINIT
EEEEECCCCCCCEEEEEEECCCCC
>Mature Secondary Structure
MLGKLINKFFLSRNERILKNLNDLVIKINILEKDLLKLSDKELKKKTNEFKLRLKYGDSL
CHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCEEEEEEEEHHHHHHHCCHHHHHCCCCCEEEEEEECCCH
DSLLPEAFSVIREASKRIFGMRHFDVQILGGIILHKQCIAEMRTGEGKTLTATLPAYLNA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHH
LTGKGVHIVTMNDYLAQRDANKNRILFEFLGLTVGINVSGMSRLDKKNAYLADITYGTNH
HCCCCEEEEEECHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCEECCCCCHHHHCCCCCEEEEEEECCCC
EYGFDYLRDNMVFNSEKKVQRKLYFALIDEVDSILIDEARTPLVISGPIENSNILYDRIN
CCCHHHHHCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHH
SLVSDLIPQNKKYDNSFNEIGDFCIDYKQRQVNLTEMGLKKIEKLLVKYKFISKEESLYL
HHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEE
SKNIFFIHHILLALKAHYLFLKNVDYIIKDDQIIIVDEHTGRIMSSRRWSDGLHQAIEAK
ECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCEEEEEECCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHH
ENVFIQNDNQTLATMTLQNYFRLYKKLSGMTGTASTEAFEFNSIYNLDTVIIPTNKPMIR
CCEEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEECCCEECCCEEEECCCCCHHH
NDLPDLVFVSKSDKMNAIISDIKNCVFRQQPVLVGTVSIEKSEKISRLLNKLNIKHNVLN
CCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCHHHHCC
AKFHSQEADIIAKAGEPNAVTIATNMAGRGTDIVLGGILKKENNEKFFTTKNSVKLLNIW
CHHCCCCCCEEEECCCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEECCCCCEEEEECCCEEEEEEE
KKKNRLVIKSGGLHIIGTERHESRRIDNQLRGRSGRQGDPGSSRFYLSLEDTLMKFFASE
CCCCEEEEEECCEEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHCC
NVIKIIKTLGLKSNQSIEHPWLNSAIERAQKKVENCNFDIRKQLLEYDNVINEQRSVIYN
CHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ERNKLINKLDIHDHILFILKDRINFCIKQYISGNSMNVDSFFALEKELKNNFYFIKSINK
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHH
FLEHDTTLYENVDKLIDLIVTTIQFSYNKNTAIVSKKYSNMIEKSVMLQILDIFWIEHLN
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
AVDFLKQSIHLRGYAQQDPQQEYKRESFFMFQSMLEAIKNNVIKSLINIFFVDFKKNKNI
HHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCE
YINFIDQKDYDSFHFLIMKSINIT
EEEEECCCCCCCEEEEEEECCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA